Pararnavirae
Pararnavirae |
---|
|
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:Pararnavirae |
Pararnavirae |
|
Pararnavirae je království virů vytvořené Mezinárodním výborem pro taxonomii virů , které zahrnuje všechny retrotranskribované viry. Zahrnuje skupiny VI a VII podle baltimorské klasifikace [2] . mohou obsahovat DNA nebo RNA , ale replikují se pomocí reverzní transkriptázy , to znamená prostřednictvím přechodného řetězce genetického materiálu , který je odlišný od toho, ze kterého se skládají. Království zahrnuje dva řády a šest rodin.
DNA viry této říše jsou blízce příbuzné RNA virům, proto jsou řazeny do riboviriánské říše spolu s posledně jmenovanými. Zdá se, že původ těchto virů se datuje do doby vzniku eukaryot . Bylo navrženo, že retrotranskripční viry pocházejí z události, ve které byl retrotransposon integrován do kapsidy jiného viru, čímž nahradil genom a enzymy hostitelského viru, ale také bylo navrženo, že by to mohl být také RNA virus. Později retrotransfekované viry vznikly z LTR retrotransposonů v důsledku virové infekce. Jsou řazeni do čeledí Pseudoviridae , Metaviridae a Belpaoviridae [3] [4] .
Virus lidské imunodeficience (HIV) a virus hepatitidy B patří mezi druhy, které postihují člověka [5] .
Klasifikace
Fylogeneze
Fylogenetická studie reverzní transkriptázy poskytla následující výsledek a byly zahrnuty i endogenizované retrotranspozony LTR přiřazené do čeledí Pseudoviridae, Metaviridae a Belpaviridae: [6] [7]
Reference
- ↑ Taxonomie virů na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
- ↑ Taxonomie virů: Vydání 2019 . talk.ikovnline.org . Mezinárodní výbor pro taxonomii virů. Datum přístupu: 25. dubna 2020. (neurčitý)
- ↑ Aršan, Násir; Caetano-Anollés, Gustavo (25. září 2015). „Fylogenomický průzkum původu a evoluce virů založený na datech“ . Vědecké pokroky . 1 (8): e1500527. Bibcode : 2015SciA....1E0527N . doi : 10.1126/ sciadv.1500527 . PMC 4643759 . PMID26601271 . _
- ↑ Eugene Koonin, Valerian V Doljja (2014). Svět virů jako evoluční síť virů a bezhlavých sobeckých prvků . Recenze mikrobiologie a molekulární biologie.
- ↑ Koonin EV, Dolja VV, Krupovic M, Varsani A, Wolf YI, Yutin N, Zerbini M, Kuhn JH Návrh: Vytvořte megataxonomický rámec, který vyplňuje všechny hlavní taxonomické úrovně, pro říši Riboviria . Mezinárodní výbor pro taxonomii virů (ICTV) . Datum přístupu: 21. května 2020.
- ↑ Mart Krupovic, Jonas Blomberg, John M. Coffin, Indranil Dasgupta, Hung Fan. Ortervirales: Nový řád virů sjednocující pět rodin virů s reverzní transkripcí // Journal of Virology / Rozanne M. Sandri-Goldin. — 2018-06-15. — Sv. 92 , iss. 12 . — P.e00515–18 . — ISSN 1098-5514 0022-538X, 1098-5514 . - doi : 10.1128/JVI.00515-18 .
- ↑ Carlos Llorens, Beatriz Soriano, Maria Navarrete-Muñoz, Ahmed Hafez, Vicente Arnau. 3 // Reverzně přepisující viry čeledí Belpaoviridae, Metaviridae a Pseudoviridae (řád Ortervirales) . - Elsevier, 2020. - ISBN 978-0-12-809633-8 .
