Preprint (méně často – pre -publication , e-print ) – verze výzkumné práce zveřejněné autory ve veřejné doméně před nebo po publikaci v recenzovaném vědeckém časopise. Preprinty se rozumí návrh verze vědeckého textu (článek, zpráva z konference, recenze), popis a zprávy o experimentech (včetně neúspěšných) a databáze .
Praxe výměny předtisků mezi badateli se začala formovat již ve 40. letech 20. století, ale nejvíce se rozšířila s příchodem internetu v 90. letech. Preprinty pomáhají urychlit proces výměny vědeckých informací a demokratizace znalostí [1] — články původně publikované ve formě preprintů získávají více citací a zmínek v médiích [2] [3] [4] . Je to dáno především rychlostí publikace – pokud v případě tradičních vědeckých časopisů trvá vydání díla od šesti měsíců do několika let, pak je předtisk k dispozici veřejnosti do 24–48 hodin od okamžiku, kdy je nahráno na web. Články ve vědeckých časopisech jsou navíc skryty za paywally , zatímco preprinty znamenají otevřený přístup k materiálům [5] [1] [6] . Nejčastěji autoři umisťují preprinty do specializovaných online archivů nebo úložišť [1] . V roce 1991 vytvořil fyzik Paul Ginsparg první online archiv preprintů arXiv.org , který se následně rozšířil – od května 2021 obsahovala sbírka portálu více než 1,8 milionu publikací [7] . Další hlavní úložiště jsou SSRN , PubMed Central , bioRxiv , SocArXiv . Každý předtisk má svůj vlastní číselný identifikátor objektu používaný pro citace.
Tradičně byl předtisk ( pauzovací papír z anglického výrazu preprint - pre-publication) chápán jako vědecký text zveřejněný ve veřejné doméně na internetu před publikací v recenzovaném vědeckém časopise. S rozšířením praxe vydávání preprintů a hnutím s otevřeným přístupem se však tento koncept výrazně rozšířil a výzkumníci si tento termín pro rok 2021 vykládají jinak. Britská vědecká asociace tedy definuje předtisk jako „verzi dokumentu před recenzním řízením“ [8] . Z takové definice ale vyplývá, že nakonec budou všechny preprinty buď recenzovány, nebo publikovány v časopise, což není vždy pravda – často se autoři rozhodnou ponechat dílo ve formě preprintu [9] [8] . V tomto ohledu si někteří badatelé položili otázku, zda lze nikdy nepublikované dílo považovat za preprint [10] . Například matematik Grigory Perelman zveřejnil důkaz Poincareho domněnky , jednoho z problémů tisíciletí , pouze ve formě předtisků na portálu arXiv.org [11] . Preprinty jsou často publikovány po vzájemném hodnocení a dokonce i publikování v časopise, po zelené cestě s otevřeným přístupem [9] . Jestliže se v 90. letech předtisky lišily od běžných vědeckých časopisů v tom, že byly hostovány na online platformách, které nebyly vlastněny vědeckými vydavateli, od 10. let 20. století začalo mnoho vydavatelů a organizací vytvářet úložiště pro hostování předtisků. Elsevier tedy inicioval vytvoření PeerJ a American Chemical Society - SSRN . Některé časopisy však používají předtiskové servery k ukládání verzí svých článků ve formátu PDF . Patří mezi ně matematický časopis Discrete Analysis a Open Journal [8] [12] . Výbor pro etiku publikací (COPE) definuje předtisk jako „Vědecký rukopis publikovaný autorem/autory na otevřené platformě, obvykle před nebo souběžně s procesem vzájemného hodnocení“ [13] .
Předtisk může být návrh verze vědeckého textu (článek, zpráva na konferenci, recenze), popis experimentů a výsledků, zpráva o výsledcích (včetně negativních), databáze. Každý předtisk obdrží svůj vlastní digitální objektový identifikátor , který používají ostatní výzkumníci pro citace. To, co odlišuje předtisk od jiných forem online publikování, včetně akademického blogování, je to, že pro publikaci nevyžaduje proces peer review [14] .
Vědci si od 40. let 20. století vyměňovali nepublikované experimentální zprávy a návrhy dokumentů. Motivoval je k tomu velmi dlouhý publikační cyklus ve vědeckých časopisech, který mohl trvat i několik let, přičemž v některých oborech exaktních věd je výměna výsledků nejnovějších experimentů zvláště důležitá kvůli nebezpečí duplikace. nákladné experimenty [13] [8] . Postupem času stále více badatelů zasílalo krátké poznámky o své práci (nebo dokonce plné texty článků před publikací) jak svým kolegům v příbuzných vědních oborech, tak velkým výzkumným institucím [15] . Tato neformální praxe kromě šíření informací o aktuálním výzkumu umožnila v případě neshody přisoudit prvenství objevu vědcům [15] [16] [17] .
Ve 40. letech se výměna předtisků stala na akademické půdě poměrně běžnou neformální praxí. K tomu přispěl i nárůst objemu vědeckých publikací po skončení druhé světové války – mnoho badatelů, kteří dříve pracovali na utajovaných projektech a technologiích, se po odstranění tajného razítka začalo dělit o své úspěchy v minulosti let s kolegy [18] . Hlavním nástrojem šíření preprintů byly v té době tematické vědecké organizace nebo neformální pracovní skupiny, v nichž se sdružovali vědci, aby diskutovali o novinkách v určité oblasti. Počínaje rokem 1945 začali v Evropě a ve Spojených státech jednotliví výzkumníci navrhovat projekty na reformu stávajícího systému vytvořením jediné federace vědeckých komunit – to by přispělo k centralizované distribuci preprintů mezi členy. Navržené projekty však nebyly nikdy realizovány. Centralizovaná distribuce předtisků byla poprvé zahájena v roce 1946 Massachusettským technologickým institutem , který začal vydávat předtisky Americké chemické společnosti v oblasti chemie ropy [19] . O tři roky později byl ve Spojených státech zahájen program Medical Science Information Exchange (MSIE), jehož cílem bylo institucionalizovat a demokratizovat proces výměny předtisků prostřednictvím distribuce článků těm výzkumníkům a vzdělávacím střediskům, které nebyly zahrnuty do distribučního seznamu předtisků. . V rámci programu byly distribuovány předtisky a zprávy o výzkumu sponzorovaném federálními a soukromými fondy. V roce 1953 byla MSIE přejmenována na Bio-Sciences Information Exchange, která se později stala součástí Smithsonian Institution . V roce 1960 začalo centrum shromažďovat data o fyzikálních a společenských vědách a v roce 1972 bylo přejmenováno na Smithsonian Science Information Exchange [18] [20] .
K rozvoji oboru a zejména k provádění experimentů s urychlovačem nabitých částic přispělo v roce 1954 vytvoření největší světové laboratoře pro fyziku vysokých energií CERN . CERN zvýšil množství dat v této oblasti a s rychlostí nových experimentálních výsledků se preprinty staly hlavním prostředkem šíření znalostí. Na počátku padesátých let si belgický částicový fyzik Léon Rosenfeld stěžoval, že byl „téměř utopen v záplavě nových výsledků experimentů s urychlovačem částic “ a poznamenal, že protože „fyzici posílají předtisky kolegům stejnou cestou... periodika přestala řádně plnit své funkce“ [18] . Dalším katalyzátorem bylo vypuštění Sputniku 1 Sovětským svazem v roce 1957, v souvislosti s nímž vláda USA začala dbát na efektivitu výměny vědeckých informací. Zejména Mezinárodní konference o vědeckých informacích, sponzorovaná National Science Foundation , National Academy of Sciences a US National Archives and Records Administration , uspořádala diskusi o současném stavu ve výzkumu publikování, která vyústila v 1 600 -stránkový dvousvazkový dokument, který obsahoval různé závěry a návrhy od známých průkopníků v oblasti výměny informací. Zvláštní pozornost byla věnována roli preprintů při výměně informací mezi vědci [18] . Podle studie o vědeckých komunikačních praktikách v psychologii z roku 1961 se výměna preprintů mezi autory a konzumenty informací v oblasti psychologických věd stala jednou z hlavních neformálních praktik, které existují jako alternativa k systému časopiseckých publikací [21 ] [22] [18] . Přitom z něj měli prospěch především mladí vědci, zaměstnanci malých institucí a výzkumníci z rozvojových zemí [18] [23] .
