POLR2A

Polypeptid A RNA polymeráza II (řízená DNA)

Zavedeno na základě PDB 2GHQ .
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolPOLR2A  ; POLR2; POLRA; RPB1; RPBhl; RPO2; RPOL2; RpIILS; hRPB220; hsRPB1
Externí IDOMIM:  180660 MGI :  98086 HomoloGene :  721 ChEMBL : 1641353 GeneCards : POLR2A Gene
EC číslo2.7.7.48, 2.7.7.6
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez543020020
SouborENSG00000181222ENSMUSG00000005198
UniProtP24928P08775
RefSeq (mRNA)NM_000937NM_001291068
RefSeq (protein)NP_000928NP_001277997
Locus (UCSC)Chr 17:
7,39 – 7,42 Mb		Chr 11:
69,73 – 69,76 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Podjednotka RPB1 RNA polymerázy II řízené DNA , také známá jako RPB1 , je enzym kódovaný u lidí genem POLR2A .

Funkce

Tento gen kóduje velkou podjednotku RNA polymerázy II , polymerázy zodpovědné za syntézu RNA v eukaryotech . Produkt tohoto genu obsahuje karboxylovou koncovou doménu sestávající z heptapeptidových repetic nezbytných pro aktivitu polymerázy . Tyto repetice obsahují serinové a threoninové zbytky, které, když jsou aktivní, fosforylují transkripci RNA polymerázy . Navíc tato podjednotka v kombinaci s některými dalšími polymerázovými podjednotkami tvoří polymerázovou DNA-vazebnou doménu, ve které je mediátorová DNA přepisována do RNA. [jeden]

Interakce

Ukázalo se, že POLR2A interaguje s:

