Vodící RNA
Guide RNA, gRNA , jsou RNA, které zprostředkovávají inzerci uridinových nukleotidů do mRNA v trypanozomech během procesu úpravy RNA . [1] [2] [3] gRNA jsou kódovány odlišnými oblastmi kinetoplastového genomu . [čtyři]
Mechanismus účinku
5' konec gRNA hybridizuje s krátkou oblastí neupravené pre-mRNA nazývané kotevní sekvence, zatímco 3' konec takových RNA je editační templát. Mnoho gRNA nehybridizuje s kotvící sekvencí primárního transkriptu, ale hybridizuje s částečně upraveným transkriptem. Proto editace trypanozomové pre-mRNA obvykle začíná blízko 3' konce a postupuje k 5' konci v iterativním procesu, který vyžaduje několik různých gRNA, které se postupně vážou na kotvící sekvenci částečně upravených oblastí. Není zcela jasné, proč trypanozomové kinetoplasty používají tak komplikovaný mechanismus pro tvorbu mRNA . Funkce mnoha gRNA nebyly studovány. [5]
Poznámky
- ↑ Stuart KD, Schnaufer A, Ernst NL, Panigrahi AK. Komplexní management: editace RNA v trypanosomech // Trends Biochem Sci. - 2005. - T. 30 , č. 2 . - S. 97-105 .
- ↑ Madison-Antenucci S, Grams J, Hajduk SL. Editační stroje: složitost editace trypanozomové RNA // Cell. - 2002. - T. 108 , č. 4 . - S. 435-438 .
- ↑ Stuart K, Allen TE, Kable ML, Lawson S. Úprava kinetoplastidové RNA: komplexy a katalyzátory // Curr Opin Chem Biol. - 1997. - T. 1 , č. 3 . - S. 340-346 .
- ↑ Uliel S, Liang XH, Unger R, Michaeli S. Malé nukleolární RNA, které vedou modifikaci u trypanosomatid: repertoár, cíle, organizace genomu a jedinečné funkce // Int J Parasitol. - 2004. - T. 34 , č. 4 . - S. 445-454 .
- ↑ Stuart K, Panigrahi AK. Editace RNA: složitost a komplikace // Mol Microbiol. - 2002. - T. 45 , č. 3 . - S. 591-596 .
Literatura
- Gurbachan S. Miglani. RNA: Jejich zpracování a funkce // Pokročilá genetika . - CRC Press, 2002. - S. 257-259. — 665 str. — ISBN 0849324254 .
- Bruce Alberts. Editace RNA může změnit význam zprávy RNA // Molekulární biologie buňky . - Garland Science, 2007. - S. 483-484. — 1601 s. — ISBN 0815341113 .
- Simpson L, Thiemann OH, Savill NJ, Alfonzo JD, Maslov DA. Evoluce editace RNA v trypanozomových mitochondriích // Proč Natl Acad Sci USA A. - 2000. - V. 97 , č. 13 . - S. 6986-6993 . — Přehledný článek o vývoji editace RNA v Trypanos v angličtině, volně dostupný
Viz také
Editace RNA