Ebolavirus | ||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
Snímek viru Ebola z transmisní elektronové mikroskopie | ||||||||
vědecká klasifikace | ||||||||
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:NegarnaviricotaPodtyp:HaploviricotinaTřída:MonjiviricetesObjednat:MononegaviralesRodina:filoviryRod:virus Ebola | ||||||||
Mezinárodní vědecký název | ||||||||
Ebolavirus | ||||||||
Druhy | ||||||||
|
||||||||
Baltimorská skupina | ||||||||
V: (-)ssRNA viry | ||||||||
|
Ebolavirus ( ebolavirus , Ebola virus nebo Ebola virus ) je rod virů z čeledi filovirů ( Filoviridae ), které způsobují hemoragickou horečku Ebola u vyšších primátů . Morfologické rysy ebolavirů jsou podobné viru Marburg , který rovněž patří do rodiny filovirů a způsobuje podobné onemocnění . Kromě rodu lze konkrétním zástupcem rodu nazvat virus Ebola - nejčastěji Zaire ebolavirus , který byl jako první z rodu izolován v roce 1976 v povodí řeky Ebola v Zairu , z čehož pochází název byl vytvořen . Ebolaviry, zejména druh ebolaviru Zair , byly příčinou několika vysoce medializovaných závažných epidemií .
Taxonomie viru Ebola se několikrát změnila. První typ viru byl izolován v roce 1976 (nyní nazývaný Zaire ebolavirus ), který se původně nazýval virus Ebola v řece Ebola protékající v Demokratické republice Kongo , kde došlo k propuknutí v roce 1976. Brzy byly objeveny další podobné viry, které byly původně označeny jako poddruh viru Ebola , a tato praxe se stále vyskytuje mezi virology; pokud však není specifikován žádný konkrétní druh, obvykle se předpokládá ebolavirus Zaire ; kromě psaní Ebola virus (samostatně, s velkým písmenem) se najde i srostlý - ebolavirus (srostlý, s malým písmenem). V roce 1998 byly tyto druhy rozděleny do samostatného rodu, původně pojmenovaného viry podobné ebole ( viry podobné ebole ) a v roce 2002 přejmenované na ebolavirus (nepřetržité hláskování) [2] . Od května 2016 byla ICTV schválena následující nomenklatura [3] : rod Ebolavirus , druh Bundibugyo ebolavirus , Reston ebolavirus , Súdánský ebolavirus , ebolavirus Taï Forest a typový druh Zaire ebolavirus .
Otázka, kam klást důraz v ruském názvu viru - na druhou slabiku ( „virus Ebola“ ) nebo první ( „virus Ebola“ ) zůstává otevřená [4] : některé zdroje, včetně lékařských terminologických slovníků , fixujte přízvuk na druhou slabiku [5] , jiné zdroje udávají přízvuk na první slabice [6] . Používá se také pravopis ebolavirus , konkrétně jej používá Rospotrebnadzor z Ruské federace [7] .
Rod Ebolavirus se dělí na šest druhů [8] . Na člověka působí pouze 4 druhy. Reston ebolavirus je obvykle asymptomatický, když je infikován lidmi . V roce 2018 byl v severní Sierra Leone objeven nový virus patřící do tohoto rodu, Bombali ebolavirus [9] , o jeho patogenitě pro člověka stále nejsou žádné informace.
Druh zairského ebolaviru ( Zaire ebolavirus [7] , Ebola virus, Ebola virus , EBOV) byl poprvé zaznamenán v Zairu (tehdejší Demokratická republika Kongo ), podle kterého dostal své jméno. Zairský ebolavirus je považován za typový druh rodu [8] a způsobil největší počet propuknutí [10] . Má nejvyšší úmrtnost, dosahuje 90 %. Průměrná úmrtnost se pohybuje kolem 83 %. Při vypuknutí v roce 1976 byla úmrtnost 88 %, v roce 1994 - 60 %, v roce 1995 - 81 %, v roce 1996 - 73 %, v letech 2001-2002 - 80 %, v roce 2003 - 90 % [10] .