V roce 1961 zahájil americký Národní institut zdraví (NIH) experimentální program nazvaný Information Exchange Group zaměřený na identifikaci komunikačních strategií a postupů mezi vědci pracujícími v jedné vědecké disciplíně. Podstatou experimentu bylo vytvořit několik skupin vědců, kteří spolu museli sdílet předtisky po dobu několika let. Za šest let existence programu vzniklo 7 skupin, do kterých se zapojilo více než 3600 lidí, kteří vytvořili a distribuovali více než 1,5 milionu preprintů [24] . 80 % materiálů, které si výzkumníci mezi sebou sdíleli, byly články, z nichž 1/3 materiálů již byla recenzována v časopisech, ale nebyly publikovány; 2/3 preprintů byly koncepty článků před recenzním řízením. Členové skupiny se vzájemně vyjadřovali ke své práci a příležitostně diskutovali o kontroverzních otázkách. Více než třetina účastníků IEG žila mimo USA (většinou ve Spojeném království , Japonsku a Austrálii ) a více než 90 % předtisků bylo v angličtině [19] [18] [25] [26] . Hlavním cílem IEG bylo analyzovat neformální komunikační praktiky mezi vědci a potenciální alternativy k systému časopisů, což výrazně zpomaluje proces šíření znalostí [27] [9] [19] [28] . Mnoho badatelů však experiment kritizovalo – podle jejich názoru preprinty přispívají k šíření neověřených a nerecenzovaných poznatků, což má pouze negativní vliv na rozvoj vědy [29] . Následně teoretický fyzik Michael Moravczyk publikoval v Physics Today návrh na vytvoření systému IEG ve fyzikálních vědách – Physics Information Exchange (PIE). Jeho volání však bylo kritizováno jinými výzkumníky. Takže odpověď Moravčíkovi publikoval ve stejném časopise jiný fyzik Simon Pasternak [19] [30] :
Jsem přesvědčen, že projekt Physics Information Exchange (PIE) navrhovaný Moravczykem představuje vážnou hrozbu pro komunikaci ve fyzikálních vědách a pro komunitu fyziků. Ve jménu zlepšení komunikace v oblasti fyziky se [projekt] zavazuje šířit neupravovanou, neabstraktovanou a nekontrolovanou sbírku dokumentů, která je mnohokrát větší než jakýkoli fyzický časopis. Bude to úplné osvobození od pravidel fyzikálních časopisů, od skutečných potřeb výzkumných fyziků, od ekonomické reality a od celistvosti anglického jazyka [31] .
Původní text (anglicky)[ zobrazitskrýt] JSEM PŘESVĚDČEN, že Physics Information Exchange (PIE) navržená Moravcsikem představuje vážnou hrozbu pro fyzikální komunikaci a pro fyzikální výzkumnou komunitu. Ve jménu zlepšené fyzikální komunikace by se zavázala distribuovat neupravenou, nereferovanou, nekontrolovanou sbírku dokumentů, která je mnohonásobně větší než jakýkoli fyzikální časopis. Měl by plošnou výjimku z předpisů fyzikálních časopisů, ze skutečných potřeb výzkumných fyziků, z ekonomické reality a z integrity anglického jazyka.V roce 1967 Stanfordská univerzita iniciovala vytvoření SPIERS , databáze fyziky vysokých energií obsahující bibliografická data o všech preprintech obdržených SLAC National Accelerator Laboratory [32] [18] . SLAC začal distribuovat týdenní seznamy obsahující informace o nových preprintech [18] [32] .
V 50. a 60. letech se rozvíjel i trh s akademickými publikacemi — spolu s růstem počtu vědeckých článků se začal objevovat konsolidovaný publikační trh a jednotlivá vydavatelství začala masivně skupovat vědecké časopisy. Během tohoto období byli hlavními hráči v této oblasti Reed-Elsevier , Blackwell Science , Alex Springer a Taylor & Francis , kteří v roce 1973 ovládali asi 20 % trhu vědeckých periodik [33] [34] [35] . V zavedeném systému byla vlastnická práva k publikování převedena na vydavatele, kteří prodávali přístup k dílům prostřednictvím systému akademického předplatného , a výzkumníci nedostávali peněžní odměny za publikaci. Vysoké ceny předplatného byly připsány nákladům na proces vydávání [36] [19] .
V letech 1970 až 1980 sehráli výzkumníci v oblasti fyziky vysokých energií největší roli při zavádění systému výměny předtisků jako neformální praxe vědecké komunikace. V roce 1971 byla tedy spuštěna elektronická nástěnka (EBB), fungující na bázi technologie přenosu dat FTP . Na tabuli vědci zveřejnili své nejnovější experimentální výsledky a předtisky, stejně jako krátké poznámky pro kolegy v podobných vědeckých oborech. Již v roce 1975 dostávala knihovna SLAC v průměru asi 70 předtisků týdně [37] [18] [38] a do roku 1980 se tento počet zvýšil na 97 [18] . V roce 1983 byl SPIERS oceněn Asociací odborných knihoven a o dva roky později katalog obsahoval asi 12 000 předtisků. Pro organizaci vyhledávání v databázi vytvořil vývojář SLAC George Crane program QSPIRES, který také umožňoval zobrazit počet citací konkrétního článku [18] .
Počínaje polovinou 70. let 20. století knihovníci americké Národní radioastronomické observatoře (NRAO) sledovali dokumenty a zprávy výzkumníků z observatoře a sestavovali každoroční bibliografický seznam. Tento systematický seznam, napsaný ve Fortranu , se jmenoval „RAPsheet“ ( Radio Astronomy Preprints) a byl seznamem nových publikací, které NRAO dostávalo od jiných výzkumníků každé dva týdny. Pracovníci knihovny poskytovali týdenní výtisk celé databáze s ročními seznamy preprintů organizovaných institucemi. Vyhledávání však stále nebylo veřejně dostupné, protože bylo pro veřejné použití příliš těžkopádné [18] [39] .
