Haploskupina X (mtDNA)

Haploskupina X (v populační genetice ) je haploskupina lidské mitochondriální DNA .

Původ

Odvozeno z haploskupiny N. Na druhé straně se asi před 30 tisíci lety rozpadla na podskupiny X1 a X2 . Doba koalescence haploskupiny X se odhaduje na 27 400 ± 2 900 let před současností , podkladů X2 - 21 600 ± 4 000 let před současností. Doba koalescence pro subklad X2e a X2f se odhaduje na 12 000 ± 4 000 a 10 800 ± 5 000 let BP [1] .

Paleogenetika

• X2a byl identifikován v Kennewick Man , který žil v Americe před 9300 lety [2] .
• X2b byl identifikován u zástupce řeckého neolitu (Revenia), který žil před 8,4-8,3 tisíci lety [3] .
• X2b byl identifikován u oběti masakru před 6200 lety v Potocani žena I10297 ( Chorvatsko ) [4] .
• X2 byl identifikován u zástupce íránského neolitu z Gandži-Dare [5]
• X2c a X1 byly identifikovány u zástupců kultury Cardiac Ware [6] .
• X2b1'2'3'4'5'6 byl identifikován u zástupce kultury nálevkovitých pohárů skupiny Salzmünde ( en:Salzmünde group ) [7] .
• X, X2b byly identifikovány u zástupců kultury s lineární pásovou keramikou [8] .
• X2f byl identifikován u zástupce kultury Kuro-Araks [5] .
• X2b byla stanovena v členu kultury nálevkovitého pohárku poz630/gr. 21, ind. 1 (3700-3300 př. n. l.) z Ilża - Chwałowski Trakt 21 v Polsku . W1 byla stanovena ve vzorcích poz377/gr. 10 (3300-3100 př. Kr.), poz465/gr. 13, ind. 5 (3495-3027 př. Kr.), poz471/gr. 13, ind. 12 (3500-2900 př. n. l.) [9]
• X1'2'3 byl identifikován v exempláři IV3002.A0101 z území Stavropol (Ipatovo 3, před 5206,5 lety, odlehlá hodnota Steppe Maykop) [10] .
• X2f byl identifikován u zástupce novosvobodněnského stupně kultury Maikop I6266 (před 5200 lety) z kladenského traktu v Adygeji [10] .
• X2b4 byl identifikován u zástupce kultury Zlota poz733/ind.2 (2900-2500 př. n. l.) ze Stary Garbów 3 v Polsku [9] .
• X2b byl identifikován ve VLI026 (Vliněves_4464/H244, 2400 B.C.) z kultury Bohemian Bell Beaker [ 11] .
• X2i byl identifikován ve vzorku KDC001.A0101 ze severního Kavkazu (Kudachurt, před 3823,5 lety, střední doba bronzová) [10] .
• Haploskupina X byla nalezena mezi zástupci starší doby bronzové z údolí Lech (jižní Německo), kteří žili ca. před 3 tisíci lety [12] .
• X2b byl určen ze vzorku z Monte Sirai na Sardinii (konec 5. století př. n. l.) [13] .
• X2i+@225 byl stanoven ve vzorku doby železné z Uzbekistánu L8002 (období Kušan, před 2100–1500 lety), X2 ve vzorku L5140 [14] .
• Haploskupina X byla nalezena v mumiích z egyptského Abúsíru [15] .
• X2c byl identifikován u jednoho z Vikingů z pohanského pohřbu Galgedil (Galgedil) na dánském ostrově Funen (700-1100 n. l.) [16] .
• Vůdce kmene Beothuk Nonosabasut ( počátek 19. století) byl vlastníkem podkladu X2a [17] .
• X2m'n byl identifikován ve dvou slovanských exemplářích (žena a dítě) pohřbených v souladu se zvykem Avarů - Av1 (asi 580-589) a Av2 (asi 592-595) v Solada na jižní pobřeží Balatonu (Maďarsko) [18] .
• X2e byl identifikován ve vzorku 531 z chazarského elitního pohřbu [19] .
• X2 byl stanoven ze vzorku z pohřebiště prvních Maďarů Karos III (hrob č. 11) [20] .
• X2f* byl stanoven ve vzorku PLEper200 z Karpatské pánve (X–XI století) [21] [22] .

