Nekódující RNA

Nekódující RNA (non-coding RNA, ncRNA) - molekuly RNA , které nejsou překládány do proteinů . Dříve používané synonymum  - "malá RNA" (smRNA, malá RNA) - se přestalo používat, protože některé nekódující RNA mohou být velmi velké, například Xist .

Sekvence DNA, na kterou jsou transkribovány nekódující RNA, se často označuje jako gen RNA .

Mezi nekódující RNA patří [1] :

• přenos RNA (tRNA),
• ribozomální RNA (rRNA),
• malá jaderná RNA (snRNA, snRNA),
• malá nukleolární RNA (snoRNA, snoRNA),
• antisense RNA (aRNA),
• mikroRNA (miRNA),
• malá interferující RNA (siRNA),
• piRNA (piwiRNA, piRNA),
• dlouhá nekódující RNA  (lncRNA) - Xist , Evf , Air , CTN , PINK , TUG1 .

Nedávné transkriptomické technologie ( sekvenování RNA ) a techniky DNA microarray identifikovaly více než 30 000 dlouhých nekódujících RNA ( long ncRNA  ) . Předpokládá se, že „řídí“ selektivní přistání polycomb represorových komplexů na určité oblasti chromatinu , stejně jako přímé DNA metyltransferázy a případně regulují selektivní metylaci DNA [2] [3] [4] [5] . Navíc, jak se ukázalo, tvoří významnou část (~20 % z celkového počtu dlouhých nekódujících RNA v savčích genomech ), tzv. divergentní dsnRNA, které jsou transkribovány v opačném směru než sousední geny kódující proteiny. regulují transkripci těchto sousedních sousedních genů [6] .

Poznámky

1. ↑ Lee T.I. , Young RA Transkripční regulace a její chybná regulace u onemocnění.  (anglicky)  // Cell. - 2013. - Sv. 152, č.p. 6 . - S. 1237-1251. - doi : 10.1016/j.cell.2013.02.014 . — PMID 23498934 .
2. ↑ Merry, CR, Forrest, ME, Sabres, JN, Beard, L., Gao, XH, Hatzoglou, M., ... & Khalil, AM Dlouhé nekódující RNA spojené s DNMT1 regulují globální genovou expresi a metylaci DNA v rakovina tlustého střeva // Lidská molekulární genetika. - 2015. - T. 24 , č. 21 . - S. 6240-6253 . doi : 10.1093 / hmg/ddv343 .
3. ↑ Správa methylace . Získáno 19. července 2022. Archivováno z originálu dne 28. listopadu 2016. (neurčitý)
4. ↑ Daniel Holoch a Danesh Moazed. Epigenetická regulace genové exprese zprostředkovaná RNA // Přehledy přírody. genetika. - 2015. - T. 16 , č. 2 . — s. 71–84 . - doi : 10.1038/nrg3863 . — PMID 25554358 .
5. ↑ Jeffrey J. Quinn a Howard Y. Chang. Jedinečné rysy biogeneze a funkce dlouhé nekódující RNA // Recenze přírody. genetika. - 2015. - T. 17 , č. 1 . — s. 47–62 . - doi : 10.1038/nrg.2015.10 . — PMID 26666209 .
6. ↑ Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu a kol., & Xiaohua Shen. Divergentní lncRNA regulují genovou expresi a diferenciaci linií v pluripotentních buňkách // Buněčná kmenová buňka. - 2016. - doi : 10.1016/j.stem.2016.01.024 .

Odkazy

• Ishitani R, Yokoyama S, Nureki O. Struktura, dynamika a funkce enzymů modifikujících RNA // Curr Opin Struct Biol. - 2008. - T. 18 , č. 3 . - S. 330-339 .
• Yeung ML, Benkirane M, Jang KT. Malé nekódující RNA, savčí buňky a viry: regulační interakce?  // Retrovirologie. - 2007. - T. 4 . - S. 74 .

Viz také

• sekvenování RNA
• Ultrakonzervativní prvky DNA
• Dlouhé a krátké nekódující RNA (lncRNA a miRNA) interagující s polycomb represorovými komplexy.