Díky rozšíření počítačů a nových metod elektronické komunikace na konci 80. let 20. století byla distribuce papírových verzí preprintů nahrazena rozesíláním výtahů zpráv e-mailem - badatelé samostatně hledali práce, které je zajímají, ve SPIERS databáze a vyžádal si kopii od autorů, kteří zase zasílali publikace klasickou poštou. Pro urychlení procesu výměny předtisků začali výzkumníci používat počítačový layoutový systém TeX , který umožňoval generovat elektronické dokumenty a odesílat je e-mailem [32] . Studie Kinga, McDonalda a Roederera o používání vědeckých časopisů ve Spojených státech zjistila, že o něco více než polovina autorů vědeckých prací mezi sebou během tohoto období sdílela předtisky [18] [40] .
V roce 1991 vytvořil fyzik Paul Ginsparg první online předtiskový archiv arXiv.org . Portál byl poháněn kódem pro automatizaci procesu sdílení souborů v elektronickém mailing listu vytvořeném Joan Cohnovou z Princetonského institutu pro pokročilé studium . Zpočátku Ginsparg vytvořil LANL nebo xxx.lanl.gov, FTP poštovní server nebo nástěnku pro asi 100 příspěvků ročně od výzkumníků v oblasti fyziky vysokoenergetických částic [41] [42] . LAML byla zkratka pro Los Alamos National Laboratory , kde byl Ginsparg zaměstnán [43] a během prvních šesti měsíců se k serveru připojilo přes 400 uživatelů [44] [45] . Díky softwaru vytvořenému Ginspargem mohli uživatelé nahrávat díla na centrální server a také stahovat a prohledávat katalog. LANL se brzy stal předním fórem pro výměny názorů a diskusí o současném výzkumu ve fyzice, částečně proto, že vědecké časopisy pomalu přecházely na online formát [46] . Články byly uloženy na levných diskových jednotkách, jeden článek vyžadoval asi 50 kilobajtů [47] . V roce 1992 měla LANL více než 2 000 registrovaných uživatelů, kteří si mohli prohlížet a stahovat předtisky v osmi oblastech fyziky, od experimentální jaderné fyziky po nelineární dynamiku a vědu o materiálech . Do roku 1993 dosáhl průměrný měsíční počet nových předtisků 600 [47] . V roce 2003 přibyla možnost publikovat práce z biologie [48] [49] . Úspěch arXiv přispěl ke vzniku podobných portálů v jiných oborech. V roce 1994 tedy vzniklo SSRN - úložiště preprintů ve společenských vědách, v roce 1999 - ClinMedNetPrints.org pro preprinty v medicíně [28] . V roce 2007 Nature Publishing Group spustila server s názvem Nature Precedings , který shromáždil přes 2 000 rukopisů, převážně z biologie. Služba trvala 5 let a byla uzavřena v roce 2012 z důvodu „nestability projektu“ [50] [51] .
V letech 1990 až 2010 tvořil předtiskový systém základ zelené cesty s otevřeným přístupem , definované v roce 2002 Budapešťskou iniciativou . „Green Way“ znamená publikování vědeckých článků v tradičních komerčních časopisech se současným umístěním v otevřených zdrojích – velkých tematických (například arXiv.org ) nebo institucionálních repozitářích [52] . Zelená cesta je nejdemokratičtější způsob, jak přejít k novým „otevřeným“ typům publikování, protože neznamená drastickou změnu v obchodním modelu vydavatelství [53] [54] [55] .
Období let 2013 až 2019 se nazývá „druhá vlna preprintů“. Je to dáno rozvojem hnutí otevřeného přístupu a zaváděním principů otevřené vědy do legislativních aktů Evropské unie – pouze sedmiletý program na podporu a povzbuzení vědeckého výzkumu „ Horizont 2020 “ vyžadoval všechny financované EU výzkum bude publikován v otevřeném přístupu [56] [57] .
Jak hnutí otevřeného přístupu rostlo v popularitě, začaly se objevovat nové předtiskové archivy s 18 novými platformami registrovanými jen v letech 2013 až 2018 [58] . V roce 2013 byl vytvořen velký server pro preprinty o biologii BioRxiv [25] a v roce 2016 Open Science Center spustilo několik tematických repozitářů najednou - SocArXiv (archiv společenskovědních preprintů), engrXiv (o strojírenství) a PsyArXiv (psychologie). V roce 2018 spustila Americká geofyzikální unie platformu ESSOAr. Ve stejné době se začaly objevovat první národní repozitáře jako ChinaXiv ( Čína ), IndiaRxiv (pro Indii ), INA-Rxiv ( Indonésie ), Frenxiv ( Francie ), Arabirxiv pro arabské země . S podporou Public Knowledge Project probíhají práce na vytvoření Scielo Preprints, předtiskového serveru pro Latinskou Ameriku [25] . Vznik úložišť začaly iniciovat i jednotlivé nadace, které financují výzkumné projekty, např. program Wellcome od Wellcome Trust . Ve stejné době také vydavatelské domy začaly přizpůsobovat postupy otevřeného přístupu. Například PeerJ a MDPI vytvořily své vlastní předtiskové služby a PLOS přispívá svým časopisem PLOS ONE do bioRxiv jménem autorů. Nové platformy vznikají ve spolupráci s významnými vydavateli: Springer Nature založil server In Review, Elsevier vytvořil ChemRN [25] . Platforma F1000 Research Publishing Platform propaguje nový model publikování, který zahrnuje předtisky, přičemž články předložené autory jsou zpřístupněny k otevřené recenzi ostatními přispěvateli [58] [59] . Výbor pro etiku publikací (COPE) , založený v roce 1994, vydal samostatná nařízení pro vydávání a distribuci předtisků. V roce 2019 byla spuštěna řada nových serverů, včetně portálu pro lékařskou přípravu MedRxiv , publikačních webů jako Research Square, Authorea a dalších a platforem jako PreReview, kde lze předtisky hodnotit [28] .
