Orthohantavirus

Orthohantavirus
Elektronová mikrofotografie viru Sin Nombre
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:NegarnaviricotaPodtyp:PolyploviricotinaTřída:EllioviricetesObjednat:BunyaviralesRodina:HantaviridaeRod:Orthohantavirus
Mezinárodní vědecký název
Orthohantavirus
Baltimorská skupina
V: (-)ssRNA viry
Systematika na Wikispecies Obrázky na Wikimedia Commons NCBI   1980442

Orthohantavirus ( lat.  Orthohantavirus , dříve Hantavirus ) je rod lidských a zvířecích virů z čeledi Hantaviridae (hantaviry) řádu Bunyavirales . Sférické viriony o velikosti od 228 do 5051 nm jsou pokryty lipidovou membránou. Typový kmen byl poprvé popsán v roce 1978. Jako členové řádu Bunyavirales mají orthohantaviry tripartitní fragmentovaný genom negativní jednovláknové RNA . Velký segment genomu kóduje RNA-dependentní RNA polymerázu (replikázu ), střední segment kóduje dva glykoproteiny vnější membrány viru a malý kóduje nukleokapsidový protein . Infekce hantaviry se u obyvatel Evropy a Asie projevuje mírnou formou hemoragické horečky s renálním syndromem , i když v posledních letech byla hlášena úmrtí pacientů s virem orthohantaviru Dobrava -Bělehrad , z toho čtyři případy byly zaznamenány v roce 2009 v Krasnodarské území [2] . Názvy virů jsou přidělovány v souladu s tradicí taxonomie pro arboviry a roboviry  - v souladu s geografickou oblastí, kde byly nalezeny [3] . Od roku 2017, aby nedošlo k záměně v názvech druhů z jednoho regionu u rodu Orthohantavirus , bylo v nich slovo virus nahrazeno slovem orthohantavirus [4] .

Příznaky

Globálně lze rozlišit dvě hlavní kategorie: hantaviry starého světa a hantaviry Nového světa .

Hemoragická horečka s renálním syndromem

Hemoragická horečka s renálním syndromem (HFRS) je skupina klinicky podobných onemocnění způsobených různými typy hantavirů ve Starém světě. Mezi ně patří: orthohantavirus Hantaan , orthohantavirus Puumala , orthohantavirus Dobrava -Belgrade a orthohantavirus Khabarovsk [5] . Úmrtnost na toto onemocnění je v průměru asi 12 %.

Hantavirový kardiopulmonální syndrom

Hantavirový kardiopulmonální syndrom je podobná skupina klinicky podobných onemocnění, která se vyskytují v Severní a Jižní Americe. Tato skupina virů zahrnuje druhy jako Andes orthohantavirus , Laguna Negra orthohantavirus , Rio Segundo virus a Sin Nombre orthohantavirus [6] . Úmrtnost na toto onemocnění dosahuje v průměru až 36 % [7] , i když v některých případech dosahuje 60 %.

Historie objevů

Za první velké setkání s hantaviry je považováno propuknutí nemoci známé jako „korejská hemoragická horečka“. Stalo se to během korejské války v letech 1950-1953. Poté bylo více než 3000 vojáků Organizace spojených národů vystaveno neznámému činiteli, který způsobil vnitřní krvácení a zhoršenou funkci ledvin. Tehdejší úroveň medicíny neumožňovala určit příčinu onemocnění, takže virus zůstal až do roku 1976 neznámý.

Lékařům Lee a Johnsonovi se podařilo izolovat původce z běžné polní myši . Plicní tkáň odchycených hlodavců vykazovala specifickou reakci na krevní sérum u pacientů s korejskou hemoragickou horečkou. Později bylo provedeno srovnání kmenů viru získaných od myší a nemocných lidí. Studie z téhož roku prokázala souvislost mezi propuknutím podobné choroby v Sovětském svazu [5] . V současné době je korejská hemoragická horečka známá jako hemoragická horečka s renálním syndromem a bylo prokázáno, že je způsobena orthohantavirem Hantaan .

K propuknutí nemoci a zahájení prací na studiu hantavirů ve Spojených státech došlo v roce 1993 v oblasti Four Corners v Coloradu . Mladému a fyzicky zdravému zástupci Navahů se náhle udělalo nevolno, začal se dusit a přes veškerou snahu lékařů zemřel. Vyšetřování ukázalo, že pár dní před incidentem zemřela na podobné příznaky i mladíkova snoubenka. Během krátké doby bylo zaznamenáno pět podobných úmrtí. Vědci z amerického Centra pro kontrolu a prevenci nemocí použili k určení zdroje novou metodu molekulární analýzy virů. Virus se ukázal jako nový, dosud neznámý druh hantaviru. Následně byl virus pojmenován Sin Nombre virus ze španělštiny pro „bezejmenný virus“ [8] .

Klasifikace

Druhy registrované u ICTV

Druhy rodu se jen málo podobají jiným skupinám virů. První klasifikace rodu Hantavirus byla navržena v roce 1987 ve zprávě pro Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV). Následně se zařazení změnilo z důvodu rozšíření a korekce druhové skladby. V roce 2017 byl v souvislosti s popisem řádu Bunyavirales rod vyčleněn do monotypické čeledi Hantaviridae , název byl změněn na Orthohantavirus [9] a bylo do něj zařazeno 41 druhů [4] :

Druhy čekající na registraci u ICTV

Každým rokem se počet objevených hantavirů zvyšuje. Jsou uznávány buď jako typové kmeny nových druhů nebo odrůdy jiných druhů. Od března 2017 mohou být viry, které mohou být zahrnuty do rodu Orthohantavirus , [4] :

• Altajský virus
• Virus Camp Ripley
• virus isla vista
• Virus Jemez Springs
• virus Kilimandžáro
• Muleshoe virus
• Virus Qian Hu Shan
• Virus Rio Segundo
• Virus Shenyang
• Virus Serang
• Uluguru virus
• virus Ussuri
• virus Xinyi
• virus xuan son
• virus Yuanjiang

Dopravci

Hantaviry jsou roboviry , což znamená, že se šíří prostřednictvím hlodavců . Kromě toho jsou známy případy, kdy k infekci došlo po kousnutí některých druhů hmyzožravých netopýrů [12] . Různé typy virů mají úzké vazby se svými nosiči a přeměňují je v přirozené rezervoáry . Nyní neexistuje přesná odpověď, zda nosiče virů ovlivňují jejich tvorbu druhů. Některé studie naznačují, že hantaviry se adaptují na nového hostitele, a tím mění strukturu své RNA a vytvářejí nové druhy [13] [14] [15] . Jiné studie ukazují, že rychlost mutací RNA virů odpovídá mutacím u jiných virů s podobnou strukturou, z čehož se usuzuje, že hypotéza o společném vývoji je nepravdivá [16] [17] .

Ve většině případů přírodní rezervoár nevykazuje žádné známky onemocnění jejich nativním hantavirem [18] (výjimkou je virus Puumala, který v některých případech vede ke smrti přenašeče [19] ). Při infekci alternativními typy hantavirů jej dospělí hlodavci během 25–50 dnů zcela odstraní z těla, u mladých jedinců je však infekce nejčastěji smrtelná [20] .

Studie provedená v roce 2010 na území Eurasie, Severní a Jižní Ameriky ukázala, že všechny typy hantavirů lze rozdělit do 3 globálních skupin podle podčeledí hlodavců, kteří jsou jejich přenašeči: myši , hraboši , křečci bavlníkové [21] .

Převod na osobu

Nejčastěji k nákaze člověka hantavirem dochází kontaktem s hlodavci nebo jejich odpadními produkty (moč, sliny, plicní sekrety a trus). Častěji se infekce vyskytuje v teplých a suchých obdobích, kdy lidé ve velkém chodí na procházky do lesa. Virus se do lidského těla dostává různými způsoby [22] :

• Vdechování mikročástic trusu spolu s prachem ve vzduchu, například při vstupu do opuštěných nebo zakonzervovaných prostor, včetně stodol, garáží a skladů.
• Konzumace močí kontaminované vody a potravin.
• Nejmenší pravděpodobnost přenosu tohoto viru je přímý kontakt s přenašečem (kousnutí hlodavcem).

Přenos onemocnění z člověka na člověka není pro hantaviry charakteristický. Přesto k takovým případům dochází, ale byly zaznamenány pouze v Argentině [23] a Chile [24] .

Diagnostika

V současné době se pro sérologickou diagnostiku hantavirových infekcí používá pouze nukleokapsidový protein . V klinické praxi se pro primární detekci infekce a její sledování široce využívá protilátková sérodiagnostika ve formě nepřímého enzymového imunoanalýzy (ELISA).

