RBBP4

Protein vázající retinoblastom 4

Zavedeno na základě PDB 2XU7 .
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolRBBP4  ; NURF55; RBAP48; řádek-53
Externí IDOMIM:  602923 MGI :  1194912 HomoloGene :  21153 GeneCards : RBBP4 Gene
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez592819646
SouborENSG00000162521ENSMUSG00000057236
UniProtQ09028Q60972
RefSeq (mRNA)NM_001135255NM_009030
RefSeq (protein)NP_001128727NP_033056
Locus (UCSC)Chr 1:
33,12 – 33,15 Mb		Chr 4:
129,31 – 129,34 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Protein vázající histony RBBP4 (také známý jako RbAp48 nebo NURF55 ) je protein kódovaný u lidí genem RBBP4 . [1] [2]

Funkce

Tento gen kóduje všudypřítomný nukleární protein, který patří do vysoce konzervované podrodiny proteinů repetice WD. Je přítomen v proteinových komplexech účastnících se acetylace histonů a sestavování chromatinu . To je součástí komplexu Mi-2/NuRD, který se podílí na remodelaci chromatinu a transkripční represi spojené s deacetylací histonů. Tento kódovaný protein je také součástí korepresorových komplexů, které jsou nedílnou součástí umlčování transkripce . To se nachází mezi několika buněčnými proteiny, které se vážou přímo na protein retinoblastomu za účelem regulace buněčné proliferace. Tento protein se také zdá být zapojen do transkripční represe genů citlivých na E2F. [3]

Klinický význam

Pokles RbAp48 v gyrus dentatus hippocampu mozku je pravděpodobně hlavní příčinou ztráty paměti při normálním stárnutí . [4] S věkem související pokles RbAp48 je pozorován v gyrus dentatus při pitvě tkáně po smrti člověka, stejně jako u myší. Kromě toho, knocking gen v dominantní negativní formě RbAp48 způsobuje deficit paměti u mladých myší, podobný tomu, co je pozorováno u starších myší. A konečně, přenos genu lentiviru ke zvýšení exprese RbAp48 v mozku obrací poškození paměti u starých myší. [čtyři]

RBBP4 využívá část dráhy PKA - CREB1-CPB. [4] Jedním z možných terapeutických přístupů k obnovení ztrát paměti související s věkem je tedy použití PKA-CREB1-CPB metabolických drah stimulačních léků. Agonisté dopaminu D1/D5, jako je 6-Br-APB a SKF-38393, které jsou pozitivně spojeny s adenylátcyklázou a inhibitorem cAMP fosfodiesterázy rolipramem , již dříve prokázaly, že snižují poruchy paměti u starých myší. [5]

Interakce

Ukázalo se, že RBBP4 interaguje s:

