MTA2
Protein asociovaný s metastázami MTA2 je protein kódovaný u lidí genem MTA2 . [1] [2]
Tento gen kóduje protein , který byl identifikován jako součást NuRD, proteinu nukleozomové rekonstrukce deacetylázového komplexu nalezeného v jádrech lidských buněk. Vykazuje velmi širokou templátovou expresi a je vysoce exprimován v mnoha tkáních. Může to být jeden člen malé rodiny genů , které kódují odlišné , ale příbuzné proteiny zapojené přímo nebo nepřímo do regulace transkripce . Jejich nepřímé účinky na regulaci transkripce mohou zahrnovat remodelaci chromatinu . Úzce souvisí s dalším členem této rodiny, proteinem, který koreluje s metastatickým potenciálem některých karcinomů . Tyto dva proteiny jsou tak blízce příbuzné, že sdílejí stejné typy domén . Tyto domény zahrnují dvě DNA-vazebné domény, dimerizační doménu a doménu běžně se vyskytující v proteinech, které methylují DNA . Jeden takový protein je znám jako cílový protein pro produkt genu p53 . Deaktivace p53 koreluje se ztrátou inhibice růstu v transformovaných buňkách udržujících komunikaci mezi těmito členy genové rodiny a metastázami . [2]
Interakce
Ukázalo se, že MTA2 interaguje s následujícími strukturami: HDAC1 , [3] [4] [5] [6] histondeacetyláza 2 , [3] [5] [7] MTA1 , [3] CHD4 , [3] RBBP7 , [3] [5] RBBP4 , [3] [5] MBD3 [5] [8] [9] a SATB1 . [6]
Poznámky
- ↑ Futamura M., Nishimori H., Shiratsuchi T., Saji S., Nakamura Y., Tokino T. Molekulární klonování, mapování a charakterizace nového lidského genu, MTA1-L1, vykazujícího homologii s genem spojeným s metastázami, MTA1 (anglicky) // Journal of Human Genetics : deník. - 1999. - březen ( roč. 44 , č. 1 ). - S. 52-6 . - doi : 10.1007/s100380050107 . — PMID 9929979 .
- ↑ 1 2 Entrez Gen: 1 rodina spojená s metastázami MTA2, člen 2 . (neurčitý)
- ↑ 1 2 3 4 5 6 Yao, Ya-Li; Yang Wen Ming. Proteiny 1 a 2 spojené s metastázami tvoří odlišné proteinové komplexy s aktivitou histondeacetylázy (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2003. - říjen ( sv. 278 , č. 43 ). - S. 42560-42568 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
- ↑ Vy, A; Tong JK; Grozinger CM; Schreiber S L. CoREST je nedílnou součástí CoREST-human histone deacetylase complex (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - Spojené státy americké, 2001. - únor ( sv. 98 , č. 4 ). - S. 1454-1458 . — ISSN 0027-8424 . - doi : 10.1073/pnas.98.4.1454 . — PMID 11171972 .
- ↑ 1 2 3 4 5 Zhang, Y; NgHH; Erdjument Bromage H; TempstP; pták A; Reinberg D. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histondeacetylázy a spojení s metylací DNA // Genes & Development : journal . - SPOJENÉ STÁTY, 1999. - Srpen ( sv. 13 , č. 15 ). - S. 1924-1935 . — ISSN 0890-9369 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
- ↑ 1 2 Yasui, Dag; Miyano Masaru, Cai Shutao, Varga-Weisz Patrick, Kohwi-Shigematsu Terumi. SATB1 se zaměřuje na remodelaci chromatinu k regulaci genů na dlouhé vzdálenosti // Nature : journal. - Anglie, 2002. - říjen ( sv. 419 , č. 6907 ). - str. 641-645 . — ISSN 0028-0836 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
- ↑ Hakimi, Mohamed-Ali; Dong Yuanshu; Lane William S; Speicher David W; Shiekhattar Ramin. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2003. - Únor ( sv. 278 , č. 9 ). - str. 7234-7239 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
- ↑ Sakai, Hirotaka; Urano Takeshi; Ookata Kayoko; Kim Mi Hyun; Hirai Yugo; Saito Motoki; Nojima Yoshihisa; Ishikawa Fuyuki. MBD3 a HDAC1, dvě složky komplexu NuRD, jsou lokalizovány na Aurora-A-pozitivních centrosomech v M fázi // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2002. - Prosinec ( sv. 277 , č. 50 ). - S. 48714-48723 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M208461200 . — PMID 12354758 .
- ↑ Saito, Motoki; Ishikawa Fuyuki. Doména vázající mCpG lidského MBD3 se neváže na mCpG, ale interaguje se složkami NuRD/Mi2 HDAC1 a MTA2 // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2002. - září ( vol. 277 , č. 38 ). - S. 35434-35439 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
Literatura
- Zhang Y., LeRoy G., Seelig HP a kol. Autoantigen Mi2 specifický pro dermatomyozitidu je součástí komplexu obsahujícího histondeacetylázu a remodelační aktivity nukleozomů. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 1998. - Sv. 95 , č. 2 . - str. 279-289 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)81758-4 . — PMID 9790534 .
- Tong JK, Hassig CA, Schnitzler GR, et al. Deacetylace chromatinu komplexem remodelace nukleozomů závislým na ATP. (anglicky) // Nature: journal. - 1998. - Sv. 395 , č.p. 6705 . - S. 917-921 . - doi : 10.1038/27699 . — PMID 9804427 .