Studie hantavirů v Rusku

Studium hemoragické horečky s renálním syndromem začalo v Rusku před více než 70 lety. Původci tohoto onemocnění jsou viry Puumala , Hantaan , Soul a Dobrava-Belgrade . Mezi ně patří kromě patogenů pro člověka také viry s dosud neprokázanými epidemiologickými charakteristikami. Na území Ruska cirkuluje mezi malými savci minimálně 8 sérotypů hantavirů.

Nejčastější přirozenou fokální infekcí v Rusku je hantavirová infekce ve formě hemoragické horečky s renálním syndromem. Podle Rospotrebnadzor bylo v roce 2006 registrováno 7197 případů onemocnění jeho obyvatel ve 48 regionech Ruské federace, míra výskytu  byla 5 případů na 100 tisíc obyvatel, což je o 1,4 % méně než v roce 2005, ale mezi dětmi do čtrnácti let se incidence zvýšila o 17,3 %, celkový počet nemocných v této skupině je 195 osob; výskyt hantavirů je více než 10–100krát vyšší než výskyt klíšťové encefalitidy , vztekliny a dalších obvyklých přirozených fokálních infekcí [25] .

Prevence a kontrola infekcí

V současnosti neexistuje na hantaviry účinná léčba kromě zmírnění příznaků a také podpory přirozené imunity organismu. V případě hantavirového kardiopulmonálního syndromu jsou pacienti okamžitě převezeni do nemocnice a pomocí kapalného kyslíku a mechanické ventilace jim pomáhá obnovit dýchací funkce [26] .

V případě HFRS je zavedeno kontinuální sledování pacienta - zohlednění vstříknutých a ztracených tekutin (zabránění dehydrataci ), je zavedena dieta č. 4 , po které se provádí: detoxikační profylaxe, antivirová terapie, antioxidační terapie , stejně jako prevence a léčba infekčně-toxického šoku [27] .

Deratizace je nejlepší způsob, jak zabránit infekci hantavirem, protože k infekci člověka dochází přímým kontaktem s tělesnými tekutinami a trusem. Pomáhá také ničit hnízda hlodavců, odstraňuje všechny možné trhliny a díry v domě, kterými se hlodavci mohou dostat dovnitř. Dobrým pomocníkem v prevenci nemocí mohou být i domácí predátoři, jako jsou kočky a fretky.

V letech korejské války (1949-1953) se hantavirová infekce jasně projevila, což přimělo vědce, aby ihned po objevení hantavirů začali pracovat na vytvoření vakcíny. V prvních letech byly používány tradičně vyvinuté antivirové vakcíny založené na inaktivovaných celovirionových materiálech nebo oslabených kmenech, ale kvůli obtížím při získávání lyzátů hantaviru s vysokým titrem byly u kandidátských vakcín proti hemoragické horečce s renálním syndromem použity také nekonvenční přístupy.[ co? ] . Nejvyzkoušenější a nejpoužívanější je usmrcená vakcína Hantavax , vyvinutá Institutem virových chorob v Jižní Koreji. V Číně se testují čtyři různé vakcíny. V Evropě vytvořil Institut lékařské virologie v Německu vakcínu na bázi chimérických částic viru Puumala a vakcíny na bázi rekombinantních proteinů [28] [29] . Od 90. let 20. století se Podnik na výrobu bakteriálních a virových přípravků IPVE pojmenoval po. MP Chumakova vyvíjí vakcínu založenou na substrátu mozkové tkáně křečků syrských [30] .

