Spacer (biologie)

Spacery (z anglického  spacer  - „separator“) jsou úseky nekódující DNA umístěné mezi tandemově se opakujícími geny , například mezi geny ribozomální RNA [1] u eukaryot . Jejich funkce s největší pravděpodobností poskytuje vysokou úroveň transkripční věrnosti v příbuzných genech.

U bakterií se distanční části DNA skládají pouze z několika nukleotidů . U eukaryot mohou být mnohem větší a mohou zahrnovat opakující se sekvence DNA , čímž obklopují většinu genomové DNA.

V ribozomální DNA jsou spacery přítomny jak uvnitř, tak mezi genovými shluky a jsou v tomto pořadí označovány jako vnitřní spacery (ITS) a externí spacery (ETS). U zvířat mívají geny mitochondriální DNA velmi krátké spacery. U hub mají spacery mitochondriální DNA variabilní délku a mohou být mobilní [2] . Protože se nukleotidové sekvence spacerů během evoluce mění mnohem rychleji než sekvence genů, má se za to, že funkce spaceru nezávisí na sekvenci jeho mononukleotidů [3] .

V užším smyslu se termín "spacer" používá k označení dělení DNA mezi tandemové kopie genů rRNA.

Poznámky

1. ↑ Lackie, JM, ed. (2007), The Dictionary of Cell & Molecular Biology (4. vydání), Burlington, MA: Academic Press, s. 394
2. ↑ Rédei, G. P. (2008), Encyklopedie genetiky, genomiky, proteomiky a informatiky (3. vyd.), Springer, s. 1848
3. ↑ Sudbery, P. (2002), Human Molecular Genetics (2. vyd.), Pearson Education, pp. 35-36