Ortervirales
Ortervirales je řád, který zahrnuje všechny akceptované druhy jednovláknových RNA virů, které se replikují prostřednictvím meziproduktu DNA (skupina VI) a všechny akceptované druhy virů dvouvláknové DNA (kromě Hepadnaviridae ), které se replikují prostřednictvím meziproduktu RNA (skupina VII) [2] [3] . Název pochází z rubu slova retro [4] .
Všechny viry s reverzní transkripcí sdílejí významné podobnosti. Jejich proteiny reverzní transkriptázy mají společný původ. Navíc belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry sdílejí další společné rysy. Jejich polymerázové proteiny jsou strukturálně podobné a zahrnují aspartátovou proteázu ( retrovirová aspartylproteáza ) a integrázu , která patří do superrodiny rekombináz DDE (viz gen aktivující rekombinaci ). Sdílejí také podobné kapsidové a nukleokapsidové proteiny/domény [5] . Kaulimoviry také sdílejí některé vlastnosti s belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry, jako je homologní aspartátová proteáza . Na druhou stranu se zdá, že čeleď Hepadnaviridae je s výše uvedenými čeledí vzdálenější [6] .
Taxonomie
Tato objednávka obsahuje pět rodin:
Reference
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: Nový řád virů sjednocující pět rodin virů s reverzní transkripcí // Journal of Virology. — 2018-06-15. - T. 92 , č.p. 12 . — S. e00515–18 . — ISSN 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
- ↑ Taxonomie . _ Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV) . Datum přístupu: 23. května 2018.
- ↑ Jens H. Kuhn, Mart Krupovic, et al. : Vytvoření nového řádu, Ortervirales, pro 5 rodin reverzně přepisujících virů , Návrh ICTV (Taxoprop) 2017.013D, DOI:10.1340/RG.2.2.24914.04804
- ↑ Krupovic, M (2017). "Homologní kapsidové proteiny svědčí o společném původu retrovirů, kaulimovirů, pseudovirů a metavirů." Virologický časopis . 91 (12). DOI : 10.1128/JVI.00210-17 . PMID28356531 . _
- ↑ Krupovic, M (4. dubna 2018). “ Ortervirales : Nový řád virů sjednocující pět rodin reverzně přepisujících virů”. Virologický časopis . 92 (12). DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642 . _
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|