Poznámky

1. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
2. ↑ Boris Klempa, Jevgenij A. Tkačenko, Tamara K. Dzagurová, Julia V. Yunicheva, Vjačeslav G. Morozov. Hemoragická horečka s renálním syndromem způsobeným 2 liniemi Dobrava Hantavirus, Rusko  // Vznikající infekční onemocnění. — 2008-04. - T. 14 , č.p. 4 . — S. 617–625 . — ISSN 1080-6059 1080-6040, 1080-6059 . – doi : 10.3201/eid1404.071310 . Archivováno z originálu 4. července 2012.
3. ↑ Plusnin A. , Vaheri A. Saaremaa Hantavirus by neměl být zaměňován s jeho nebezpečným příbuzným, virem Dobrava  //  Journal of Clinical Microbiology: journal. - 2006. - Duben ( č. 44 ). — S. 1608 . - doi : 10.1128/JCM.44.4.1608-1611.2006 . .
4. ↑ 1 2 3 V rodu Hantavirus (navržená čeleď Hantaviridae , navrhovaný řád Bunyavirales ) vytvořte 24 nových druhů, zrušte 7 druhů, změňte demarkační kritéria a změňte název rodu na Orthohantavirus ; podobně přejmenujte jeho základní druh  : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělený kód: 2016.023a-cM. - 2016. - S. 8, 14-15.
5. ↑ 1 2 Lee H. W. , Lee P. W. , Johnson K. M. Izolace etiologického agens korejské hemoragické horečky  //  Transactions of the Royal Society of Tropical Medicine and Hygiene: Journal. - 1978. - březen ( č. 137 ). - str. 298-308 .
6. ↑ Padula P. J. , Colavecchia S. B. , Martinez V. P. , Gonzalez Della Valle M. O. , Edelstein A. , Miguel S. D. L. , Russi J. , Mora Riquelme J. , Colucci N. , Almiron M. , Rabinovich Genetics of Divers and D. Features Hantavirová infekce v pěti zemích Jižní Ameriky  (anglicky)  // Journal of Clinical Microbiology: journal. - 2000. - srpen ( č. 38 ). - S. 3029-3035 .
7. ↑ Hlášené případy HPS: HPS ve Spojených státech . Centra pro kontrolu a prevenci nemocí (CDC) (21. dubna 2014). Získáno 21. listopadu 2015. Archivováno z originálu 26. srpna 2017. (neurčitý)
8. ↑ Fulhorst C. F. , Monroe M. C. , Salas R. A. , Duno G. , Utrera A. , Ksiazek T. G. , Nichol S. T. , de Manzione N. M. , Tovar D. , Tesh R. B. Izolace, charakterizace a geografické rozšíření viru South Cañ v Americe, nově objevená geografická distribuce viru South Cañ hantavirus (čeleď Bunyaviridae)  (anglicky)  // Výzkum virů: časopis. - 1997. - říjen ( č. 51 ). - S. 159-171 .
9. ↑ Vytvořte nový řád Bunyavirales pro devět rodin (osm nových, jedna přejmenovaná) obsahující třináct rodů  : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělený kód: 2016.030a-vM. - 2016. - 5., 13. str.
10. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Implementace nelatinizovaných binomických jmen druhů v čeledi Bunyaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělený kód: 2015.003 hod. - 2015. - S. 3-4.
11. ↑ Seznam mikroorganismů, toxinů, zařízení a technologií podléhajících kontrole vývozu  : [schváleno. Dekret prezidenta Ruské federace ze dne 20. srpna 2007 č. 1083]: úřední. text: zpřístupněno 1. června 2016
12. ↑ Guo W. P. , Lin X. D. , Wang W. , Tian J. H. , Cong M. L. , Zhang H. L. , Wang M. R. , Zhou R. H. , Wang J. B. , Li M. H. , Xu J. , Holmes E. Yantas netopýří viry původem z hylbored , Phylborshanges , původem Phylborshanges virus hmyzožravci a hlodavci  (anglicky)  // PLoS Pathogens: journal. - 2013. - únor ( č. 9 ). - doi : 10.1371/journal.ppat.1003159 . .
13. ↑ Hughes A. L. , Friedman R. Evoluční diverzifikace genů hantavirů kódujících protein   // Molekulární biologie a evoluce : časopis. - Oxford University Press , 2000. - říjen ( č. 17 ). - S. 1558-1568 .
14. ↑ Plyusnin A. , Morzunov S. P. Evoluce virů a genetická diverzita hantavirů a jejich hostitelů hlodavců  (anglicky)  // Current Topics in Microbiology and Immunology : journal. - 2001. - Ne. 256 . - str. 47-75 .
15. ↑ Jackson A. P. , Charleston M. A. Kofylogenetická perspektiva evoluce RNA-virů  //  Molekulární biologie a evoluce : časopis. - Oxford University Press , 2004. - Leden ( č. 21 ). - str. 45-57 .
