Histon deacetyláza 8
Histon deacetyláza 8 |
---|
PNR je založen na 1t64. |
PNR |
Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
|
1T64 , 1T67 , 1T69 , 1VKG , 1W22 , 2V5W , 2V5X , 3EW8 , 3EWF , 3EZP , 3EZT , 3F06 , 3F07 , 3F3Z3Z6 , 3F3Z3Z6 , 4F3Z3Z6 , 4F3Z0R , 4 _ __ _ _ _ |
|
|
|
Symbol | HDAC8 ; CDLS5; HD8; HDACL1; MRXS6; RPD3; WTS |
---|
Externí ID | OMIM: 300269 MGI : 1917565 HomoloGene : 41274 IUPHAR : ChEMBL : 3192 GeneCards : HDAC8 Gene |
---|
EC číslo | 3.5.1.98 |
---|
|
|
Pohled | Člověk | Myš | |
---|
Entrez | 55869 | 70315 | |
---|
Soubor | ENSG00000147099 | ENSMUSG00000067567 | |
---|
UniProt | Q9BY41 | Q8VH37 | |
---|
RefSeq (mRNA) | NM_001166418 | NM_027382 | |
---|
RefSeq (protein) | NP_001159890 | NP_081658 | |
---|
Locus (UCSC) | Chr HG1438_PATCH: 71,55 – 71,79 Mb | Chr X: 102,28 – 102,51 Mb | |
---|
Hledejte v PubMed | [jeden] | [2] | |
Histone deacetyláza 8 ( Histone deacetyláza 8 ) je enzym kódovaný u lidí genem HDAC8 [1] [2] [3] .
Funkce
Histony hrají klíčovou roli v regulaci transkripce , progrese buněčného cyklu a vývojových procesů. Acetylace/deacetylace histonů mění chromozomální strukturu a ovlivňuje přístup transkripčních faktorů k DNA . Protein kódovaný tímto genem patří do třídy I v rodině histondeacetylázy/acuc/Apha. Má aktivitu histondeacetylázy a při navázání na promotor potlačuje transkripci [3] .
Histondeacetyláza 8 se podílí na morfogenezi lebky [4] a metabolické kontrole transkripčního komplexu ERR-alfa / PGC1-alfa [5] [5] .
Klinický význam
HDAC8 je spojován s řadou chorobných stavů, zejména s akutní myeloidní leukémií , a je také spojován s aktinovým cytoskeletem v buňkách hladkého svalstva. siRNA cílené na HDAC8 prokázaly protirakovinné účinky [6] . Inhibice indukované apoptózy pomocí HDAC8 byla pozorována u T-buněčných lymfomů [7] . Kromě toho se enzym HDAC8 účastní patogeneze neuroblastomu [8] . Existuje tedy zájem o vývoj selektivních inhibitorů založených na HDAC8 [9] [10] .
Interakce
Viz také
Poznámky
- ↑ McDonell N., Ramser J., Francis F., Vinet MC, Rider S., Sudbrak R., Riesselman L., Yaspo ML, Reinhardt R., Monaco AP, Ross F., Kahn A., Kearney L., Buckle V., Chelly J. Charakterizace vysoce komplexní oblasti v Xq13 a mapování tří izodicentrických zlomů spojených s preleukémií // Genomics : journal. - Academic Press , 2000. - Květen ( roč. 64 , č. 3 ). - str. 221-229 . - doi : 10.1006/geno.2000.6128 . — PMID 10756090 .
- ↑ Van den Wyngaert I., de Vries W., Kremer A., Neefs J., Verhasselt P., Luyten WH, Kass SU Klonování a charakterizace lidské histondeacetylázy 8 // FEBS Lett : deník. - 2000. - srpen ( roč. 478 , č. 1-2 ). - str. 77-83 . - doi : 10.1016/S0014-5793(00)01813-5 . — PMID 10922473 .
- ↑ 1 2 Entrez Gen: HDAC8 histon deacetyláza 8 . (neurčitý)
- ↑ Haberland M., Mokalled MH, Montgomery RL, Olson EN Epigenetická kontrola morfogeneze lebky histondeacetylázou 8 // Genes Dev . : deník. - 2009. - Červenec ( roč. 23 , č. 14 ). - S. 1625-1630 . - doi : 10.1101/gad.1809209 . — PMID 19605684 .
- ↑ 1 2 Wilson BJ, Tremblay AM, Deblois G., Sylvain-Drolet G., Giguère V. Acetylační spínač moduluje transkripční aktivitu estrogenového receptoru alfa // Mol . Endocrinol. : deník. - 2010. - Červenec ( roč. 24 , č. 7 ). - S. 1349-1358 . — doi : 10.1210/me.2009-0441 . — PMID 20484414 .