Distribuce

Obecně haploskupina X tvoří asi 2 % populace Evropy , Středního východu a severní Afriky . Podskupina X1 je poměrně vzácná, je zastoupena pouze v severní a východní Africe a také na Středním východě. Podskupina X2 se rozprostírala na velké ploše krátce po posledním zalednění , asi před 21 tisíci lety. Tato podskupina je silněji zastoupena na Blízkém východě, na Kavkaze a v jižní Evropě a v menší míře i ve zbytku Evropy. Obzvláště vysoké koncentrace se nacházejí v Gruzii (8 %), na Orknejských ostrovech (Skotsko) (7 %) a mezi izraelskými Drúzy (25 % [23] ), v druhém případě zřejmě kvůli efektu zakladatele .

Severní a Jižní Amerika

Haploskupina X je jednou z 5 mitochondriálních haploskupin přítomných mezi původní populací Ameriky [24] . Přestože tvoří pouhá 3 % moderní indické populace, jde o velmi významnou haploskupinu z hlediska rozšíření na severu Severní Ameriky a mezi Algonkiny X2a je až 25 % mtDNA. V menším počtu je také zastoupen na západě a jihu Severní Ameriky – mezi Siouxy (15 %), nuu-chah-nulth (11 % -13 %), Navahy (7 %) a Yakamy (5 %) .

Na rozdíl od čtyř hlavních mtDNA haploskupin Indů - ( A , B , C a D ), haploskupina X není spojena s východní Asií. Většina případů X v Asii se nachází v pohoří Altaj na jižní Sibiři [25] , zatímco altajské genetické soubory jsou téměř totožné (subhaploskupina X2e), což naznačuje, že na Altaj dorazily z jižního Kavkazu před 5000 lety nebo dokonce později.

Dvě varianty haploskupiny X2 byly nalezeny východně od Altaje mezi Evenky střední Sibiře [26] . Tyto dvě varianty patří do podkladů X2* a X2b. Není jasné, zda představují pozůstatky starověké migrace X2 přes Sibiř nebo výsledek nedávné migrace.

Relativní vzácnost haploskupiny X2 v Asii vyvolala nutnost přehodnotit předchozí modely osídlení Ameriky. Na druhou stranu podklad Nového světa X2a se od podkladů Starého světa X2b, X2c, X2d, X2e a X2f liší stejně tak, jako se liší od sebe navzájem, což naznačuje jeho raný původ a distribuci pravděpodobně ze Středního východu [26] .

Podle Solutrejské hypotézy haploskupina X dosáhla Severní Ameriky spolu s vlnou migrace z Evropy asi před 20 tisíci lety, zástupci solutréské kultury , která existovala v paleolitické éře v jihozápadní Francii a Španělsku, kteří dorazili lodí podél jižního cípu arktického ledovce, ale tato hypotéza není podporována genetiky, kteří studovali 86 kompletních mitochondriálních genomů a došli k závěru, že nositelé všech indických haploskupin, včetně haploskupiny X, jsou součástí stejné základní populace, která přišla z Asie [27 ] .

Populární kultura

Ve své populární knize Sedm dcer Evy dal Brian Sykes této haploskupině jméno „Xenie“.

