CHD3

DNA-vazebný protein helikázová chromodoména 3

Identifikátory

CHD3 ; Mi-2a; Mi2-ALPHA; ZFH

Externí ID

OMIM: 602120 MGI : 1344395 HomoloGene : 62693 GeneCards : CHD3 Gene

3.6.4.12

Genová ontologie
Funkce	• Vazba na DNA • ATP-dependentní DNA helikázová aktivita • helikázová aktivita • proteinová vazba • ATP vazba • vazba zinkových iontů • vazba poly(A) RNA
buněčná složka	• jádro • jadérko • cytoplazma • centrosom • NuRD komplex • cytoskelet intermediárního filamentu
biologický proces	• Katabolický proces ATP • sestavení nebo rozložení chromatinu • transkripce, templátová DNA • regulace transkripce, templátová DNA • regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • organizace vřeténka • modifikace chromatinu • odvíjení duplexu DNA • organizace centrosomu
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 17:
7,79 – 7,82 Mb

Chr 11:
69,34 – 69,37 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

CHD3 (z anglického C hromodoména - Helicase - D NA-binding protein 3) je enzym kódovaný u lidí genem CHD3 . [1] [2] [3]

Tento gen kóduje člena rodiny proteinů CHD, které se vyznačují přítomností chromodomén (organizace modifikátoru chromatinu) a domén helikázy/ATPázy asociovaných s SNF2. Tento protein je jednou ze složek komplexu histon deacetylázy nazývaného komplex Mi-2/NuRD, který se podílí na remodelaci chromatinu během deacetylace histonů. Remodelace chromatinu je nezbytná pro mnoho procesů, včetně transkripce . Autoprotilátky proti tomuto proteinu se nacházejí u podskupiny pacientů s dermatomyozitidou . Existují tři alternativní sestřihové transkripty kódující různé izoformy. [3]

Interakce

Ukázalo se, že CHD3 interaguje s HDAC1 , [4] [5] histon deacetylázou 2 [4] [6] [7] a SERBP1 . [8] [9]

Poznámky

↑ Woodage T., Basrai MA, Baxevanis AD, Hieter P., Collins FS Charakterizace proteinů rodiny CHD // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 1997. - Listopad ( roč. 94 , č. 21 ). - S. 11472-11477 . - doi : 10.1073/pnas.94.21.11472 . — PMID 9326634 .
↑ Ge Q., Nilasena DS, O'Brien CA, Frank MB, Targoff IN Molekulární analýza hlavní antigenní oblasti 240-kD proteinu Mi-2 autoantigenu // J Clin Invest : deník. - 1995. - Listopad ( roč. 96 , č. 4 ). - S. 1730-1737 . - doi : 10.1172/JCI118218 . — PMID 7560064 .
↑ 1 2 Entrez Gen: CHD3 chromodoménová helikáza DNA vázající protein 3 . (neurčitý)
↑ 12 Tong , JK; Hassig C.A.; Schnitzler GR; Kingston RE; Schreiber S L. Deacetylace chromatinu pomocí komplexu remodelace nukleozomů závislých na ATP (anglicky) // Nature : journal. - ANGLIE, 1998. - říjen ( roč. 395 , č. 6705 ). - S. 917-921 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
↑ Kuzmichev, A; Zhang Y; Erdjument Bromage H; TempstP; Reinberg D. Role komplexu Sin3-histone deacetylázy v regulaci růstu kandidátem na supresor nádoru p33ING1 // Mol . buňka. Biol. : deník. - Spojené státy americké, 2002. - únor ( vol. 22 , č. 3 ). - S. 835-848 . — ISSN 0270-7306 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu // J. Biol. Chem. : deník. - Spojené státy americké, 2003. - Únor ( sv. 278 , č. 9 ). - str. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Bochar Daniel A; Schmiesing John A; Dong Yuanshu; Barak Orr G; Speicher David W; Yokomori Kyoko; Shiekhattar Ramin. Komplex remodelace chromatinu, který nahrává kohezin do lidských chromozomů (anglicky) // Nature : journal. — Anglie, 2002. — Srpen ( sv. 418 , č. 6901 ). - str. 994-998 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
↑ Lemos, Taila A; Passos Dario O; Nery Flavia C; Kobarg Jörg. Charakterizace nové rodiny proteinů, které interagují s C-terminální oblastí chromatin-remodelačního faktoru CHD-3 // FEBS Lett . : deník. - Nizozemsko, 2003. - Leden ( sv. 533 , č. 1-3 ). - str. 14-20 . — ISSN 0014-5793 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
↑ Stelzl, Ulrich; Worm Uwe, Lalowski Maciej, Haenig Christian, Brembeck Felix H., Goehler Heike, Stroedicke Martin, Zenkner Martina, Schoenherr Anke, Koeppen Susanne, Timm Jan, Mintzlaff Sascha, Abraham Claudia, Bock Nicole, Kietzmann Silvia, Toksö Astrid, Toksö Astrid Droege Anja, Krobitsch Sylvia, Korn Bernhard, Birchmeier Walter, Lehrach Hans, Wanker Erich E. Síť interakce mezi lidským proteinem a proteinem: zdroj pro anotaci proteomu // Cell : journal. - Spojené státy americké: Cell Press , 2005. - Září ( vol. 122 , č. 6 ). - S. 957-968 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2005.08.029 . — PMID 16169070 .

