Desulfovibrio

Desulfovibrio

Desulfovibrio vulgaris , TEM, pruh 0,5 µm
vědecká klasifikace
Doména:bakterieTyp:ProteobakterieTřída:Delta ProteobakterieObjednat:DesulfovibrionalesRodina:DesulfovibrionaceaeRod:Desulfovibrio
Mezinárodní vědecký název
Desulfovibrio Kluyver a van Niel 1936
Druhy

četné, včetně:

  • Desulfovibrio acrylicus
  • Desulfovibrio africanus
  • Desulfovibrio alkoholivorans
  • Desulfovibrio baarsii
  • Desulfovibrio carbinolicus
  • Desulfovibrio desulfuricans typus
  • Desulfovibrio gigas
  • Desulfovibrio halophilus
  • Desulfovibrio inopinatus
  • Desulfovibrio longus
  • Desulfovibrio magneticus
  • Desulfovibrio oxamicus
  • Desulfovibrio piger
  • Desulfovibrio psychrotolerans
  • Desulfovibrio salexigens

Desulfovibrio   (latinsky)  je rod gramnegativních , obligátních anaerobních bakterií redukujících sulfát . Rod obsahuje asi 65 skutečně publikovaných druhů [1] . Žijí v anaerobních sedimentech sladkých a brakických vod, moří a také ve střevech některých zvířat , v hnoji a výkalech .

Biologické vlastnosti

Zakřivené nebo příležitostně rovné nesporotvorné tyčinky , někdy esovité nebo spirálovité , 0,5–1,5 × 2,5–10 µm velké, morfologie závisí na stáří kultury. Jsou pohyblivé díky přítomnosti jednoho nebo více bičíků uspořádaných polárně. Chemoorganoheterotrofy , obligátní anaeroby , používají sírany nebo jiné sloučeniny síry obsahující kyslík jako konečný akceptor elektronů a emitují sirovodík jako konečný produkt . Většina druhů oxiduje organickou hmotu na acetát a jen několik druhů může používat sacharidy jako zdroj uhlíku a energie . Všichni členové rodu obsahují desulfoviridin . Některé kmeny jsou schopny chemolithoheterotrofního metabolismu oxidací molekulárního vodíku a asimilací acetátu a oxidu uhličitého jako zdroje uhlíku [2] . Některé druhy jsou schopny využívat aminokyseliny jako zdroj uhlíku [3] . Některé druhy žijí v hydrotermálních průduchech [4] . Byly zaznamenány změny ve struktuře nitrocelulózy způsobené Desulfovibrio desulfuricans [5] . Desulfovibrio desulfuricans , Desulfovibrio HL21 a Desulfovibrio vulgaris používají polyglukózu jako rezervní zdroj uhlíku [ 6] . Zástupci rodu Desulfovibrio jsou schopni během růstu na agarových živných půdách uvolňovat oxid siřičitý S 2 O [7] . Redukce šestimocného chrómu v buňkách Desulfovibrio vulgaris inhibuje redukci sulfátu a buněčný růst [8] .

Genom

Byly studovány kompletní nukleotidové sekvence genomů zástupců rodu Desulfovibrio . Genom Desulfovibrio desulfuricans kmene G20 je reprezentován kruhovou dvouvláknovou molekulou DNA o velikosti 3730232 bp. a obsahuje 3865 genů , z nichž 3775 kóduje proteiny [9] . Genom Desulfovibrio vulgaris kmene Hildenborough je také reprezentován kruhovou dvouvláknovou molekulou DNA o velikosti 3570858 bp, byly nalezeny nové cytochromy typu C asociované s periplazmatickými hydrogenázami a formiátdehydrogenázami , což souvisí se zvláštnostmi metabolismu těchto bakterií redukujících sulfáty [10] obsahuje genom Desulfovibrio vulgaris kmen Hildenborough 3634 genů, z nichž 3551 kóduje proteiny [11] . Také v genomu Desulfovibrio desulfuricans byl nalezen malý kryptický plazmid pBG1 o velikosti 2,3 kilobází a vyvíjejí se metody pro jeho použití jako kyvadlového vektoru [12] . Procento % párů G + C se u zástupců rodu pohybuje od 46,1 % do 61,2 %.

Význam

Zástupci rodu Desulfovibrio mají velký význam v procesech biomineralizace , v koloběhu síry v přírodě a biokorozi kovů [13] . S ohledem na relativní odolnost zástupců rodu Desulfovibrio vůči těžkým kovům a také na schopnost redukovat sloučeniny chrómu III, mědi II, manganu II, niklu II a zinku II je perspektivní použití zástupců rodu Desulfovibrio při biologickém čištění odpadních vod kontaminovaných sloučeninami těžkých kovů [14] .

Poznámky

  1. ↑ LPSN: Rod Desulfovibrio . Staženo 31. 5. 2015. Archivováno z originálu 29. 5. 2019.
  2. ↑ Bergeyův manuál systematické bakteriologie . Získáno 3. října 2017. Archivováno z originálu 31. ledna 2010.
  3. ↑ Desulfovibrio aminophilus sp. nov., nová bakterie degradující aminokyseliny a redukující sírany z anaerobní laguny odpadních vod z mléčných výrobků (nedostupný odkaz) . Získáno 9. září 2008. Archivováno z originálu 22. července 2015. 
  4. ↑ Desulfovibrio hydrothermalis sp. nov., nová sulfát-redukující bakterie izolovaná z hydrotermálních průduchů - Alazard et al. 53 (1): 173 - International Journal of Systematic a ... (odkaz nepřístupný) . Získáno 9. září 2008. Archivováno z originálu 7. ledna 2009. 
  5. ↑ Změny v molekule nitrocelulózy indukované bakterií redukující sulfát Desulfovibrio desulfuricans 1388. The Enzy Archivováno z originálu 4. března 2016.
  6. ↑ Výskyt polyglukózy jako zásobního polymeru u druhů Desulfovibrio a Desulfobulbus propionius  (nedostupný odkaz)
  7. ↑ Disulfur Monoxide: Production by Desulfovibrio - Iverson 156 (3778): 1112 - Science
  8. ↑ Publikace za rok 2008 | Center for Biofilm Engineering  (nedostupný odkaz)
  9. ↑ uid=18914 Výsledek genomu
  10. ↑ http://srs.ebi.ac.uk/srsbin/cgi-bin/wgetz?-noSession+-view+MedlineFull+  (nedostupný odkaz) [MEDLINE:15077118]
  11. ↑ Desulfovibrio vulgaris Hildenborough Genome Page  (downlink)
  12. ↑ NCBI – WWW Error Blocked Diagnostic
  13. ↑ ITQB/UNL - Desulfovibrio gigas Archivováno z originálu 25. října 2008.
  14. ↑ Toxické účinky rozpuštěných těžkých kovů na Desulfo… [J Hazard Mater. 2006] - Výsledek PubMed

Odkazy