Viz také

Poznámky

1. ↑ Maere Reidla a kol. Původ a šíření mtDNA Haplogroup X Archivováno 23. května 2018 na Wayback Machine
2. ↑ Rod a příslušnost Kennewick Man/Nature (2015) . Získáno 29. června 2015. Archivováno z originálu 29. června 2015. (neurčitý)
3. ↑ Hofmanová Z. a kol. Raní farmáři z celé Evropy přímo pocházející z neolitického Egejského moře Archivováno 24. května 2017 na Wayback Machine , bioRxiv preprint poprvé zveřejněno online 25. listopadu 2015
4. ↑ Mario Novak a spol. Genomová analýza téměř všech obětí 6200 let starého masakru Archivováno 9. června 2022 na Wayback Machine , 10. března 2021
5. ↑ 1 2 Iosif Lazaridis a kol. Genetická struktura prvních farmářů na světě Archivováno 16. července 2018 na Wayback Machine , 2016
6. ↑ Společný genetický původ pro rané farmáře ze středomořských kardiálních a středoevropských kultur LBK . Získáno 5. září 2015. Archivováno z originálu 5. září 2015. (neurčitý)
7. ↑ Brandt, G. a kol. (2013), Ancient DNA Reveals Key Stages in the Formation of Central European Mitochondrial Genetic Diversity, Science, sv. 342, č.p. 6155 (2013), str. 257-261.
8. ↑ Rivollat ​​​​M. a kol. (2015) When the Waves of European Neolithization Met: First Paleogenetic Evidence from Early Farmers in the Southern Paris Basin, PLoS ONE 10(4): e0125521.
9. ↑ 1 2 Anna Juras a kol. Mateřský genetický původ pozdní a poslední neolitické lidské populace ze současného Polska Archivováno 27. července 2021 na Wayback Machine , 26. července 2021
10. ↑ 1 2 3 Chuan-Chao Wang a kol. Genetická prehistorie Velkého Kavkazu Archivováno 9. května 2020 na Wayback Machine , 16. května 2018
11. ↑ Luka Papac a kol. Dynamické změny v genomických a sociálních strukturách ve třetím tisíciletí před naším letopočtem ve střední Evropě Archivováno 14. listopadu 2021 na Wayback Machine // Science Advances. sv. 7, vydání 35, 25. srpna 2021
12. ↑ Corina Knipper a kol. Ženská exogamie a diverzifikace genofondu při přechodu z Final Neolithic Archived 8. září 2017 na Wayback Machine , 2017
13. ↑ Matisoo-Smith a kol. Starověké mitogenomy Féničanů ze Sardinie a Libanonu: Příběh osídlení, integrace a ženské mobility Archivováno 14. února 2022 na Wayback Machine , 2018
14. ↑ Vikas Kumar a kol. Genetická kontinuita předků z doby bronzové se zvýšenými předky souvisejícími se stepí v pozdní době železné v Uzbekistánu Archivováno 1. srpna 2021 na Wayback Machine // Molekulární biologie a evoluce, 28. července 2021
15. ↑ Verena J. Schuenemann a kol. Genomy staroegyptských mumií naznačují nárůst předků ze subsaharské Afriky v postřímských obdobích Archivováno 30. září 2019 na Wayback Machine , 30. května 2017
16. ↑ Linea Melchior, Toomas Kivisild, Niels Lynnerup, Jørgen Dissing . Důkazy o autentické DNA z dánských koster z doby Vikingů nedotčených lidmi po dobu 1000 let Archivováno 10. dubna 2022 na Wayback Machine , 28. května 2008
17. ↑ Starověká DNA . Datum přístupu: 1. února 2015. Archivováno z originálu 23. dubna 2015. (neurčitý)
18. ↑ Carlos Eduardo G. Amorim, Krishna R. Veeramah a kol. Pochopení barbarské společenské organizace a migrace v 6. století prostřednictvím paleogenomiky Archivováno 7. listopadu 2018 na Wayback Machine , 2018
19. ↑ Alexander Mikheyev, Lijun Qiu, Alexei Zarubin, Nikita Moshkov, Yuri Orlov, Duane Chartier, Tatiana Faleeva, Igor Kornienko, Vladimir Klyuchnikov, Elena Batieva, Tatiana V Tatarinova . Různorodý genetický původ středověkých dobyvatelů stepních nomádů Archivováno 21. prosince 2019 na Wayback Machine , 16. prosince 2019
20. ↑ Endre Neparaczki a kol. Genetická struktura raných maďarských dobyvatelů odvozená z haplotypů mtDNA a haploskupin Y-chromozomu na malém hřbitově Archivováno 4. ledna 2018 na Wayback Machine , 2017
21. ↑ Kitti Mar a kol. Mateřské linie z 10.–11. století obyčejných hřbitovů v Karpatské pánvi Archivováno 30. března 2021 na Wayback Machine , březen 2021
22. ↑ X2f MTree . Získáno 27. března 2021. Archivováno z originálu dne 15. ledna 2022. (neurčitý)
23. ↑ Starikovskaya E. B. Fylogeografie mitogenomů domorodé populace Sibiře Archivní kopie ze dne 21. ledna 2022 na Wayback Machine , 2016
24. ↑ Dolan DNA Learning Center – indiánské haploskupiny: Evropská linie, Douglas Wallace . Získáno 30. května 2009. Archivováno z originálu 28. září 2007. (neurčitý)
25. ↑ Derenko MV, Grzybowski T., Malyarchuk BA, Czarny J., Miścicka-Sliwka D., Zakharov IA Přítomnost mitochondriální haploskupiny x u Altajců z jižní Sibiře   // Am . J. Hum. Genet. : deník. - 2001. - Červenec ( roč. 69 , č. 1 ). - str. 237-241 . - doi : 10.1086/321266 . — PMID 11410843 .
26. ↑ 1 2 Reidla M., Kivisild T. , Metspalu E. et al. Původ a difúze mtDNA haploskupiny X  (anglicky)  // Am. J. Hum. Genet. : deník. - 2003. - Listopad ( roč. 73 , č. 5 ). - S. 1178-1190 . - doi : 10.1086/379380 . — PMID 14574647 .
27. ↑ Raff, Jennifer A.; Bolnick, Deborah A. Naznačuje mitochondriální haploskupina X starověkou transatlantickou migraci do Ameriky? A Critical Re-Evaluation  (anglicky)  // PaleoAmerica: Časopis rané lidské migrace a šíření: časopis. — Sv. 1 , ne. 4 . - doi : 10.1179/2055556315Z.00000000040 .

