Poliomaviry
Poliomaviry |
---|
Mikrofotografie buňky infikované poliomavirem - velká modrá buňka vlevo pod středem. vzorek moči |
Skupina:Viry [1]Oblast:MonodnaviriaKrálovství:ShotokuviraeTyp:cossaviricotaTřída:PapovaviricetesObjednat:SepolyviralesRodina:Poliomaviry |
Polyomaviridae |
- Alfapolyomavirus
- Betapolyomavirus
- Gamapolyomavirus
- Deltapolyomavirus
|
I: dsDNA viry |
|
Polyomaviry [2] ( lat. Polyomaviridae ) jsou čeledí neobalených virů . Patří do I. skupiny klasifikace virů podle Baltimoru . V souladu s revizí schválenou Mezinárodním výborem pro taxonomii virů (ICTV) v roce 2016 zahrnuje 4 rody [3] .
Historie výzkumu
Myší polyomavirus byl popsán v roce 1953 Ludwikem Grossem [4] . Později bylo popsáno mnoho polyomavirů, které infikují ptáky a savce . Rod Polyomavirus , který je spojuje, byl nejprve přiřazen do čeledi Papovaviridae a od roku 1999, po oddělení poslední jmenované, do čeledi Polyomaviridae [5] .
Polyomaviry jsou široce studovány jako tumorigenní viry pro lidi a zvířata. Protein p53 , nádorový supresor, byl například izolován jako buněčný protein spojený s velkým T antigenem viru SV40 .
Popis
Polyomaviry jsou viry obsahující DNA ( genom je kruhová dvouvláknová DNA dlouhá asi 5000 párů bází), viriony jsou malé, o průměru asi 40-50 nm, dvacetistěnného tvaru, nepokryté lipidovou membránou. Viry jsou obvykle onkogenní, často latentní v organismu hostitele a nezpůsobují onemocnění, ale tvoří nádory v organismech jiných druhů, nebo v případě imunitní nedostatečnosti hostitele. Kořen "polyoma" v názvu viru naznačuje, že viry mohou způsobit mnohočetné nádory.
Velké a malé T antigeny
Velký T antigen hraje důležitou roli v regulaci životního cyklu viru vazbou na virovou DNA a zvýšením její replikace . Pro replikaci vyžadují polyomaviry enzymy pro metabolismus nukleových kyselin buňky, replikace genomové virové DNA je proto možná pouze v S-fázi buněčného cyklu. Velký T antigen se váže na proteiny řídící buněčný cyklus a stimuluje zahájení replikace DNA [6] . Dělá to inhibicí genu potlačujícího nádor p53 a genů rodiny retinoblastomů . V tomto případě je buněčné dělení stimulováno vazbou na buněčnou DNA, helikázu , DNA polymerázu α a faktory pre-iniciace transkripce [7] . Takové změny v buněčném cyklu vedou k onkogenní transformaci.
Malý T antigen také aktivuje několik buněčných drah, které stimulují buněčnou proliferaci , jako je mitogenem aktivovaná proteinkináza ( MAPK ) a stresem aktivovaná proteinkináza ( SAPK ) [8] [ 9] .
