Procesivita

V molekulární biologii je procesivita schopnost enzymu provádět sekvenci chemických reakcí bez uvolnění substrátu .  Processivita se nejčastěji hovoří u DNA polymeráz, kde lze procesivitu vyjádřit jako průměrný počet nukleotidů přidaných enzymem DNA polymerázou v jednom aktu vazby/disociace s templátem. DNA polymerázy, které provádějí replikaci DNA , mají tendenci mít vysokou procesivitu, zatímco ty, které provádějí opravu DNA, mají nízkou procesivitu. [jeden]

Protože vazba polymerázy na templát je rychlost omezující krok v syntéze DNA , celková rychlost replikace DNA během S-fáze buněčného cyklu závisí na procesivitě DNA polymeráz zapojených do replikace. Proteiny posuvného zipu jsou nedílnou součástí replikace DNA a slouží ke zvýšení procesivity příslušných polymeráz. Některé polymerázy přidávají k rostoucímu řetězci DNA před disociací více než 50 000 nukleotidů, což odpovídá rychlosti asi 1 000 nukleotidů za sekundu. [2]

Také u proteáz je procesivita vyjádřena úplným a konzistentním štěpením proteinů bez uvolnění meziproduktů, neúplně štěpených polypeptidů (viz ClpP ). Processivita může být také diskutována při diskuzi o předpisu a překladu .

Poznámky

  1. Breyer WA, Matthews BW. Strukturální základ pro procesivitu // Protein Sci. - 2001. - T. 10 , č. 9 . - S. 1699-1711 .
  2. Lloyd RS. Processivita DNA reparačních enzymů // Methods Mol Biol. - 2001. - č. 160 . - S. 3-14 .

Viz také