Literatura

• Ribetio-dos-Santos AK, Santos SE, Machado AL, Guapindaia V., Zago MA Heterogenita haplotypů mitochondriální DNA u předkolumbovských domorodců v oblasti Amazonie  (anglicky)  // Am. J Phys. Anthropol.  : deník. - 1996. - září ( roč. 101 , č. 1 ). - str. 29-37 . - doi : 10.1002/(SICI)1096-8644(199609)101:1<29::AID-AJPA3>3.0.CO;2-8 . — PMID 8876812 .
• Peter N. Jones. mtDNA amerických Indiánů, genetická data chromozomu Y a obyvatelé Severní  Ameriky . - Boulder: Bauu Press, 2004. - ISBN 978-0-9721349-1-0 . Archivováno 27. září 2007 na Wayback Machine
• Easton RD, Merriwether DA, Crews DE, Ferrell RE Variace mtDNA v Yanomami: důkazy pro další zakládající linie Nového světa   // Am . J. Hum. Genet. : deník. - 1996. - Červenec ( roč. 59 , č. 1 ). - str. 213-225 . — PMID 8659527 .
• Brown MD, Hosseini SH, Torroni A., et al. mtDNA haploskupina X: starověké spojení mezi Evropou/západní Asií a Severní Amerikou? (anglicky)  // Am. J. Hum. Genet. : deník. - 1998. - prosinec ( roč. 63 , č. 6 ). - S. 1852-1861 . - doi : 10.1086/302155 . — PMID 9837837 .
• Smith DG, Malhi RS, Eshleman J., Lorenz JG, Kaestle FA Distribuce mtDNA haploskupiny X mezi původními obyvateli Severní Ameriky   // Am . J Phys. Anthropol.  : deník. - 1999. - Listopad ( roč. 110 , č. 3 ). - str. 271-284 . - doi : 10.1002/(SICI)1096-8644(199911)110:3<271::AID-AJPA2>3.0.CO;2-C . — PMID 10516561 .
• Zakharov IA, Derenko MV, Maliarchuk BA, Dambueva IK, Dorzhu CM, Rychkov SY Variace mitochondriální DNA v domorodých populacích regionu Altaj-Bajkal: důsledky pro genetickou historii Severní Asie a Ameriky  (anglicky)  // Ann. NY Acad. sci. : deník. - 2004. - Duben ( sv. 1011 ). - str. 21-35 . - doi : 10.1196/annals.1293.003 . — PMID 15126280 .  (nedostupný odkaz)

Odkazy

Obecné informace

• Místo mitochondriální DNA Iana Logana
• PhyloTree.org – strom mtDNA Sestavení 17 (18. února 2016): podstrom X
• X YFull MTree 1.02.00 (ve výstavbě)

Haploskupina X

• • Carolyn Bensonová [www.familytreedna.com/public/x/ Projekt X mtDNA] na Family Tree DNA
  • Rozšíření Haploskupiny X od National Geographic