16. ↑ Ramsden C. , Melo F. L. , Figueiredo L. M. , Holmes E. C. , Zanotto P. M. , VGDN Consortium. Vysoká rychlost molekulární evoluce u hantavirů   // Molekulární biologie a evoluce : časopis. — Oxford University Press , 2008. — Červenec ( č. 25 ). - S. 1488-1492 . - doi : 10.1093/molbev/msn093 . .
17. ↑ Ramsden C. , Holmes E.C. , Charleston M.A. Evoluce hantaviru ve vztahu k jeho hlodavcům a hmyzožravým hostitelům  : žádný důkaz kodivergence  // Molekulární biologie a evoluce : časopis. - Oxford University Press , 2009. - Leden ( č. 26 ). - S. 143-153 . - doi : 10.1093/molbev/msn234 . .
18. ↑ B. Fildis , D. Knipe. Virologie. - M .: Mir, 1989. - T. 1. - S. 272-273. — ISBN 5-03-000283-9 . .
19. ↑ Kallio ER, Voutilainen L., Vapalahti O., Vaheri A., Henttonen H., Koskela E., Mappes T. Endemická infekce hantavirem zhoršuje zimní přežití hostitele hlodavců  //  Ekologie: časopis. - 2007. - Srpen ( roč. 88 , č. 8 ). - S. 1911-1916 . - doi : 10.1890/06-1620.1 . — PMID 17824420 . . PMID 17824420 .
20. ↑ Schountz T. , Quackenbuch S. , Rovnak J. , Haddock E. , Black W. C. IV , Feldman H. , Prescott J. Diferenciální lymfocytární a protilátkové odezvy u jeleních myší infikovaných Sin Nombre Hantavirus nebo Andes   Hantavirus // - 2014. - srpen ( č. 88 ). - S. 8319-8331 .
21. ↑ Jonsson CB , Figueiredo LT , Vapalahti O. Globální pohled na ekologii, epidemiologii a epidemiologii hantavirů  //  Recenze klinické mikrobiologie: časopis. - 2010. - Duben ( č. 23 ). - str. 412-441 . - doi : 10.1128/CMR.00062-09 . .
22. ↑ Jak lidé dostanou Hantavirový plicní syndrom (HPS  ) . cdc.gov. Získáno 24. listopadu 2015. Archivováno z originálu dne 21. března 2021.
23. ↑ Padula P. J. , Edelstein A. , Miguel S. D. , López N. M. , Rossi C. M. , Rabinovich R. D. Propuknutí plicního syndromu Hantaviru v Argentině: molekulární důkazy přenosu viru And z člověka na člověka  //  Virology : journal. - 1998. - únor ( č. 241 ). - str. 323-330 .
24. ↑ Toro J. , Vega J. D. , Khan A. S. , Mills J. N. , Padula P. , Terry W. , Yadón Z. , Valderrama R. , Ellis B. A. , Pavletic C. , Cerda R. , Zaki S. , Shieh W. J. , Meyer R. , Meyer R. . , Tapia M. , Mansilla C. , Baro M. , Vergara J. A. , Concha M. , Calderon G. , Enria D. , Peters C. J. , Ksiazek T. G. An outbreak of hantavirus pulmonary syndrome, Chile, 1997  (anglicky)  // Virology : deník. - 1998. - 10-12 ( č. 4 ). - str. 687-694 .
25. ↑ Výnos hlavního státního sanitáře Ruské federace ze dne 13. června 2007 č. 33 „O opatřeních k prevenci onemocnění osob s hemoragickou horečkou s renálním syndromem“ . Získáno 29. listopadu 2020. Archivováno z originálu dne 24. července 2018. (neurčitý)
26. ↑ Safronetz D. , Ebihara H. , Feldmann H. , Hooper J. W. The Syrian hamster model of hantavirus pulmonary syndrome  (anglicky)  // Antiviral Research : journal. - 2012. - září ( č. 95 ). - str. 282-292 . doi : 10.1016 / j.antiviral.2012.06.002 . .
27. ↑ Khunafina D.Kh., Galiyeva A.T. , Burganova A.N. , Syrtlanova G.R. Hemoragická horečka s renálním syndromem  (anglicky)  // International Journal of Experimental Education: Journal. - 2010. - Ne. 12 . - str. 31-32 .
28. ↑ Maes P. , Clement J. , Van Ranst M. Současné přístupy ve vývoji vakcín proti hantavirům  //  Vznikající infekční choroby : časopis. - Centra pro kontrolu a prevenci nemocí , 2009. - Leden ( č. 8 ). - str. 67-76 . - doi : 10.1586/14760584.8.1.67 . .
29. ↑ Schmaljohn C. Vakcíny proti hantavirům  //  Vaccine: Journal. - 2009. - 5. listopadu ( č. 27 ). - str. 61-64 . - doi : 10.1016/j.vaccine.2009.07.096 . .
30. ↑ Vakcíny proti HFRS // Vznik a kontrola virových onemocnění přenášených hlodavci, Francie, Elsevier. 1999, 147-156.

Taxonomie	GBIF NCBI IRMNG