CTBP1

C-terminální vazebný protein 1

PNR vychází z 1hku.
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolCTBP1  ; TYČE
Externí IDOMIM:  602618 MGI :  1201685 HomoloGene :  1015 GeneCards : CTBP1 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez148713016
SouborENSG00000159692ENSMUSG00000037373
UniProtQ13363O88712
RefSeq (mRNA)NM_001012614NM_001198859
RefSeq (protein)NP_001012632NP_001185788
Locus (UCSC)Chr 4:
1,21 - 1,24 Mb		Chr 5:
33,25 – 33,28 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

C-terminální vazebný protein 1 , také známý jako CtBP1  , je protein kódovaný u lidí genem CTBP1 [1] .

Funkce

Protein CtBP1 byl původně identifikován jako lidský protein, který je asociován s motivem PLDLS na C-konci adenovirových proteinů E1A.Tento a jemu příbuzný protein CTBP2 jsou transkripčními korepresory [2] . Jedná se o regulační proteiny, které se vážou na místně specifické proteiny vázající DNA a pomáhají vypnout gen. Dělají to náborem enzymů modifikujících histony, které deaktivují histony a odstraňují aktivační značky. CtBP proteiny se také mohou samy asociovat a pravděpodobně sestavovat genové komplexy [3] .

CtBP1 je široce exprimován ve všech fázích vývoje, od embrya po dospělého, zatímco CtBP2 je exprimován v užším rozmezí věků. Tyto proteiny mají mnoho biologických funkcí a zdají se být důležité při regulaci epiteliálně-mezenchymálního přechodu a také při ovlivňování metabolismu . Mají vliv na metabolismus vazbou NADH, ale špatně váží NAD+. Tyto proteiny jsou tedy citlivé na poměr NAD+/NADH. Jakmile se navážou na NADH, podstoupí konformační změny, které jim umožní vytvořit dimer a interagovat s partnerskými beky, čímž umlčí specifické geny .

Během vývoje skeletu a T-lymfocytů se CtBP1 a CtBP2 spojují s PLDLSL doménou δEF1, homeodoménou zinkového prstu, a tím zvyšují δEF1-dependentní umlčování transkripce . CtBP také váže Krüppelovy faktory rodiny proteinů se zinkovým prstem KLF3 , KLF8 a KLF12 . CtBP a CTIP navíc tvoří 125 kDa komplex, který rozpoznává zcela odlišné motivy proteinu CtBP. CTIP se váže na repetici BRCT genu pro rakovinu prsu BRCA1 , což umožňuje CtBP ovlivňovat aktivitu BRCA1. Oba proteiny mohou také interagovat s polycomb proteinovým komplexem , který se podílí na regulaci genové exprese během vývoje. Gen prochází alternativním sestřihem a existuje ve formě několika transkriptů [4] .

Interakce

Ukázalo se, že CTBP1 interaguje s:

Poznámky

  1. ↑ 1 2 Schaeper U., Subramanian T., Lim L., Boyd JM, Chinnadurai G. Interakce mezi buněčným proteinem, který se váže na C-terminální oblast adenoviru E1A (CtBP) a novým buněčným proteinem je narušena E1A prostřednictvím konzervovaný motiv PLDLS  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1998. - Duben ( roč. 273 , č. 15 ). - S. 8549-8552 . doi : 10.1074/ jbc.273.15.8549 . — PMID 9535825 .
  2. ↑ 1 2 Turner J., Crossley M. Klonování a charakterizace mCtBP2, korepresoru, který se spojuje se základním Krüppelovým faktorem a dalšími savčími transkripčními regulátory  // EMBO  J. : deník. - 1998. - září ( roč. 17 , č. 17 ). - str. 5129-5140 . - doi : 10.1093/emboj/17.17.5129 . — PMID 9724649 .
  3. ↑ Chinnadurai G. CtBP, nekonvenční transkripční korepresor ve vývoji a onkogenezi   // Mol . buňka : deník. - 2002. - Sv. 9 , č. 2 . - str. 213-224 . - doi : 10.1016/S1097-2765(02)00443-4 . — PMID 11864595 .
  4. ↑ Entrez Gen: CTBP1 C-terminální vazebný protein 1 .
  5. ↑ Oma Y., Nishimori K., Harata M. Protein příbuzný mozkovému aktinu ArpN alfa interaguje s transkripčním korepresorem CtBP   // Biochem . Biophys. Res. komunální. : deník. - 2003. - únor ( roč. 301 , č. 2 ). - str. 521-528 . - doi : 10.1016/S0006-291X(02)03073-5 . — PMID 12565893 .
  6. ↑ Paliwal S., Pande S., Kovi RC, Sharpless NE, Bardeesy N., Grossman SR Targeting of C-Terminal Binding Protein (CtBP) by ARF Results in p53-Independent Apoptosis   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2006. - březen ( roč. 26 , č. 6 ). - str. 2360-2372 . - doi : 10.1128/MCB.26.6.2360-2372.2006 . — PMID 16508011 .
  7. ↑ Chakraborty S., Senyuk V., Sitailo S., Chi Y., Nucifora G. Výsledky interakce EVI1 s cAMP-responzivním proteinem vázajícím protein (CBP) a faktorem spojeným s p300/CBP (P/CAF) při reverzibilní acetylaci EVI1 a při společné lokalizaci v jaderných skvrnách  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2001. - Listopad ( roč. 276 , č. 48 ). - S. 44936-44943 . - doi : 10.1074/jbc.M106733200 . — PMID 11568182 .
  8. ↑ Izutsu K., Kurokawa M., Imai Y., Maki K., Mitani K., Hirai H.  Korepresor CtBP interaguje s Evi-1 za účelem potlačení signalizace transformujícího růstového faktoru beta  // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 2001. - Květen ( roč. 97 , č. 9 ). - S. 2815-2822 . - doi : 10.1182/krev.V97.9.2815 . — PMID 11313276 .
  9. ↑ Li S., Weidenfeld J., Morrisey EE Transkripční a DNA vazebná aktivita rodiny Foxp1/2/4 je modulována heterotypickými a homotypickými proteinovými interakcemi   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2004. - Leden ( roč. 24 , č. 2 ). - S. 809-822 . - doi : 10.1128/MCB.24.2.809-822.2004 . — PMID 14701752 .
  10. ↑ Zhang CL, McKinsey TA, Lu JR, Olson EN Asociace COOH-terminálního vazebného proteinu (CtBP) a MEF2-interagujícího transkripčního represoru (MITR) přispívá k transkripční represi transkripčního faktoru MEF2  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2001. - Leden ( roč. 276 , č. 1 ). - S. 35-9 . - doi : 10.1074/jbc.M007364200 . — PMID 11022042 .
  11. ↑ 1 2 Melhuish TA, Wotton D. Interakce proteinu vázajícího karboxylový konec s korepresorem Smad TGIF je narušena holoprosencefalickou mutací v TGIF  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - prosinec ( roč. 275 , č. 50 ). - S. 39762-39766 . - doi : 10.1074/jbc.C000416200 . — PMID 10995736 .
  12. ↑ Sundqvist A., Sollerbrant K., Svensson C. Karboxy-terminální oblast adenoviru E1A aktivuje transkripci prostřednictvím cílení komplexu C-terminální vazebný protein-histon deacetyláza  // FEBS Lett  . : deník. - 1998. - Červen ( roč. 429 , č. 2 ). - S. 183-188 . - doi : 10.1016/S0014-5793(98)00588-2 . — PMID 9650586 .
  13. ↑ Koipally J., Georgopoulos K. Interakce Ikaros s CtBP odhalují represivní mechanismus, který je nezávislý na aktivitě histondeacetylázy  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2000. - Červen ( roč. 275 , č. 26 ). - S. 19594-19602 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .
  14. ↑ Perdomo J., Crossley M. Protein Eos rodiny Ikaros se spojuje s C-terminálními vazebnými proteinovými korepresory   // Eur . J Biochem. : deník. - 2002. - prosinec ( roč. 269 , č. 23 ). - S. 5885-5892 . - doi : 10.1046/j.1432-1033.2002.03313.x . — PMID 12444977 .
  15. ↑ van Vliet J., Turner J., Crossley M. Human Krüppel-like factor 8: CACCC-box binding protein, který se spojuje s CtBP a potlačuje transkripci  // Nucleic Acids Res  . : deník. - 2000. - Květen ( roč. 28 , č. 9 ). - S. 1955-1962 . - doi : 10.1093/nar/28.9.1955 . — PMID 10756197 .
  16. ↑ Mirnezami AH, Campbell SJ, Darley M., Primrose JN, Johnson PW, Blaydes JP Hdm2 získává korepresor citlivý na hypoxii k negativní regulaci transkripce závislé na p53   // Curr . Biol.  : deník. - 2003. - Červenec ( roč. 13 , č. 14 ). - S. 1234-1239 . - doi : 10.1016/S0960-9822(03)00454-8 . — PMID 12867035 .
  17. ↑ Xia ZB, Anderson M., Diaz MO, Zeleznik-Le NJ MLL represní doména interaguje s histondeacetylázami, proteiny polycomb group HPC2 a BMI-1 a korepresorovým C-terminálním vazebným proteinem  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 2003. - Červenec ( roč. 100 , č. 14 ). - S. 8342-8347 . - doi : 10.1073/pnas.1436338100 . — PMID 12829790 .
  18. ↑ Castet A., Boulahtouf A., Versini G., Bonnet S., Augereau P., Vignon F., Khochbin S., Jalaguier S., Cavaillès V. Multiple domains of the Receptor-Interacting Protein 140 přispívají k inhibici transkripce  ( anglicky)  // Nucleic Acids Res. : deník. - 2004. - Sv. 32 , č. 6 . - S. 1957-1966 . doi : 10.1093 / nar/gkh524 . — PMID 15060175 .
  19. ↑ Perissi V., Scafoglio C., Zhang J., Ohgi KA, Rose DW, Glass CK, Rosenfeld MG TBL1 a TBLR1 Fosforylace na regulovaných promotorech genů překonává duální kontrolní body CtBP a NCoR/SMRT transkripční represe   // Mol . buňka : deník. - 2008. - březen ( roč. 29 , č. 6 ). - str. 755-766 . - doi : 10.1016/j.molcel.2008.01.020 . — PMID 18374649 .
  20. ↑ Alpatov R., Munguba GC, Caton P., Joo JH, Shi Y., Shi Y., Hunt ME, Sugrue SP Nuclear Speckle-Associated Protein Pnn/DRS se váže na transkripční korepresor CtBP a zmírňuje represi zprostředkovanou CtBP E-Cadherin Gene  (anglicky)  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2004. - prosinec ( roč. 24 , č. 23 ). - S. 10223-10235 . - doi : 10.1128/MCB.24.23.10223-10235.2004 . — PMID 15542832 .
  21. ↑ Li S., Chen PL, Subramanian T., Chinnadurai G., Tomlinson G., Osborne CK, Sharp ZD, Lee WH Vazba CtIP na BRCT repetice BRCA1 zapojená do regulace transkripce p21 je narušena při poškození DNA  ( anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 1999. - Duben ( roč. 274 , č. 16 ). - S. 11334-11338 . doi : 10.1074 / jbc.274.16.11334 . — PMID 10196224 .

Literatura