Haploskupina K(xLT) (Y-DNA)

Haploskupina K(xLT) - MNOPS
Původ haploskupiny K(xLT) - MNOPS
Typ Y-DNA makroskupina
Doba vzhledu před 55–47 tisíci lety
Umístění spawn jižní nebo střední Asie
Rodová skupina makroskupina K
sesterské skupiny makroskupina LT (předchůdce L a T )
Podklady K1, K2, K3, M a S , NO a P makroskupiny
Markerové mutace M526/PF5979 (původně rs2033003)

V populační genetice a lidské genogeografii studující Y-chromozomální haploskupiny, K2 nebo K-M526 (dříve známé jako K(xLT) a MNOPS) je patrilineární dědičnost charakterizovaná mutací Y-chromozomální DNA M526/PF5979 [1] . Protože z ní pochází řada dalších haploskupin, jde o makroskupinu . Podle společnosti YFull haploskupina K2 vznikla z makroskupiny K-M9 před 47 200 lety [2] . Tamara Karafet a kolegové v práci z roku 2014 dospěli k závěru, že k rychlé diverzifikaci K2-M526 pravděpodobně došlo v jihovýchodní Asii [3] .

V raných verzích stromu chyběla Y-DNA (v makroskupině K byly spolu s malými podklady přímo rozlišeny větve L, M, NO a P; v roce 2008 k nim byly přidány S a T). Následně byla ve skupinách NO a P objevena společná mutace rs2033003 a v roce 2009 se tyto haploskupiny začaly považovat za větve makroskupiny NOP . Již v roce 2010 se však ukázalo, že stejný label (pojmenovaný M526) je přítomen i ve skupinách M a S, a tak vznikla makroskupina MNOPS . Dále byly v roce 2011 objeveny mutace, které příbuzné haploskupiny L a T a M526 byly nalezeny také v malých podkladech K1, K2, K3 a K4, takže skupina LT se objevila na stromě haploskupin a skupina MNOPS byla přejmenována na K ( xLT) . protože nyní v makroskupině K zůstávají pouze dvě větve: "LT" a "non-LT".

Toto „revoluční“ rozhodnutí IHC ( anglicky  Y Chromosome Consortium (YCC) ) vyvolalo řadu sporů, protože zaprvé vznikl zmatek: skupiny K1, K2, K3, K4 se začaly netýkat přímo K, ale místo toho k jeho podkladu K(xLT), a za druhé, formulace jako „K(xLT)“ tradičně znamenala „všechno, co se týká K kromě LT“ (nebo, stručně, „K mimo LT“), a nyní není zřejmý způsob, jak rozlišit staré a nové použití. Rozdíl v jejich významech v tomto konkrétním případě není velký, ale zcela jednoznačný, totiž: „K(xLT)“ by v tradičním slova smyslu zahrnovalo také paragrupu K* a možná v budoucnu otevřené větve K, které nebudou mít štítku M526, ale nepatří a do LT.

Tradiční řešení v této situaci by bylo:

  1. přejmenujte haploskupiny K1, K2, K3 a K4 na U, V, W a X a makroskupinu MNOPS na MNOPSUVWX;
  2. přejmenujte Kl, K2, K3 a K4 na K(xLT)1, K(xLT)2, K(xLT)3 a K(xLT)4;
  3. přejmenujte LT na K1, MNOPS na K2 a K1, K2, K3 a K4 na K2a, K2b, K2c a K2d, v tomto případě M, NO, P a S jsou podmnožiny větve K2;

Konsorcium však tyto možnosti neshledalo uspokojivými a rozhodlo se výjimečně připustit hierarchickou nekonzistenci v označení větví K a K(xLT).

V roce 2012 byla ze stromu odstraněna dílčí větev K1, protože byla uznána jako nedostatečně stará, a K2, K3 a K4 byly přejmenovány na K1, K2 a K3.

Paleogeografie

Strom

Obecná struktura je následující:

Strom pojmenovaných podkladů makroskupiny K(xLT) a mutace, které je určují na začátku roku 2013, jsou následující [10] (sestupné větve haploskupin jsou vynechány):

K(xLT) (M526/PF5979)


Evoluční stromhaploskupin lidského chromozomu Y
Y-chromozomální Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   ČT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
já J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N Ó   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) Q R  


Poznámky

  1. ↑ Jacques Chiaroni, Peter A. Underhill a Luca L. Cavalli-Sforza, „Diverzita chromozomů Y, lidská expanze, drift a kulturní evoluce“, PNAS zveřejněno online před tiskem 17. listopadu 2009, doi: 10.1073/pnas.0910803106
  2. ↑ KYStrom . Datum přístupu: 30. července 2016. Archivováno z originálu 20. května 2016.
  3. ↑ Karafet, Taťána; Mendez, Fernando; Sudoyo, Herawati. Vylepšené fylogenetické rozlišení a rychlá diverzifikace haploskupiny Y-chromozomu K-M526 v jihovýchodní Asii  (anglicky)  // Nature : journal. - 2014. - Sv. 23 . - str. 369-373 . - doi : 10.1038/ejhg.2014.106 . — PMID 24896152 .
  4. ↑ Doplňující informace 9. Filogenetická rekonstrukce Ust'Ishim Y-chromozomu . Získáno 6. prosince 2014. Archivováno z originálu dne 24. března 2016.
  5. ↑ Palaeolitická DNA z Eurasie archivována 3. října 2016 na Wayback Machine
  6. ↑ Posnik GD a kol. (2016) Přerušované vzplanutí v lidské mužské demografii odvozené z 1 244 celosvětových sekvencí Y-chromozomů Archivováno 28. května 2017 na Wayback Machine , Nature Genetics, 48, 593–599 (Poznik supp. obr. 15).
  7. ↑ Genotypy současných a starověkých dat DNA ke stažení (shromážděno z publikovaných prací) | David Reich Lab (nedostupný odkaz) . reich.hms.harvard.edu . Získáno 11. září 2019. Archivováno z originálu 2. listopadu 2019. 
  8. ↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven a kol. , "Dopad austronéské expanze: důkazy z mtDNA a diverzity chromozomů Y na Admirality Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
  9. ↑ Tatiana M. Karafet, Brian Hallmark, Murray P. Cox a kol. , "Major East-West Division Underlies Y Chromosome Stratification Across Indonésie," MBE Advance Access zveřejněno 5. března 2010
  10. ↑ Y-DNA Haploskupina K a její podtřídy -  2013 . International Society of Genetic Genealogy (poslední aktualizace: 4. ledna 2013). Datum přístupu: 7. ledna 2013. Archivováno z originálu 11. ledna 2013.

Odkazy