Klasifikace
V roce 2015 rod Polyomavirus , v té době jediný v rodině polyomavirů, zahrnoval 13 druhů [10] . V důsledku revize z roku 2016 byly v rodině vytvořeny 4 nové rody a zahrnuto 68 nových druhů [11] , rod Polyomavirus a 5 starých druhů bylo vypuštěno ( polyomavirus africké zelené opice, polyomavirus paviána 2, lidský polyomavirus, králičí ledvina vakuolizující virus, Simian virus 12 ) [12] a zbytek druhů byl rozdělen do nových rodů a změnil se jejich jména [13] . Podle ICTV je od března 2017 klasifikace rodiny následující [14] :
- Rod Alphapolyomavirus (37 druhů)
- Mesocricetus auratus polyomavirus 1 [ syn. Křeččí polyomavirus ]
- Mus musculus polyomavirus 1 [syn. myší polyomavirus ]
- Rod Betapolyomavirus (29 druhů)
- Lidský polyomavirus 1 [syn. B.K. polyomavirus ]
- Lidský polyomavirus 2 [syn. JC polyomavirus ]
- Macaca mulatta polyomavirus 1 [syn. Simian virus 40 ]
- Mus musculus polyomavirus 2 [syn. Myší pneumotropní virus ]
- Rod Gammapolyomavirus (7 druhů)
- Aves polyomavirus 1 [syn. Polyomavirus onemocnění mláděte andulky ]
- Rod Deltapolyomavirus (4 druhy)
- Species incertae sedis (3 druhy)
- Bos taurus polyomavirus 1 [syn. bovinní polyomavirus ]
Lidské polyomaviry
Od roku 2016 bylo hlášeno 13 typů polyomavirů, které infikovaly lidi:
Pohled |
Rod |
Název druhu před rokem 2016 [15] |
Kód
|
Lidský polyomavirus 1 |
Betapolyomavirus |
BK polyomavirus |
BKPyV
|
Lidský polyomavirus 2 |
Betapolyomavirus |
JC polyomavirus |
JCPyV
|
Lidský polyomavirus 3 |
Betapolyomavirus |
KI polyomavirus |
KIPyV [16]
|
Lidský polyomavirus 4 |
Betapolyomavirus |
WU polyomavirus |
WUPyV [16]
|
Lidský polyomavirus 5 |
Alfapolyomavirus |
Polyomavirus z Merkelových buněk |
MCPyV [17]
|
Lidský polyomavirus 6 |
Deltapolyomavirus |
— |
—
|
Lidský polyomavirus 7 |
Deltapolyomavirus |
— |
—
|
Lidský polyomavirus 8 |
Alfapolyomavirus |
Polyomavirus spojený s trichodysplasia spinulosa |
TSPyV [17]
|
Lidský polyomavirus 9 |
Alfapolyomavirus |
— |
—
|
Lidský polyomavirus 10 |
Deltapolyomavirus |
MW polyomavirus |
MWPyV [18]
|
Lidský polyomavirus 11 |
Deltapolyomavirus |
STL polyomavirus |
StLPyV [18]
|
Lidský polyomavirus 12 |
Alfapolyomavirus |
— |
—
|
Lidský polyomavirus 13 |
Alfapolyomavirus |
Polyomavirus z New Jersey |
NJPyV [17]
|
Infekci lidským polyomavirem 1-4 je obtížné odlišit od infekce polyomavirem Macaca mulatta 1 [19] [20] .
Lidský polyomavirus 1 způsobuje mírné respirační infekce a infikuje ledviny u imunosuprimovaných pacientů, například po transplantacích orgánů . Lidský polyomavirus 2 infikuje buňky v dýchacím systému , ledvinách nebo mozku . Oba tyto viry jsou v populaci široce rozšířeny, asi 80 % dospělých v USA má protilátky proti těmto virům.
Lidský polyomavirus 5 byl popsán v roce 2008 jako způsobující Merkelovou rakovinu kůže [21] [22] [23] .
Lidský polyomavirus 8 byl popsán v roce 2010 jako způsobující trichodysplazii.
Poznámky
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: Učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M . : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 114. - ISBN 5-89481-136-8 .
- ↑ Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. jeden.
- ↑ GROSS L. Filtrovatelné činidlo získané z leukemických extraktů Ak, způsobující karcinomy slinných žláz u myší C3H // Proceedings of the Society for Experimental Biology and Medicine. Společnost pro experimentální biologii a medicínu: časopis. - 1953. - Červen ( roč. 83 , č. 2 ). - str. 414-421 . — PMID 13064287 .
- ↑ van Regenmortel, MHV, Fauquet, CM, Bishop, DHL, Carstens, EB, Estes, MK, Lemon, SM, Maniloff, J., Mayo, MA, McGeoch, DJ, Pringle, ČR a Wickner, RB Virus taxonomie. Sedmá zpráva Mezinárodního výboru pro taxonomii virů : [ eng. ] . — 7. zpráva ICTV. - San Diego: Academic Press, 2000. - S. 1.
