Bunyavirales
Bunyavirales |
---|
Tkáňové místo infikované flebovirem horečky Rift Valley |
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:NegarnaviricotaPodtyp:PolyploviricotinaTřída:EllioviricetesObjednat:Bunyavirales |
Bunyavirales |
- Feraviridae
- Fimoviridae
- Hantaviridae
- Jonviridae
- Nairoviridae
- Peribunyaviridae
- Phasmaviridae
- Phenuiviridae
- Tospoviridae
|
V: (-)ssRNA viry |
|
Bunyavirales ( latinsky , z názvu lokality Bunyamvera v Ugandě [2] ) je řád virů izolovaný v roce 2016. Genom je reprezentován jednovláknovou (-) RNA (většina rodů) nebo (+/-) RNA. Některé viry tohoto řádu, které se vyskytujíu členovců , hlodavců a jiných savců , mohou infikovat lidi, některé mohou infikovat rostliny .
Zástupci Bunyavirales jsou přenosné viry. S výjimkou hantavirů dochází k přenosu viru členovci (od klíšťat , komárů , komárů ). Pravděpodobnost infekce závisí na ročním období, například viry přenášené komáry způsobují infekci častěji v letních měsících.
Virion
Bunyavirales viriony mají podobný tvar jako viriony virů z čeledi Paramyxoviridae , jsou pokryty skořápkou obsahující lipid s hroty a mají průměr asi 80-120 nm.
Genom
Genom se skládá ze tří molekul RNA: velké (L), střední (M) a malé (S). Genomické RNA jsou jednovláknové, negativní nebo variabilní (+/-) polarity. Dlouhá RNA kóduje RNA-dependentní RNA polymerázu nezbytnou pro replikaci a syntézu mRNA, 247 kDa, asi 25 molekul na virion. Střední RNA kóduje glykoproteiny viru. Krátký kóduje N nukleokapsidový protein, který je ve virionu přítomen v množství asi 2000 kusů.
Genom má délku 10,5 až 22,7 tisíc nukleotidů .
Replikace
Genomická (-) RNA virů se replikuje nejprve do antigenomické (+) RNA a poté do (-) mRNA. K replikaci dochází v cytoplazmě hostitelské buňky. Virové proteiny pak vstupují do endoplazmatického retikula a Golgiho aparátu . Zralé viriony vyrážejí z membrán Golgiho aparátu a jsou transportovány do plazmatické membrány.
Diagnostika a léčba
Během akutní fáze je možné diagnostikovat IgG a IgM pomocí ELISA , stejně jako PCR . Byly vyvinuty celovirionové a inaktivované vakcíny a je po nich relativně nízká poptávka. Lék ribavirin snižuje mortalitu.
Historie taxonomie
První druh, Bunyamwera virus (od roku 2015 - Bunyamwera orthobunyavirus ), byl zaregistrován v roce 1975 jako součást monotypického rodu Bunyavirus a čeledi bunyavirů [2] nebo bunyavirů [3] ( Bunyaviridae ) [4] . Již v příštím roce bylo do rodu zařazeno dalších 86 druhů [5] a do budoucna se počet taxonů v čeledi jen zvyšoval. V roce 2015 (schváleno v roce 2016), aby nedošlo k záměně v podobných názvech druhů ze stejného regionu, bylo provedeno hromadné přejmenování, u kterého bylo slovo virus v názvu druhu nahrazeno názvem rodu [6] . V roce 2016 (schváleno v roce 2017) byl na návrh skupiny Bunyaviridae Mezinárodního výboru pro taxonomii virů identifikován nový řád Bunyavirales [7] a byly provedeny následující změny:
- Řád zahrnuje 8 nových čeledí a čeleď Bunyaviridae , přejmenovanou na Peribunyaviridae [8] ;
- Řád zahrnuje 2 rody, jejichž taxonomická pozice byla dříve nejasná ( incertae sedis ): Emaravirus , Tenuivirus [9] ;
- 4 rody z čeledi Bunyaviridae byly převedeny do jiných čeledí se změnami jména nebo bez nich: Phlebovirus , Hantavirus, Nairovirus, Tospovirus [10] ;
- Přejmenované druhy podle nových rodových jmen [11] [12] ;
- Řád zahrnuje nové rody a druhy [13] [14] [15] ;
- Odstraněny (prohlášeny za mladší synonyma) některé druhy [16] .
Klasifikace
Od května 2020 je v objednávce zahrnuto 12 rodin [17] :
- Čeleď Arenaviridae - Arenaviry
- Rod Antennavirus (2 druhy)
- Rod Hartmanivirus (4 druhy)
- Rod Mammarenavirus (39 druhů)
- Rod Reptarenavirus (5 druhů)
- Čeleď Cruliviridae
- Čeleď Fimoviridae
- Rod Emaravirus (11 druhů)
- Čeleď Hantaviridae
- Podčeleď Actantavirinae
- Rod Actinovirus (3 druhy)
- Podčeleď Agantavirinae
- Rod Agnathovirus (1 druh)
- Podčeleď Mammantavirinae
- Rod Loanvirus (2 druhy)
- Rod Mobatvirus (3 druhy)
- Rod Orthohantavirus (36 druhů)
- Rod Thottimvirus (2 druhy)
- Podčeleď Repantavirinae
- Rod Reptillovirus (1 druh)
- Čeleď Leishbuviridae
- Čeleď Mypoviridae
- Čeleď Nairoviridae
- Rod Orthonairovirus (15 druhů)
- Rod Shaspivirus (1 druh)
- Rod Striwavirus (1 druh)
- Čeleď Peribunyaviridae
- Rod Herbevirus (3 druhy)
- Rod Orthobunyavirus — Orthobunyaviry [18] (88 druhů)
- Rod Pacuvirus (5 druhů)
- Rod Shangavirus (1 druh)
- Čeleď Phasmaviridae
- Rod Feravirus (1 druh)
- Rod Jonvirus (1 druh)
- Rod Orthophasmavirus (9 druhů)
- Rod Sawastrivirus (1 druh)
- Rod Wuhivirus (1 druh)
- Čeleď Phenuiviridae
- Rod Bandavirus (7 druhů)
- Rod Beidivirus (1 druh)
- Rod Coguvirus (2 druhy)
- Rod Entovirus (1 druh)
- Rod Goukovirus (3 druhy)
- Rod Horwuvirus (1 druh)
- Rod Hudivirus (1 druh)
- Rod Hudovirus (1 druh)
- Rod Ixovirus (3 druhy)
- Rod Laulavirus (1 druh)
- Rod Lentinuvirus (1 druh)
- Rod Mobuvirus (1 druh)
- Rod Phasivirus (5 druhů)
- Rod Phlebovirus (60 druhů)
- Rod Pidchovirus (1 druh)
- Rod Rubodvirus (2 druhy)
- Rod Tenuivirus (8 druhů)
- Rod Uukuvirus (17 druhů)
- Rod Wenrivirus (1 druh)
- Čeleď Tospoviridae
- Rod Orthotospovirus (26 druhů)
- Čeleď Wupedeviridae
Viz také
Poznámky
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ 1 2 Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: Učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 130. - 236 s. — ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Biologický encyklopedický slovník / Ch. vyd. M. S. Gilyarov ; Redakce: A. A. Baev , G. G. Vinberg , G. A. Zavarzin a další - M . : Sov. Encyklopedie , 1986. - S. 84. - 831 s. — 100 000 výtisků.
- ↑ Zápis ze třetího zasedání ICTV konaného v Madridu, 12. a 16. září 1975 : [ eng. ] // ICTV. - Madrid, 1975. - S. 4.
- ↑ Virus Taxonomy: 1976 Release on the International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) website (Accessed 1 June 2020) .
- ↑ Implementace nelatinizovaných binomických jmen druhů v čeledi Bunyaviridae : [ eng. ] // ICTV. — Přidělený kód: 2015.003 hod. - 2015. - 15 s.
- ↑ 2016.030a-vM, 2016 , str. 5.
- ↑ 2016.030a-vM, 2016 , str. 3, 5, 16-17.
- ↑ 2016.030a-vM, 2016 , str. 8-9, 11-12.
- ↑ 2016.030a-vM, 2016 , str. 10, 13-15.
- ↑ 2016.030a-vM, 2016 , str. osmnáct.
- ↑ 2016.023a-cM, 2016 , str. osm.
- ↑ 2016.023a-cM, 2016 , str. 3-5.
- ↑ Čtyři (4) nové druhy v jednom novém rodu ( Herbevirus ) v Bunyaviridae , řád Bunyavirales : [ eng. ] // ICTV. — Přidělený kód: 2016.024a-dM. - 2016. - 20:00
- ↑ Čtyři (4) nové druhy v jednom (1) novém rodu ( Phasivirus ) v navrhované čeledi Phenuiviridae v navrhovaném řádu Bunyavirales : [ eng. ] // ICTV. — Přidělený kód: 2016.027a-dM. - 2016. - 19:00
- ↑ 2016.023a-cM, 2016 , str. 6-7.
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 1. června 2020) .
- ↑ Makarov V.V., Gulyukin M.I., Lvov D.K. Zoopatogenní orthobunyaviry ( Orthobunyavirus , Bunyaviridae) // Problémy virologie. - 2016. - T. 61 , č. 2 . - S. 53-58 . - doi : 10.18821/0507-4088-2016-61-2-53-58 .
Literatura
Odkazy
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|