Virus Lloviu

Virus Lloviu
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:NegarnaviricotaPodtyp:HaploviricotinaTřída:MonjiviricetesObjednat:MononegaviralesRodina:filoviryRod:CuevavirusPohled:Virus Lloviu
Mezinárodní vědecký název
Cuevavirus Lloviu
Synonyma
  • LLOV
Baltimorská skupina
V: (-)ssRNA viry

Lloviu virus ( angl.  Lloviu cuevavirus ) je typ viru z monotypického rodu Cuevavirus z čeledi filovirů (Filoviridae). Virus dostal své jméno podle jeskyně Cueva del Lloviu, kde byl poprvé objeven [ 2] .

Historie

Virus byl poprvé detekován v roce 2002 u dlouhokřídlých nalezených mrtvých v jeskyni v Cueva del Llovu, Asturias a v jeskyních v Kantábrii ve Španělsku , stejně jako v jeskyních ve Francii a Portugalsku [3] . Dosud nebylo prokázáno, že virus je původcem nového onemocnění u netopýrů, u zdravých jedinců však zjištěn nebyl. Patogenita tohoto viru pro tato zvířata je tedy docela možná . Pitva mrtvých dlouhokřídlých neprokázala žádnou makroskopickou patologii , ale mikroskopické vyšetření odhalilo virovou pneumonii [3] . Jeskyně Cueva del Llovu je hojně navštěvována turisty, nicméně nebyly pozorovány žádné související lidské infekce nebo nemoci . Lloviu je považován za druhý filovirus , který není pro člověka patogenní (prvním je virus Reston (RESTV) ).

Virologie

Genom

LLOV dosud nebyl izolován v tkáňové kultuře nebo v organismech, ale jeho genom byl přečten jako celek kromě 3'- a 5'- UTR [3] . Stejně jako všechny Mononegavirales obsahuje virus neinfekční lineární nesegmentovaný jednovláknový RNA genom negativní polarity, který má s největší pravděpodobností reverzní komplementární 3' a 5' zakončení, nemá strukturu čepičky , není polyadenylovaný a je není kovalentně spojen s proteinem [4] . Velikost genomu je přibližně 19 kb ; obsahuje sedm genů v pořadí 3'-UTR-NP-VP35-VP40-GP-VP30-VP24-L-5'-UTR. Na rozdíl od ebolaviru a viru Marburg , které syntetizují sedm mRNA pro sedm strukturálních proteinů, virus Lloviu produkuje pouze šest mRNA, tj. jedna mRNA (VP24/L) je bicistron . Místa iniciace genomové transkripce viru Lloviu jsou totožná s místy ebolaviru, ale liší se od míst viru Marburg. Terminační místa transkripce viru Lloviu jsou jedinečná [3] .

Struktura

Struktura LLOV virionů nebyla dosud popsána. Stejně jako ostatní filoviry se předpokládá, že viriony LLOV jsou vláknité částice ve formě háčku, „U“ nebo „6“, nebo mohou být složené do prstence, toroidu nebo rozvinuté. Jejich průměr je 80 nm, ale existují rozdíly v délce [5] . Genom viru naznačuje, že částice LLOV se skládají ze sedmi strukturních proteinů. Uprostřed je pravděpodobně stočený ribonukleokapsid, který se skládá z genomové RNA omotané kolem nukleoproteinového (NP) polymeru . Pravděpodobně existuje RNA-dependentní RNA polymeráza (L) spojená s ribonukleoproteinem s kofaktorem polymerázy (VP35) a aktivátorem transkripce (VP30). Ribonukleoprotein je zabudován do matrice tvořené hlavními (VP40) a vedlejšími (VP24) matricovými proteiny. Částice jsou obklopeny lipidovou membránou odvozenou z membrány hostitelské buňky. Membrána zadržuje glykoprotein (GP 1,2 ), který vyčnívá 7–10 nm z jejího povrchu. Ačkoli je virus Lloviu svou strukturou téměř identický s ebolavirem a virem Marburg, může se od obou antigenně lišit (stejně jako jsou od sebe navzájem).

