EED
Embryonální vývoj ektodermu |
---|
Zavedeno na základě PDB 3IIW . |
PNR |
Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
|
3IIW , 3IIY , 3IJ0 , 3IJ1 , 3IJC , 3JPX , 3JZG , 3JZH , 3JZN , 3K26 , 3K27 |
|
|
|
Symbol | EED ; DBÁT; ČEKEJTE 1 |
---|
Externí ID | OMIM: 605984 MGI : 95286 HomoloGene : 2814 IUPHAR : GeneCards : EED Gene |
---|
|
|
|
|
Více informací |
|
Pohled | Člověk | Myš | |
---|
Entrez | 8726 | 13626 | |
---|
Soubor | ENSG00000074266 | ENSMUSG00000030619 | |
---|
UniProt | O75530 | Q921E6 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_003797 | NM_021876 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_003788 | NP_068676 | |
---|
Locus (UCSC) | Chr 11: 85,96 – 85,99 Mb | Chr 7: 89,95 – 89,98 Mb | |
---|
Hledejte v PubMed | [jeden] | [2] | |
Proteinová skupina Polycomb EED (embryonální vývoj ektodermu) ( angl. Polycomb protein EED ) je protein kódovaný u člověka genem EED [1] [2] [3] .
Funkce
Protein Polycomb EED je členem rodiny Polycomb (PcG). Členové rodiny PcG tvoří vícerozměrné proteinové komplexy , které se podílejí na udržování transkripčně -represivního stavu genů během po sobě jdoucích generací buněk . Tento protein interaguje s zesilovačem zeste 2 , cytoplazmatickým koncem β7 integrinu , MA proteinem viru imunodeficience typu 1 ( HIV - 1) a histondeacetylázami . Tento protein zprostředkovává potlačení aktivity histonového genu prostřednictvím deacetylace a může působit jako specifický regulátor funkce integrinu . Pro tento gen byly identifikovány dvě varianty transkriptů kódujících různé izoformy [3] .
Klinický význam
U lidí bylo hlášeno, že de novo mutace v EED má za následek symptomy připomínající Weaverův syndrom [4] .
Interakce s jinými proteiny
Bylo prokázáno, že EED interaguje s:
Poznámky
- ↑ 1 2 Rietzler M. , Bittner M. , Kolanus W. , Schuster A. , Holzmann B. Lidský protein WD repetice WAIT-1 specificky interaguje s cytoplazmatickými konci beta7-integrinů. (anglicky) // The Journal of biologické chemie. - 1998. - Sv. 273, č.p. 42 . - S. 27459-27466. — PMID 9765275 .
- ↑ Schumacher A. , Lichtarge O. , Schwartz S. , Magnuson T. Potřeba myšího genu skupiny Polycomb a jeho lidský ortolog: funkční důsledky evoluční ochrany. (anglicky) // Genomics. - 1998. - Sv. 54, č.p. 1 . - S. 79-88. doi : 10.1006 / geno.1998.5509 . — PMID 9806832 .
- ↑ 1 2 Entrez Gen: EED vývoj embryonálního ektodermu . (neurčitý)
- ↑ Cohen AS , Tuysuz B. , Shen Y. , Bhalla SK , Jones SJ , Gibson WT Nová mutace v EED spojená s přerůstáním. (anglicky) // Journal of human genetics. - 2015. - doi : 10.1038/jhg.26.2015 . — PMID 25787343 .
- ↑ 1 2 3 van der Vlag J. , Otte AP Transkripční represe zprostředkovaná lidským proteinem polycomb-group EED zahrnuje deacetylaci histonů. (anglicky) // Genetika přírody. - 1999. - Sv. 23, č. 4 . - S. 474-478. - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
- ↑ van Lohuizen M. , Tijms M. , Voncken JW , Schumacher A. , Magnuson T. , Wientjens E. Interakce myších proteinů polycomb-group (Pc-G) Enx1 a Enx2 s Eed: indikace pro samostatné komplexy Pc-G. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 6 . - S. 3572-3579. — PMID 9584197 .
- ↑ Denisenko O. , Shnyreva M. , Suzuki H. , Bomsztyk K. Bodové mutace v doméně WD40 Eed blokují jeho interakci s Ezh2. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 10 . - S. 5634-5642. — PMID 9742080 .
- ↑ Jin Q. , van Eynde A. , Beullens M. , Roy N. , Thiel G. , Stalmans W. , Bollen M. Regulátor proteinové fosfatázy-1 (PP1), jaderný inhibitor PP1 (NIPP1), interaguje s polycomb group protein, vývoj embryonálního ektodermu (EED) a funguje jako transkripční represor. (anglicky) // The Journal of biologické chemie. - 2003. - Sv. 278, č.p. 33 . - S. 30677-30685. - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
- ↑ Enünlü I. , Pápai G. , Cserpán I. , Udvardy A. , Jang KT , Boros I. Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy/trimethylguanosinsyntázou se lokalizují do cytoplazmy a jádra. (anglicky) // Biochemické a biofyzikální výzkumné komunikace. - 2003. - Sv. 309, č.p. 1 . - S. 44-51. — PMID 12943661 .
Literatura
- Joseph AM , Kumar M. , Mitra D. Nef: „nezbytný a vynucující faktor“ při infekci HIV. (anglicky) // Současný výzkum HIV. - 2005. - Sv. 3, č. 1 . - S. 87-94. — PMID 15638726 .
- Van Maele B. , Debyser Z. HIV-1 integrace: souhra mezi HIV-1 integrázou, buněčnými a virovými proteiny. (anglicky) // AIDS recenze. - 2005. - Sv. 7, č. 1 . - S. 26-43. — PMID 15875659 .