- ↑ White MK, Gordon J., Reiss K. et al. Lidské polyomaviry a mozkové nádory (neopr.) // Výzkum mozku. Recenze výzkumu mozku. - 2005. - prosinec ( roč. 50 , č. 1 ). - S. 69-85 . - doi : 10.1016/j.brainresrev.2005.04.007 . — PMID 15982744 .
- ↑ Kelley WL, Georgopoulos C. Společný exon T/t polyomavirových T antigenů opičího viru 40, JC a BK může funkčně nahradit J-doménu molekulárního chaperonu Escherichia coli DnaJ // Proceedings of the National Academy sciences : journal. - United States National Academy of Sciences , 1997. - Duben ( vol. 94 , č. 8 ). - str. 3679-3684 . - doi : 10.1073/pnas.94.8.3679 . — PMID 9108037 .
- ↑ Sontag E., Fedorov S., Kamibayashi C., Robbins D., Cobb M., Mumby M. Interakce antigenu malého nádoru SV40 s protein fosfatázou 2A stimuluje dráhu map kinázy a indukuje proliferaci buněk // Cell : journal. - Cell Press , 1993. - Prosinec ( roč. 75 , č. 5 ). - S. 887-897 . - doi : 10.1016/0092-8674(93)90533-V . — PMID 8252625 .
- ↑ Watanabe G., Howe A., Lee RJ et al. Indukce cyklinu D1 opičím virem 40 small tumor antigen (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences : journal. - United States National Academy of Sciences , 1996. - Listopad ( vol. 93 , č. 23 ). - S. 12861-12866 . - doi : 10.1073/pnas.93.23.12861 . — PMID 8917510 .
- ↑ Virus Taxonomy: 2014 Release Archived 27 March 2017 at Wayback Machine on the ICTV website ( Open 26 March 2017) .
- ↑ Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. 1-7.
- ↑ Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. 12-13.
- ↑ Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. 14-19.
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 24. března 2017) .
- ↑ Druhy (kromě BK polyomaviru a JC polyomaviru ) nebyly registrovány u ICTV až do roku 2016.
- ↑ 1 2 Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. čtyři.
- ↑ 1 2 3 Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. 2.
- ↑ 1 2 Revize o čeledi Polyomaviridae , 2015 , str. 6.
- ↑ Poulin DL, DeCaprio JA Hraje SV40 roli v lidské rakovině? (neopr.) // Journal of Clinical Oncology. - 2006. - září ( roč. 24 , č. 26 ). - S. 4356-4365 . - doi : 10.1200/JCO.2005.03.7101 . — PMID 16963733 .
- ↑ zur Hausen H. SV40 u lidských rakovin – nekonečný příběh? (neopr.) // International Journal of Cancer. - 2003. - prosinec ( roč. 107 , č. 5 ). - S. 687 . - doi : 10.1002/ijc.11517 . — PMID 14566815 .
- ↑ L. Altman . Virus je spojen se silnou rakovinou kůže , New York Times (18. ledna 2008). Archivováno z originálu 19. února 2015. Staženo 18. ledna 2008.
- ↑ Feng H., Shuda M., Chang Y., Moore PS Klonální integrace polyomaviru do lidského karcinomu Merkelových buněk // Science : journal. - 2008. - únor ( roč. 319 , č. 5866 ). - S. 1096-1100 . - doi : 10.1126/science.1152586 . — PMID 18202256 .
- ↑ Shuda M., Arora R., Kwun HJ et al. Infekce lidským polyomavirem z Merkelových buněk I. Exprese MCV T antigenu v karcinomu Merkelových buněk, lymfoidních tkáních a lymfoidních nádorech (anglicky) // International Journal of Cancer: journal. - 2009. - září ( roč. 125 , č. 6 ). - S. 1243-1249 . - doi : 10.1002/ijc.24510 . — PMID 19499546 .
Literatura
Slovníky a encyklopedie |
|
---|
Taxonomie |
|
---|
V bibliografických katalozích |
|
---|
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|