Kmeny SARS-CoV-2

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 5. června 2022; kontroly vyžadují 3 úpravy .

Kmeny SARS-CoV-2  jsou odrůdy koronaviru SARS-CoV-2 , které jsou považovány za zvláště důležité [1] . Genetická sekvence WIV04/2019 je pravděpodobně původní kmen , který infikuje lidi, známý jako „genetická sekvence nula“ [2] .

Označují se písmeny řecké abecedy .

Systém pojmenování

Světová zdravotnická organizace se ve snaze nepoužívat georeferencování v názvech kmenů nového koronaviru [3] rozhodla v květnu 2021 označit je písmeny řecké abecedy. To vylučuje jména „britský“, „brazilský“ atd., spojená se jmény těch zemí, kde byly příslušné kmeny poprvé objeveny [4] . Konkrétně nový kmen SARS-CoV-2 objevený v listopadu 2021 byl pojmenován „omikron“ [5] .

Současně se upustilo od používání písmen „ nu “ a „ xi “ [6] : první připomíná anglické slovo new (new) a druhé - čínské příjmení Xi, což je zejména Xi Ťin- pching [7] [8] .

Kontingenční tabulka

Riziko:   velmi vysoký   vysoký   průměrný   krátký

název První objev Významné mutace Klinické změny
SZO pangolin Místo datum Přenosnost Úmrtnost
Beta B.1.351
Jižní Afrika 		května 2020 N501Y, K417N, E484K +25 % (20-30 %) [9] Případně rostoucí
Epsilon B.1.427,
B.1.429
USA 		července 2020 +20 % (19–24 %)
lambda C.37
Peru 		srpna 2020
Alfa B.1.1.7
Velká Británie 		20. září 2020 [10] N501Y, 69-70del, P681H +29 % (24–33 %) [9] +59 % (44–74 %)
Delta B.1.617.2
Indie 		října 2020 L452R, T478K, P681R +97 % (76–117 %) [9] [11] +137 % (50–230 %) [12]
Gamma B.1.1.28
(P.1)
Brazílie 		listopadu 2020 K417T, E484K, N501Y +38 % (29–48 %) [9] +50 % (20–90 %)
Zeta B.1.1.28
(P.2)
Brazílie 		listopadu 2020
Iota B.1.526
USA 		listopadu 2020
Toto B.1.525
Spojené království Nigérie

prosince 2020
Kappa B.1.617.1
Indie 		prosince 2020
Mu B.1.621
Kolumbie 		ledna 2021
Theta B.1.1.28
(P.3)
Filipíny 		února 2021
Omicron B.1.1.529
Jižní Afrika Botswana

8. listopadu 2021 [13] Zvýšeno [14] [15] −75 % [16] [Comm. jeden]

Hromady

Korespondenční tabulka pro různé názvy odrůd SARS-CoV-2
Čáry podle Rambauta a dalších. Poznámky k Rambaut et al. Nextstrain clades GISAID clades Významné kmeny nebo mutace
A.1-A.6 19B S
B.3–B.7 , B.9 , B.10 , B.13 – B.16 19A L
Ó
B.2 PROTI
B.1 B.1.5–B.1.72 20A G Linie B.1 od Rambauta et al., zahrnuje kmeny s mutací D614G
B.1.9 , B.1.13 , B.1.22 , B.1.26 , B.1.37 GH
B.1.3–B.1.66 20C Obsahuje kmen 501.V2
B.1.1 20B GR Zahrnuje kmen 202012/01 , kmeny B.1.1.207 a B.1.1.284
B.1.177 20A.EU1 [17] GV

V přírodě existuje několik tisíc kmenů viru SARS-CoV-2. Oni jsou obvykle seskupeni do velkých skupin volal clades . Bylo navrženo několik různých nomenklatur kladů pro SARS-CoV-2.

Významné virové kmeny

Strains of Concern (VOC)

Níže jsou uvedeny kmeny uvedené WHO jako znepokojené (Varianty znepokojení) [18] .

Alfa (řádek B.1.1.7)

Kmen 202012/01 (VOC-202012/01), dříve známý jako první kmen zkoumaný v prosinci 2020 (VUI - 202012/01) a také jako linie B.1.1.7 nebo 20B/501Y.V1, byl poprvé detekován v října 2020 během pandemie COVID-19 ve Spojeném království ze vzorku odebraného v předchozím měsíci. Od té doby se jeho šance na dominantní postavení zdvojnásobily každých 6,5 dne (odhadovaný generační interval). To koreluje s významným nárůstem výskytu COVID-19 ve Spojeném království. Předpokládá se, že toto zvýšení je alespoň částečně způsobeno změnou N501Y v doméně spike glykoproteinu vázajícího receptor, která je nezbytná pro vazbu na ACE2 v lidských buňkách.

Existují určité důkazy, že tato varianta má o 30–70 % zvýšenou přenosnost a předběžné studie naznačují zvýšenou letalitu [19] .

2. února 2021 britští úředníci oznámili, že z 214 000 geneticky sekvenovaných vzorků tohoto kmene mělo 11 také mutaci E484K [20] [21] . Jedna z mutací (N501Y) je také přítomna v kmenech beta a gama.

31. května 2021 Světová zdravotnická organizace oznámila, že pro použití ve veřejné komunikaci bude britský kmen označován jako „alfa“ [22] [23] .

Beta (řádek B.1.351)

Kmen 501.V2, také známý jako linie 501.V2, 20C/501Y.V2 nebo B.1.351, byl poprvé identifikován v Jižní Africe, jak oznámilo jihoafrické ministerstvo zdravotnictví 18. prosince 2020. Výzkumníci a úředníci uvedli, že prevalence tohoto kmene byla vyšší u mladých dospělých bez jakéhokoli základního onemocnění a ve srovnání s jinými kmeny je pravděpodobnější, že v těchto případech způsobí vážné onemocnění. Jihoafrické ministerstvo zdravotnictví také uvedlo, že tento kmen může být hnacím motorem druhé vlny pandemie COVID-19 v zemi kvůli skutečnosti, že se kmen šíří rychleji než jiné dřívější kmeny viru.

Vědci poznamenali, že tento kmen obsahuje několik mutací, které mu umožňují snadněji se připojit k lidským buňkám. Jedná se o tři mutace v doméně vázající receptor (RBD) v spike glykoproteinu viru: N501Y [24] [25] (místo aminokyseliny asparaginu (N) aminokyseliny tyrosinu (Y) [26] na pozici 501), K417N a E484K [27] [28] . Dvě z těchto mutací (E484K a N501Y) jsou v motivu vazby receptoru (RBM) v doméně vázající receptor (RBD) [29] .

Nový kmen byl objeven sekvenováním genomu . Několik genomových sekvencí z této linie bylo předloženo do databáze sekvencí GISAID ( Global I nitiative on S haring A via I nfluenza D ata) , například sekvence EPI_ISL_678597 [30] .

4. ledna 2021 The Telegraph oznámil, že oxfordský imunolog Sir John Bell věří, že nový jihoafrický kmen vyvolává „velkou otázku“, protože by mohl být odolný vůči vakcínám, čímž by rozbil naděje a nahradil je strachem [31] . Téhož dne profesor vakcinologie Shabir Madhi řekl CBS News, že není jisté, že nový kmen 501.V2 bude schopen „obejít“ ochranu vakcíny, ale věří, že „může být méně účinný“ [32 ] . Další mutace v spike proteinu v kmeni 501.V2 byly citovány docentem buněčné mikrobiologie z University of Reading Simonem Clarkem jako znepokojivé, protože "mohou způsobit, že virus bude méně náchylný k imunitní odpovědi vyvolané vakcínou." Lawrence Young, virolog na University of Warwick, také poznamenal, že mnohočetné mutace hrotu u tohoto kmene „mohou vést k určitému úniku z imunitní obrany“ [33] .

Ugur Sahin, generální ředitel společnosti BioNTech , uvedl, že je zapotřebí dalšího výzkumu, aby se zajistilo, že současná vakcína společnosti funguje proti kmenu 501.V2, pokud však bude potřeba vakcínu upravit, společnost tak může učinit přibližně za 6 týdnů [ 34] . Dne 8. ledna 2021 Guardian oznámil, že vakcína COVID-19 společnosti Pfizer a BioNTech prokázala v testech zahrnujících 20 krevních testů, že je schopna poskytnout ochranu proti kmeni 501.V2. Pro stanovení přesného stupně ochrany je zapotřebí další výzkum [35] .

Gamma (řádek B.1.1.248)

Linie B.1.1.248 byla objevena v Tokiu 6. ledna 2021 Národním institutem pro infekční choroby (NIID). Nový kmen byl nalezen u čtyř lidí, kteří dorazili do Tokia z Amazonas 2. ledna 2021. Brazilská státní nadace Oswaldo Cruz potvrdila jejich domněnku, že tento kmen byl běžný v amazonském deštném pralese. Tento kmen SARS-CoV-2 má 12 mutací v spike proteinu, včetně N501Y a E484K.

Předtiskový papír od Caroline M. Voloch a kol., identifikoval novou linii SARS-CoV-2, 'B.1.1.248', distribuovanou v Brazílii, odvozenou od kmene B.1.1.28. Popisuje, že nový kmen se poprvé objevil v červenci a byl poprvé detekován v říjnu, ale v době zveřejnění (prosinec 2020), ačkoli se jeho frekvence výrazně zvýšila, jeho distribuce byla stále většinou omezena na hlavní město státu Rio de Janeiro.

Tento kmen způsobil propuknutí ve městě Manaus , a to navzdory skutečnosti, že město zažilo masivní infekci již v květnu [36] a studie ukázala [37] vysokou prevalenci sérotypů protilátek SARS-CoV-2 [38] .

11. února 2021 šéf brazilského ministerstva zdravotnictví Eduardo Pazuello oznámil, že tento kmen je třikrát infekčnější než „originální“ SARS-CoV-2 [39] .

Delta (řádek B.1.617.2)

V říjnu 2020 byla linie B.1.617.2 poprvé zjištěna v Indii [40] [41] [42] . V druhé polovině dubna 2021 se do Ruska dostal kmen Indian Delta [43] .

14. června 2021 byla v Indii objevena mutovaná varianta B.1.617.2, která je známá jako AY.1 nebo delta plus varianta [44] . "Delta plus" se vyznačuje přítomností mutace K417N v spike proteinu, která může snížit aktivitu protilátek u uzdravených a očkovaných lidí [45] . Ministerstvo zdravotnictví Indie jmenovalo tři charakteristické znaky „delta plus“: zvýšená nakažlivost, zvýšená schopnost vázat se na plicní buněčné receptory a potenciální odolnost vůči terapii monoklonálními protilátkami [46] .

V říjnu 2021 britští virologové při sledování vývoje kmene delta objevili nový kmen AY.4.2, který je nakažlivější než předchozí kmeny. AY.4.2 je o 10-15 % infekčnější než kmen delta. Ve Spojeném království představuje jeden z deseti případů infekce koronavirem v zemi [47] [48] .

Omicron (řádek B.1.1.529)

V listopadu 2021 byla linie B.1.1.529 poprvé detekována v Botswaně a Jižní Africe. Liší se velkým počtem mutací v popeloměrech [49] . Podle britského úřadu pro zdravotní bezpečnost má tato varianta spike protein, který se výrazně liší od původního koronaviru (varianta, na které jsou vakcíny založeny), což vyvolává obavy o účinnost stávajících vakcín. Objev nového kmene vyvolal 26. listopadu 2021 celosvětovou paniku. Mnoho zemí pozastavilo cestování z Jižní Afriky a akciové trhy na obou stranách Atlantiku zažily nejhorší poklesy za více než rok [50] . Britský premiér Boris Johnson oznámil, že země zavádí povinný test PCR pro všechny vstupující do země a vlastní izolaci, dokud nebude získán negativní výsledek. Povinná desetidenní izolace je také zavedena pro ty, kteří jsou podezřelí z infekce kmenem omikron [51] .

Strains of Interest (VOI)

Níže jsou uvedeny kmeny uvedené WHO jako zajímavé varianty [18] .

Lambda (řádek C.37)

V srpnu 2020 byla linie C.37 poprvé zjištěna v Peru [52] . V červnu 2021 v Peru představoval kmen lambda 81 % všech případů hlášených v zemi. V Argentině a Chile je podíl „lambdy“ asi třetinový [53] .

Ostatní

Toto (řádek B.1.525)

Linie B.1.525, také známá jako VUI-202102/03 nebo UK1188, je částečně podobná kmenu 501.V2, ale liší se přítomností mutace E484K a nové mutace F888L (substituce fenylalaninu (F) za leucin ( L) v doméně S2 spike protein). K 16. únoru byl kmen detekován v 15 zemích, včetně Spojeného království, Dánska, Finska, Nizozemska, Belgie, Francie, Španělska, Nigérie, Ghany, Jordánska, Japonska, Singapuru, Austrálie, Kanady a USA. První případy byly identifikovány v prosinci 2020 ve Spojeném království a Nigérii a od 15. února se jedná o nejčastěji izolovaný kmen v Nigérii. K 15. únoru bylo ve Spojeném království identifikováno 38 případů infekce. Dánsko identifikovalo 55 případů infekce tímto kmenem od 14. ledna do 9. února, sedm z nich přímo souviselo se zahraničním cestováním.

Britští experti studují rizika spojená s tímto kmenem. V současné době je považován za „prošetřovaný kmen“, ale jak bude k dispozici více údajů, může se stát „objemovým kmenem“. Profesor Ravi Gupta z University of Cambridge řekl BBC, že B.1.525 má podle všeho "významné mutace" již pozorované u některých dalších nových kmenů, což je poněkud uklidňující, protože jejich pravděpodobný účinek je do jisté míry předvídatelnější.

Mutace v tomto kmeni zahrnují E484K, deleci v pozicích 69-70, nové mutace Q677H (glutamin na histidin v pozici 677) a F888L (fenylalanin na leucin v pozici 888) [54] .

Cluster 5

Cluster 5, také nazývaný ΔFVI-spike Dánským státním institutem pro sérum (SSI) , byl nalezen v Severním Jutsku v Dánsku . Předpokládá se, že se přenesl z norků na lidi na norkových farmách. 4. listopadu 2020 bylo oznámeno, že populace norků v Dánsku bude utracena, aby se zabránilo možnému šíření této mutace a snížilo se riziko výskytu nových mutací. Uzamčení a cestovní omezení byla zavedena v sedmi obcích v Severním Jutsku, aby se zabránilo šíření mutace, která by mohla ohrozit účinnost národních nebo mezinárodních reakcí na pandemii COVID-19.

Světová zdravotnická organizace (WHO) uvedla, že shluk 5 má „středně sníženou citlivost na neutralizační protilátky“. SSI varovala, že mutace by mohla snížit účinek vyvíjených vakcín COVID-19, i když je nepravděpodobné, že by je učinila nepoužitelnými.

Po karanténě a hromadném testování SSI 19. listopadu 2020 oznámila, že cluster 5 je se vší pravděpodobností zaniklý [55] .

Významné mutace

D614G

D614G je mutace ovlivňující spike protein SARS-CoV-2. Kmen G ( glycin na pozici 614) se během pandemie zvýšil, pravděpodobně poté, co původně pochází z Číny a poté se v lednu rozšířil do Itálie a odtud do celého světa. G nahradil D ( kyselinu asparagovou ) v mnoha zemích, zejména v Evropě, a poněkud pomaleji v Číně a zbytku východní Asie, což podporuje hypotézu, že G zvyšuje rychlost přenosu, což je v souladu s vyššími virovými titry a in vitro infekčností . 56] .

V červenci 2020 bylo hlášeno, že nakažlivější D614G kmen SARS-CoV-2 se stal dominantní formou pandemie [57] [58] [59] .

Globální prevalence D614G koreluje s prevalencí ztráty čichu ( anosmie ) jako příznaku COVID-19, pravděpodobně zprostředkované vyšší vazbou tohoto kmene na receptor ACE2 nebo vyšší stabilitou odpovídajícího proteinu, a tedy vyšší infekčností vůči čichům. epitel [60] .

Viry obsahující mutaci G považuje GISAID za součást kladu G [56] a pomocí[ upřesnit ] PANGOLIN ( Phylogenetic A ssignment of N med G lobal O eages LIN eages )  — patří do kladu B1 [61] .

E484K

Uvádí se, že E484K je mutace propůjčující rezistenci na alespoň jednu formu anti-SARS-CoV-2 monoklonálních protilátek, což ukazuje na „možnou změnu antigenicity“. Kmeny B.1.1.248 (Brazílie/Japonsko) a 501.V2 (Jižní Afrika) obsahují tuto mutaci. Název mutace, E484K, označuje nahrazení kyseliny glutamové (E) lysinem (K) na pozici aminokyseliny 484. Uvádí se, že monoklonální a sérové ​​protilátky jsou 10-60krát méně účinné při neutralizaci viru nesoucího mutaci E484K [62] [63] .

N501Y

N501Y představuje změnu z asparaginu (N) na tyrosin (Y) na pozici aminokyseliny 501. Public Health England považuje tuto změnu za zvýšení vazebné afinity k receptoru díky své poloze v doméně spike glykoproteinu, která se váže na receptor. ACE2 receptor v lidských buňkách; data také podporují hypotézu zvýšené vazebné afinity v důsledku této změny. Mezi kmeny s N501Y patří B.1.1.248 (Brazílie/Japonsko), „kmen vzbuzující obavy“ 202012/01 (UK), 501.V2 (Jižní Afrika) a kmen Columbus, Ohio, který se stal dominantní formou viru v Columbusu na konci prosince 2020 a v lednu. Poslední jmenovaný byl pojmenován COH.20G/501Y a zdá se, že se vyvinul nezávisle na jiných kmenech.

Nová platforma pro hodnocení kmenů

26. ledna 2021 britská vláda uvedla, že bude sdílet své schopnosti sekvenování genomu s dalšími zeměmi, aby zvýšila rychlost sekvenování a sledovala nové kmeny [64] . Od ledna 2021 byla více než polovina veškerého sekvenování genomu COVID-19 provedena ve Spojeném království [65] .

Účinnost vakcíny

Předběžná studie společnosti Pfizer, Inc. ukázala, že došlo pouze k mírnému snížení účinnosti jejich mRNA vakcíny proti novým kmenům SARS-CoV-2 [66] . Podle článku publikovaného 28. ledna 2021 na webu US Centers for Disease Control je výskyt mutantních kmenů, které se zcela vyhýbají imunitní reakci, považován za nepravděpodobný vzhledem k povaze viru [67] .

Řešením problému snížené účinnosti vakcín proti novým kmenům může být možná T-buněčná imunita. Biotechnologická firma Gritstone Oncology z Emeryville, Kalifornie, USA vyvíjí vakcínu speciálně navrženou k navození imunity T-buněk [68] . Peptidová vakcína vyvíjená na univerzitě v Tübingenu v Německu se pokouší vyvolat imunitu T-buněk spíše než protilátky [69] .

Dne 29. ledna 2021 se zástupkyně moskevské městské dumy Daria Besedina obrátila na ministra zdravotnictví Ruské federace s žádostí o financování studie nových kmenů a provedení studií o účinnosti ruských vakcín proti těmto kmenům [70][ význam skutečnosti? ] . Dne 10. února 2021 vydala Evropská léková agentura podobnou výzvu výrobcům vakcín [71] . 15. února ruský prezident Vladimir Putin nařídil vládě, aby do měsíce nasadila sekvenování genomu ruských kmenů SARS-CoV-2, vyčlenila finanční prostředky na tyto studie a také zkontrolovala, zda jsou ruské vakcíny proti novým kmenům účinné [72] .

19. února 2021 společnost Pfizer oznámila, že její vakcína produkuje přibližně o 66 % méně protilátek aktivních proti jihoafrickému kmeni 501.V2 ve srovnání s „klasickým“ kmenem, přičemž imunitní systém je stále schopen virus úspěšně neutralizovat [73] .

Údaje izraelského ministerstva zdravotnictví za červenec 2021 naznačují pokles účinnosti vakcíny americké společnosti Pfizer během měsíce na 39 % v prevenci infekce delta kmenem koronaviru, ale vakcína nadále chrání 88 % před hospitalizace a 91,4 % z těžkých případů onemocnění . [74]

Komentáře

  1. ↑ Údaje získané monitorováním pacientů v nemocnici v městské části Tswane ( provincie Gauteng , Jižní Afrika) Národním institutem infekčních chorob a Univerzitou v Pretorii . Viz: Vědci z Jižní Afriky zveřejnili údaje o úmrtnosti na kmen omikronů Archivní kopie ze dne 2. ledna 2022 na Wayback Machine // RBC , 30.12.2021.

Poznámky

  1. ↑ KDO | Varianty SARS-CoV-2 (nedostupný odkaz) . KDO . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 5. ledna 2021. 
  2. ↑ Anna Zhuková, Luc Blassel, Frederic Lemoine, Marie Morel, Jakub Voznica. Původ, vývoj a globální šíření SARS-CoV-2  // Comptes Rendus. Biologie. - 0. - T. 0 , ne. 0 _ - doi : 10.5802/crbiol.29 . Archivováno z originálu 21. února 2021.
  3. ↑ Prohlášení o práci šestého zasedání Výboru pro mezinárodní zdravotní předpisy (2005) k mimořádné situaci v souvislosti s pandemií ‎koronavirovou infekcí ( COVID 4. prosince 2021 na Wayback Machine // Článek ze dne 15.01.2021 // Světová zdravotnická organizace, oficiální stránky, 15.01.2021.
  4. ↑ Kmeny koronaviru obdrží řecká písmena _ _
  5. ↑ Nový kmen koronaviru s názvem „Omicron“ Archivní kopie ze dne 27. února 2022 na Wayback Machine // Organizace spojených národů, oficiální stránky, 26.11.2021
  6. ↑ „Nu“ padlo, „Xi“ zmizelo Archivní kopie z 1. prosince 2021 na Wayback Machine // „ Moskva 24 “, 29. 11. 2021.
  7. ↑ WHO vysvětlila název kmene „ omikron “ a vynechání dvou písmen abecedy
  8. ↑ Chybějící písmena: proč WHO pojmenovala nový kmen „ omikron “
  9. ↑ 1 2 3 4 Campbell F, Archer B, Laurenson-Schafer H, Jinnai Y, Konings F, Batra N a kol. (červen 2021). „Zvýšená přenositelnost a globální šíření variant SARS-CoV-2 vzbuzujících obavy v červnu 2021“. Eurosurveillance . 26 (24): 2100509. DOI : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  10. ↑ Předběžná genomická charakterizace vznikající linie SARS-CoV-2 ve Spojeném království definovaná novou sadou hrotových mutací . Virologické (18. prosince 2020). Získáno 14. června 2021. Archivováno z originálu dne 21. prosince 2020.
  11. ↑ Finlay Campbell, Brett Archer, Henry Laurenson-Schafer, Yuka Jinnai, Franck Konings. Zvýšená přenositelnost a globální šíření variant SARS-CoV-2 vzbuzujících obavy k červnu 2021  // Eurosurveillance. — 2021-06-17. - T. 26 , č.p. 24 . — ISSN 1025-496X . - doi : 10.2807/1560-7917.ES.2021.26.24.2100509 .
  12. ↑ David N. Fisman, Ashleigh R. Tuite. Progresivní nárůst virulence nových variant SARS-CoV-2 v Ontariu, Kanada   // medRxiv . — 2021-08-04. — S. 2021.07.05.21260050 . - doi : 10.1101/2021.07.05.21260050 . Archivováno z originálu 2. září 2021.
  13. ↑ Omicron se stává dominantní variantou v Jižní Africe  (2. prosince 2021). Archivováno z originálu 2. prosince 2021. Staženo 21. prosince 2021.
  14. ↑ "Omicron" identifikovaný ve 110 zemích po celém světě . " Kommersant " (24. prosince 2021). Získáno 24. prosince 2021. Archivováno z originálu dne 24. prosince 2021.
  15. ↑ Murashko hovořil o výsledcích cesty ruských specialistů do Jižní Afriky Archivní kopie ze dne 29. prosince 2021 na Wayback Machine // TASS , 25.12.2021.
  16. ↑ Vědci z Jižní Afriky zveřejnili údaje o úmrtnosti na kmen omikronů Archivní kopie z 2. ledna 2022 na Wayback Machine // RBC , 30. 12. 2021.
  17. ↑ Aktualizace COG-UK o mutacích Spike SARS-CoV-2 zvláštního zájmu: Zpráva 1, COVID-19 Genomics UK Consortium (COG-UK), 20. prosince 2020, s. 2 , < https://web.archive.org/web/20201225050316/https://www.cogconsortium.uk/wp-content/uploads/2020/12/Report-1_COG-UK_20-December-2020_SARS-CoV-2 -Mutations_final_updated2.pdf > . Staženo 18. ledna 2021. . 
  18. ↑ 1 2 Sledování variant SARS-CoV-2 . Získáno 29. listopadu 2021. Archivováno z originálu dne 6. června 2021.
  19. ↑ Koronavirus: varianta pro Spojené království „může být smrtelnější“ , BBC News  (22. ledna 2021). Archivováno 23. května 2021. Staženo 3. února 2021.
  20. ↑ Rachael Rettner-Senior Writer 2. února 2021. Britská varianta koronaviru vyvíjí mutaci vyhýbající se vakcíně  . livescience.com . Získáno 3. února 2021. Archivováno z originálu dne 2. února 2021.
  21. ↑ Achenbach, Joel . Znepokojivá mutace koronaviru pozorovaná ve variantě pro Spojené království a v některých vzorcích z USA , Washington Post . Archivováno z originálu 2. února 2021. Staženo 3. února 2021.
  22. ↑ Vysvětleno: Proč WHO pojmenovala varianty Covid-19 nalezené v Indii jako „Kappa“ a „Delta“ | India News - Times of India  (anglicky) . The Times of India . Získáno 2. června 2021. Archivováno z originálu dne 25. listopadu 2021.
  23. ↑ WHO oznamuje jednoduché, snadno vyslovitelné štítky pro SARS-CoV-2 Variants of Interest and  Concern . www.who.int . Získáno 6. června 2021. Archivováno z originálu dne 6. prosince 2021.
  24. ↑ Fink, Sheri . Jižní Afrika oznamuje novou variantu koronaviru. , The New York Times  (18. prosince 2020). Archivováno z originálu 21. prosince 2020. Staženo 5. ledna 2021.
  25. ↑ Kompletní prezentace SSAK – 18. prosince | virus | Mutace . Scribd . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 6. ledna 2021.
  26. ↑ 3AA-1 a 3AA-2 . web.archive.org (9. října 2008). Staženo: 5. ledna 2021.
  27. ↑ Prohlášení pracovní skupiny WHO pro zvířecí modely COVID-19 (WHO-COM) o nových variantách SARS-CoV-2 ve Spojeném království a Jižní Africe (PDF), Světová zdravotnická organizace . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 7. října 2021.
  28. ↑ Derek Lowe 22.  prosince 2020. Nové mutace  ? . In the Pipeline (22. prosince 2020). Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 29. ledna 2021.
  29. ↑ reakce expertů na jihoafrickou variantu SARS-CoV-2, jak ji zmínil Matt Hancock na tiskovém briefingu v Downing Street | Science Media   Center ? . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 8. října 2021.
  30. ↑ „Varianta COVID-19 GISAID Acknowledgement Threat Assessment UK“ (PDF) . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 28. října 2021.
  31. ↑ Knapton, Sarah . Jihoafrická varianta se může vyhnout vakcínám a testování, varují vědci , The Telegraph  (4. ledna 2021). Archivováno z originálu 15. prosince 2021. Staženo 5. ledna 2021.
  32. ↑ Vakcíny proti COVID „nemusí“ fungovat stejně dobře na jihoafrický kmen,   varují vědci ? . www.cbsnews.com . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 3. prosince 2021.
  33. ↑ Britští vědci se obávají, že vakcíny nemusí chránit proti variantě koronaviru nalezené v Jižní Africe | Zprávy CBC , CBC . Archivováno z originálu 5. ledna 2021. Staženo 5. ledna 2021.
  34. ↑ Vakcína BioNTech pro novou variantu COVID-19 by mohla být připravena za 6  týdnů . euronews (22. prosince 2020). Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 8. ledna 2021.
  35. ↑ Geddes, Linda . Vakcína Pfizer chrání před novými variantami Covid, uvádí studie The Guardian  (8. ledna 2021). Archivováno z originálu 8. ledna 2021. Staženo 9. ledna 2021.
  36. ↑ Matt Rivers CNN. Může za kolaps tohoto brazilského města nová varianta koronaviru? . CNN . Získáno 2. února 2021. Archivováno z originálu dne 6. listopadu 2021.
  37. ↑ Lewis F. Buss, Carlos A. Prete, Claudia MM Abrahim, Alfredo Mendrone, Tassila Salomon. Míra napadení SARS-CoV-2 ze tří čtvrtin v brazilské Amazonii během převážně nezmírněné epidemie   // Science . — 2021-01-15. — Sv. 371 , iss. 6526 . — S. 288–292 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.abe9728 . Archivováno z originálu 2. února 2021.
  38. ↑ Ester C. Sabino, Lewis F. Buss, Maria PS Carvalho, Carlos A. Prete, Myuki AE Crispim. Obnovení COVID-19 v Manaus, Brazílie, navzdory vysoké séroprevalenci  //  The Lancet. — 27. 1. 2021. - T. 0 , ne. 0 _ — ISSN 1474-547X 0140-6736, 1474-547X . - doi : 10.1016/S0140-6736(21)00183-5 .
  39. ↑ „Brazilský“ kmen koronaviru je třikrát infekčnější než úplně první verze COVID-19 – ministerstvo zdravotnictví země . nv.ua. _ Datum přístupu: 12. února 2021.
  40. ↑ Rodové linie PANGO . cov-lineages.org . Získáno 18. dubna 2021. Archivováno z originálu dne 3. června 2021.
  41. ↑ Koronavirus | Indický „dvojitý mutant“ kmen s názvem B.1.617 (en-IN), The Hindu  (8. dubna 2021). Archivováno 26. května 2021. Staženo 18. června 2021.
  42. ↑ Indická druhá vlna poháněná variantami se časově shodovala s prudkým nárůstem infikovaných letů přistávajících v Kanadě , Toronto Sun (10. dubna 2021). Archivováno z originálu 2. června 2021. Staženo 18. června 2021.
  43. ↑ Tvůrce Sputniku V mluvil o upraveném indickém kmeni v Moskvě. Vysvětluje se jim třetí vlna COVID-19 Archivováno 16. června 2021 na Wayback Machine , 16.06.2021
  44. ↑ Sharma, Milan Identifikována nová varianta SARS-CoV-2 „Delta Plus“;  zde je to, co zatím víme . Indie dnes . Získáno 16. června 2021. Archivováno z originálu dne 17. června 2021.
  45. ↑ V Indii byl identifikován nový kmen delta plus koronavirus Archivováno 23. června 2021 na Wayback Machine , 21. června 2021
  46. ↑ Nový superinfekční kmen Covid objevený v Indii Archivní kopie z 25. června 2021 na Wayback Machine
  47. ↑ Potomek New Delta může být infekčnější než jeho předek . Získáno 23. října 2021. Archivováno z originálu dne 23. října 2021.
  48. ↑ Velká Británie odhaluje podrobnosti o novém kmeni koronaviru Archivováno 23. října 2021 na Wayback Machine , 20. října 2021
  49. ↑ [Nová botswanská varianta s 32 „hrozivými“ mutacemi je nejvyvinutějším kmenem Covid EVER a mohla by být „horší než Delta“ – jak říká odborník, mohla se objevit u pacienta s HIV], 25. listopadu 2021
  50. ↑ Nová varianta COVID Omicron způsobuje globální paniku Archivováno 28. listopadu 2021 na Wayback Machine , 28. 11. 2021
  51. ↑ V Británii bude zavedena karanténa pro ty, kdo jsou v kontaktu s přenašeči omikronového kmene Archivní kopie ze dne 28. listopadu 2021 na Wayback Machine // RIA Novosti, 27.11.2021
