Inaktivace chromozomu X

Inaktivace X-chromozomů ( angl.  X-inactivation, lyonization ) je epigenetický proces, v jehož důsledku během raného embryonálního vývoje transkripčně utichne jedna ze dvou kopií X chromozomů přítomných v buňkách savců . V tomto případě tvoří DNA inaktivního X chromozomu fakultativní heterochromatin .

K inaktivaci chromozomu X dochází v buňkách samic savců, takže dvě kopie chromozomu X netvoří dvakrát více produktů odpovídajících genů než u samců savců. Tento proces se nazývá kompenzace dávky genů . V placentách je výběr chromozomu X, který má být inaktivován, náhodný (jak je ukázáno pro myší a lidské buňky). Inaktivovaný chromozom X zůstane neaktivní ve všech následujících dceřiných buňkách vzniklých dělením.

Historie

V roce 1959 Susumu Ohno ukázal, že jeden ze dvou chromozomů X u žen se choval jako autozom, zatímco druhý byl ve stavu heterochromatinu. [2] Dvě skupiny výzkumníků nezávisle na sobě navrhly, že jeden ze dvou chromozomů X podléhá inaktivaci. V roce 1961 Mary Lyon navrhla, že inaktivace jednoho z chromozomů X u samic způsobuje skvrnitou barvu srsti u myší heterozygotních pro barevné geny. [3] Lyonova hypotéza o jediné X inaktivaci v savčích ženských buňkách také vysvětlila skutečnost, že myši s pouze jedním X chromozomem mají ženský fenotyp . Ernest Beutler ,  který nezávisle na Lyonu studoval heterozygotní ženy s deficitem enzymu glukóza-6-fosfatáza dehydrogenáza, navrhl existenci dvou typů erytrocytů v heterozygotních organismech – deficitních v enzymu a normálních. [čtyři]

Mechanismus

Ve stádiu dvou- nebo čtyřbuněčného myšího embrya je otcovský chromozom X inaktivován mechanismem imprintingu . [5] [6] [7] V časném stádiu blastocysty se oba chromozomy X stanou aktivními v buňkách vnitřní buněčné hmoty . Poté je ve všech buňkách vnitřní buněčné hmoty blastocysty jeden z chromozomů X nevratně a nezávisle na sobě inaktivován. Inaktivovaný v tomto raném stadiu embryonálního vývoje bude potom chromozom X inaktivován ve všech somatických buňkách potomstva této buňky. Inaktivace chromozomu X je v buňkách ženské zárodečné linie obrácena, a proto všechny oocyty obsahují oba aktivní chromozomy X.

Bylo ukázáno, že normální stav chromozomu X v savčích buňkách je inaktivovaný stav, protože v organismech nebo buňkách obsahujících více než dva chromozomy X je aktivní pouze jeden, zatímco zbytek chromozomů X je neaktivní. Na chromozomech X je znázorněna přítomnost místa centra inaktivace chromozomu X - XIC (z angl.  X inactivation center ). Pro inaktivaci chromozomu X je nezbytná a postačující přítomnost inaktivačního centra. Translokace oblasti chromozomu obsahující XIC do autosomu vede k inaktivaci odpovídajícího autosomu, zatímco chromozomy X bez XIC zůstávají aktivní.

Oblast XIC obsahuje dva nekódující geny RNA , které nejsou přeloženy do proteinu - Xist a Tsix , které se podílejí na inaktivaci chromozomu X. XIC také obsahuje vazebná místa pro odpovídající regulační proteiny.

Nekódující RNA Xist a Tsix

Xist je gen kódující dlouhou nekódující molekulu RNA , která zprostředkovává specifickou inaktivaci chromozomu X, ze kterého byl přepsán. [8] Neaktivní chromozom X je pokryt RNA transkribovanou z genu Xist, [9] aktivní chromozom X není pokryt takovou RNA. Gen Xist je exprimován pouze z neaktivního chromozomu X, chromozomy, které neobsahují gen Xist, nelze inaktivovat. [10] Umělý přenos genu Xist na jiné chromozomy a jeho exprese vede k inaktivaci ostatních chromozomů. [11] [12]

Do okamžiku inaktivace oba chromozomy X slabě exprimují RNA produkt genu Xist, během procesu inaktivace se exprese Xist na aktivním chromozomu snižuje, na inaktivovaném zvyšuje. Produkt genu Xist postupně pokrývá inaktivovaný chromozom počínaje oblastí XIC; [11] Umlčení genu inaktivovaného chromozomu začíná krátce poté, co se chromozom pokryje přepisem genu Xist .

Tsix je dlouhá molekula RNA, která nekóduje protein. Transkript Tsix je antisense k transkriptu genu Xist, to znamená, že je transkribován z opačného řetězce DNA stejného genu. [13] Tsix je negativní regulátor Xist; Chromozomy X, které neexprimují Tsix, a proto mají zvýšenou úroveň exprese Xist, jsou inaktivovány mnohem častěji než normální chromozomy.

