IKZF1

Zinkový prst 1 (Ikaros) z rodiny IKAROS
Identifikátory
SymbolIKZF1  ; Hs.54452; IK1; IKAROS; LYF1; LyF-1; PPP1R92; PRO0758; ZNFN1A1
Externí IDOMIM:  603023 MGI :  1342540 HomoloGene :  55948 GeneCards : IKZF1 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez1032022778
SouborENSG00000185811ENSMUSG00000018654
UniProtQ13422Q03267
RefSeq (mRNA)NM_001220765NM_001025597
RefSeq (protein)NP_001207694NP_001020768
Locus (UCSC)Chr 7:
50,34 – 50,47 Mb		Chr 11:
11,69 – 11,77 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Protein vázající DNA Ikaros , také známý jako protein zinkového prstu 1 z rodiny Ikaros ( angl.  DNA-binding protein Ikaros, Ikaros family zinc finger protein 1, IKZF1 ) je protein kódovaný u lidí genem IKZF1 [1] [2 ] [3] .

Funkce

Ikaros plní důležité funkce v hematopoetickém systému a ztráta jeho funkcí je spojena se vznikem lymfoidní leukémie [4] . Zejména se v posledních letech ukázalo, že Ikaros je jedním z hlavních nádorových supresorů podílejících se na rozvoji B-buněčné akutní lymfoblastické leukémie u lidí [4] . IKZF1 je upregulován v granulocytech , B buňkách, T buňkách nesoucích CD4 a CD8 receptory , NK buňkách a je downregulován v erytroblastech , megakaryocytech a monocytech [5] . U IKZF1 knockout myší se T buňky, ale ne B buňky, stále tvoří pozdě ve vývoji v důsledku pozdní kompenzační exprese blízce příbuzného genu (IKZF3) 6] . Ikaros má za následek smrt plodu u mutantních myší v důsledku anémie ; mají závažné defekty v terminální diferenciaci erytrocytů a granulocytů a nadměrnou produkci makrofágů [7] .

Klinický význam

U lidí byly SNP lokalizované v blízkosti 3' oblasti genu IKZF1 spojeny s náchylností k dětské akutní lymfoblastické leukémii (ALL) [8] a také k diabetes mellitus 1. typu [9] . Zdá se, že tyto dva účinky jsou v opačných směrech, tj. alela zodpovědná za náchylnost k ALL poskytuje ochranu proti diabetes mellitus 1. typu a naopak [9] .

Interakce s jinými proteiny

Ukázalo se, že IKZF1 interaguje s: IKZF2 [10] , IKZF3 [11] [12] [13] , IKZF4 [14] [15] , histon deacetyláza 5 [16] , HDAC1 [ 17] [16] , HDAC7A [16] , SIN3B [12] [16] , SIN3A [12] [16] [18] a CTBP1 [19] .

