Oxidoreduktáza

Oxidoreduktázy ( EC 1 ) jsou samostatnou třídou enzymů , které katalyzují reakce, které jsou základem biologické oxidace, doprovázené přenosem elektronů z jedné molekuly (redukční činidlo - akceptor protonu nebo donor elektronu) na jinou (oxidační činidlo - donor protonu nebo akceptor elektronu) . [1] [2]

Katalyzované reakce

Reakce katalyzované oxidoreduktázami obecně vypadají takto:

Kde A je redukční činidlo (donor elektronů) a B je oxidační činidlo (akceptor elektronů)

Při biochemických přeměnách vypadají redoxní reakce někdy komplikovaněji. Zde je například jedna z reakcí glykolýzy :

Zde NAD + působí jako oxidační činidlo a glyceraldehyd-3-fosfát je redukční činidlo.

Nomenklatura

Systematické názvy enzymů třídy jsou tvořeny podle schématu „ donor:akceptor + oxidoreduktáza“. Hojně se však používají i jiná schémata pojmenování. Pokud je to možné, jsou enzymy pojmenovány ve formě " donor + dehydrogenáza", např. glyceraldehyd-3-fosfátdehydrogenáza pro druhou reakci uvedenou výše. Název je někdy psán jako „ akceptor + reduktáza“, například NAD + -reduktáza . V konkrétním případě, kdy je oxidačním činidlem kyslík, může být název ve formě " donor + oxidáza".

Klasifikace

Podle mezinárodní klasifikace a nomenklatury enzymů patří oxidoreduktázy do třídy 1 , ve které se rozlišuje dvacet dva podtříd:

• EC 1.1 zahrnuje enzymy, které interagují se skupinou donorů CH–OH ;
• EC 1.2 zahrnuje enzymy, které interagují s aldehydovou nebo oxoskupinou donorů;
• EC 1.3 zahrnuje enzymy, které interagují se skupinou CH-CH dárců;
• EC 1.4 zahrnuje enzymy, které interagují se skupinou dárců CH–NH 2 ;
• EC 1.5 zahrnuje enzymy, které interagují se skupinou dárců CH–NH ;
• EC 1.6 zahrnuje enzymy, které interagují s NAD H nebo NADP H;
• EC 1.7 zahrnuje enzymy, které interagují s jinými sloučeninami obsahujícími dusík jako donory;
• EC 1.8 zahrnuje enzymy, které interagují se skupinou donorů obsahujících síru;
• EC 1.9 zahrnuje enzymy, které interagují s hemovou skupinou dárců;
• EC 1.10 zahrnuje enzymy, které interagují s difenoly a příbuznými sloučeninami jako donory;
• EC 1.11 zahrnuje enzymy, které interagují s peroxidem jako akceptorem ( peroxidáza );
• EC 1.12 zahrnuje enzymy, které interagují s vodíkem jako donorem;
• EC 1.13 zahrnuje enzymy interagující s jednotlivými donory s inkorporací molekulárního kyslíku ( oxygenázy );
• EC 1.14 zahrnuje enzymy interagující s párovými donory s inkorporací molekulárního kyslíku;
• EC 1.15 zahrnuje enzymy, které interagují se superoxidovými radikály jako akceptory;
• EC 1.16 zahrnuje enzymy, které oxidují kovové ionty;
• EC 1.17 zahrnuje enzymy interagující se skupinami CH nebo CH2 ;
• EC 1.18 zahrnuje enzymy, které interagují s proteiny železo-síra jako donory;
• EC 1.19 zahrnuje enzymy, které interagují s redukovaným flavodoxinem jako donorem;
• EC 1.20 zahrnuje enzymy, které interagují s fosforem nebo arsenem jako donorem;
• EC 1.21 zahrnuje enzymy, které interagují s molekulami typu X–H a Y–H za vzniku vazby X–Y ;
• EC 1,97 zahrnuje další oxidoreduktázy.

Odkazy

• EC 1 Úvod z katedry chemie na Queen Mary University of London

Poznámky

1. ↑ Price, Nicholas C. Základy enzymologie: buněčná a molekulární biologie katalytických proteinů . — 3. vyd. - Oxford: Oxford University Press, 1999. - xviii, 478 stran, 7 barevných desek str. — ISBN 019850229X .
2. ↑ Evoluce bílkovin . - Hoboken, NJ: Wiley, 2007. - 1 online zdroj (xiii, 314 stran) str. — ISBN 0471205036 .