- ↑ Gallinari P., Di Marco S., Jones P., Pallaoro M., Steinkühler C. HDAC, deacetylace histonů a genová transkripce: od molekulární biologie k léčbě rakoviny // Cell Res . : deník. - 2007. - březen ( roč. 17 , č. 3 ). - S. 195-211 . - doi : 10.1038/sj.cr.7310149 . — PMID 17325692 .
- ↑ Balasubramanian S., Ramos J., Luo W., Sirisawad M., Verner E., Buggy JJ Nový specifický //inhibitor histon deacetylázy 8 (HDAC8) PCI-34051 indukuje apoptózu u T-buněčných lymfomů - 2008. - Květen ( roč. 22 , č. 5 ). - S. 1026-1034 . - doi : 10.1038/leu.2008.9 . — PMID 18256683 .
- ↑ Oehme I., Deubzer HE, Wegener D., Pickert D., Linke JP, Hero B., Kopp-Schneider A., Westermann F., Ulrich SM, von Deimling A., Fischer M., Witt O. Histondeacetyláza 8 v tumorigenezi neuroblastomu (anglicky) // Clin. Cancer Res. : deník. - 2009. - Leden ( roč. 15 , č. 1 ). - S. 91-9 . - doi : 10.1158/1078-0432.CCR-08-0684 . — PMID 19118036 .
- ↑ Patil V., Sodji QH, Kornacki JR, Mrksich M., Oyelere AK 3-Hydroxypyridin-2-thion jako nová skupina vázající zinek pro selektivní inhibici histondeacetylázy // Journal of Medicinal Chemistry : deník. - 2013. - Květen ( roč. 56 , č. 9 ). - S. 3492-3506 . doi : 10.1021 / jm301769u . — PMID 23547652 .
- ↑ Suzuki T., Ota Y., Ri M., Bando M., Gotoh A., Itoh Y., Tsumoto H., Tatum PR, Mizukami T., Nakagawa H., Iida S., Ueda R., Shirahige K ., Miyata N. Rychlý objev vysoce účinných a selektivních inhibitorů histondeacetylázy 8 pomocí klikací chemie k vytvoření kandidátních knihoven // Journal of Medicinal Chemistry : deník. - 2012. - Listopad ( roč. 55 , č. 22 ). - S. 9562-9575 . doi : 10.1021 / jm300837y . — PMID 23116147 .
Literatura
- Waltregny D., De Leval L., Glénisson W., Ly Tran S., North BJ, Bellahcène A., Weidle U., Verdin E., Castronovo V. Exprese histon deacetylázy 8, histon deacetylázy I. třídy, je omezena na buňky vykazující diferenciaci hladkého svalstva v normálních lidských tkáních. (anglicky) // Am J Pathol. : deník. - 2004. - Sv. 165 , č.p. 2 . - str. 553-564 . - doi : 10.1016/S0002-9440(10)63320-2 . — PMID 15277229 .
- Glénisson W., Waltregny D., Tran SL, North BJ, Verdin E., Colige A., Castronovo V. Histonová deacetyláza HDAC8 se spojuje s alfa-aktinem hladkého svalstva a je nezbytná pro kontraktilitu buněk hladkého svalstva. (anglicky) // The FASEB Journal : deník. — Federace amerických společností pro experimentální biologii, 2005. - Červen ( roč. 19 , č. 8 ). - S. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
- Wedel T., Van Eys GJ, Waltregny D., Glénisson W., Castronovo V., Vanderwinden JM. Nové markery hladkého svalstva odhalují abnormality střevního svalstva u těžkých poruch kolorektální motility. (anglicky) // Neurogastroenterol Motil. : deník. - 2006. - Sv. 18 , č. 7 . - str. 526-538 . - doi : 10.1111/j.1365-2982.2006.00781.x . — PMID 16771768 .
- Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG Histon deacetylázy třídy II: všestranné regulátory. (anglicky) // Trends Genet. : deník. - 2003. - Sv. 19 , č. 5 . - str. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
- Hu E., Chen Z., Fredrickson T. a kol. Klonování a charakterizace nové lidské histondeacetylázy I. třídy, která funguje jako transkripční represor. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 20 . - S. 15254-15264 . - doi : 10.1074/jbc.M908988199 . — PMID 10748112 .
- Buggy JJ, Sideris ML, Mak P. a kol. Klonování a charakterizace nové lidské histondeacetylázy, HDAC8. (anglicky) // Biochem. J. : deník. - 2001. - Sv. 350 , č. 1 . - S. 199-205 . - doi : 10.1042/0264-6021:3500199 . — PMID 10926844 .