Literatura

Bowen NJ, Fujita N., Kajita M., Wade PA Mi-2/NuRD: vícenásobné komplexy pro mnoho účelů // Biochim . Biophys. Acta : deník. - 2004. - Sv. 1677 , č.p. 1-3 . - str. 52-7 . - doi : 10.1016/j.bbaexp.2003.10.010 . — PMID 15020045 .
Gieser L., Swaroop A. Exprimované sekvenční značky a chromozomální lokalizace cDNA klonů z knihovny subtrahovaného retinálního pigmentového epitelu (anglicky) // Genomics : journal. - Academic Press , 1992. - Sv. 13 , č. 3 . - S. 873-876 . - doi : 10.1016/0888-7543(92)90173-P . — PMID 1639417 .
Seelig HP, Moosbrugger I., Ehrfeld H., et al. Hlavním autoantigenem Mi-2 specifickým pro dermatomyozitidu je předpokládaná helikáza zapojená do aktivace transkripce // Arthritis Rheum . : deník. - 1995. - Sv. 38 , č. 10 . - S. 1389-1399 . - doi : 10.1002/art.1780381006 . — PMID 7575689 .
Seelig HP, Renz M., Targoff IN, a kol. Dvě formy hlavního antigenního proteinu autoantigenu Mi-2 specifického pro dermatomyozitidu // Arthritis Rheum . : deník. - 1996. - Sv. 39 , č. 10 . - S. 1769-1771 . - doi : 10.1002/art.1780391029 . — PMID 8843877 .
Bonaldo MF, Lennon G., Soares MB Normalizace a odečítání: dva přístupy k usnadnění objevování genů // Genome Res . : deník. - 1997. - Sv. 6 , č. 9 . - S. 791-806 . - doi : 10.1101/gr.6.9.791 . — PMID 8889548 .
Aubry F., Mattéi MG, Galibert F. Identifikace lidské 17p-lokalizované cDNA kódující protein z rodiny helikáz podobných Snf2 // Eur . J Biochem. : deník. - 1998. - Sv. 254 , č.p. 3 . - S. 558-564 . - doi : 10.1046/j.1432-1327.1998.2540558.x . — PMID 9688266 .
Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, et al. Deacetylace chromatinu komplexem remodelace nukleozomů závislým na ATP (anglicky) // Nature : journal. - 1998. - Sv. 395 , č.p. 6705 . - S. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
Kleiderlein JJ, Nisson PE, Jessee J. a kol. CCG repetice v cDNA z lidského mozku // Hum . Genet. : deník. - 1999. - Sv. 103 , č. 6 . - str. 666-673 . - doi : 10.1007/s004390050889 . — PMID 9921901 .
Kim J., Sif S., Jones B. a kol. Ikaros DNA-binding proteins přímá tvorba chromatinových remodelačních komplexů v lymfocytech (anglicky) // Immunity : journal. - Cell Press , 1999. - Vol. 10 , č. 3 . - S. 345-355 . - doi : 10.1016/S1074-7613(00)80034-5 . — PMID 10204490 .
Wade PA, Gegonne A., Jones PL, a kol. Komplex Mi-2 spojuje methylaci DNA s remodelací chromatinu a deacetylací histonů (anglicky) // Nat. Genet. : deník. - 1999. - Sv. 23 , č. 1 . - S. 62-6 . - doi : 10.1038/12664 . — PMID 10471500 .
Cousin P., Billotte J., Chaubert P., Shaw P. Fyzická mapa 17p13 a genů sousedících s p53 // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Sv. 63 , č. 1 . - S. 60-8 . doi : 10.1006 / geno.1999.6062 . — PMID 10662545 .
Minty A., Dumont X., Kaghad M., Caput D. Kovalentní modifikace p73alfa pomocí SUMO-1. Dvouhybridní screening s p73 identifikuje nové proteiny interagující se SUMO-1 a motiv interakce SUMO-1 // J. Biol. Chem. : deník. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 46 . - S. 36316-36323 . - doi : 10.1074/jbc.M004293200 . — PMID 10961991 .
Schultz DC, Friedman JR, Rauscher FJ Cílení na komplexy histondeacetylázy prostřednictvím proteinů KRAB-zinc finger: PHD a bromodomény KAP-1 tvoří kooperativní jednotku, která rekrutuje novou izoformu Mi-2α podjednotky NuRD // Gene Dev. : deník. - 2001. - Sv. 15 , č. 4 . - str. 428-443 . - doi : 10.1101/gad.869501 . — PMID 11230151 .
Yasui D., Miyano M., Cai S. a kol. SATB1 se zaměřuje na remodelaci chromatinu k regulaci genů na dlouhé vzdálenosti // Nature: journal. - 2002. - Sv. 419 , č.p. 6907 . - str. 641-645 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 lidských a myších sekvencí cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Lemos TA, Passos DO, Nery FC, Kobarg J. Charakterizace nové rodiny proteinů, které interagují s C-terminální oblastí chromatin-remodelačního faktoru CHD-3 // FEBS Lett . : deník. - 2003. - Sv. 533 , č.p. 1-3 . - str. 14-20 . - doi : 10.1016/S0014-5793(02)03737-7 . — PMID 12505151 .
Fujita N., Jaye DL, Kajita M. a kol. MTA3, podjednotka komplexu Mi-2/NuRD, reguluje invazivní růstovou dráhu u rakoviny prsu (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 113 , č. 2 . - str. 207-219 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . — PMID 12705869 .
Lee BH, Yoshimatsu K., Maeda A. a kol. Asociace nukleokapsidového proteinu hantavirů Soul a Hantaan s malými molekulami podobnými ubikvitinu modifikátoru-1 // Virus Res. : deník. - 2004. - Sv. 98 , č. 1 . - S. 83-91 . - doi : 10.1016/j.virusres.2003.09.001 . — PMID 14609633 .