Poznámky

  1. ↑ Qian YW, Wang YC, Hollingsworth RE Jr, Jones D., Ling N., Lee EY Protein vázající retinoblastom související s negativním regulátorem Ras v kvasinkách  //  Nature: journal. - 1993. - září ( roč. 364 , č. 6438 ). - S. 648-652 . - doi : 10.1038/364648a0 . — PMID 8350924 .
  2. ↑ Barak O., Lazzaro MA, Lane WS, Speicher DW, Picketts DJ, Shiekhattar R. Isolation of human NURF: a regulator of Engrailed gene expression   // EMBO J : deník. - 2003. - Listopad ( roč. 22 , č. 22 ). - S. 6089-6100 . - doi : 10.1093/emboj/cdg582 . — PMID 14609955 .
  3. ↑ Entrez Gen: RBBP4 retinoblastom-vazebný protein 4 .
  4. ↑ 1 2 3 Pavlopoulos E., Jones S., Kosmidis S., Close M., Kim C., Kovalerchik O., Small SA, Kandel ER Molecular Mechanism for Age-Related Memory Loss: The Histone-Binding Protein  RbAp48.)  // Sci Transl Med : deník. - 2013. - Srpen ( ročník 5 , č. 200 ). — S. 200ra115 . - doi : 10.1126/scitranslmed.3006373 . — PMID 23986399 .
  5. ↑ Bach ME, Barad M., Son H., Zhuo M., Lu YF, Shih R., Mansuy I., Hawkins RD, Kandel ER Věkové defekty v prostorové paměti korelují s defekty v pozdní fázi hippocampu long -termínová potenciace in vitro a jsou zeslabeny léky, které zlepšují signální dráhu cAMP  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1999. - Duben ( roč. 96 , č. 9 ). - str. 5280-5285 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.5280 . — PMID 10220457 .
  6. ↑ Yarden RI, Brody LC BRCA1 interaguje se složkami komplexu histon deacetylázy  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Sv. 96 , č. 9 . - str. 4983-4988 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4983 . — PMID 10220405 .
  7. ↑ Zhang Q., Vo N., Goodman RH Protein vázající histon RbAp48 interaguje s komplexem proteinu vázajícího CREB a fosforylovaného CREB   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2000. - Sv. 20 , č. 14 . - S. 4970-4978 . - doi : 10.1128/MCB.20.14.4970-4978.2000 . — PMID 10866654 .
  8. ↑ Feng Q., Cao R., Xia L., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Zhang Y. Identifikace a funkční charakterizace složek p66/p68 komplexu MeCP1   // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 2 . - str. 536-546 . - doi : 10.1128/MCB.22.2.536-546.2002 . — PMID 11756549 .
  9. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Duální mechanismy regulace transkripce genu receptoru luteinizačního hormonu nukleárními sirotčími receptory a komplexy histondeacetylázy  (anglicky)  // J. Steroid Biochem. Mol. Biol. : deník. - 2003. - Sv. 85 , č. 2-5 . - str. 401-414 . - doi : 10.1016/S0960-0760(03)00230-9 . — PMID 12943729 .
  10. ↑ 1 2 Yao YL, Yang WM Proteiny 1 a 2 spojené s metastázami tvoří odlišné proteinové komplexy s aktivitou histondeacetylázy  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 43 . - S. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
  11. ↑ 1 2 3 Nicolas E., Ait-Si-Ali S., Trouche D. Histondeacetyláza HDAC3 cílí RbAp48 na protein retinoblastomu  // Nucleic Acids Res  . : deník. - 2001. - Sv. 29 , č. 15 . - str. 3131-3136 . doi : 10.1093 / nar/29.15.3131 . — PMID 11470869 .
  12. ↑ Grozinger CM, Hassig CA, Schreiber SL Tři proteiny definují třídu lidských histonových deacetyláz souvisejících s kvasinkou Hda1p  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 1999. - Sv. 96 , č. 9 . - str. 4868-4873 . - doi : 10.1073/pnas.96.9.4868 . — PMID 10220385 .
  13. ↑ You A., Tong JK, Grozinger CM, Schreiber SL CoREST je nedílnou součástí komplexu CoREST-lidská histondeacetyláza  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2001. - Sv. 98 , č. 4 . - S. 1454-1458 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
  14. ↑ 1 2 Hassig CA, Fleischer TC, Billin AN, Schreiber SL, Ayer DE Aktivita histonové deacetylázy je vyžadována pro úplnou transkripční represi pomocí mSin3A  // Cell  :  journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , č. 3 . - str. 341-347 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80214-7 . — PMID 9150133 .
  15. ↑ Ng HH, Zhang Y., Hendrich B., Johnson CA, Turner BM, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D., Bird A. MBD2 je transkripční represor patřící do komplexu histon deacetylázy MeCP1  . )  / / Nat. Genet.  : deník. - 1999. - Sv. 23 , č. 1 . - str. 58-61 . - doi : 10.1038/12659 . — PMID 10471499 .
  16. ↑ 1 2 3 Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H., Tempst P., Bird A., Reinberg D. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histon deacetylázy  a /spojení s metylací DNA  Genes Dev.  : deník. - 1999. - Sv. 13 , č. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
  17. ↑ 1 2 Zhang Y., Dufau ML Umlčení transkripce genu receptoru lidského luteinizačního hormonu komplexem histondeacetyláza-mSin3A  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 36 . - S. 33431-33438 . - doi : 10.1074/jbc.M204417200 . — PMID 12091390 .
  18. ↑ Hassig CA, Tong JK, Fleischer TC, Owa T., Grable PG, Ayer DE, Schreiber SL Role aktivity histondeacetylázy v transkripční represi zprostředkované HDAC1  //  Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : časopis. - 1998. - Sv. 95 , č. 7 . - S. 3519-3524 . - doi : 10.1073/pnas.95.7.3519 . — PMID 9520398 .
  19. ↑ Zhang Y., Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Histonové deacetylázy a SAP18, nový polypeptid, jsou součástmi lidského komplexu Sin3  (anglicky)  // Cell  : journal. - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , č. 3 . - str. 357-364 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80216-0 . — PMID 9150135 .
  20. ↑ Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, Speicher DW, Shiekhattar R. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histon deacetylázu  (anglicky)  // J. Biol. Chem.  : deník. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 9 . - str. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
  21. ↑ Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, Kingston RE, Schreiber SL Deacetylace chromatinu komplexem remodelace nukleozomů závislým na ATP  //  Příroda: časopis. - 1998. - Sv. 395 , č.p. 6705 . - S. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
  22. ↑ Qian YW, Lee EY Duální retinoblastom-vazebné proteiny s vlastnostmi souvisejícími s negativním regulátorem ras v kvasinkách  //  J. Biol. Chem.  : deník. - 1995. - Sv. 270 , č.p. 43 . - S. 25507-25513 . doi : 10.1074/ jbc.270.43.25507 . — PMID 7503932 .
  23. ↑ Nicolas E., Morales V., Magnaghi-Jaulin L., Harel-Bellan A., Richard-Foy H., Trouche D.  RbAp48 patří ke komplexu histon deacetylázy, který se spojuje s proteinem retinoblastomu  // J Biol. Chem.  : deník. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 13 . - S. 9797-9804 . doi : 10.1074 / jbc.275.13.9797 . — PMID 10734134 .
  24. ↑ 1 2 Zhang Y., Sun ZW, Iratni R., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Hampsey M., Reinberg D. SAP30, nový protein konzervovaný mezi člověkem a kvasinkami, je součástí komplexu histon deacetylázy  (anglicky)  // Mol. buňka : deník. - 1998. - Sv. 1 , ne. 7 . - S. 1021-1031 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80102-1 . — PMID 9651585 .
  25. ↑ Kuzmichev A., Zhang Y., Erdjument-Bromage H., Tempst P., Reinberg D. Role komplexu Sin3-histone deacetyláza v regulaci růstu kandidátním supresorem nádorů p33(ING1  )  // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2002. - Sv. 22 , č. 3 . - S. 835-848 . - doi : 10.1128/MCB.22.3.835-848.2002 . — PMID 11784859 .

Literatura