Histon deacetyláza 2

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 3. června 2015; kontroly vyžadují 6 úprav .
Histon deacetyláza 2
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolHDAC2  ; HD2; RPD3; YAF1
Externí IDOMIM:  605164 MGI :  1097691 HomoloGene :  68187 ChEMBL : 1937 GeneCards : HDAC2 Gene
EC číslo3.5.1.98
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez306615182
SouborENSG00000196591ENSMUSG00000019777
UniProtQ92769P70288
RefSeq (mRNA)NM_001527NM_008229
RefSeq (protein)NP_001518NP_032255
Locus (UCSC)Chr 6:
114,25 – 114,33 Mb
Chr 10:
36,97 - 37 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Histondeacetyláza 2  je enzym z rodiny histondeacetyláz kódovaný u lidí genem HDAC2 . [jeden]

Funkce

Produkt genu HDAC2 patří do rodiny histonových deacetyláz . Histonové deacetylázy fungují jako součást velkých multiproteinových komplexů a jsou zodpovědné za deacetylaci lysinových zbytků v N-terminální oblasti jádrových histonů (H2A, H2B, H3 a H4). Tento protein také tvoří transkripční represorové komplexy vazbou na různé proteiny, včetně YY1, jednoho ze savčích transkripčních faktorů . Histondeacetyláza 2 hraje důležitou roli v regulaci transkripce , buněčného cyklu a vývoje. [2]

Interakce

Histondeacetyláza 2 interaguje s:

Poznámky

  1. Betz R., Grey SG, Ekström C., Larsson C., Ekström TJ Lidská histonová deacetyláza 2, HDAC2 (Human RPD3), je lokalizována do 6q21 pomocí radiačního hybridního mapování  // Genomics  :  journal. - Academic Press , 1998. - Prosinec ( roč. 52 , č. 2 ). - str. 245-246 . doi : 10.1006 / geno.1998.5435 . — PMID 9782097 .
  2. Entrez Gen: HDAC2 histon deacetyláza 2 .
  3. 1 2 Schmidt DR, Schreiber SL Molekulární asociace mezi ATR a dvěma složkami nukleozomového remodelačního a deacetylačního komplexu, HDAC2 a CHD4  //  Biochemistry: journal. — Sv. 38 , č. 44 . - S. 14711-14717 . - doi : 10.1021/bi991614n . — PMID 10545197 .
  4. 1 2 3 4 Yoon YM, Baek KH, Jeong SJ, Shin HJ, Ha GH, Jeon AH, Hwang SG, Chun JS, Lee CW WD mitotické kontrolní proteiny obsahující opakování působí jako transkripční represory během   interfáze // FEBS Lett. : deník. — Sv. 575 , č.p. 1-3 . - S. 23-9 . - doi : 10.1016/j.febslet.2004.07.089 . — PMID 15388328 .
  5. 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu   // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 278 , č.p. 9 . - str. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  6. 1 2 3 4 5 Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetylace chromatinu komplexem remodelace nukleozomů závislým na ATP  //  Nature: journal. — Sv. 395 , č.p. 6705 . - S. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  7. 1 2 Hakimi MA, Bochar DA, Schmiesing JA, Dong Y., Barak OG, Speicher DW, Yokomori K., Shiekhattar R. A chromatin remodeling complex that loads cohesin into human chromozomes  //  Nature : journal. — Sv. 418 , č.p. 6901 . - str. 994-998 . - doi : 10.1038/nature01024 . — PMID 12198550 .
  8. Rountree MR, Bachman KE, Baylin SB DNMT1 váže HDAC2 a nový korepresor, DMAP1, za vzniku komplexu v replikačních ohniscích   // Nat . Genet.  : deník. — Sv. 25 , č. 3 . - str. 269-277 . - doi : 10.1038/77023 . — PMID 10888872 .
  9. 1 2 3 van der Vlag J., Otte AP Transkripční represe zprostředkovaná lidským proteinem polycomb-group EED zahrnuje deacetylaci histonů   // Nat . Genet.  : deník. — Sv. 23 , č. 4 . - str. 474-478 . - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
  10. Yang WM, Yao YL, Seto E. FK506-vazebný protein 25 funkčně asociuje s histon deacetylázami a s transkripčním faktorem YY1  // EMBO  J. : deník. — Sv. 20 , č. 17 . - S. 4814-4825 . - doi : 10.1093/emboj/20.17.4814 . — PMID 11532945 .
  11. Třícestná kontrola proliferace srdečních buněk plodu by mohla pomoci regenerovat srdeční buňky  (7. října 2010). Archivováno z originálu 3. ledna 2012. Staženo 9. dubna 2015.
  12. Wen YD, Cress WD, Roy AL, Seto E. Histondeacetyláza 3 se váže na multifunkční transkripční faktor TFII-I a reguluje jej  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 278 , č.p. 3 . - S. 1841-1847 . - doi : 10.1074/jbc.M206528200 . — PMID 12393887 .
  13. 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Izolace a charakterizace nové histon deacetylázy třídy II , HDAC10  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 8 . - S. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  14. 1 2 3 Yao YL, Yang WM Proteiny 1 a 2 spojené s metastázami tvoří odlišné proteinové komplexy s aktivitou histondeacetylázy  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 278 , č.p. 43 . - S. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  15. 1 2 3 4 Hakimi MA, Bochar DA, Chenoweth J., Lane WS, Mandel G., Shiekhattar R. Komplex core-BRAF35 obsahující histon deacetylázu zprostředkovává represi neuronově specifických genů  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. — Sv. 99 , č. 11 . - str. 7420-7425 . - doi : 10.1073/pnas.112008599 . — PMID 12032298 .
  16. 1 2 Johnson CA, White DA, Lavender JS, O'Neill LP, Turner BM Lidské histondeacetylázové komplexy třídy I vykazují zvýšenou katalytickou aktivitu v přítomnosti ATP a koimunoprecipitátu s ATP-dependentním chaperonovým proteinem  Hsp70  // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 11 . - S. 9590-9597 . - doi : 10.1074/jbc.M107942200 . — PMID 11777905 .
  17. Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II je závislá na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT/N-  CoR  // Mol. buňka : deník. — Sv. 9 , č. 1 . - str. 45-57 . - doi : 10.1016/s1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. Fischle W., Dequiedt F., Fillion M., Hendzel MJ, Voelter W., Verdin E. Aktivita lidské HDAC7 histon deacetylázy je spojena s HDAC3 in vivo  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 276 , č.p. 38 . - S. 35826-35835 . - doi : 10.1074/jbc.M104935200 . — PMID 11466315 .
