Ortervirales

Ortervirales

HI-virion
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:PararnaviraeTyp:ArtverviricotaTřída:RevtraviricetesObjednat:Ortervirales
Mezinárodní vědecký název
Ortervirales
Dceřiné taxony

Ortervirales  je řád, který zahrnuje všechny akceptované druhy jednovláknových RNA virů, které se replikují prostřednictvím meziproduktu DNA (skupina VI) a všechny akceptované druhy virů dvouvláknové DNA (kromě Hepadnaviridae ), které se replikují prostřednictvím meziproduktu RNA (skupina VII) [2] [3] . Název pochází z rubu slova retro [4] .

Všechny viry s reverzní transkripcí sdílejí významné podobnosti. Jejich proteiny reverzní transkriptázy mají společný původ. Navíc belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry sdílejí další společné rysy. Jejich polymerázové proteiny jsou strukturálně podobné a zahrnují aspartátovou proteázu ( retrovirová aspartylproteáza ) a integrázu , která patří do superrodiny rekombináz DDE (viz gen aktivující rekombinaci ). Sdílejí také podobné kapsidové a nukleokapsidové proteiny/domény [5] . Kaulimoviry také sdílejí některé vlastnosti s belpaoviry, metaviry, pseudoviry a retroviry, jako je homologní aspartátová proteáza . Na druhou stranu se zdá, že čeleď Hepadnaviridae je s výše uvedenými čeledí vzdálenější [6] .

Taxonomie

Tato objednávka obsahuje pět rodin:

Reference

  1. Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
  2. Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: Nový řád virů sjednocující pět rodin virů s reverzní transkripcí  // Journal of Virology. — 2018-06-15. - T. 92 , č.p. 12 . — S. e00515–18 . — ISSN 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
  3. Taxonomie  . _ Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV) . Datum přístupu: 23. května 2018.
  4. Jens H. Kuhn, Mart Krupovic, et al. : Vytvoření nového řádu, Ortervirales, pro 5 rodin reverzně přepisujících virů , Návrh ICTV (Taxoprop) 2017.013D, DOI:10.1340/RG.2.2.24914.04804
  5. Krupovic, M (2017). "Homologní kapsidové proteiny svědčí o společném původu retrovirů, kaulimovirů, pseudovirů a metavirů." Virologický časopis . 91 (12). DOI : 10.1128/JVI.00210-17 . PMID28356531  . _
  6. Krupovic, M (4. dubna 2018). “ Ortervirales : Nový řád virů sjednocující pět rodin reverzně přepisujících virů”. Virologický časopis . 92 (12). DOI : 10.1128/JVI.00515-18 . PMID29618642  . _