Metaviridae
Metaviridae je rodina virů , které existují jako Ty3-gypsy LTR retrotranspozony v eukaryotickém hostitelskémgenomu [2] . Jsou blízce příbuzné retrovirům : členové čeledi Metaviridae sdílejí mnoho genomových prvků s retroviry, včetně délky, organizace a samotných genů. To zahrnuje geny kódující reverzní transkriptázu , integrázu a kapsidové proteiny. Proteiny reverzní transkriptázy a integrázy jsou nezbytné pro retrotransposonovou aktivitu viru. V některých případech mohou být z kapsidových proteinů vytvořeny částice podobné virům [3] .
Některé shromážděné částice podobné viru ze členů čeledi Metaviridae mohou vstoupit do dříve neinfikovaných buněk a infikovat je. Příkladem toho je cikán, retroelement nalezený v genomu Drosophila melanogaster . Schopnost infikovat další buňky je určena přítomností retrovirových genů env , které kódují obalové proteiny.
Metaviridae je čeleď retrotranspozonů nalezených u všech známých a studovaných eukaryot. Viry v této rodině se množí prostřednictvím meziproduktů nazývaných částice podobné virům, které jsou známé svou schopností vyvolat mutace a sekvenování genomu. Členové čeledi Metaviridae jsou často označováni jako LTR retrotranspozony z čeledi Ty3-gypsy. Mezi členy jsou pouze druhy, které produkují intracelulární částice, celkový počet těchto částic je heterogenní. Extracelulární částice jsou obklopeny oválnými jádry a nazývají se viriony. V mnoha systémech jsou viriony charakterizovány biochemicky. Retrotransposonové genomy této rodiny jsou RNA s pozitivním řetězcem. Kromě RNA genomu mohou být některé buněčné RNA náhodně asociovány s částicemi, včetně specifických tRNA, v případě virové replikace připravené tRNA. Frakce částic z buněk jsou heterogenní, pokud jde o zrání, a jsou proto kromě genomové RNA spojeny s transkripčními meziprodukty a produkty reverzní transkripce. Pokud jde o členy produkující viriony, ukazuje se, že virionová membrána pochází z membrány hostitelské buňky.
Taxonomie
Čeleď Metaviridae se dělí do následujících rodů:
- Rod Metavirus
- Rod Errantivirus
Řád Ortervirales je tvořen čeledí Metaviridae , Belpaoviridae , Pseudoviridae , Retroviridae a Caulimoviridae [4] .
Reference
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Llorens, C (listopad 2020). „Profil taxonomie viru ICTV: Metaviridae “. The Journal of General Virology . 101 (11): 1131-1132. DOI : 10.1099/jgv.0.001509 . PMID 33048045 .
- ↑ Zpráva ICTV Metaviridae . (neurčitý)
- ↑ Krupovic, M (4. dubna 2018). „ Ortervirales : Nový řád virů sjednocující pět rodin reverzně přepisujících virů“ (PDF) . Virologický časopis . 92 (12). DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642 . _
Odkazy
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|
Retroviry |
---|
ssRNA-RT-viry | Retroviry | Alfaretroviry |
- Virus ptačí erytroleukémie
- Virus Rousova sarkomu
- …
|
---|
Betaretroviry |
- Jaagsiekte ovčí retrovirus
- virus myšího nádoru mléčné žlázy
- …
|
---|
Gammaretroviry |
- Virus kočičí leukémie
- Virus myší leukémie
- Abelsonův virus myší leukémie
- kamarádský virus
- Xenotropní virus myší leukémie související s virem
- Koala retrovirus
- …
|
---|
Deltaretroviry |
- Virus bovinní leukémie
- T-lymfotropní virus primátů 1
- T-lymfotropní virus primátů 2
- T-lymfotropní virus primátů 3
|
---|
Epsilonretroviry |
- Virus Walleye epidermální hyperplazie
- …
|
---|
Lentiviry |
|
---|
Spumaretrovirinae |
- Bovispumavirus
- Equipumavirus
- Felispumavirus
- Prosimiiispumavirus
- Simiispumavirus
|
---|
|
---|
jiný |
|
---|
|
---|
dsDNA-RT-viry |
|
---|
Endogenní |
- ERVWE1
- HCP5
- Virus odvozený od lidského teratokarcinomu
|
---|