První ohnisko bylo zaznamenáno 26. srpna 1976 v malém městě Yambuku . Prvním případem byl 44letý učitel školy. Příznaky nemoci se podobaly příznakům malárie . Předpokládá se, že počáteční šíření viru bylo usnadněno opakovaným používáním injekčních jehel bez sterilizace.
Súdánský druh ebolaviru (Sudan ebolavirus [7] , SUDV) byl zaznamenán téměř současně se zairským virem. Předpokládá se, že první ohnisko vzniklo mezi továrními dělníky v malém městě Nzara v Súdánu . Přenašeč tohoto viru nebyl nikdy identifikován, a to i přesto, že hned po propuknutí viru vědci testovali na přítomnost viru u různých zvířat (včetně hmyzu) žijících v okolí tohoto města.
Poslední ohnisko bylo zaznamenáno v listopadu 2012 - lednu 2013 v Ugandě . Průměrná úmrtnost byla 54 % v roce 1976, 68 % v roce 1979 a 53 % v letech 2000 a 2001 [10] .
Druh Reston ebolavirus (Reston ebolavirus [7] , RESTV) je klasifikován jako jeden z druhů viru Ebola. Na rozdíl od ostatních je tento druh asijského původu; jeho domovinou a zdrojem jsou Filipíny . Virus byl objeven během propuknutí viru opičí hemoragické horečky (SHFV) v roce 1989. Bylo zjištěno, že zdrojem viru byli makakové cynomolgus , kteří byli převezeni z Filipín do jedné z výzkumných laboratoří v Restonu , Virginie , USA [11] . Od té doby byla ohniska hlášena na Filipínách, v Itálii a ve Spojených státech [10] . Reston ebolavirus není patogenní pro člověka, ale je nebezpečný pro opice a prasata [11] .
Ebolavirus Taï Forest ( Taï Forest ebolavirus [7] , TAFV, dříve Cote d'Ivoire ebolavirus , CIEBOV) byl poprvé objeven u šimpanzů v Taï Forest v Pobřeží slonoviny v Africe. 1. listopadu 1994 byla objevena těla dvou šimpanzů . Pitva prokázala přítomnost krve v dutinách některých orgánů. Studie tkání šimpanzů přinesly stejné výsledky jako studie tkání lidí, kteří se nakazili ebolou v roce 1976 v Zairu a Súdánu.
Později, ve stejném roce 1994, byly nalezeny další mrtvoly šimpanzů, ve kterých byl nalezen stejný podtyp viru Ebola. Ebolou onemocněl jeden z vědců, kteří prováděli pitvu mrtvých opic. Příznaky onemocnění se objevily týden po pitvě mrtvoly šimpanze. Bezprostředně poté byl pacient převezen k léčbě do Švýcarska , která skončila úplným uzdravením šest týdnů po infekci [10] .
Dne 24. listopadu 2007 oznámilo ugandské ministerstvo zdravotnictví vypuknutí eboly v Bundibugyo . Po izolaci viru a jeho analýze ve Spojených státech potvrdila Světová zdravotnická organizace přítomnost nového typu viru Ebola - Bundibugyo ebolavirus (Bundibugo ebolavirus [7] , BDBV). 20. února 2008 ugandské ministerstvo zdravotnictví oficiálně oznámilo konec epidemie v Bundibugyo. Celkem bylo zaznamenáno 149 případů nákazy tímto novým typem eboly, 37 z nich bylo smrtelných . Poslední ohnisko onemocnění bylo v roce 2012 v DRC , úmrtnost byla 36 % [10] .
V roce 2018 byl v severní Sierra Leone v okrese Bombali objeven nový druh rodu Ebolavirus , který byl pojmenován Bombali ebolavirus [9] . Virus byl detekován v ústních a rektálních výtěrech dvou hmyzožravých druhů netopýrů, angolského mops condylurus a chaerephon pumilus . Později byl virus Bombali nalezen ve tkáních vnitřních orgánů angolských složených rtů Mops condylurus v Keni a Guineji [12] [13] . Tyto výsledky naznačují, že menší a angolské složené rty jsou rezervoárem hostitele viru Bombali. Oba tyto druhy netopýrů jsou široce rozšířeny v Africe, proto může mít virus Bombali také širší rozšíření.