Poznámky
Klasifikace virů podle Baltimoru |
---|
DNA | I: viry |
---|
Adnaviria | |
---|
Duplodnaviria | |
---|
Monodnaviria | |
---|
Varidnaviria | Bamfordvirae | Nukleocytovirikota | Pokkesviricetes | |
---|
Megaviricetes | Algavirales |
|
---|
Imitervirales |
|
---|
Pimascovirales |
|
---|
|
---|
|
---|
Preplasmiviricota | |
---|
|
---|
Helvetiavirae | Dividoviricota | Laserviricetes | Halopanivirales |
- Matshushitaviridae
- Simuloviridae
- Sphaerolipoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Nezařazeno | Naldaviricetes | |
---|
Nezařazeno |
- čeleď : Ampullaviridae
- Bicaudaviridae
- Clavaviridae
- Fuselloviridae
- Globuloviridae
- Guttaviridae
- Halspiviridae
- Ovaliviridae
- Plasmaviridae
- Polydnaviridae
- Portogloboviridae
- Thaspiviridae
- Rod : Dinodnavirus
- Rhizidiovirus
|
---|
|
---|
|
| II: DNA viry |
---|
Monodnaviria | Loebvirae | Hofneiviricota | Faserviricetes | Tubulavirales |
- Inoviridae
- Paulinoviridae
- Plectroviridae }
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Sangervirae | |
---|
Shotokuvirae | Cossaviricota | |
---|
Cressdnaviricota | Arfiviricetes | Baphyvirales |
|
---|
Cirlivirales |
|
---|
Cremevirales |
|
---|
Mulpavirales |
- Metaxyviridae
- Nanoviridae
|
---|
Recrevirales |
|
---|
|
---|
Repensiviricetes | Geplafuvirales |
- Geminiviridae
- Genomoviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
---|
Trapavirae | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
|
---|
|
|
|
---|
RNA | | IV: (+) RNA viry |
---|
Riboviria | Orthornavirae | Kitrinoviricota | Alsuviricetes | Hepelivirales |
- Alphatetraviridae
- Benyviridae
- Hepeviridae
- Matonaviridae
|
---|
Martellivirales |
|
---|
tymovirály |
- Alphaflexiviridae
- Betaflexiviridae
- Deltaflexiviridae
- Gammaflexiviridae
- Tymoviridae
|
---|
|
---|
Flasuviricetes | |
---|
Magsaviricetes | Nodamuvirales |
- Nodaviridae
- Sinhaliviridae
|
---|
|
---|
tolucaviricetes | Tolivirales |
- Carmotetraviridae
- Luteoviridae
- Tombusviridae
|
---|
|
---|
|
---|
Lenarviricota | Leviviricetes | Norzivirales |
- Atkinsviridae
- Duinviridae
- Fiersviridae
- Solspiviridae
|
---|
Timlovirales |
- Blumeviridae
- Steitzviridae
|
---|
|
---|
Amabiliviricetes | |
---|
Howeltoviricetes | |
---|
miaviricetes | |
---|
|
---|
Pisuviricota | Pisoniviricetes | Nidovirales |
- Abyssoviridae
- Arteriviridae
- Cremegaviridae
- Coronaviridae
- Euroniviridae
- Gresnaviridae
- Medioniviridae
- Mesoniviridae
- Mononiviridae
- Nanghoshaviridae
- Nanhypoviridae
- Olifoviridae
- Roniviridae
- Tobaniviridae
|
---|
Picornavirales |
- Picornaviridae
- Marnaviridae
- Solinviviridae
- Caliciviridae
- Flaviridae
- Secoviridae
- Dicistroviridae
- Polycipiviridae
|
---|
Sobelivirales |
- Alvernaviridae
- Barnaviridae
- Solemoviridae
|
---|
|
---|
Stelpaviricetes | |
---|
|
---|
Nezařazeno |
- Čeleď : Permutotetraviridae
- Sarthroviridae
|
---|
|
---|
|
---|
|
| |
|
---|
Z | |
---|