POLR2E

Polypeptid E RNA polymerázy II (řízená DNA), 25 kDa

Identifikátory

POLR2E ; RPABC1; RPB5; XAP4; hRPB25; hsRPB5

Externí ID

OMIM: 180664 MGI : 1913670 HomoloGene : 2018 GeneCards : POLR2E Gene

2.7.7.6

Genová ontologie
Funkce	• Aktivita RNA polymerázy I • Aktivita RNA polymerázy II • Aktivita RNA polymerázy III • Vazba DNA • Aktivita RNA polymerázy řízená DNA • vazba na bílkoviny
buněčná složka	• jádro • nukleoplazma • DNA-řízená RNA polymeráza II, jádrový komplex • DNA-řízená RNA polymeráza III komplex • DNA-řízená RNA polymeráza I komplex • cytosol
biologický proces	• sestřih mRNA prostřednictvím spliceosomu • oprava DNA • transkripčně spřažená nukleotid-excizní oprava • nukleotid-excizní oprava • transkripce z promotoru RNA polymerázy I • transkripce z promotoru RNA polymerázy II • iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy II • 7-methylguanosin capping mRNA • transkripce z promotoru RNA polymerázy III • prodloužení transkripce z promotoru RNA polymerázy III • ukončení transkripce RNA polymerázy III • sestřih RNA • genová exprese • virový proces • pozitivní regulace produkce interferonu typu I • vrozená imunitní odpověď • pozitivní regulace virové transkripce
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 19:
1,09 - 1,1 Mb

Chr 10:
80,04 – 80,04 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Podjednotka RPABC1 DNA-dependentní RNA polymerázy I, II a III je protein kódovaný u lidí genem POLR2E . [jeden]

Tento gen kóduje pátou největší podjednotku RNA polymerázy II , polymerázy zodpovědné za syntézu RNA v eukaryotech . Tuto podjednotku sdílejí další dvě DNA-dependentní RNA polymerázy a její koncentrace je dvojnásobná než u ostatních podjednotek polymerázy. Byla prokázána interakce mezi touto podjednotkou a transaktivací proteinu viru hepatitidy . Předpokládá se, že prostřednictvím této podjednotky může dojít k interakci mezi aktivátorem transkripce a polymerázou. Pseudogen této gneny se nachází na chromozomu 11 [2] .

Interakce

Ukázalo se, že POLR2E spolupracuje s:

TAF15 , [3] POLR2C , [4] POLR2G , [4] POLR2H , [4] POLR2A , [4] POLR2B , [4] POLR2L [4] a GTF2F2 [5] .

Poznámky

↑ Acker J., Mattei MG, Wintzerith M., Roeckel N., Depetris D., Vigneron M., Kedinger C. Chromosomal localisation of human RNA polymerase II subunit genes // Genomics : journal. - 1994. - Srpen ( roč. 20 , č. 3 ). - str. 496-499 . - doi : 10.1006/geno.1994.1208 . — PMID 8034326 .
↑ Entrez Gen: POLR2E polymeráza (RNA) II (DNA řízený) polypeptid E, 25 kDa . Archivováno z originálu 5. prosince 2010. (neurčitý)
↑ Bertolotti, A; Melot T; Acker J; Vigneron M; Delattre O; Tora L. EWS, ale ne EWS-FLI-1, je spojena s TFIID i RNA polymerázou II: interakce mezi dvěma členy rodiny TET, EWS a hTAFII68, a podjednotkami komplexů TFIID a RNA polymerázy II / Molekulární a buněčná biologie : deník. - SPOJENÉ STÁTY, 1998. - Březen ( roč. 18 , č. 3 ). - S. 1489-1497 . — ISSN 0270-7306 . — PMID 9488465 .
↑ 1 2 3 4 5 6 Acker, J; de Graaff M; Cheynel I; Khazak V; Kedinger C; Vigneron M. Interakce mezi podjednotkami lidské RNA polymerázy II (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - SPOJENÉ STÁTY, 1997. - Červenec ( sv. 272 , č. 27 ). - S. 16815-16821 . — ISSN 0021-9258 . doi : 10.1074 / jbc.272.27.16815 . — PMID 9201987 .
↑ Wei, W; Dorjsuren D; Vrásčitý; Qin W; Nomura T; Hayashi N; Murakami S. Přímá interakce mezi podjednotkou RAP30 transkripčního faktoru IIF (TFIIF) a podjednotkou 5 RNA polymerázy, která přispívá ke spojení mezi TFIIF a RNA polymerázou II // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2001. - Duben ( sv. 276 , č. 15 ). - S. 12266-12273 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M009634200 . — PMID 11278533 .

