Nestrukturální protein 5A , zkráceně NS5A , je hydrofilní fosfoprotein bohatý na prolin vázající zinek , který hraje klíčovou roli v replikaci RNA viru hepatitidy C (HCV) [1] [2] . Jde o dimer bez transmembránových šroubovic [3] .
Genom RNA viru hepatitidy C (HCV) kóduje polypeptid s ~3000 aminokyselinami, který je zpracován virovými i buněčnými proteázami na strukturní proteiny (Core, E1 a E2), iontový kanál (p7) a nestrukturální proteiny (NS2, NS3). NS4A, NS4B, NS5A a NS5B) [4] . Nestrukturní proteiny jsou zodpovědné za replikaci virového genomu a za sestavení virové částice ze strukturních proteinů s pomocí hostitelských faktorů . HCV NS5A je peptid o 447 aminokyselinových zbytcích, který se skládá ze tří domén spojených krátkými fragmenty, označovaných jako sekvence s nízkou komplexitou (LCS) [5] .
NS5A vzniká z komplexního proteinu, který je výsledkem translace HCV genomu, po které prochází posttranslační modifikací virovou proteázou NS3 [6] . Navzdory nedostatku přímé enzymatické aktivity tohoto proteinu je jeho funkce vykonávána prostřednictvím interakce s jinými nestrukturními (NS) virovými a buněčnými proteiny [2] [6] . NS5A má dvě fosforylované formy, p56 a p58 , které se liší elektroforetickou mobilitou [3] . p56 je fosforylován proteinkinázou hostitelské buňky ve středu a poblíž C-konce a p58 je hyperfosforylován ve středu oblasti bohaté na serin [3] . 30 aminokyselinových zbytků na N-konci tvoří konzervovaný amfipatický alfa helix , který je nezbytný pro vazbu tohoto proteinu na endoplazmatické retikulum [3] [6] . Oblast určující citlivost na IFN lokalizovaná na C-konci má silnou transaktivační aktivitu, což ukazuje na působení NS5A jako aktivátoru transkripce [3] .
NS5A má tři strukturně odlišné domény . Krystalografie ukázala, že doména I je alternativní dimerní strukturou, zatímco domény II a III zůstávají nerozbalené [1] . Kromě toho hraje konformační flexibilita NS5A důležitou roli v různých stádiích infekce HCV [1] . Je také možné, že NS5A je kritickou složkou v procesu replikace HCV a subcelulární lokalizace, což může vrhnout světlo na nedostatečně pochopený životní cyklus HCV [1] [6] . Kromě toho NS5A moduluje polymerázovou aktivitu NS5B , RNA-dependentní RNA polymerázy [3] . NS5A je schopen vázat 3'-nepřekládanou oblast plusových a mínusových řetězců virové RNA [3] .
NS5A je klíčovým mediátorem v regulaci funkce a aktivity hostitelské buňky [6] a také reguluje interferonovou odpověď. Z tohoto důvodu je tento protein aktivně zkoumán jako cíl pro antivirová léčiva pro léčbu hepatitidy C [1] [6] . Léky s malou molekulou zaměřené na tento protein vykazují lepší výsledky než jiné léky [1] .