poliovirus | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
vědecká klasifikace | ||||||
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:PisuviricotaTřída:PisoniviricetesObjednat:PicornaviralesRodina:pikornaviryRod:EnteroviryPohled:poliovirus | ||||||
Mezinárodní vědecký název | ||||||
Enterovirus C | ||||||
Baltimorská skupina | ||||||
IV: (+)ssRNA viry | ||||||
|
Poliovirus neboli poliomyelitis virus [2] ( angl. Enterovirus C ) je druh enterovirů ( Enterovirus ) z čeledi pikornavirů ( Picornaviridae ) [3] , infekční agens způsobující lidskou poliomyelitidu .
Virion polioviru obsahuje genomovou RNA a proteinovou kapsidu . Genomová RNA je prezentována jako jednovláknová plusvláknová RNA (+ssRNA) a je dlouhá asi 7500 nukleotidů . Virová částice má průměr přibližně 30 nanometrů a má ikosaedrickou symetrii [4] [5] .
Poliovirus byl poprvé izolován v roce 1909 Karlem Landsteinerem a Erwinem Popperem . [a] . V roce 1981 byl genom polioviru dešifrován dvěma nezávislými skupinami [7] .
V současné době je poliovirus jedním z nejlépe charakterizovaných virů a je vhodným modelem pro studium biologie RNA virů .
Existují tři typy divokého polioviru: typ 1 (distribuovaný primárně v Afghánistánu a Pákistánu ), typ 2 a 3 (v přírodě zničený), stejně jako tři typy cirkulujícího polioviru odvozeného z vakcíny: cVDPV1, cVDPV2, cVDP3.
Tento virus byl prvním syntetickým virem vytvořeným v roce 2002 na New York University [8] .
Poliovirus je strukturálně podobný jiným lidským enteroviry ( coxsackieviry , echoviry a rhinoviry ), které také používají molekuly podobné imunoglobulinu k rozpoznání a vstupu do hostitelských buněk. Fylogenetická analýza RNA a proteinových sekvencí polioviru naznačuje, že se mohl vyvinout z C clusteru předchůdce viru Coxsackie A , který je výsledkem mutace v kapsidě . K odlišné speciaci polioviru pravděpodobně došlo v důsledku změny specifity buněčného receptoru z intercelulární adhezní molekuly-1 (ICAM-1), používané C-klastry Coxsackie A virů, na CD155 ; to vede ke změně patogenity a umožňuje viru infikovat nervovou tkáň .
Míra mutací ve viru je relativně vysoká i u RNA viru se synonymní mírou substituce 1,0 x 10 −2 substitucí/místo/rok a mírou nesynonymní substituce 3,0 x 10 −4 substitucí/místo/rok. Distribuce bází v genomu není náhodná: adenosin se vyskytuje méně často na 5' konci, než se očekávalo, a častěji na 3' konci. Použití kodonů také není náhodné, s preferencí kodonů končících na adenosin a vyhýbání se kodonům končícím na cytosin nebo guanin . Využití kodonů pro tři genové (sero?) typy se liší a zdá se, že je způsobeno spíše mutací než selekcí.
Tři sérotypy polioviru, PV-1, PV-2 a PV-3, mají mírně odlišné kapsidové proteiny. Kapsidové proteiny určují specificitu buněčných receptorů a antigenicitu viru. PV-1 je nejběžnější forma nalezená v přírodě, ale všechny tři formy viru jsou vysoce nakažlivé. Od března 2020 se divoký PV-1 nejčastěji vyskytuje v oblastech Pákistánu a Afghánistánu . Divoká PV-2 byla prohlášena za zničenou v září 2015 po posledním objevu v roce 1999 , zatímco divoká PV-3 byla prohlášena za zničenou v roce 2019 po posledním objevu v roce 2012 .
Pro přípravu vakcín proti dětské obrně se používají specifické kmeny každého sérotypu. Neaktivní vakcína proti obrně se získává formalínovou inaktivací tří divokých virulentních referenčních kmenů: Mahoney nebo Brunenders (PV-1), MEF-1/Lansing (PV-2) a Saukett/Leon (PV-3). Perorální vakcína proti obrně obsahuje živé atenuované (oslabené) kmeny tří sérotypů polioviru. Zaočkování virových kmenů do epiteliálních buněk opičích ledvin vede k mutacím ve virových vnitřních ribozomových vstupních místech ( IRES ) a narušuje (nebo zhoršuje) schopnost viru infikovat nervovou tkáň.
Polioviry byly dříve klasifikovány jako samostatné druhy patřící do rodu enterovirů z čeledi Picornaviridae . V roce 2008 byl druh polioviru zrušen a tři sérotypy byly přiřazeny k lidskému druhu Enterovirus C (později přejmenovanému na Enterovirus C ) v rodu Enterovirus z čeledi Picornaviridae . Typový druh rodu Enterovirus byl změněn z polioviru na (lidský) enterovirus C.
Slovníky a encyklopedie | |
---|---|
Taxonomie | |
V bibliografických katalozích |