IFITM3

Identifikátory

IFITM3 , 1-8U, DSPA2b, IP15, interferonem indukovaný transmembránový protein 3

Externí ID

OMIM: 605579 MGI: 1913391 HomoloGene: 136199 GeneCards: 10410

Genová ontologie
Funkce	• GO:0001948, GO:0016582 vazba na plazmatické proteiny
buněčná složka	• membránová část • endozom • membrána • pozdní endozomová membrána • buněčná membrána • lysozomální membrána • Lysozom • GO:0009327 komplex obsahující protein
biologický proces	• negativní regulace vstupu viru do hostitelské buňky • odpověď na interferon-gama • proces imunitního systému • odpověď na virus • odpověď na interferon-beta • odpověď na biotický podnět • negativní regulace replikace virového genomu • signální dráha interferonu typu I • GO: 0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 imunitní reakce • reakce na interferon-alfa • Vrozená imunita • negativní regulace virové transkripce • obranná reakce na virus
Zdroje: Amigo / QuickGO

ortology

Druhy

Člověk

Myš

Entrez


10410


66141

Soubor


ENSG00000142089


ENSMUSG00000025492

UniProt


Q01628


Q9CQW9

RefSeq (mRNA)


NM_021034


NM_025378

RefSeq (protein)


NP_066362


NP_079654

Locus (UCSC)

Chr 11: 0,32 – 0,33 Mb

Chr 7: 140,59 – 140,59 Mb

Vyhledávání PubMed

[jeden]

[2]

Upravit (člověk)

Upravit (myš)

IFITM3 ( Interferon-induced transmembrane protein 3; GGT1 ) je membránový protein z rodiny interferonem indukovaných membránových proteinů, produkt lidského genu IFITM3 [1] [2] [3] .

U lidí je rodina IFITM reprezentována 4 geny na 11. chromozomu : IFITM1 , IFITM2, IFITM3 a IFITM5 [4] . U myší rodina zahrnuje 7 proteinů (existují také IFITM6 a IFITM7).

Funkce

IFITM3 , stejně jako ostatní členové této rodiny, je antivirový protein, který inhibuje vstup viru do buněčné cytoplazmy. Protein narušuje homeostázu cholesterolu . Inhibuje vstup viru do cytoplazmy hostitelské buňky tím, že brání fúzi viru s endozomy ochuzenými o cholesterol. Může inaktivovat nově vytvořené virové částice pučící z membrány infikované buňky v důsledku jejich pučení z membrány ochuzené o cholesterol. Protein je aktivní proti viru chřipky A, koronaviru SARS , viru Marburg , viru Ebola , viru horečky dengue , viru West Nile , HIV-1 a viru vezikulární stomatitidy. Hraje důležitou roli ve strukturální stabilitě a fungování vakuolární ATPázy ( v-ATPázy ). Interaguje s endozomální v-ATPázou, která je kritická pro správnou lokalizaci klatrinu a je nutná pro to, aby ATPáza fungovala při odkyselení fagocytárních endozomů, což má za následek antivirový stav buňky.

Poznámky

↑ Lewin AR, Reid LE, McMahon M., Stark GR, Kerr IM Molekulární analýza rodiny genů indukovatelných lidským interferonem // Eur J Biochem : deník. - 1991. - Srpen ( roč. 199 , č. 2 ). - str. 417-423 . - doi : 10.1111/j.1432-1033.1991.tb16139.x . — PMID 1906403 .
↑ Tanaka SS, Yamaguchi YL, Tsoi B., Lickert H., Tam PP Proteiny IFITM / Mil/fragilis rodiny IFITM1 a IFITM3 hrají odlišné role v navádění a odpuzování myších primordiálních zárodečných buněk // Dev Cell : deník. - 2005. - prosinec ( roč. 9 , č. 6 ). - str. 745-756 . - doi : 10.1016/j.devcel.2005.10.010 . — PMID 16326387 .
↑ Entrez Gen: IFITM3 interferonem indukovaný transmembránový protein 3 (1-8U) . (neurčitý)
↑ Hickford D., Frankenberg S., Shaw G., Renfree MB Evoluce interferonem indukovatelných transmembránových proteinů obratlovců // BMC Genomics : deník. - 2012. - Sv. 13 . — S. 155 . - doi : 10.1186/1471-2164-13-155 . — PMID 22537233 .

Literatura

Vaarala MH, Porvari K., Kyllönen A., Vihko P. Diferenciálně exprimované geny ve dvou buněčných liniích rakoviny prostaty LNCaP odrážející změny během progrese rakoviny prostaty // Lab . Investovat. : deník. - 2000. - Sv. 80 , č. 8 . - S. 1259-1268 . - doi : 10.1038/labinvest.3780134 . — PMID 10950117 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA DNA klonování pomocí in vitro místně specifické rekombinace // Genome Res . : deník. - 2001. - Sv. 10 , č. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných rozsáhlým sekvenováním cDNA // EMBO Rep . : deník. - 2001. - Sv. 1 , ne. 3 . - str. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Tetřev LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C. M.; Schuler, GD Generace a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C. M.; Tetřev, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Starý, S; Rasooly, R. Stav, kvalita a rozšíření projektu NIH plné délky cDNA: sbírka savčích genů (MGC ) // Genome Res. : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. Od ORFeome k biologii: funkční genomický kanál // Genome Res . : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Kimura K; Wakamatsu A; Suzuki Y; Ota, T; Nishikawa, T; Yamashita, R; Yamamoto, J; Sekine, M; Tsuritani, K. Diverzifikace transkripční modulace: rozsáhlá identifikace a charakterizace domnělých alternativních promotorů lidských genů // Genome Res . : deník. - 2006. - Sv. 16 , č. 1 . - str. 55-65 . - doi : 10.1101/gr.4039406 . — PMID 16344560 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. Databáze LIFEdb v roce 2006 // Nucleic Acids Res . : deník. - 2006. - Sv. 34 , č. Problém s databází . - S. D415-D418 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .