Caudovirales
Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od
verze recenzované 9. července 2019; kontroly vyžadují
5 úprav .
Caudovirales ( lat. , od cauda - tail ) - řád virů obsahujících DNA - bakteriofágů , jejichž viriony mají ikosaedrický tvar hlavy a spirálovitý ocas.
Genom je reprezentován jednou nesegmentovanou lineární dvouvláknovou molekulou DNA . Lineární molekula může někdy nabýt prstencového tvaru; jednovláknové mezery se mohou vyskytovat i ve dvouvláknové struktuře. Konce molekuly jsou kovalentně spojeny s koncovými proteiny. Genom může obsahovat od 18 do 500 tisíc párů bází a kóduje strukturální i nestrukturální proteiny [2] .
Řád zahrnuje velké množství virů [3] , z nichž mnohé mají podobné geny, ale jejich sekvence se může výrazně lišit i v rámci stejného rodu. Společný původ je posuzován podle charakteristické struktury virových částic.
V roce 2016 byla na návrh podvýboru pro bakteriální a archaální viry Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) změněna vědecká jména zástupců řádu a dalších bakteriofágů:
- ze jmen rodů byly odstraněny kombinace jako a phi [4] ;
- v názvech druhů bylo slovo fág nahrazeno virem jako uznání skutečnosti, že bakteriofágy jsou obyčejné viry ; objasnil infikované organismy na název rodu, odstranil konkrétní názvy prokaryot a pomlčky; odstranil kombinaci phi tam, kde neexistuje žádný historický důvod pro její přítomnost [5] .
Klasifikace
Od dubna 2018 jsou v objednávce zahrnuty následující rodiny a podrodiny [3] :
- Ackermanviridae
- Autographiviridae
- Chaseviridae
- Demerecviridae
- Drexlerviridae
- Guelinviridae
- Herelleviridae
- Myoviridae
- Podoviridae
- Rountreeviridae
- Salasmaviridae
- Schitoviridae
- Siphoviridae
- Zobellviridae
- Incertae sedis
Poznámky
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Správa ICTVdB (2006). 02. Caudovirales. Archivováno 15. června 2010 na Wayback Machine In: ICTVdB - The Universal Virus Database, verze 4. Büchen-Osmond, C. (Ed), Columbia University, New York, USA
- ↑ 1 2 Taxonomy of Viruses (anglicky) na stránkách International Committee on the Taxonomy of Viruses (ICTV) . (Přístup: 10. 5. 2018) .
- ↑ Přejmenování všech rodů fágů : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělený kód: 2015.006aB. - 2015. - 17:00
- ↑ Přejmenování všech (522) existujících bakteriálních virů a 2 druhů archaálních virů : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělený kód: 2015.025aB. - 2015. - 18:00
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|