Literatura

Zhang KT Tat, Tat-asociovaná kináza a transkripce. (anglicky) // Journal of Biomedical Science : deník. - 1998. - Sv. 5 , č. 1 . - S. 24-7 . - doi : 10.1007/BF02253352 . — PMID 9570510 .
Yankulov K., Bentley D. Transkripční kontrola: Tat kofaktory a transkripční elongace. (anglicky) // Current Biology : journal. - Cell Press , 1998. - Sv. 8 , č. 13 . - P.R447-9 . - doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . — PMID 9651670 .
Romano G., Kasten M., De Falco G. a kol. Regulační funkce Cdk9 a cyklinu T1 v genové expresi transaktivační dráhy HIV tat. (anglicky) // Journal of Cellular Biochemistry : deník. - 2000. - Sv. 75 , č. 3 . - str. 357-368 . - doi : 10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K . — PMID 10536359 .
Marcello A., Zoppé M., Giacca M. Vícenásobné způsoby regulace transkripce transaktivátorem HIV-1 Tat. (anglicky) // IUBMB Life: journal. - 2002. - Sv. 51 , č. 3 . - S. 175-181 . - doi : 10.1080/152165401753544241 . — PMID 11547919 .
Stevens M., De Clercq E., Balzarini J. Regulace transkripce HIV-1: molekulární cíle pro chemoterapeutickou intervenci. (anglicky) // Med Res Rev : journal. - 2007. - Sv. 26 , č. 5 . - str. 595-625 . - doi : 10.1002/med.20081 . — PMID 16838299 .
Harrich D., McMillan N., Munoz L. a kol. Povedou různé interakce Tat k novým cílům antiretrovirových léků? (eng.) // Současné cíle v oblasti drog: časopis. - 2007. - Sv. 7 , č. 12 . - S. 1595-1606 . - doi : 10.2174/138945006779025338 . — PMID 17168834 .
Kato H., Sumimoto H., Pognonec P. a kol. HIV-1 Tat působí jako procesní faktor in vitro ve spojení s buněčnými elongačními faktory. (anglicky) // Genes & Development : journal. - 1992. - Sv. 6 , č. 4 . - S. 655-666 . - doi : 10.1101/gad.6.4.655 . — PMID 1559613 .
Pati UK, Weissman SM Izolace a molekulární charakterizace cDNA kódující 23-kDa podjednotku lidské RNA polymerázy II. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1991. - Sv. 266 , č.p. 20 . — S. 13468 . — PMID 2071613 .
Southgate C., Zapp ML, Green MR Aktivace transkripce proteinem HIV-1 Tat připoutaným k rodící se RNA prostřednictvím jiného proteinu. (anglicky) // Nature: journal. - 1990. - Sv. 345 , č.p. 6276 . - S. 640-642 . - doi : 10.1038/345640a0 . — PMID 2190099 .
Pati UK, Weissman SM Izolace a molekulární charakterizace cDNA kódující 23-kDa podjednotku lidské RNA polymerázy II. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1989. - Sv. 264 , č.p. 22 . - S. 13114-13121 . — PMID 2753903 .
Wu-Baer F., Sigman D., Gaynor RB Specifická vazba RNA polymerázy II na trans-aktivační oblast RNA viru lidské imunodeficience je regulována buněčnými kofaktory a Tat. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1995. - Sv. 92 , č. 16 . - str. 7153-7157 . - doi : 10.1073/pnas.92.16.7153 . — PMID 7638159 .
Cheong JH, Yi M., Lin Y., Murakami S. Human RPB5, podjednotka sdílená eukaryotickými jadernými RNA polymerázami, váže protein X lidského viru hepatitidy B a může hrát roli v transaktivaci X. (anglicky) // The EMBO Journal : deník. - 1995. - Sv. 14 , č. 1 . - S. 143-150 . — PMID 7828586 .
Herrmann CH, Rice AP Lentivirus Tat proteiny se specificky spojují s buněčnou proteinkinázou, TAK, která hyperfosforyluje karboxy-terminální doménu velké podjednotky RNA polymerázy II: kandidát na kofaktor Tat. (anglicky) // Journal of Virology : deník. - 1995. - Sv. 69 , č. 3 . - S. 1612-1620 . — PMID 7853496 .
Keen NJ, Gait MJ, Karn J. Virus lidské imunodeficience typu 1 Tat je nedílnou součástí aktivovaného transkripčně-prodlužovacího komplexu. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 93 , č. 6 . - S. 2505-2510 . - doi : 10.1073/pnas.93.6.2505 . — PMID 8637904 .
Yang X., Herrmann CH, Rice AP Proteiny Tat viru lidské imunodeficience se specificky spojují s TAK in vivo a pro svou funkci vyžadují karboxy-terminální doménu RNA polymerázy II. (anglicky) // Journal of Virology : deník. - 1996. - Sv. 70 , č. 7 . - S. 4576-4584 . — PMID 8676484 .
Agostini I., Navarro JM, Rey F. a kol. Transaktivátor viru lidské imunodeficience typu 1 Vpr: spolupráce s doménami aktivátoru vázanými na promotor a vazba na TFIIB. (anglicky) // Journal of Molecular Biology : deník. - 1996. - Sv. 261 , č.p. 5 . - S. 599-606 . - doi : 10.1006/jmbi.1996.0485 . — PMID 8800208 .
Zhou Q., Sharp PA Tat-SF1: kofaktor pro stimulaci transkripčního prodloužení pomocí HIV-1 Tat. (anglicky) // Science: journal. - 1996. - Sv. 274 , č.p. 5287 . - S. 605-610 . - doi : 10.1126/science.274.5287.605 . — PMID 8849451 .
Okamoto H., Sheline CT, Corden JL a kol. Transaktivace Tat proteinem viru lidské imunodeficience vyžaduje C-terminální doménu RNA polymerázy II. (anglicky) // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal. - 1996. - Sv. 93 , č. 21 . - S. 11575-11579 . - doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . — PMID 8876177 .
Chun RF, Zhang KT Požadavky na karboxyterminální doménu RNA polymerázy II pro aktivovanou transkripci lidských retrovirů lidský T-buněčný lymfotropní virus I a HIV-1. (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - 1996. - Sv. 271 , č.p. 44 . - S. 27888-27894 . doi : 10.1074 / jbc.271.44.27888 . — PMID 8910388 .