Replikace

Životní cyklus LLOV pravděpodobně začíná připojením virionu ke specifickým receptorům buněčného povrchu , následuje internalizace, fúze virionu s endozomem a současné uvolnění nukleokapsidu viru do cytosolu . Glykoprotein (GP) je štěpen endozomálními cysteinovými proteázami ( kathepsiny ) a štěpený glykoprotein pak interaguje s intracelulárním Niemann-Pick C1 vstupním receptorem ( NPC1 ) [6] . Virová RNA-dependentní RNA polymeráza (L) částečně otevírá nukleokapsidu a přepisuje geny do pozitivních mRNA, na kterých jsou syntetizovány strukturální a nestrukturní proteiny. RNA polymeráza (L) se váže na jediný promotor umístěný na 3' konci genomu. Po transkripci genu může transkripce buď pokračovat, nebo se zastavit. To znamená, že geny blízko 3' konce genomu jsou transkribovány častěji, zatímco geny blíže 5' konci budou transkribovány méně. Pořadí genů je tedy jednoduchý, ale účinný způsob regulace transkripce. V důsledku toho bude nejhojněji produkovaným proteinem nukleoprotein. Jeho koncentrace v buňce určí, kdy se L přesune z genové transkripce do genomové replikace. Replikace dá vzniknout pozitivním antigenomům v plné délce, které budou následně přepsány do negativních kopií nového virionového genomu. Syntetizované strukturní proteiny a nukleové kyseliny se samy shromažďují a hromadí v blízkosti vnitřní části buněčné membrány. Zralé viriony vylétají z buňky a zachycují části buněčné membrány jako obal. Nyní jsou připraveny infikovat nové buňky a opakovat cyklus [4] .

Poznámky

  1. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  2. Kuhn, JH; Becker, S.; Ebihara, H.; Geisbert, TW; Johnson, KM; Kawaoka, Y.; Lipkin, W. I.; Negredo, AI; Netěšov, SV; Nichol, ST; Palacios, G.; Peters, CJ; Tenorio, A.; Volčkov, VE; Jahrling, PB Návrh na revidovanou taxonomii čeledi Filoviridae: Klasifikace, názvy taxonů a virů a zkratky virů // Archives of Virology : journal. - 2010. - Sv. 155. - S. 2083-2103. - doi : 10.1007/s00705-010-0814-x . — PMID 21046175 .
  3. 1 2 3 4 Negredo, A.; Palacios, G.; Vázquez-Morón, S.; Gonzalez, FL; Dopazo, HN; Molero, F.; Juste, J.; Quetglas, J.; Savji, N.; de la Cruz Martinez M; Herrera, JE; Pizarro, M.; Hutchison, S.K.; Echevarría, JE; Lipkin, W. I.; Tenorio, A. Objev filoviru podobného ebolaviru v Evropě // PLoS patogeny. - 2011. - Sv. 7. - doi : 10.1371/journal.ppat.1002304 . — PMID 22039362 .
  4. 12 Easton , ČR; Pringle. Order Mononegavirales // Taxonomie virů – devátá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů. - Academic Press, 2011. - S. 653-657. — ISBN 978-0-12-384684-6 .
  5. Geisbert, TW; Jahrling, PB Diferenciace filovirů elektronovou mikroskopií // Výzkum virů. - 1995. - Sv. 39. - S. 129-150. - doi : 10.1016/0168-1702(95)00080-1 . — PMID 8837880 .
  6. Ng M., Ndungo E., Jangra RK, Cai Y., Postnikova E., Radoshitzky SR, Dye JM, Ramirez de Arellano E., Negredo A., Palacios G., Kuhn JH, Chandran K. Cell entry by a nový evropský filovirus vyžaduje hostitelské endosomální cysteinové proteázy a Niemann-PickC1 // Virology. - 2014. - S. 637-646. - doi : 10.1016/j.virol.2014.08.019 . — PMID 25310500 .