Hráč v kostky

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 16. dubna 2018; kontroly vyžadují 3 úpravy .

Dicer 1, ribonukleáza III

Struktura RNázy IIIb a myší dsRNA-vazebné domény (Dicer).

Dostupné struktury

PNR

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID
2EB1 , 4NGB , 4NGC , 4NGD , 4NGF , 4NGG , 4NH3 , 4NH5 , 4NH6 , 4NHA

Identifikátory

Symbol

DICER1 ; DCR1; Hráč v kostky; HERNA; MNG1; RMSE2

Externí ID

OMIM: 606241 MGI : 2177178 HomoloGene : 13251 GeneCards : DICER1 Gene

EC číslo

3.1.26.3

Genová ontologie
Funkce	• vazba dvouřetězcové RNA • aktivita helikázy • aktivita ribonukleázy III • vazba na protein • vazba ATP • vazba na miRNA • vazba kovových iontů
buněčná složka	• endoplazmatické retikulum-Golgiho intermediární kompartment • cytosol • RISC komplex • axon • dendrit • růstový kužel
biologický proces	• negativní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • angiogeneze • postembryonální vývoj • asymetrické dělení zygoty • genová exprese • negativní regulace proliferace Schwannových buněk • pozitivní regulace diferenciace Schwannových buněk • udržování kmenových buněk • diferenciace motorických neuronů míchy • vývoj nervů • diferenciace mezineuronů čichových bulbů • mozková kůra vývoj • vývoj plic • produkce siRNA podílející se na interferenci RNA • cílení mRNA pro destrukci podílející se na interferenci RNA • zpracování pre-miRNA • morfogeneze vlasových folikulů • pozitivní regulace myelinizace • tvorba myelinu periferního nervového systému • morfogeneze zadních končetin embrya • produkce miRNA podílí se na umlčování genů pomocí miRNA • růst mnohobuněčných organismů • regulace replikace virového genomu • regulace diferenciace neuronů • pozitivní regulace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • vývoj sleziny • regulace diferenciace oligodendrocytů • větvení morfoge néza epiteliální trubice • morfogeneze projekce neuronů • sestavení vřeténka • obranná reakce na virus • regulace buněčného cyklu • vývoj buněk srdečního svalu • vývoj buněk receptoru vnitřního ucha • vývoj buněk střevního epitelu • regulace mineralizace skloviny • proliferace buněk vlasového folikulu • RNA hydrolýza fosfodiesterové vazby • hydrolýza fosfodiesterové vazby RNA, endonukleolytická • pozitivní regulace metabolického procesu miRNA
Zdroje: Amigo / QuickGO

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 14:
95,55 – 95,62 Mb

Chr 12:
104,69 – 104,75 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Dicer je ribonukleáza z rodiny RNázy III (RNáza III), která štěpí dvouvláknové molekuly RNA a pre-miRNA (premiRNA ) za vzniku krátkých dvouvláknových fragmentů RNA nazývaných malá interferující RNA (siRNA) a miRNA (miRNA). Tyto fragmenty jsou dlouhé přibližně 20-25 nukleotidů , typicky s přesahem 2-3 nukleotidů na 3' konci [1] .

Dicer obsahuje dvě domény RNázy III a jednu doménu PAZ . Vzdálenost mezi těmito oblastmi v molekule je určena délkou a úhlem spojovací smyčky a určuje délku výsledné siRNA. Dicer katalyzuje první krok v procesu RNA interference a iniciuje tvorbu RISC (RNA-induced silencing complex), jehož katalytická složka, protein Argonaute , je endonukleáza, která degraduje mRNA komplementární k vedoucímu řetězci siRNA [2] .

Viz také

RNA interference

Poznámky

↑ 1 2 Macrae I., Zhou K., Li F., Repic A., Brooks A., Cande W., Adams P., Doudna J. Strukturální //základ pro zpracování dvouřetězcové RNA od Dicer - 2006. - Sv. 311 , č.p. 5758 . - str. 195-198 . - doi : 10.1126/science.1121638 . — PMID 16410517 .
↑ Jaronczyk K., Carmichael J., Hobman T. Zkoumání funkcí proteinů RNA interference: některé funkce jsou více RISCy než jiné? (anglicky) // Biochem J : deník. - 2005. - Sv. 387 , č.p. Pt 3 . - str. 561-571 . - doi : 10.1042/BJ20041822 . — PMID 15845026 .