- Amann JM, Nip J., Strom DK, a kol. ETO, cíl t(8;21) u akutní leukémie, vytváří zřetelné kontakty s mnohočetnými histondeacetylázami a váže mSin3A prostřednictvím své oligomerizační domény. (anglicky) // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2001. - Sv. 21 , č. 19 . - str. 6470-6483 . - doi : 10.1128/MCB.21.19.6470-6483.2001 . — PMID 11533236 .
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH a kol. Generování a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA plné délky. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
- Durst KL, Lutterbach B., Kummalue T., et al. Fúzní protein inv(16) se spojuje s korepresory prostřednictvím domény těžkého řetězce myosinu hladkého svalstva. (anglicky) // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2003. - Sv. 23 , č. 2 . - S. 607-619 . - doi : 10.1128/MCB.23.2.607-619.2003 . — PMID 12509458 .
- Rodriguez M., Yu X., Chen J., Songyang Z. Fosfopeptidové vazebné specificity BRCA1 COOH-terminálních (BRCT) domén. (anglicky) // J. Biol. Chem. : deník. - 2004. - Sv. 278 , č.p. 52 . - S. 52914-52918 . - doi : 10.1074/jbc.C300407200 . — PMID 14578343 .
- Johnson JM, Castle J., Garrett-Engele P. a kol. Genomový průzkum lidského alternativního sestřihu pre-mRNA pomocí mikročipů s exonovým spojením. (anglicky) // Science: journal. - 2004. - Sv. 302 , č.p. 5653 . - S. 2141-2144 . - doi : 10.1126/science.1090100 . — PMID 14684825 .
- Lee H., Rezai-Zadeh N., Seto E. Negativní regulace aktivity histondeacetylázy 8 cyklickou AMP-dependentní proteinkinázou A. // Mol . buňka. Biol. : deník. - 2004. - Sv. 24 , č. 2 . - str. 765-773 . - doi : 10.1128/MCB.24.2.765-773.2004 . — PMID 14701748 .
- Vannini A., Volpari C., Filocamo G. a kol. Krystalová struktura eukaryotické histondeacetylázy závislé na zinku, lidské HDAC8, v komplexu s inhibitorem kyseliny hydroxamové. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 2004. - Sv. 101 , č. 42 . - S. 15064-15069 . - doi : 10.1073/pnas.0404603101 . — PMID 15477595 .
- Waltregny D., North B., Van Mellaert F., a kol. Screening exprese histonových deacetyláz (HDAC) u lidské rakoviny prostaty odhaluje odlišné profily HDAC třídy I mezi epiteliálními a stromálními buňkami. (anglicky) // European Journal of Histochemistry : journal. - 2005. - Sv. 48 , č. 3 . - S. 273-290 . — PMID 15590418 .
- Waltregny D., Glénisson W., Tran SL, a kol. Histondeacetyláza HDAC8 se spojuje s alfa-aktinem hladkého svalstva a je nezbytná pro kontraktilitu buněk hladkého svalstva. (anglicky) // The FASEB Journal : deník. — Federace amerických společností pro experimentální biologii, 2006. - Sv. 19 , č. 8 . - S. 966-968 . - doi : 10.1096/fj.04-2303fje . — PMID 15772115 .
- Gantt SL, Gattis SG, Fierke CA Katalytická aktivita a inhibice lidské histondeacetylázy 8 je závislá na identitě aktivního místa kovového iontu. (anglicky) // Biochemistry : journal. - 2006. - Sv. 45 , č. 19 . - str. 6170-6178 . doi : 10.1021/ bi060212u . — PMID 16681389 .
- Lee H., Sengupta N., Villagra A. a kol. Histon deacetyláza 8 chrání lidský stále kratší telomerový protein 1B (hEST1B) před degradací zprostředkovanou ubikvitinem. (anglicky) // Mol. buňka. Biol. : deník. - 2006. - Sv. 26 , č. 14 . - str. 5259-5269 . - doi : 10.1128/MCB.01971-05 . — PMID 16809764 .
- Vannini A., Volpari C., Gallinari P. a kol. Vazba substrátu na histondeacetylázy, jak ukazuje krystalová struktura komplexu HDAC8-substrát. (anglicky) // Zprávy EMBO : deník. - 2007. - Sv. 8 , č. 9 . - S. 879-884 . - doi : 10.1038/sj.embor.7401047 . — PMID 17721440 .
- Nakagawa M., Oda Y., Eguchi T. a kol. Profil exprese histonových deacetyláz I. třídy v lidských rakovinných tkáních. (anglicky) // Oncol. Rep. : deník. - 2007. - Sv. 18 , č. 4 . - str. 769-774 . doi : 10.3892 / or.18.4.769 . — PMID 17786334 .
Odkazy
- MeSH HDAC8+protein,+člověk