  19. Ashburner BP, Westerheide SD, Baldwin AS Podjednotka p65 (RelA) NF-kappaB interaguje s korepresory histondeacetylázy (HDAC) HDAC1 a HDAC2 a negativně reguluje genovou expresi   // Mol . buňka. Biol. : deník. — Sv. 21 , č. 20 . - str. 7065-7077 . - doi : 10.1128/MCB.21.20.7065-7077.2001 . — PMID 11564889 .
  20. 1 2 3 4 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histon deacetylázy a spojení s metylací DNA   // Genes Dev .  : deník. — Sv. 13 , č. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  21. Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Role aktivity histondeacetylázy v transkripční represi zprostředkované HDAC1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : časopis. — Sv. 95 , č. 7 . - S. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  22. Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histonové deacetylázy a SAP18, nový polypeptid, jsou součástmi lidského komplexu Sin3  (anglicky)  // Cell  : journal. — Cell Press . — Sv. 89 , č. 3 . - str. 357-364 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  23. Wysocka J., Myers MP, Laherty CD, Eisenman RN, Herr W. Lidská Sin3 deacetyláza a s trithoraxem související Set1/Ash2 histon H3-K4 methyltransferáza jsou spojeny selektivně buněčným proliferačním faktorem HCF-   1 / Genes Dev.  : deník. — Sv. 17 , č. 7 . - S. 896-911 . - doi : 10.1101/gad.252103 . — PMID 12670868 .
  24. Mazumdar A., ​​​​Wang RA, Mishra SK, Adam L., Bagheri-Yarmand R., Mandal M., Vadlamudi RK, Kumar R. Transkripční represe estrogenového receptoru  korepresorem proteinu 1 asociovaného s metastázami  // Nat . Buněčný biol.  : deník. — Sv. 3 , ne. 1 . - S. 30-7 . - doi : 10.1038/35050532 . — PMID 11146623 .
  25. 1 2 Laherty CD, Yang WM, Sun JM, Davie JR, Seto E., Eisenman RN Histonové deacetylázy spojené s korepresorem mSin3 zprostředkovávají šílenou transkripční represi  (anglicky)  // Cell  : journal. — Cell Press . — Sv. 89 , č. 3 . - str. 349-356 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)80215-9 . — PMID 9150134 .
  26. Spronk CA, Tessari M., Kaan AM, Jansen JF, Vermeulen M., Stunnenberg HG, Vuister GW Interakce Mad1-Sin3B zahrnuje nový helikální fold   // Nat . Struktura. Biol.  : deník. — Sv. 7 , č. 12 . - S. 1100-1104 . - doi : 10.1038/81944 . — PMID 11101889 .
  27. Brackertz M., Boeke J., Zhang R., Renkawitz R. Dva vysoce příbuzné proteiny p66 tvoří novou rodinu účinných transkripčních represorů interagujících s MBD2 a MBD3  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 43 . - S. 40958-40966 . - doi : 10.1074/jbc.M207467200 . — PMID 12183469 .
  28. Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 je transkripční represor patřící do komplexu histon deacetylázy MeCP1  . )  / / Nat. Genet.  : deník. — Sv. 23 , č. 1 . - str. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  29. Iwase S., Januma A., Miyamoto K., Shono N., Honda A., Yanagisawa J., Baba T. Charakterizace BHC80 v komplexu BRAF-HDAC, zapojený do neuronové specifické genové   represe // Biochem. Biophys. Res. komunální. : deník. — Sv. 322 , č.p. 2 . - S. 601-608 . - doi : 10.1016/j.bbrc.2004.07.163 . — PMID 15325272 .
  30. Jin Q., van Eynde A., Beullens M., Roy N., Thiel G., Stalmans W., Bollen M. Regulátor protein fosfatázy-1 (PP1), jaderný inhibitor PP1 (NIPP1), interaguje s polycomb group protein, vývoj embryonálního ektodermu (EED) a funguje jako transkripční represor  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 278 , č.p. 33 . - S. 30677-30685 . - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
  31. 1 2 Zhang Y., Dufau ML Duální mechanismy regulace transkripce genu receptoru luteinizačního hormonu nukleárními sirotčími receptory a komplexy histondeacetylázy  (anglicky)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : deník. — Sv. 85 , č. 2-5 . - str. 401-414 . - doi : 10.1016/s0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  32. 1 2 3 Zhang Y., Dufau ML Umlčení transkripce genu receptoru lidského luteinizačního hormonu komplexem histondeacetyláza-mSin3A  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 36 . - S. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  33. You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST je nedílnou součástí komplexu CoREST-lidská histondeacetyláza  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . — Sv. 98 , č. 4 . - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  34. Kiernan R., Brès V., Ng RW, Coudart MP, El Messaoudi S., Sardet C., Jin DY, Emiliani S., Benkirane M. Post-aktivační vypnutí NF-kappa B-dependentní transkripce je regulováno acetylací p65  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 278 , č.p. 4 . - str. 2758-2766 . - doi : 10.1074/jbc.M209572200 . — PMID 12419806 .