V roce 2016 se konala konference ASAPbio s cílem prozkoumat širší využití preprintů a šíření výsledků výzkumu [1] . Následně se ASAPbio rozrostla v iniciativu na podporu šíření preprintů v biomedicínských vědách. Uživatelé používají hashtag #ASAPbio, aby upozornili na publikování prací z biologie s otevřeným přístupem [60] [61] [62] [63] . Například v únoru 2016 americká molekulární bioložka a nositelka Nobelovy ceny za fyziologii a medicínu Carol Greiderová zveřejnila zprávu jako předtisk na portálu bioRxiv, než byla zaslána do vědeckého časopisu k recenznímu řízení. Aby to připomněla, tweetovala o tom a použila hashtag #ASAPbio [64] [65] . Další biologové také podporovali ASAPbio, včetně Steve O'Shea z Cold Spring Harbor Laboratory [66] .
Pandemie COVID-19 vedla k nárůstu vědeckých prací o různých aspektech viru . Jen The New England Journal of Medicine tak na jaře 2020 dostával denně 110–150 článků [67] . Aby se urychlil proces sdílení vědeckých dat, vydavatelé výrazně zkrátili čas vyhrazený pro recenze rukopisů o COVID-19 . Nicméně i přes skutečnost, že průměrná doba mezi odesláním a publikací článku byla zkrácena o 49 %, kompletní proces publikování vědecké práce byl stále minimálně 4-5 týdnů [30] [68] [69] . To vedlo ke zvýšení popularity předtisků, které zpřístupňují díla během 24–48 hodin od nahrání na web. Z 30 260 vědeckých prací o COVID -19 publikovaných během prvních deseti měsíců po začátku pandemie bylo více než 25 % původně publikováno jako preprint. Jen v létě 2020 se počet publikovaných preprintů na serveru MedRXiv zvýšil o 400 % ve srovnání se stejným obdobím v roce 2019 [70] . Zároveň se zvýšil počet čtenářů a míra důvěry v neověřené články – předtisky COVID-19 byly zhlédnuty 18,2krát častěji a staženy 27,1krát více než předtisky na jiná témata vydané ve stejném desetiměsíčním období. Ve stejné době začala zpravodajská média, včetně BBC , aktivně odkazovat na předtisky, aby upozornila na aktuální výzkum viru [71] [72] , a Světová zdravotnická organizace a Evropské centrum pro prevenci a kontrolu nemocí využívaly studie publikované v předtištěné podobě k přijímání určitých politických rozhodnutí.rozhodování a příprava strategických dokumentů během pandemie [71] . Celkem asi 4 % všech vědeckých publikací vydaných v roce 2020 byla věnována COVID-19 [73] .
Rozšířené používání předtisků pro podávání zpráv a sdílení během pandemie vedlo k obnovené debatě o jejich roli ve vědecké komunikaci [74] [75] . Mnoho výzkumníků vyjádřilo znepokojení nad kvalitou publikovaných preprintů a jejich negativním dopadem na vědecké objevy v této oblasti. V boji proti dezinformacím spustilo na konci června 2020 MIT Press experimentální časopis s otevřeným přístupem Rapid Reviews, sponzorovaný grantem od Patrick Joseph McGovern Foundation. Pomocí nástrojů umělé inteligence časopis identifikuje významné předtisky hostované v online repozitářích a poté je publikuje na platformě a zahájí vzájemné hodnocení, které trvá několik dní. Kromě toho nejsou autoři zpoplatněni za zveřejnění článku ve veřejné doméně [76] [77] [78] [28] .
V červenci 2020 Rospotrebnadzor spustil portál COVID-19 PREPRINTS, kam mohou vědci nahrávat články o viru v ruštině i angličtině [79] [80] [81] .