- Xue Y., Wong J., Moreno GT a kol. NURD, nový komplex s jak ATP-dependentní remodelací chromatinu, tak aktivitami histondeacetylázy. (anglicky) // Molecular Cell : deník. - 1999. - Sv. 2 , ne. 6 . - S. 851-861 . - doi : 10.1016/S1097-2765(00)80299-3 . — PMID 9885572 .
- Zhang Y., Ng HH, Erdjument-Bromage H. a kol. Analýza podjednotek NuRD odhaluje komplex jádra histon deacetylázy a spojení s metylací DNA. (anglicky) // Genes & Development : journal. - 1999. - Sv. 13 , č. 15 . - S. 1924-1935 . - doi : 10.1101/gad.13.15.1924 . — PMID 10444591 .
- Wade PA, Gegonne A., Jones PL, a kol. Komplex Mi-2 spojuje methylaci DNA s remodelací chromatinu a deacetylací histonů. (anglicky) // Nature Genetics : journal. - 1999. - Sv. 23 , č. 1 . - S. 62-6 . - doi : 10.1038/12664 . — PMID 10471500 .
- Luo J., Su F., Chen D. a kol. Deacetylace p53 moduluje jeho účinek na buněčný růst a apoptózu. (anglicky) // Nature: journal. - 2000. - Sv. 408 , č.p. 6810 . - str. 377-381 . - doi : 10.1038/35042612 . — PMID 11099047 .
- Humphrey GW, Wang Y., Russanova VR a kol. Stabilní histondeacetylázové komplexy vyznačující se přítomností proteinů SANT domény CoREST/kiaa0071 a Mta-L1. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 9 . - str. 6817-6824 . - doi : 10.1074/jbc.M007372200 . — PMID 11102443 .
- Feng Q., Zhang Y. Komplex MeCP1 potlačuje transkripci prostřednictvím preferenční vazby, remodelace a deacetylace methylovaných nukleozomů. (anglicky) // Genes & Development : journal. - 2001. - Sv. 15 , č. 7 . - S. 827-832 . - doi : 10.1101/gad.876201 . — PMID 11297506 .
- Shi Y., Downes M., Xie W., a kol. Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderného receptoru. (anglicky) // Genes & Development : journal. - 2001. - Sv. 15 , č. 9 . - S. 1140-1151 . - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .
- Saito M., Ishikawa F. mCpG-vazebná doména lidského MBD3 se neváže na mCpG, ale interaguje s NuRD/Mi2 složkami HDAC1 a MTA2. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 38 . - S. 35434-35439 . - doi : 10.1074/jbc.M203455200 . — PMID 12124384 .
- Yasui D., Miyano M., Cai S. a kol. SATB1 se zaměřuje na remodelaci chromatinu k regulaci genů na dlouhé vzdálenosti. (anglicky) // Nature: journal. - 2002. - Sv. 419 , č.p. 6907 . - str. 641-645 . - doi : 10.1038/nature01084 . — PMID 12374985 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA plné délky. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
- Hakimi MA, Dong Y., Lane WS, a kol. Kandidátní gen mentální retardace vázaný na X je součástí nové rodiny komplexů obsahujících histondeacetylázu. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 9 . - str. 7234-7239 . - doi : 10.1074/jbc.M208992200 . — PMID 12493763 .
- Fujita N., Jaye DL, Kajita M. a kol. MTA3, podjednotka komplexu Mi-2/NuRD, reguluje invazivní růstovou dráhu u rakoviny prsu. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2003. - Vol. 113 , č. 2 . - str. 207-219 . - doi : 10.1016/S0092-8674(03)00234-4 . — PMID 12705869 .
- Yao YL, Yang WM Proteiny 1 a 2 spojené s metastázami tvoří odlišné proteinové komplexy s aktivitou histondeacetylázy. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2004. - Sv. 278 , č.p. 43 . - S. 42560-42568 . - doi : 10.1074/jbc.M302955200 . — PMID 12920132 .
- Zoltewicz JS, Stewart NJ, Leung R., Peterson AS Atrofin 2 rekrutuje histondeacetylázu a je nezbytný pro funkci více signálních center během embryogeneze myší. (anglicky) // Development : journal. - 2004. - Sv. 131 , č.p. 1 . - str. 3-14 . - doi : 10.1242/dev.00908 . — PMID 14645126 .
- Miaczynska M., Christoforidis S., Giner A., et al. APPL proteiny spojují Rab5 s transdukcí jaderného signálu přes endozomální kompartment. (anglicky) // Cell : journal. - Cell Press , 2004. - Vol. 116 , č. 3 . - str. 445-456 . - doi : 10.1016/S0092-8674(04)00117-5 . — PMID 15016378 .
- Jiang CL, Jin SG, Pfeifer GP MBD3L1 je transkripční represor, který interaguje s methyl-CpG-vazebným proteinem 2 (MBD2) a složkami komplexu NuRD. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2005. - Sv. 279 , č.p. 50 . - S. 52456-52464 . - doi : 10.1074/jbc.M409149200 . — PMID 15456747 .
- Gerhard DS, Wagner L., Feingold EA a kol. Stav, kvalita a rozšíření projektu NIH plné délky cDNA: sbírka savčích genů (MGC). (anglicky) // Genome Research : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .