Kmen koronaviru SARS-CoV-2 delta ( kmen B.1.617.2 [1] ) je jedním z kmenů viru SARS-CoV-2 , původce COVID-19 , patřícího do generace B.1.617 linka . Poprvé objeven a popsán v Indii [2] .
K přenosu dochází v různých věkových skupinách, včetně jedinců ve věku 12 až 20 let [3] . Inkubační doba není 3–7 dní, ale 1–3 dny [4] . Ve srovnání s jinými kmeny je také zvýšená virová zátěž [4] . Doba vylučování patogenu z těla je 13-15 dní, zatímco u ostatních kmenů je to 7-9 dní [4] .
Způsobuje vážné příznaky nachlazení včetně malátnosti, horečky, migrény (bolesti hlavy), bolesti v krku, kašle a rýmy [3] [5] . Riziko hospitalizace ve srovnání s alfa kmenem je 1,85krát vyšší [3] .
Od konce prosince 2021 je delta kmen rychle nahrazován omikronovým kmenem v zemích, kde se omikronový kmen začal šířit [6] (zejména se tak děje v Dánsku, Norsku, Spojeném království a USA) [7] .
Bylo zjištěno, že kmen delta má mutaci P681R. V důsledku toho se změnil malý fragment S-proteinu a virus se stal infekčnějším [2] .
Dne 14. června 2021 byla v Indii objevena mutovaná varianta B.1.617.2, která je známá jako varianta AY.1 neboli „delta plus“ [8] . "Delta plus" se vyznačuje přítomností mutace K417N v spike proteinu, která může snížit aktivitu protilátek u uzdravených a očkovaných lidí [9] . Ministerstvo zdravotnictví Indie jmenovalo tři charakteristické znaky „delta plus“: zvýšená nakažlivost, zvýšená schopnost vázat se na receptory plicních buněk a potenciální odolnost vůči terapii monoklonálními protilátkami [10] . "Delta Plus" má mutaci K417N v spike proteinu (tj. v spike proteinu viru), v důsledku toho se virus váže na lidské plicní buňky rychleji. Bylo navrženo, že K417N také pomáhá viru vyhýbat se neutralizačním protilátkám. Podobné mutace se nacházejí u kmenů " beta " a " gama ". [jedenáct]
V říjnu 2021 britští virologové při sledování vývoje kmene delta objevili nový kmen AY.4.2, který je nakažlivější než předchozí kmeny. AY.4.2 je o 10-15 % infekčnější než kmen delta. Ve Spojeném království představuje jeden z deseti případů infekce koronavirem v zemi [12] [13] .
Do začátku července 2021 Světová zdravotnická organizace zaznamenala kmen delta v 98 zemích s vysokou i nízkou proočkovaností populace, v mnoha zemích se stává dominantním [14] .
Feng Zijian, výzkumník z Čínského centra pro kontrolu a prevenci nemocí, se domnívá, že je pravděpodobné, že kmen delta se stane celosvětově dominantním [15] .
V Rusku byly první případy kmene detekovány v dubnu 2021 a v červnu byla prevalence kmene delta 41 %. [16] . Podle informací z poloviny června 2021 byl podíl delta kmene (B.1.617 podle klasifikace PANGO) za předchozí čtyři týdny v Rusku 63,2 %, jak je uvedeno na mezinárodní platformě GISAID , která poskytuje otevřený přístup ke genomovým sekvencím virů chřipky a koronaviru a geografickým údajům o distribuci variant koronaviru. Podobná data lze nalézt v databázi projektu CoVariants Univerzity v Bernu a Basileji ve Švýcarsku, která naznačila, že v druhé polovině května 2021 byl podíl delta kmene pro sekvenované vzorky z Ruska 66 % [17]. . Podle ruského konsorcia pro sekvenování genomu SARS-CoV-2 (Coronavirus Russian Genetic Initiative, CoRGI) zaujímal kmen delta o něco více než polovinu (52 %) ve vzorcích získaných v Petrohradě v květnu 2021 a v červnu 2021 — více než 90 % [18] [19] .
V Petrohradě se delta varianta rozšířila za 2 měsíce a na konci druhé dekády června 2021 nahradila alfa kmen . Petrohrad je jediným regionem v Rusku s dostatečnými údaji o sekvenování virových kmenů [2] .
Dne 29. června 2021 oznámila vedoucí Rospotrebnadzor, Anna Popova, že v Rusku byla objevena varianta kmene delta - „delta plus“. [dvacet]
13. července 2021 hlavní sanitární lékař Rostovské oblasti řekl, že za poslední 3 týdny specialisté Rospotrebnadzor zjišťovali pouze kmen delta, zatímco v 90 % případů jeho nosiči necestovali do zahraničí. Kromě toho poznamenal, že tento kmen je detekován u občanů přijíždějících z Tádžikistánu, Uzbekistánu a Kyrgyzstánu [21] .