Nukleosom
Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od
verze recenzované 24. srpna 2021; kontroly vyžadují
2 úpravy .
Nukleozom je strukturální část chromozomu vytvořená společným zabalením řetězce DNA s histonovými proteiny H2A, H2B, H3 a H4. Sekvence nukleozomů spojených histonovým proteinem H1 tvoří nukleozomální vlákno nebo jinak nukleozomální vlákno.
Kolem nukleozomálního jádra, představovaného histonovým oktamerem, DNA dělá 1,67 závitů (147 bp). Supercoil DNA kolem nukleozomu je levotočivý, i když samotná šroubovice DNA je pravotočivá. Úsek DNA mezi nukleozomy se nazývá linker DNA a má 10-100 bp.
Sestavení nukleozomu probíhá na DNA. Během replikace DNA jsou mateřské histony distribuovány náhodně v dceřiných vláknech. Histonové chaperony dočasně chrání kladný náboj histonů , což umožňuje správné sestavení nukleozomu. Chaperon CAF1 je spojen s PCNA , sedí v replikační vidlici, váže „staré“ dimery H3H4 a zahajuje poreplikační sestavování nukleozomů od přistání tohoto dimeru.
Ačkoli nukleozom váže DNA bez ohledu na sekvenci, různé sekvence DNA se mohou lišit až 1000krát ve svém potenciálu vázat nukleozom. Pokud sekvence, které ohýbají DNA v jednom směru, následují za sebou (například TATA), vazba nukleozomů bude nestabilní.
Genom obsahuje:
- oblasti bez nukleozomů ( otevřený chromatin : vazebná místa pro transkripční faktory, regulační proteiny);
- oblasti, kde je pozice nukleozomu přísně fixována (například začátek transkripce mnoha genů);
- oblasti, kde nukleozomální záhyb podléhá regulaci proteiny remodelující chromatin závislými na ATP .
Viz také
Literatura
- Zhimulev I. F. Obecná a molekulární genetika. - 1. - Novosibirsk: Univerzitní nakladatelství Novosibirsk, 2002. - 459 s. - 2000 výtisků. — ISBN 5761505096 .
- Teif V. B. a kol. (2011). Nukleosomy v genové regulaci: teoretické přístupy. Molek. Biol. , svazek 45, č. 6, s. 1-11. [1] Archivováno 4. března 2016 na Wayback Machine
- Peter Tessarz & Tony Kouzarides (2014). Modifikace histonového jádra regulující strukturu a dynamiku nukleozomů . Nature Reviews Molecular Cell Biology 15, 703–708 doi : 10.1038/nrm3890
- Sheila S. Teves, Christopher M. Weber, Steven Henikoff (2014). Transkripce přes nukleozom. Trends in Biochemical Sciences, 39(12), p577–586 DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.tibs.2014.10.004
- Thuy TM Ngo, Qiucen Zhang, Ruobo Zhou, Jaya G. Yodh, Taekjip Ha. (2015). Asymetrické rozbalování nukleozomů pod napětím řízené DNA Local Flexibility Archivováno 24. září 2015 na Wayback Machine . Cell, 160(6): 1135–1144 doi : 10.1016/j.cell.2015.02.001