Ve většině případů autoři umisťují předtisky do specializovaných online archivů nebo úložišť , a poté jsou dostupné všem uživatelům [82] . Na rozdíl od vědeckých časopisů nezahrnuje publikování preprintů peer review, nicméně všechny příspěvky jsou moderovány administrátory kvůli potenciálním nesrovnalostem, plagiátorství a duplicitě [83] [9] . K doplňování archivních sbírek dochází samoarchivací – autoři samostatně nahrávají své návrhy prací nebo duplikují již publikované studie. Díla publikovaná v repozitářích jsou volně dostupná a splňují principy otevřené vědy . Přístup k publikacím je otevřen ihned po umístění do repozitáře, přičemž každému preprintu je přiděleno jedinečné identifikační číslo , které je následně použito pro citaci díla [12] [84] .
V roce 2009 byla založena Konfederace repozitářů s otevřeným přístupem (COAR), která sdružuje a podporuje úložiště po celém světě. Konfederace zahrnuje mimo jiné knihovny a archivní služby univerzit ve Vídni a Antverpách , Univerzitní knihovnu McMaster , bepress a Světovou banku . Jedním z projektů COAR byla iniciativa Next Generation Repositories, jejímž cílem je identifikovat běžné chování, protokoly a technologie, které umožňují fungování nových a vylepšených funkcí pro úložiště. V roce 2017 organizace zveřejnila první zprávu o 19 potenciálně užitečných protokolech a technologiích, které lze implementovat pro úložiště [85] . Jednotliví organizátoři vytvářejí globální vyhledávače, které umožňují prohledávat katalogy archivů. Například Bielefeld Academic Search Engine , vytvořený Univerzitní knihovnou Bielefeld v Německu , prohledává repozitáře [86] . Platforma OAIster umožňuje prohlížet téměř dva miliony elektronických dokumentů ve více než 200 úložištích. Do roku 2007 měl OAIster 10 milionů záznamů a v roce 2015 jich bylo asi 30 milionů [87] [88] [89] . Platformy jako OpenDOAR , která prohledává 3250 repozitářů, a Registry of Open Access Repositories (ROAR) [90] také umožňují kombinovat a ukládat data .
Existují tematická (disciplinární) a institucionální úložiště. Tematické platformy zahrnují platformy komerčních i nekomerčních organizací, které obsahují soubor děl v konkrétní tematické oblasti. Vědci z kterékoli vzdělávací instituce mohou předkládat příspěvky [91] . Naproti tomu institucionální repozitáře obsahují kolekci preprintů vytvořených vědci z jediné vzdělávací instituce [92] . Tyto archivy mohou obsahovat elektronické kopie prací napsaných jak jednotlivými badateli, tak skupinou kateder. V institucionálních archivech jsou uloženy i elektronické tištěné publikace, technické zprávy, dizertační práce a databáze. Příkladem institucionálních repozitářů je DSpace MIT [89] .
Předpokládá se, že první úložiště vytvořil Paul Ginsparg v roce 1991 arXiv.org. Do roku 2011 měla platforma 1 milion stažení ročně a průměrně 75 000 publikovaného obsahu [41] [93] . Do prosince 2014 portál zpracoval více než 10 milionů žádostí o stažení [94] [95] . V červnu 2020 bylo na portál nahráno 17 000 předtisků a celkový počet stažení byl 1,89 miliardy pro 1,8 milionu článků [96] . Platformu spravuje Cornell University Library [97] .
V roce 1999 byl vytvořen PubMed Central - online archiv lékařských prací. Projekt inicioval National Institutes of Health (NIH) [98] . PubMed Central (PMC) je jedním z největších veřejných archivů biomedicínských článků, což bylo částečně umožněno uložením veškerého výzkumu financovaného NIH na portál [99] . V červnu 2013 tvořilo archivní fond 2,7 milionu článků; 1200 časopisů tam umístilo kopie všech publikovaných prací [100] . Ke květnu 2021 bylo na platformě zveřejněno přes 6 milionů textů [101] . Další velký online archiv lékařských preprintů vznikl v roce 2019 medRxiv [102] [103] , který za první měsíc své existence obdržel 176 žádostí o zveřejnění, z nichž 116 (66 %) bylo úspěšně moderováno a umístěno na stránky. K 30. červnu 2020 bylo na portálu zveřejněno 7695 předtisků. V roce 2020 neprošlo moderováním asi 31 % podaných žádostí na téma COVID-19 [104] . V roce 2013 byl spuštěn server bioRxiv, který publikuje předtisky biologických věd. Portál se brzy stal největší platformou pro šíření znalostí v těchto oborech. V roce 2018 přesáhl počet stažení z webu 1 milion za měsíc – za prvních 11 měsíců roku 2018 poslali výzkumníci do bioRxivu průměrně 1711 předtisků měsíčně [105] . Od roku 2019 byl server zobrazen více než čtyři miliony zobrazení měsíčně. Zpočátku portálu dominovaly články z evoluční biologie , genetiky a výpočetní biologie , ale od roku 2015 výzkumníci stále častěji nahrávají články z neurovědy , buněčné biologie a vývojové biologie . V roce 2019 uživatelský průzkum bioRxiv zjistil, že 42 % autorů publikuje své preprinty před recenzním řízením, zatímco 37 % publikuje články ve stejnou dobu, kdy je zasílají do časopisu. Obecně se autoři snaží, aby bylo dílo otevřeno co nejdříve [106] . Analýza všech 37 648 preprintů nahraných do roku 2019 ukázala, že dvě třetiny preprintů publikovaných do roku 2017 byly později publikovány v recenzovaných časopisech [107] .
