Fragmenty Okazaki

Okazakiho fragmenty jsou relativně krátké DNA fragmenty ( s RNA  primerem na 5' konci), které se tvoří na zaostávajícím řetězci během replikace DNA . Délka Okazakiho fragmentů v E. coli je asi 1000-2000 nukleotidů , zatímco u eukaryot  je to obvykle 100-200 nukleotidů.

Fragmenty Okazakiho popsali v roce 1968 Reiji Okazaki , Tsuneko Okazaki a spoluautoři při studiu replikace bakteriofágové DNA v E. coli [1] [2] .

Mechanismus

Každý Okazakiho fragment se tvoří vedle replikační vidlice po RNA primeru vytvořeném primázou a dále pokračuje DNA polymerázou III v případě prokaryot. U eukaryot je zaostávající řetězec syntetizován DNA polymerázou α. Primér je později odstraněn enzymem s endonukleázovou aktivitou, jako je RNáza H , klapková endonukleáza a DNA2L helikáza /nukleáza [ en .

Poznámky

1. ↑ Okazaki R, Okazaki T, Sakabe K, Sugimoto K. Mechanismus replikace DNA možná diskontinuita růstu řetězce DNA. Jpn J Med Sci Biol. červen 1967;20(3):255-260. PMID 4861623
2. ↑ Ogawa T, Okazaki T, Diskontinuální replikace DNA. Annu. Rev. Biochem. 49:421-457, 1980. doi : 10.1146/annurev.bi.49.070180.002225

Literatura

1. Inman RB, Schnos M. Struktura bodů větvení v replikující se DNA: Přítomnost jednořetězcových spojení v bodech větví lambda DNA. J. Mol Biol. 56:319-325, 1971. doi : 10.1016/0022-2836(71)90467-0 . PMID 4927949
2. Thommes P, Hubscher U. Replikace eukaryotické DNA. Enzymy a proteiny působící na vidličku. Eur. J Biochem. 194(3):699-712, 1990. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19460.x . PMID 2269294