Poznámky

  1. ↑ Georgopoulos K., Moore DD, Derfler B. Ikaros, časný lymfoidně specifický transkripční faktor a domnělý mediátor pro nasazení T buněk  //  Science : journal. - 1992. - prosinec ( roč. 258 , č. 5083 ). - S. 808-812 . - doi : 10.1126/science.1439790 . — PMID 1439790 .
  2. ↑ Hahm K., Ernst P., Lo K., Kim GS, Turck C., Smale ST Lymfoidní transkripční faktor LyF-1 je kódován specifickými, alternativně sestřihovanými mRNA odvozenými z genu Ikaros   // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1994. - Listopad ( roč. 14 , č. 11 ). - str. 7111-7123 . — PMID 7935426 .
  3. ↑ Entrez Gene: IKZF1 IKAROS rodina zinkový prst 1 (Ikaros) .
  4. ↑ 1 2 Kastner P., Chan S. Role of Ikaros in T-cell akutní lymfoblastic leukemia  (anglicky)  // World J Biol Chem : journal. - 2011. - Červen ( vol. 2 , č. 6 ). - str. 108-114 . - doi : 10.4331/wjbc.v2.i6.108 . — PMID 21765975 .
  5. ↑ Watkins NA, Gusnanto A., de Bono B., De S., Miranda-Saavedra D., Hardie DL, Angenent WG, Attwood AP, Ellis PD, Erber W., Foad NS, Garner SF, Isacke CM, Jolley J ., Koch K., Macaulay IC, Morley SL, Rendon A., Rice KM, Taylor N., Thijssen-Timmer DC, Tijssen MR, van der Schoot CE, Wernisch L., Winzer T., Dudbridge F., Buckley CD , Langford CF, Teichmann S., Göttgens B., Ouwehand WH; Bloodomics Consortium. A HaemAtlas: charakterizující genovou expresi v diferencovaných lidských krevních   buňkách // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 2009. — Květen ( roč. 113 , č. 19 ). - S. e1-9 . - doi : 10.1182/krev-2008-06-162958 . — PMID 19228925 .
  6. ↑ Georgopoulos K., Winandy S., Avitahl N. Role genu Ikaros ve vývoji lymfocytů a homeostáze. (anglicky)  // Ann Rev Immunol. : deník. - 1997. - Sv. 15 . - S. 155-176 . - doi : 10.1146/annurev.immunol.15.1.155 . — PMID 9143685 .
  7. ↑ Papathanasiou P., Perkins AC, Cobb BS, Ferrini R., Sridharan R., Hoyne GF, Nelms KA, Smale ST, Goodnow CC. Rozsáhlé selhání hematolymfoidní diferenciace způsobené recesivní alelou vyplňující niku transkripčního faktoru Ikaros  //  Imunita: časopis. - 2003. - Červenec ( roč. 19 , č. 1 ). - str. 131-144 . - doi : 10.1016/s1074-7613(03)00168-7 .
  8. ↑ Papaemmanuil E., Hosking FJ, Vijayakrishnan J., Price A., Olver B., Sheridan E., Kinsey SE, Lightfoot T., Roman E., Irving JA, Allan JM, Tomlinson IP, Taylor M., Greaves M ., Holston RS. Lokusy na 7p12.2, 10q21.2 a 14q11.2 jsou spojeny s rizikem dětské akutní lymfoblastické leukémie. (anglicky)  // Ann Rev Immunol. : deník. - 2009. - září ( roč. 41 , č. 9 ). - S. 1006-1010 . - doi : 10.1038/ng.430 . — PMID 19684604 .
  9. ↑ 1 2 Swafford AD, Howson JM, Davison LJ, Wallace C., Smyth DJ, Schuilenburg H., Maisuria-Armer M., Mistry T., Lenardo MJ, Todd JA. Alela IKZF1 (Ikaros) propůjčující náchylnost k dětské akutní lymfoblastické leukémii chrání před diabetem 1. typu. (anglicky)  // Diabetes: journal. - 2011. - únor ( roč. 60 , č. 3 ). - S. 1041-1044 . doi : 10,2337 /db10-0446 . — PMID 21270240 .
  10. ↑ Kelley CM, Ikeda T., Koipally J., Avitahl N., Wu L., Georgopoulos K., Morgan BA. Helios, nový dimerizační partner Ikaros vyjádřený v prvních hematopoetických progenitorech  // Current Biology  : journal  . - Cell Press , 1998. - Duben ( vol. 8 , č. 9 ). - S. 508-915 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70202-7 . — PMID 9560339 .
  11. ↑ Morgan B., Sun L., Avitahl N., Andrikopoulos K., Ikeda T., Gonzales E., Wu P., Neben S., Georgopoulos K. Aiolos, lymfoidně omezený transkripční faktor, který interaguje s Ikarosem za účelem regulace lymfocytů diferenciace. (anglicky)  // EMBO: journal. - 1997. - Duben ( roč. 16 , č. 8 ). - S. 2004-2013 . - doi : 10.1093/emboj/16.8.2004 . — PMID 9155026 .
  12. ↑ 1 2 3 Koipally J., Renold A., Kim J., Georgopoulos K. Represe ze strany Ikarose a Aiolose je zprostředkována prostřednictvím komplexů histondeacetylázy. (anglicky)  // EMBO: journal. - 1999. - Červen ( roč. 18 , č. 11 ). - S. 3090-3100 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  13. ↑ Kim J., Sif S., Jones B., Jackson A., Koipally J., Heller E., Winandy S., Viel A., Sawyer A., ​​​​Ikeda T., Kingston R., Georgopoulos K. Ikaros DNA-vazebné proteiny řídí tvorbu komplexů remodelujících chromatin v lymfocytech. (anglicky)  // Imunita : journal. - 1999. - březen ( roč. 10 , č. 3 ). - S. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
  14. ↑ Honma, Y; Kiyosawa H., Mori T., Oguri A., Nikaido T., Kanazawa K., Tojo M., Takeda J., Tanno Y., Yokoya S., Kawabata I., Ikeda H., Wanaka A. Eos: a nový člen genové rodiny Ikaros exprimovaný převážně ve vyvíjejícím se nervovém systému  //  FEBS Letters : deník. - NIZOZEMSKO, 1999. - březen ( roč. 447 , č. 1 ). - S. 76-80 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(99)00265-3 . — PMID 10218586 .
  15. ↑ Perdomo, J; Holmes M; Chong B; Crossley M. Eos a pegasus, dva členové rodiny proteinů Ikaros s odlišnými vazebnými aktivitami DNA  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - SPOJENÉ STÁTY, 2000. - Prosinec ( sv. 275 , č. 49 ). - S. 38347-38354 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M005457200 . — PMID 10978333 .
  16. ↑ 1 2 3 4 5 Koipally, Josef; Georgopoulos Katia. Molekulární pitva represivních obvodů Ikaros  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - Spojené státy americké, 2002. - Srpen ( sv. 277 , č. 31 ). - S. 27697-27705 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M201694200 . — PMID 12015313 .
  17. ↑ Koipally, J; Renold A; Kim J; Georgopoulos K. Represe ze strany Ikaros a Aiolos je zprostředkována prostřednictvím komplexů histon deacetylázy  (anglicky)  // The EMBO Journal : deník. - ANGLIE, 1999. - červen ( roč. 18 , č. 11 ). - S. 3090-3100 . — ISSN 0261-4189 . - doi : 10.1093/emboj/18.11.3090 . — PMID 10357820 .
  18. ↑ Koipally, Josef; Georgopoulos Katia. Interakce Ikaros-CtIP nevyžadují C-terminální vazebný protein a účastní se režimu represe nezávislého na deacetyláze  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - Spojené státy americké, 2002. - Červen ( sv. 277 , č. 26 ). - S. 23143-23149 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M202079200 . — PMID 11959865 .
  19. ↑ Koipally, J; Interakce Georgopoulos K. Ikaros s CtBP odhalují represivní mechanismus, který je nezávislý na aktivitě histondeacetylázy  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - SPOJENÉ STÁTY, 2000. - Červen ( sv. 275 , č. 26 ). - S. 19594-19602 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M000254200 . — PMID 10766745 .

Literatura