  35. Yu Z., Zhang W., Kone BC Histonové deacetylázy zvyšují cytokinovou indukci genu iNOS  //  J. Am. soc. Nephrol. : deník. — Sv. 13 , č. 8 . - str. 2009-2017 . - doi : 10.1097/01.asn.0000024253.59665.f1 . — PMID 12138131 .
  36. Lai A., Lee JM, Yang WM, DeCaprio JA, Kaelin WG, Seto E., Branton PE RBP1 rekrutuje represivní aktivity závislé na histondeacetyláze i nezávislé na proteinech rodiny retinoblastomů   // Mol . buňka. Biol. : deník. — Sv. 19 , č. 10 . - S. 6632-6641 . — PMID 10490602 .
  37. Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, nový protein konzervovaný mezi člověkem a kvasinkami, je součástí komplexu histon deacetylázy  .)  // Mol. buňka : deník. — Sv. 1 , ne. 7 . - S. 1021-1031 . - doi : 10.1016/s1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  38. Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role komplexu Sin3-histone deacetyláza v regulaci růstu kandidátním supresorem nádorů p33(ING1  )  // Mol. buňka. Biol. : deník. — Sv. 22 , č. 3 . - S. 835-848 . - doi : 10.1128/mcb.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .
  39. Fleischer TC, Yun UJ, Ayer DE Identifikace a charakterizace tří nových složek korepresorového komplexu mSin3A   // Mol . buňka. Biol. : deník. — Sv. 23 , č. 10 . - S. 3456-3467 . - doi : 10.1128/mcb.23.10.3456-3467.2003 . — PMID 12724404 .
  40. Yang L., Mei Q., ​​​​Zielinska-Kwiatkowska A., Matsui Y., Blackburn ML, Benedetti D., Krumm AA, Taborsky GJ, Chansky HA Histon methyltransferáza spojená s ERG (ets-related gene) interaguje s histondeacetylázy 1/2 a korepresory transkripce mSin3A/B  (anglicky)  // Biochem. J. : deník. — Sv. 369 , č.p. Pt 3 . - S. 651-657 . - doi : 10.1042/BJ20020854 . — PMID 12398767 .
  41. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD Role SKIP v EBNA2 aktivaci CBF1-reprimovaných promotorů  //  J. Virol. : deník. — Sv. 74 , č. 4 . - S. 1939-1947 . doi : 10.1128 / jvi.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  42. Vaute O., Nicolas E., Vandel L., Trouche D. Funkční a fyzikální interakce mezi histon methyl transferázou Suv39H1 a histon deacetylázami  // Nucleic Acids Res  . : deník. — Sv. 30 , č. 2 . - str. 475-481 . doi : 10.1093 / nar/30.2.475 . — PMID 11788710 .
  43. 1 2 Won J., Yim J., Kim TK Sp1 a Sp3 rekrutují histon deacetylázu k potlačení transkripce promotoru lidské telomerasové reverzní transkriptázy (hTERT) v normálních lidských somatických buňkách  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 41 . - str. 38230-38238 . - doi : 10.1074/jbc.M206064200 . — PMID 12151407 .
  44. 1 2 Sun JM, Chen HY, Moniwa M., Litchfield DW, Seto E., Davie JR Transkripční represor Sp3 je spojen s CK2-fosforylovanou histondeacetylázou 2  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 277 , č.p. 39 . - S. 35783-35786 . - doi : 10.1074/jbc.C200378200 . — PMID 12176973 .
  45. Tsai SC, Valkov N., Yang WM, Gump J., Sullivan D., Seto E. Histonová deacetyláza interaguje přímo s DNA topoizomerázou II   // Nat . Genet.  : deník. — Sv. 26 , č. 3 . - str. 349-353 . - doi : 10.1038/81671 . — PMID 11062478 .
  46. Yang WM, Yao YL, Sun JM, Davie JR, Seto E. Izolace a charakterizace cDNA odpovídajících dalšímu členu rodiny genů lidské histondeacetylázy  //  J. Biol. Chem.  : deník. — Sv. 272 , č.p. 44 . - S. 28001-28007 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.28001 . — PMID 9346952 .
  47. Yao YL, Yang WM, Seto E. Regulace transkripčního faktoru YY1 acetylací a deacetylací   // Mol . buňka. Biol. : deník. — Sv. 21 , č. 17 . - S. 5979-5991 . - doi : 10.1128/mcb.21.17.5979-5991.2001 . — PMID 11486036 .
  48. Kalenik JL, Chen D., Bradley ME, Chen SJ, Lee TC Kvasinkové dvouhybridní klonování nového proteinu se zinkovým prstem, který interaguje s multifunkčním transkripčním faktorem YY1  // Nucleic Acids Res  . : deník. — Sv. 25 , č. 4 . - S. 843-849 . doi : 10.1093 / nar/25.4.843 . — PMID 9016636 .

Literatura