- Jones CA , Ng J. , Peterson AJ , Morgan K. , Simon J. , Jones RS Proteiny Drosophila esc a E(z) jsou přímými partnery v represi zprostředkované polycomb group. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 5 . - S. 2825-2834. — PMID 9566901 .
- van Lohuizen M. , Tijms M. , Voncken JW , Schumacher A. , Magnuson T. , Wientjens E. Interakce myších proteinů polycomb-group (Pc-G) Enx1 a Enx2 s Eed: indikace pro samostatné komplexy Pc-G. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 6 . - S. 3572-3579. — PMID 9584197 .
- Sewalt RG , van der Vlag J. , Gunster MJ , Hamer KM , den Blaauwen JL , Satijn DP , Hendrix T. , van Driel R. , Otte AP Charakterizace interakcí mezi proteiny savčí polykomb-skupiny Enx1/EZH2 a EED naznačuje, existence různých savčích proteinových komplexů polycomb-group. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 6 . - S. 3586-3595. — PMID 9584199 .
- Denisenko O. , Shnyreva M. , Suzuki H. , Bomsztyk K. Bodové mutace v doméně WD40 Eed blokují jeho interakci s Ezh2. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 1998. - Sv. 18, č. 10 . - S. 5634-5642. — PMID 9742080 .
- Peytavi R. , Hong SS , Gay B. , d'Angeac AD , Selig L. , Bénichou S. , Benarous R. , Boulanger P. HEED, produkt lidského homologu myšího genu eed, se váže na matricový protein HIV-1. (anglicky) // The Journal of biologické chemie. - 1999. - Sv. 274, č.p. 3 . - S. 1635-1645. — PMID 9880543 .
- van der Vlag J. , Otte AP Transkripční represe zprostředkovaná lidským proteinem polycomb-group EED zahrnuje deacetylaci histonů. (anglicky) // Genetika přírody. - 1999. - Sv. 23, č. 4 . - S. 474-478. - doi : 10.1038/70602 . — PMID 10581039 .
- Satijn DP , Hamer KM , den Blaauwen J. , Otte AP Polycomb group protein EED interaguje s YY1 a oba proteiny indukují nervovou tkáň u embryí Xenopus. (anglicky) // Molekulární a buněčná biologie. - 2001. - Sv. 21, č. 4 . - S. 1360-1369. - doi : 10.1128/MCB.21.4.1360-1369.2001 . — PMID 11158321 .
- Kuzmichev A. , Nishioka K. , Erdjument-Bromage H. , Tempst P. , Reinberg D. Aktivita histon methyltransferázy spojená s lidským multiproteinovým komplexem obsahujícím Enhancer of Zeste protein. (anglicky) // Genes & development. - 2002. - Sv. 16, č. 22 . - S. 2893-2905. - doi : 10.1101/gad.1035902 . — PMID 12435631 .
- Jin Q. , van Eynde A. , Beullens M. , Roy N. , Thiel G. , Stalmans W. , Bollen M. Regulátor protein fosfatázy-1 (PP1), jaderný inhibitor PP1 (NIPP1), interaguje s polycomb skupinový protein, vývoj embryonálního ektodermu (EED) a funguje jako transkripční represor. (anglicky) // The Journal of biologické chemie. - 2003. - Sv. 278, č.p. 33 . - S. 30677-30685. - doi : 10.1074/jbc.M302273200 . — PMID 12788942 .
- Enünlü I. , Pápai G. , Cserpán I. , Udvardy A. , Jang KT , Boros I. Různé izoformy proteinu interagujícího s PRIP s doménou methyltransferázy/trimethylguanosinsyntázou se lokalizují v cytoplazmě a jádře. (anglicky) // Biochemické a biofyzikální výzkumné komunikace. - 2003. - Sv. 309, č.p. 1 . - S. 44-51. — PMID 12943661 .
- Violot S. , Hong SS , Rakotobe D. , Petit C. , Gay B. , Moreau K. , Billaud G. , Priet S. , Sire J. , Schwartz O. , Mouscadet JF , Boulanger P. The human polycomb group EED protein interaguje s integrázou viru lidské imunodeficience typu 1. (anglicky) // Journal of virology. - 2003. - Sv. 77, č.p. 23 . - S. 12507-12522. — PMID 14610174 .
- Witte V. , Laffert B. , Rosorius O. , Lischka P. , Blume K. , Galler G. , Stilper A. , Willbold D. , D'Aloja P. , Sixt M. , Kolanus J. , Ott M. , Kolanus W. , Schuler G. , Baur AS HIV-1 Nef napodobuje signál integrinového receptoru, který rekrutuje protein Eed polycomb group do plazmatické membrány. (anglicky) // Molecular cell. - 2004. - Sv. 13, č. 2 . - S. 179-190. — PMID 14759364 .
- Cao R. , Zhang Y. SUZ12 je vyžadován jak pro aktivitu histon methyltransferázy, tak pro umlčovací funkci komplexu EED-EZH2. (anglicky) // Molecular cell. - 2004. - Sv. 15, č. 1 . - S. 57-67. - doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.020 . — PMID 15225548 .
- Pasini D. , Bracken AP , Jensen MR , Lazzerini Denchi E. , Helin K. Suz12 je nezbytný pro vývoj myší a pro aktivitu histon methyltransferázy EZH2. (anglicky) // The EMBO journal. - 2004. - Sv. 23, č. 20 . - S. 4061-4071. - doi : 10.1038/sj.emboj.7600402 . — PMID 15385962 .