Stejně jako v případě genu Xist oba chromozomy X před inaktivací slabě exprimují RNA genu Tsix z odpovídajícího genu. Poté, co začne inaktivace chromozomu X, budoucí inaktivovaný chromozom přestane exprimovat Tsix RNA, zatímco aktivní chromozom pokračuje v expresi Tsix ještě několik dní.

Barrovo tělo

Barrovo tělísko se nazývá chromozom X, jehož DNA je ve stavu heterochromatinu . [14] Barrovo tělísko obsahuje produkt genu Xist , je obvykle umístěno na periferii jádra, DNA Barrova tělíska se replikuje pozdě .

Poznámky

  1. Gartler SM, Varadarajan KR, Luo P., Canfield TK, Traynor J., Francke U., Hansen RS Normální modifikace histonů na inaktivním X chromozomu v buňkách ICF a Rettova syndromu: implikace pro methyl-CpG vazebné  proteiny  // BMC Biology : deník. - 2004. - Sv. 2 . — S. 21 . - doi : 10.1186/1741-7007-2-21 .  — Obrázek 1 Archivováno 8. srpna 2010 na Wayback Machine
  2. Ohno S., Kaplan WD, Kinosita R. Tvorba pohlavního chromatinu jedním X-chromozomem v jaterních buňkách rattus norvegicus  //  Exp Cell Res : deník. - 1959. - Sv. 18 . - str. 415-419 . - doi : 10.1016/0014-4827(59)90031-X . — PMID 14428474 .
  3. ↑ Akce Lyon MF genu v X -chromozomu myši ( Mus musculus L.  )  // Nature  : journal. - 1961. - Sv. 190 , č. 4773 . - str. 372-373 . - doi : 10.1038/190372a0 . — PMID 13764598 .
  4. Beutler E., Yeh M., Fairbanks VF Normální lidská žena jako mozaika aktivity X-chromozomu: Studie využívající gen pro deficit G-6-PD jako marker  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the Spojené státy americké  : časopis. - 1962. - Leden ( roč. 48 ). - S. 9-16 . — PMID 13868717 .
  5. Takagi N., Sasaki M. Preferenční inaktivace X chromozomu odvozeného z otcovy strany v extraembryonálních membránách myši  //  Nature : journal. - 1975. - Sv. 256 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/256640a0 . — PMID 1152998 .
  6. Cheng MK, Disteche CM Mlčení otců: časná  inaktivace X  // BioEssays : deník. - 2004. - Sv. 26 , č. 8 . - S. 821-824 . - doi : 10.1002/bies.20082 . — PMID 15273983 .  (nedostupný odkaz)
  7. Okamoto I., Otte A., Allis C., Reinberg D., Heard E. Epigenetická dynamika inaktivace otištěného X během raného vývoje myší  //  Science : journal. - 2004. - Sv. 303 , č.p. 5658 . - S. 644-649 . - doi : 10.1126/science.1092727 . — PMID 14671313 .
  8. Hoki Y., Kimura N., Kanbayashi M., Amakawa Y., Ohhata T., Sasaki H., Sado T. Proximální konzervovaná repetice v genu Xist je nezbytná jako genomový prvek pro X-inaktivaci u myši  .)  // Vývoj : časopis. - 2009. - Sv. 136 . - S. 139-146 . - doi : 10.1242/dev.026427 . — PMID 19036803 .
  9. Ng K., Pullirsch D., Leeb M., Wutz A. Xist a řád umlčování  //  EMBO Rep : deník. - 2007. - Sv. 8 . - S. 34-9 . - doi : 10.1038/sj.embor.7400871 . — PMID 17203100 . . — « Obrázek 1 Xist RNA zahrnuje X, ze kterého je transkribována. ".
  10. Penny GD, Kay GF, Sheardown SA, Rastan S., Brockdorff N. Požadavek na Xist při inaktivaci chromozomu X   // Příroda . - 1996. - Sv. 379 . - str. 116-117 . - doi : 10.1038/379131a0 . — PMID 8538762 .
  11. 1 2 Herzing LB, Romer JT, Horn JM, Ashworth A. Xist má vlastnosti centra inaktivace X-chromozomu  //  Nature : journal. - 1997. - Sv. 386 . - str. 272-275 . - doi : 10.1038/386272a0 . — PMID 9069284 .
  12. Lee JT, Jaenisch R. Dálkové cis účinky ektopických X-inaktivačních center na myší autozom  //  Nature : journal. - 1997. - Sv. 386 . - str. 275-279 . - doi : 10.1038/386275a0 . — PMID 9069285 .
  13. Lee JT, Davidow LS, Warshawsky D. Tisx , genový antisense k Xist v centru X-inaktivace  // Nat Genet  : časopis  . - 1999. - Sv. 21 . - str. 400-404 . - doi : 10.1038/7734 .
  14. Barr ML, Bertram EG Morfologický rozdíl mezi neurony muže a ženy a chování nukleárního satelitu během zrychlené syntézy nukleoproteinů  // Nature  :  journal. - 1949. - Sv. 163 , č.p. 4148 . - str. 676-677 . - doi : 10.1038/163676a0 .

Literatura