Patogenita viru Bombali pro člověka zůstává nejasná. V experimentálních podmínkách je virus schopen infikovat lidské buňky in vitro [14] , ale neexistuje jediný potvrzený případ detekce viru u lidí. Nepřímým potvrzením hypotézy o nepatogenní povaze viru Bombali je jeho detekce u netopýrů, kteří žijí v koloniích v rámci sídlišť – na půdách stodol, obytných budov a administrativních budov [13] .
Viriony viru Ebola jsou podlouhlého tvaru a dosahují délky 1400 nm (1,4 μm) a šířky asi 80 nm (pro srovnání: průměr virionu HIV nebo viru chřipky je 100–120 nm, délka jednotlivé bakteriální buňky Escherichia coli je 1–3 μm, filoviry obecně patří mezi největší viry, s viriony co do velikosti až po mimivirech a megavirech ).
Mají membránovou pochvu, která je vytvořena z membrány infikované buňky. Separace zralé virové částice také zachycuje část membránových proteinů hostitelské buňky (například složky hlavního histokompatibilního komplexu nebo povrchové receptory), které zůstávají ve virovém obalu a mohou ovlivnit infekčnost viru. Kvalitativní a kvantitativní složení proteinů lidské buněčné membrány zachycených virovými částicemi není konstantní. Hlavní povrchový protein (glykoprotein) viru Ebola je kódován virovým genem gp a je nezbytný pro průnik obsahu částice do buňky. Svou strukturou a funkcemi se podobá povrchovému proteinu GP kódovanému virem imunodeficience a hemaglutininem viru chřipky: tvoří také trimery, z nichž každý z monomerů má transmembránovou a povrchovou podjednotku. Povrchový glykoprotein virů indukuje destrukci endoteliálních buněk a zprostředkovává vstup do hostitelské buňky. Přímo pod membránou virů je matrice, která má s největší pravděpodobností spirálovitou strukturu a je tvořena převážně proteinem VP40. Proteiny VP40 interagují jak s membránou virové částice, tak mezi sebou navzájem. Malá C-koncová doména je zodpovědná za interakci s membránou, zatímco relativně velká N-koncová doména se podílí na vzájemné interakci proteinů. Proteiny VP40 tvoří dimery, které následně oligomerizují za vzniku kruhových struktur, které mohou obsahovat různý počet dimerů. VP40 je také hlavním proteinem zodpovědným za oddělení zralé virové částice od infikované buňky. V samém středu virionu je nukleokapsida. Je to také šroubovitá struktura tvořená převážně velkým NP proteinem, se kterým interaguje virová RNA. Průměr šroubovice je asi 50 nm, zatímco uvnitř můžeme rozlišit kanál o průměru asi 20 nm. Nukleokapsida virů se strukturou podobá dobře prostudovanému nukleokapsidu lidského respiračního syncyciálního viru . Nukleokapsida obsahuje také protein VP24, jehož role není zcela jasná, ačkoli existují důkazy, že kromě strukturální složky může být tento protein antagonistou interferonu . Bylo zjištěno, že mutace v genu proteinu VP24 jsou spojeny s adaptací virů na různé hostitele (včetně savců jiných než primátů).
U lidí vyvolávají NP a VP40 silnou imunitní odpověď (vyvolávají tvorbu specifických imunoglobulinů třídy G ).
Uvnitř virionu je také RNA-dependentní RNA polymeráza (protein L) a minoritní proteiny VP30 a VP35. Nashromážděná data naznačují, že všechny jsou umístěny blíže k jednomu z konců virové částice. Nemají strukturální funkci. Polymeráza je zodpovědná za syntézu virové RNA. Jedná se o největší protein kódovaný virovým genomem (L znamená velký). Proteiny VP30 a VP35 jsou transkripční faktory a antagonisté interferonové odpovědi. VP35 také hraje roli virového polymerázového kofaktoru.