Poznámky

  1. ↑ Entrez Gen: Polypeptid A POLR2A polymerázy (RNA) II (řízená DNA), 220 kDa .
  2. ↑ Krum SA, Miranda GA, Lin C., Lane TF BRCA1 asociuje s procesivní RNA polymerázou II  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2003. - prosinec ( roč. 278 , č. 52 ). - S. 52012-52020 . - doi : 10.1074/jbc.M308418200 . — PMID 14506230 .
  3. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 8 Scully R., Anderson SF, Chao DM, Wei W., Ye L., Young RA, Livingston DM, Parvin JD BRCA1 je složkou   holoenzymu RNA polymerázy II / Proceedings of the Národní akademie věd Spojených států amerických  : časopis. - 1997. - Květen ( roč. 94 , č. 11 ). - S. 5605-5610 . - doi : 10.1073/pnas.94.11.5605 . — PMID 9159119 .
  4. ↑ Chiba N., Parvin JD Redistribuce BRCA1 mezi čtyři různé proteinové komplexy po zablokování replikace  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2001. - říjen ( roč. 276 , č. 42 ). - S. 38549-38554 . - doi : 10.1074/jbc.M105227200 . — PMID 11504724 .
  5. ↑ Krum SA, Womack JE, Lane TF Bovinní BRCA1 vykazuje klasické reakce na genotoxický stres, ale nízkou  aktivitu aktivace transkripce in vitro //  Onkogen : deník. - 2003. - září ( roč. 22 , č. 38 ). - S. 6032-6044 . - doi : 10.1038/sj.onc.1206515 . — PMID 12955082 .
  6. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Cho H., Orphanides G., Sun X., Yang XJ, Ogryzko V., Lees E., Nakatani Y., Reinberg D. Komplex lidské RNA polymerázy II obsahující faktory, které modifikují strukturu chromatinu  (anglicky)  // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1998. - září ( roč. 18 , č. 9 ). - S. 5355-5363 . — PMID 9710619 .
  7. ↑ Suñé C., Hayashi T., Liu Y., Lane WS, Young RA, Garcia-Blanco MA CA150, jaderný protein spojený s holoenzymem RNA polymerázy II, se podílí na transkripci viru lidské imunodeficience typu 1 aktivovaného Tat  .)  // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1997. - říjen ( roč. 17 , č. 10 ). - S. 6029-6039 . — PMID 9315662 .
  8. ↑ Sato S., Tomomori-Sato C., Parmely TJ, Florens L., Zybailov B., Swanson SK, Banks CA, Jin J., Cai Y., Washburn MP, Conaway JW, Conaway RC Soubor konsenzuálního savčího mediátora podjednotky identifikované technologií vícerozměrné identifikace proteinů  //  Molecular Cell : deník. - 2004. - Červen ( roč. 14 , č. 5 ). - S. 685-691 . - doi : 10.1016/j.molcel.2004.05.006 . — PMID 15175163 .
  9. ↑ 1 2 3 4 Acker J., de Graaff M., Cheynel I., Khazak V., Kedinger C., Vigneron M. Interactions between the human RNA polymerase II subunits  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 1997. - Červenec ( roč. 272 , č. 27 ). - S. 16815-16821 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
  10. ↑ Humbert S., Saudou F. K buněčné specificitě v SCA1  //  Neuron. - Cell Press , 2002. - Květen ( vol. 34 , č. 5 ). - S. 669-670 . - doi : 10.1016/s0896-6273(02)00715-8 . — PMID 12062012 .
  11. ↑ 1 2 3 Sif S., Saurin AJ, Imbalzano AN, Kingston RE Purifikace a charakterizace komplexů pro remodelaci chromatinu Brg1 a hBrm obsahujících mSin3A   // Genes & Development  : journal. - 2001. - březen ( roč. 15 , č. 5 ). - S. 603-618 . - doi : 10.1101/gad.872801 . — PMID 11238380 .
  12. ↑ 1 2 3 Wang W., Côté J., Xue Y., Zhou S., Khavari PA, Biggar SR, Muchardt C., Kalpana GV, Goff SP, Yaniv M., Workman JL, Crabtree GR Purifikace a biochemická heterogenita savčí komplex SWI-SNF  //  The EMBO Journal : deník. - 1996. - Říjen ( roč. 15 , č. 19 ). - str. 5370-5382 . — PMID 8895581 .
  13. ↑ Zhao K., Wang W., Rando OJ, Xue Y., Swiderek K., Kuo A., Crabtree GR Rychlá a na fosfoinositolu závislá vazba komplexu SWI/SNF-like BAF na chromatin po  signalizaci receptoru T lymfocytů.)  // Buňka  : deník. - Cell Press , 1998. - Listopad ( roč. 95 , č. 5 ). - S. 625-636 . - doi : 10.1016/s0092-8674(00)81633-5 . — PMID 9845365 .
  14. ↑ Hamamoto R., Furukawa Y., Morita M., Iimura Y., Silva FP, Li M., Yagyu R., Nakamura Y. SMYD3 kóduje histon methyltransferázu zapojenou do proliferace rakovinných buněk  (Angl.)  // Nature Buněčná biologie  : časopis. - 2004. - Srpen ( ročník 6 , č. 8 ). - str. 731-740 . - doi : 10.1038/ncb1151 . — PMID 15235609 .
  15. ↑ Yang J., Aittomäki S., Pesu M., Carter K., Saarinen J., Kalkkinen N., Kieff E., Silvennoinen O. Identifikace p100 jako koaktivátoru pro STAT6, který přemosťuje STAT6 s RNA polymerázou  II )  // EMBO Journal : deník. - 2002. - září ( roč. 21 , č. 18 ). - S. 4950-4958 . - doi : 10.1093/emboj/cdf463 . — PMID 12234934 .
  16. ↑ Kim JB, Yamaguchi Y., Wada T., Handa H., Sharp PA Tat-SF1 protein asociuje s RAP30 a lidskými SPT5 proteiny   // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 1999. - září ( roč. 19 , č. 9 ). - S. 5960-5968 . — PMID 10454543 .
  17. ↑ Wada T., Takagi T., Yamaguchi Y., Ferdous A., Imai T., Hirose S., Sugimoto S., Yano K., Hartzog GA, Winston F., Buratowski S., Handa H. DSIF, a nový transkripční elongační faktor, který reguluje procesivitu RNA polymerázy II, se skládá z lidských homologů  Spt4 a Spt5  // Genes & Development  : journal. - 1998. - únor ( roč. 12 , č. 3 ). - str. 343-356 . - doi : 10.1101/gad.12.3.343 . — PMID 9450929 .
  18. ↑ Conaway RC, Kong SE, Conaway JW TFIIS a GreB: dva stejně smýšlející transkripční elongační faktory s lepkavými prsty  // Cell  :  journal. - Cell Press , 2003. - Srpen ( roč. 114 , č. 3 ). - str. 272-274 . — PMID 12914690 .
  19. ↑ Archambault J., Pan G., Dahmus GK, Cartier M., Marshall N., Zhang S., Dahmus ME, Greenblatt J. FCP1, RAP74-interagující podjednotka lidské proteinové fosfatázy, která defosforyluje karboxy-terminální doménu RNA polymeráza IIO  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - 1998. - říjen ( roč. 273 , č. 42 ). - S. 27593-27601 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27593 . — PMID 9765293 .
  20. ↑ Pan G., Aso T., Greenblatt J. Interakce elongačních faktorů TFIIS a elonginu A s holoenzymem lidské RNA polymerázy II schopným promotorově specifické iniciace a citlivým na transkripční aktivátory  //  Journal of Biological Chemistry  : journal . - 1997. - Září ( roč. 272 ​​​​, č. 39 ). - S. 24563-24571 . doi : 10.1074 / jbc.272.39.24563 . — PMID 9305922 .
  21. ↑ Carty SM, Goldstrohm AC, Suñé C., Garcia-Blanco MA, Greenleaf AL Moduly proteinové interakce, které organizují jadernou funkci: FF domény  CA150 vážou fosfoCTD RNA polymerázy II  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United Státy americké  : časopis. - 2000. - srpen ( roč. 97 , č. 16 ). - S. 9015-9020 . - doi : 10.1073/pnas.160266597 . — PMID 10908677 .
  22. ↑ Grondin B., Côté F., Bazinet M., Vincent M., Aubry M. Přímá interakce proteinu zinkového prstu KRAB  / Cys2-His2 ZNF74 s hyperfosforylovanou formou největší podjednotky RNA polymerázy II  // Journal of Biological Chemistry  : deník. - 1997. - říjen ( roč. 272 , č. 44 ). - S. 27877-27885 . doi : 10.1074 / jbc.272.44.27877 . — PMID 9346935 .

Literatura

Odkazy