PeerJ Preprints je biologický, lékařský a počítačový předtiskový server spravovaný společností PeerJ [9] . V roce 2016 se portál rozhodl vytvořit poradní skupinu 15 výzkumníků věnující se odbornému rozhodování o publikacích na portálu [108] . SocArxiv spravuje sbírku společenskovědních preprintů a je partnerem neziskového Centra pro otevřenou vědu [109] . Portál je založen na Open Science Framework (OSF) provozovaném University of Maryland [110] [111] . Ke květnu 2021 portál obsahoval 8100 článků [112] .
Preprinty přispívají k urychlení procesu výměny vědeckých informací a demokratizaci znalostí [1] . Samostatné studie zjistily, že těm článkům, které byly původně vydány ve formě preprintů, se dostává větší pozornosti veřejnosti a jsou častěji používány pro citování [2] [3] [4] . Je to dáno především rychlostí publikace – pokud v případě tradičních vědeckých časopisů trvá vydání díla od šesti měsíců do několika let, pak se předtisk zpřístupní veřejnosti do 24–48 hodin od okamžiku, kdy je nahráno na web. Články ve vědeckých časopisech jsou navíc skryty za paywally , zatímco předtisky znamenají otevřený přístup k materiálům. Zatímco poplatek za zveřejnění článku v časopisech s otevřeným přístupem může být 1500–3000 USD, předtisky jsou vydávány zdarma, což dává mladým výzkumníkům a vědcům z rozvojových zemí šanci šířit svou práci rychleji [5] [1] . Předtisky navíc zahrnují získávání zpětné vazby od kolegů, což má pozitivní vliv na konečnou verzi práce [6] .
Preprinty a vědecké recenzované časopisy slouží různým účelům – první umožňují editaci a sledování pracovních změn v textu, zatímco druhé hrají důležitou roli v šíření poznatků ověřených odborníky [1] [113] . Počet vědců, kteří používají preprinty k publikování raných verzí své práce, se každým rokem zvyšuje. Podle průzkumu, který v roce 2016 provedla nezisková organizace ASAPbio, má tedy 90 % z 392 respondentů, včetně biologů, zaměstnanců nadací a novinářů, kladný vztah k předtiskům, 78 % alespoň jednou přečetlo předtisk a 31 % sami publikovali koncepty článků. 59 % respondentů přitom považovalo za dostatečný důvod pro odmítnutí uveřejnění předtisku odmítnutí publikovat článek v konkrétním recenzovaném časopise; velká část – 29 % účastníků průzkumu – by předtisk stejně vydala [14] .
Distribuce předtisků měla významný dopad na akademické publikační postupy, protože vydavatelé začali vytvářet své vlastní předtiskové servery, aby byli schopni ovládat nové pole otevřeného přístupu a držet krok s budoucími generacemi výzkumníků. Například v roce 2018 Springer Nature spustil preprintovou platformu Research Square, která se brzy stala jedním z nejrychleji rostoucích úložišť a od května 2020 hostila přes 20 000 preprintů. V roce 2018 Research Square inicioval vytvoření bezplatné předtiskové služby, která umožňuje autorům nahrávat koncepty dokumentů současně s předáváním rukopisů vydavatelům. Autoři tak mohou kromě formálního systému vzájemného hodnocení získat zpětnou vazbu od odborné komunity. Pokud není rukopis přijat k publikaci, pak předtisk zůstává na platformě, ale bez závazných informací o vydavateli [114] [115] . Stejně jako Springer i Wiley implementoval systém Under Review, který umožňuje autorům zveřejňovat rukopisy jako předtisky na platformě Authorea během procesu vzájemného hodnocení [115] . Na rozdíl od Springer Nature a Wiley vydává Elsevier předtisky na pokročilejší platformě SSRN , kterou vydavatel získal v roce 2016. K integraci rukopisů odeslaných do časopisů s SSRN vydavatel používá službu FirstLook. Tato praxe byla během pandemie zvláště rozšířena v Cell Press a The Lancet – všechny preprinty zveřejněné v SSRN jsou před publikováním přezkoumány redaktory časopisu [115] . Další významné nakladatelství Taylor & Francis (T&F) získalo v lednu 2020 platformu F1000 Research , která zajišťuje proces kolektivního hodnocení děl [116] - poté, co autor odevzdá rukopis a moderuje administrátory, se články stanou k dispozici pro veřejné recenze, protože je předkládá autor má možnost článek upravit [115] .
