Malé nukleolární RNA

Malá nukleolární RNA (snoRNA, angl.  snoRNA ) je třída malých RNA zapojených do chemických modifikací (methylace a pseudouridylace) ribozomálních RNA , stejně jako tRNA a malých jaderných RNA . Podle klasifikace MeSH jsou malé nukleolární RNA považovány za podskupinu malých jaderných RNA. snoRNA se běžně označují jako „vodící“ RNA, neměly by však být zaměňovány s vodicími RNA , které řídí editaci RNA v trypanu .

modifikace řízené snoRNA

Poté , co jsou geny rRNA transkribovány , musí výsledné molekuly (nazývané pre-rRNA) projít řadou kroků zpracování, aby se staly zralými rRNA. Zpracování zahrnuje methylaci a pseudouridylaci řízenou snoRNA.

• Methylace je adice methylových skupin na různé substráty. Lidské rRNA obsahují přibližně 115 methylačních modifikací. Většina těchto modifikací je methylace na 2'0-atomu ribózy . [jeden]
• Pseudouridylace je izomerizace uridinu na pseudouridin (Ψ). Zralé lidské rRNA obsahují asi 95 pseudouridinových zbytků [1] .

Každá molekula snoRNA působí jako „průvodce“ pouze pro jednu nebo dvě modifikace cílové RNA. Kromě toho je každá molekula snoRNA spojena s alespoň čtyřmi proteinovými molekulami, které tvoří komplexy RNA-protein nazývané malé nukleolární ribonukleoproteiny (angl. snoRNP). Které proteiny jsou součástí komplexu, závisí na typu snoRNA (viz níže). Molekula snoRNA obsahuje sekvenci 10-20 nukleotidů , komplementární k sekvenci, která zahrnuje modifikovaný nukleotid, což umožňuje snoRNA specificky se vázat na požadované místo zpracované rRNA. Poté, co se snoRNA naváže na zpracovávané místo, proteiny, které tvoří komplex, katalyzují chemickou modifikaci báze.

Význam modifikací rRNA

Vliv methylace a pseudouridylace na funkce zralé rRNA není dobře znám. Modifikace pravděpodobně nejsou nutné, ale je známo, že poněkud zlepšují skládání RNA a interakci s ribozomálními proteiny. Modifikace se přitom nacházejí výhradně v konzervovaných a funkčně důležitých rRNA doménách a jsou podobné v evolučně vzdálených skupinách eukaryot. [2] .

1. 2'-O-methylace ribózy stabilizuje 3'-endo konformaci.
2. Pseudouridin (Ψ) má ve srovnání s uridinem další schopnost tvořit vodíkové vazby.
3. Vysoce methylovaná RNA je chráněna před hydrolýzou. ( rRNA působí jako  ribozym tím, že katalyzuje svou vlastní hydrolýzu a sestřih ).

Organizace v rámci genomu

Většina genů snoRNA obratlovců se nachází v intronech genů kódujících proteiny zapojené do sestavení nebo translace ribozomů. Geny SnoRNA jsou transkribovány RNA polymerázou typu II, ale mohou být také transkribovány z jejich vlastních promotorů RNA polymerázou typu II nebo III.

Další vlastnosti

Nedávno bylo zjištěno, že snoRNA mají funkce nesouvisející s rRNA. Jednou z takových funkcí je regulace alternativního sestřihu trans - transkriptů pomocí snoRNA nazývané HBII-52 (SNORD115). [3]

Poznámky

1. ↑ 1 2 Maden BE, Hughes JM Eukaryotická ribozomální RNA: nedávné vzrušení v problému modifikace nukleotidů  //  Chromosoma: journal. - 1997. - Sv. 105 , č. 7-8 . - S. 391-400 . — PMID 9211966 .
2. ↑ Bachellerie, JP; Cavaille J., Huttenhofer A. The expanding snoRNA world  (anglicky)  // Biochimie : deník. - 2002. - Sv. 84 . - str. 775-790 . - doi : 10.1016/S0300-9084(02)01402-5 . — PMID 12457565 .
3. ↑ Kishore S., Stamm S. SnoRNA HBII-52 reguluje alternativní sestřih serotoninového receptoru 2C  //  Science : journal. - 2006. - Sv. 311 , č.p. 5758 . - S. 230-231 . - doi : 10.1126/science.1118265 . — PMID 16357227 .