  52. ↑ Sledování variant SARS-CoV-2  . Světová zdravotnická organizace . Získáno 17. června 2021. Archivováno z originálu 9. června 2021.
  53. ↑ V Latinské Americe zuří nový nebezpečný kmen koronaviru – „lambda“ . Získáno 24. června 2021. Archivováno z originálu dne 24. června 2021.
  54. ↑ Ještě jeden mutant: světem se začal šířit nový, potenciálně nebezpečný kmen Covid-19 . The Insider . Získáno 17. února 2021. Archivováno z originálu 16. února 2021.
  55. ↑ De fleste restriktioner lempes i Nordjylland . Sundheds- og Ældreministeriet (19. listopadu 2020). — “Sekventeringen af ​​​​de positive prøver viser samtidig, at der ikke er påvist yderligere tilfælde af minkvariant med cluster 5 side den 15. září, hvorfor Statens Serums Institut vurderer, at den variant med stor sanddøud er der. ("S vysokou pravděpodobně [...] vymřela")". Získáno 16. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 20. ledna 2021.
  56. ↑ 1 2 Původ, vývoj a globální šíření SARS-CoV-2 (nepřístupný odkaz) . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 21. února 2021. 
  57. ↑ Koronavirus: Dělají ho mutacemi infekčnější? , BBC News  (18. července 2020). Archivováno z originálu 30. prosince 2020. Staženo 5. ledna 2021.
  58. ↑ Nový, infekčnější kmen COVID-19 nyní dominuje celosvětovým případům viru:  studie . medicalxpress.com . Získáno 5. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 17. listopadu 2020.
  59. ↑ Bette Korber, Will M. Fischer, Sandrasegaram Gnanakaran, Hyejin Yoon, James Theiler. Sledování změn v Spike SARS-CoV-2: Důkaz, že D614G zvyšuje infekčnost viru COVID-19  // Buňka. — 20.08.2020. - T. 182 , č.p. 4 . — s. 812–827.e19 . — ISSN 0092-8674 . - doi : 10.1016/j.cell.2020.06.043 . Archivováno 1. listopadu 2020.
  60. ↑ Rafal Butowt, Katarzyna Bilinska, Christopher S. Von Bartheld. [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7581292/ Chemosenzorická dysfunkce u COVID-19: Integrace genetických a epidemiologických datových bodů do varianty Spike Protein D614G jako přispívající faktor] // ACS Chemical Neuroscience . — 2020-09-30. - T. 11 , č.p. 20 . — S. 3180–3184 . — ISSN 1948-7193 . - doi : 10.1021/acschemneuro.0c00596 . Archivováno z originálu 12. ledna 2021.
  61. ↑ cov-lineages/pangolin . — 5. 1. 2021. Archivováno z originálu 15. února 2021.
  62. ↑ Allison J. Greaney, Andrea N. Loes, Katharine H. D. Crawford, Tyler N. Starr, Keara D. Malone. Komplexní mapování mutací vazebné domény SARS-CoV-2 receptoru, které ovlivňují rozpoznávání polyklonálními lidskými sérovými protilátkami   // bioRxiv . — 4. 1. 2021. — S. 2020.12.31.425021 . - doi : 10.1101/2020.12.31.425021 . Archivováno z originálu 26. ledna 2021.
  63. ↑ Kai Kupferschmidt. Nové mutace vyvolávají přízrak „imunitního úniku“   // Science . — 22. 1. 2021. — Sv. 371 , iss. 6527 . — S. 329–330 . — ISSN 1095-9203 0036-8075, 1095-9203 . - doi : 10.1126/science.371.6527.329 . Archivováno 13. května 2021.
  64. ↑ Smout, Alistair . Británie pomůže dalším zemím vystopovat varianty koronaviru , Reuters  (26. ledna 2021). Archivováno z originálu 26. ledna 2021. Staženo 29. ledna 2021.
  65. ↑ Donnelly, Lauro . Velká Británie pomůže sekvenovat mutace Covidu po celém světě a najít nové nebezpečné varianty , The Telegraph  (26. ledna 2021). Archivováno z originálu 27. ledna 2021. Staženo 29. ledna 2021.
  66. ↑ Collier DA, Meng B, Ferreira, Gupta RK (2021). „Neutralizace delece hrotu 69/70, E484K a N501Y SARS-CoV-2 pomocí séra vyvolaného vakcínou BNT162b2“ . Získáno 29. ledna 2021. Archivováno z originálu dne 26. ledna 2021.
  67. ↑ Vznikající varianty SARS-CoV-2 – CDC . Získáno 4. února 2021. Archivováno z originálu dne 15. května 2021.
  68. ↑ Jak by „vražedné“ T buňky mohly posílit imunitu COVID tváří v tvář novým variantám Archivováno 15. února 2021 na Wayback Machine , 12. února 2021
  69. ↑ Biotech vysvětluje, co je s EpiVacCoronou špatně: „Je to figurína. Letadlo s pohodlnou kabinou, levné a snadno se staví. Ale on nelétá! . Přítomno (23. června 2021). Získáno 24. června 2021. Archivováno z originálu dne 24. června 2021.
  70. ↑ Korespondenční věstník poslance Besediny . besedina.moskva . Získáno 19. února 2021. Archivováno z originálu 17. února 2021.
  71. ↑ EMA připravuje pokyny k řešení variant COVID-19 . Získáno 19. února 2021. Archivováno z originálu 15. února 2021.
  72. ↑ Seznam pokynů po schůzce se členy vlády • Prezident Ruska . prezident Ruska . Získáno 19. února 2021. Archivováno z originálu 17. února 2021.
  73. ↑ Jihoafrický kmen SARS-CoV-2 podezřelý ze snížení imunitní odpovědi na vakcínu Pfizer . TASS . Získáno 24. února 2021. Archivováno z originálu dne 18. února 2021.
  74. ↑ Odhaduje se, že Pfizer je 39% účinný proti delta infekci v Izraeli . TASS . Získáno 25. července 2021. Archivováno z originálu dne 25. července 2021.