NS5B

Nestrukturální protein 5B ( NS5B ) je protein viru hepatitidy C (HCV) [1] . Jedná se o RNA polymerázu , její klíčovou funkcí je replikace virové RNA z virového RNA pozitivního řetězce jako templátu pro katalýzu polymerace rNTP během replikace RNA [2] [3] [4] .

Na základě konsensuální sekvence CD (HCV-CD genotyp 1) bylo identifikováno několik krystalových struktur NS5B polymerázy v několika krystalových formách [5] .

Struktura připomíná tvar pravé ruky s dlaní a prsty, obklopenou aktivním místem jedinečným pro NS5B, proteinovou strukturou obsahující dlaň.

Drogy zaměřené na NS5B

Několik léků na trhu nebo v různých fázích výzkumu se zaměřuje na NS5B jako prostředek k prevenci další replikace virové RNA, a tedy k léčbě nebo vyléčení HCV [6] :

• Beclabuvir , v současné době v klinických studiích
• Dasabuvir (Viekira Pak), nenukleosidové inhibitory/nukleotidové analogy, schválený FDA v prosinci 2014 (pouze v kombinaci s ombitasvirem , paritaprevirem a ritonavirem )
• Deleobuvir , vývoj se zastavuje
• Filibuvir , vývoj se zastaví
• Radalbuvir , v současné době v klinických studiích
• Setrobuvir , vývoj se zastaví
• Sofosbuvirový nukleotidový analog schválený FDA v prosinci 2013 (Sovaldi; Harvoni (kombinace s ledipasvirem )).

Viz také

• NS5A

Poznámky

1. ↑ Gehring S., Gregory SH, Wintermeyer P., Aloman C., Wands JR Generation of Immune Responses Against HCV using Dendritic Cells Contenting NS5 Protein-  coated Microparticles  // Clin . Vaccine Immunol. : deník. - 2008. - prosinec ( roč. 16 , č. 2 ). - S. 163-171 . - doi : 10.1128/CVI.00287-08 . — PMID 19091993 .
2. ↑ Z; jin; Leveque, V; Ma, H; Johnson, K. A.; Klumpp, K. Sestavení, čištění a kinetická analýza před ustáleným stavem aktivního prodlužovacího komplexu RNA polymerázy závislé na RNA  //  Journal of Biological Chemistry  : časopis. - 2012. - Sv. 287 , č.p. 13 . - S. 10674-10683 . - doi : 10.1074/jbc.M111.325530 . — PMID 22303022 .
3. ↑ Moradpour, D; Penin, F; Rice, CM Replikace viru hepatitidy C  (neopr.)  // Recenze přírody. mikrobiologie. - 2007. - V. 5 , č. 6 . - S. 453-463 . - doi : 10.1038/nrmicro1645 . — PMID 17487147 .
4. ↑ Rigat, K.; Wang, Y.; Hudyma, TW; Ding, M.; Zheng, X.; Gentles, R.G.; Beno, B.R.; Gao, M.; Roberts, SB Ligandem indukované změny ve struktuře polymerázy NS5B viru hepatitidy C  //  Antivirový výzkum : deník. - 2010. - Sv. 88 , č. 2 . - S. 197-206 . doi : 10.1016 / j.antiviral.2010.08.014 . — PMID 20813137 .
5. ↑ Biswal, BK; Cherney, M. M.; Wang, M.; Chan, L.; Yannopoulos, C. G.; Bilimoria, D.; Nicholas, O.; Bedard, J.; James, MN Krystalové struktury RNA-dependentní RNA polymerázy genotypu 2a viru hepatitidy C odhalují dvě konformace a naznačují mechanismy inhibice nenukleosidovými inhibitory  // The  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2005. - Sv. 280 , č.p. 18 . - S. 18202-18210 . - doi : 10.1074/jbc.M413410200 . — PMID 15746101 .
6. ↑ Biswal, BK Nenukleosidové inhibitory vázající se na polymerázu NS5B viru hepatitidy C odhalují nový mechanismus inhibice  //  Journal of Molecular Biology : deník. - 2006. - Sv. 361 , č.p. 1 . - str. 33-45 . - doi : 10.1016/j.jmb.2006.05.074 . — PMID 16828488 .