V důsledku pučení se do prostoru uvnitř virionu dostávají i různé buněčné proteiny, mezi nimiž jsou zastoupeny především složky cytoskeletu infikovaných buněk. Množství cytoplazmy , které je absorbováno viriony během zrání a separace od buňky, se může lišit. To ovlivňuje jak buněčné proteiny, které se nacházejí ve virionech, tak morfologii virové částice, která někdy nabývá kyjovitého tvaru.
Genom je reprezentován jednovláknovou RNA , obsahuje 7 genů (kódujících 7 strukturálních a jeden nestrukturální protein) a má délku asi 19 000 nukleotidů . Pořadí genů v genomu: 3'-koncová vedoucí oblast, nukleoproteinový gen (velikost - 2167 nukleotidů), virové proteiny VP35, VP40 (1069 nukleotidů), glykoprotein (2174 nukleotidů), VP30, VP24 (853 nukleotidů), RNA -dependentní RNA-polymeráza (L protein), 5' konec. Nejvariabilnější (podléhající mutacím) jsou oblasti genomu odpovídající genům proteinu VP35, VP24 a střední část genu hlavního povrchového glykoproteinu (hypervariabilní oblast o velikosti 180 nukleotidů). Mutace v genech těchto proteinů pravděpodobně ovlivňují virulenci kmenů v rámci stejného druhu viru. Nukleoproteinový gen je nejstabilnější z hlediska výskytu mutací, což z tohoto proteinu činí nejslibnější cíl pro tvorbu antivirotik.
Obecně, na rozdíl od velkých RNA virů, se původce Ebola vyznačuje vysokou genetickou stabilitou, která může být způsobena čtyřmi hlavními faktory: nízká chyba ve specifickém působení RNA polymerázy , spíše pomalá replikace v přirozeném rezervoáru infekce, omezená počet citlivých přirozených hostitelů a slabý imunitní tlak. Přesto jsou četnosti mutací v genomech virů již během zaznamenaných epidemií charakterizovány jako vysoké . Vzhledem k tomu, že povaha vlivu mutací v genomech ebolavirů na jejich vlastnosti (zejména virulenci ) není dostatečně pochopena, vyžaduje to co nejrychlejší eliminaci nově vznikajících epidemií horečky Ebola [15] [16] .
Virus Ebola způsobuje nebezpečné onemocnění – hemoragickou horečku Ebola [17] . K infekci dochází kontaktem prostřednictvím tělních tekutin [18] . Virus se na člověka přenáší z infikovaných zvířat při jejich konzumaci (při špatné tepelné úpravě), při krájení jejich masa (když se kapky dostanou do očí, nosu a jiných sliznic) prostřednictvím ovoce, které sežrala infikovaná zvířata. Z člověka na člověka – krví, jinými tekutinami a tkáněmi infikované osoby, může se přenášet i kontaktem sliznic zdravého člověka s oděvem a ložním prádlem pacienta [19] [20] . Dokud se u infikované osoby nerozvinou příznaky, není nakažlivá [20] . K přenosu viru vzduchem nedochází [18] . Inkubační doba je od 2 do 21 dnů.
Ebola se vyznačuje náhlým zvýšením tělesné teploty, silnou celkovou slabostí, bolestmi svalů a hlavy a bolestí v krku . Často je doprovázeno zvracením , průjmem , vyrážkou, poruchou funkce ledvin a jater a v některých případech vnitřním i zevním krvácením . Laboratorní testy odhalují nízké hladiny bílých krvinek a krevních destiček spolu se zvýšenými hladinami jaterních enzymů [19] .
Od svého objevení v roce 1976 způsobily ebolaviry, zejména druh ebolaviru Zair , několik vážných epidemií. Podle US Centers for Disease Control , v jednom z nich do 20. října 2015 onemocnělo 30 939 lidí, z toho 12 910 (42 %) zemřelo [21] .
V roce 2016 byly provedeny klinické testy první vakcíny proti ebole vyvinuté v Kanadě, které prokázaly její vysokou účinnost [22] [23] .
![]() | |
---|---|
Taxonomie | |
V bibliografických katalozích |