Zároveň se objevují nové typy časopisů, které jsou plně zaměřeny na práci s preprinty - overlay journals . V takových publikacích editoři nezávisle recenzují již vydané preprinty, vybírají ty nejslibnější a poté projednávají články s redakční radou a zvou autory k publikaci. Jedním z prvních časopisů v této oblasti byl PLOS Genetics [74] [117] .
Praxe distribuce preprintů je založena na principu samoarchivace – autor své dílo samostatně umístí do repozitáře nebo na osobní stránku a dodává mu klíčová slova [118] [89] . Samoarchivace vytvořila základ „zelené cesty“ pro přechod k otevřenému přístupu, formulované v roce 2001 v Budapešťské iniciativě pro otevřený přístup . V rámci zelené cesty výzkumníci nadále publikují svou práci v tradičních komerčních vědeckých časopisech, ale zároveň s předložením publikace umístí kopii práce do otevřených zdrojů. Články jsou umístěny v repozitářích jak ve formě preprintů, tak již publikovaných verzí. V době vzniku iniciativy se zelená cesta jevila jako nejdemokratičtější způsob, jak dosáhnout praktik otevřeného přístupu [53] [54] .
Předtisky byly kritizovány za potenciální nebezpečí šíření dezinformací — nedostatek vzájemného hodnocení může vést ke zveřejnění neověřených výsledků a propagaci nepravdivých údajů. Tyto obavy zesílily během pandemie COVID-19, kdy média a sociální sítě začaly masivně šířit data, která nebyla ověřena vědeckou komunitou [119] . Například na konci ledna 2020 skupina výzkumníků z Indického technologického institutu zveřejnila předtisk o insertech genomu HIV do SARS-CoV-2 , které nebyly v předchozích verzích koronavirů – vědci navrhli, že byly úmyslně umístěn do viru. Další předtisk, který na ResearchGate zaslal zaměstnanec South China University of Technology , také spekuloval o umělém původu COVID-19. V obou případech byly dokumenty okamžitě staženy po odporu ze strany výzkumné komunity. Ačkoli čínská vláda a Světová zdravotnická organizace tyto publikace odsoudily, šířily je příznivci konspiračních teorií ohledně koronaviru [120] . Někteří výzkumníci tvrdili, že nesrovnatelné lékařské články by měly být publikovány pouze pod kontrolou vědecké komunity [121] . Například generální ředitelka Cell Press Emily Marcusová v roce 2016 uvedla, že nemá důvěru v předtisky [122] :
[…] Je-li však primární motivací rychlost [publikace] a komunita stále podporuje důležitost vzájemného hodnocení, existují jiná řešení, která by mohla peer review urychlit, spíše než ho obejít předtisky? Jako příklad, když jsme diskutovali o tom, jak může Cell Press nejlépe přispět k současné krizi viru Zika , společnost Wellcome Trust vydala prohlášení podepsané mnoha časopisy, že budou zveřejňovat veškerý obsah Zika ve veřejné doméně, čímž podporuje neomezený přístup k nezkontrolovaným materiálům v předtiskové verzi. servery. Byli jsme znepokojeni společenskou odpovědností budování důvěry v nesrovnatelný výzkum, který by mohl mít přímý dopad na lidské zdraví, a rozhodli jsme se nepodepsat deklaraci důvěry Wellcome [123] .
Původní text (anglicky)[ zobrazitskrýt] Ale pokud je rychlost hlavním motivátorem a komunita stále podporuje důležitost vzájemného hodnocení, existují jiná řešení, která by urychlila peer review, spíše než aby je ustoupila předtisky? Jako příklad, když jsme diskutovali o tom, jak by Cell Press mohl nejlépe přispět k vyřešení současné krize Zika, vydal Wellcome Trust prohlášení, že mnoho časopisů podepsalo prohlášení, že uvolní veškerý obsah týkající se viru Zika a povzbudí neomezený přístup. šíření nerecenzovaného obsahu na předtiskových serverech. Byli jsme znepokojeni společenskou odpovědností podpory důvěry v nerecenzovaný výzkum, který má potenciální přímý dopad na lidské zdraví, a rozhodli jsme se nepodepsat prohlášení Wellcome Trust.Další obavy z preprintů se týkají možné krádeže dat či nápadů a také potenciálních předtiskových válek – vzhledem k jednoduchému a rychlému publikačnímu procesu vyvolávají jednotlivá díla na internetu bitvy, což ve svém důsledku může také podkopat důvěryhodnost badatelů [51 ] [1] [23] .
Slovníky a encyklopedie | |
---|---|
V bibliografických katalozích |