NCOR2

Korepresor jaderných receptorů 2

PNR je založen na 1xc5.
Dostupné struktury
PNR Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB
Identifikátory
SymbolNCOR2  ; CTG26; N-CoR2; SMAP270; SMRT; SMRTE; SMRTE-tau; TNRC14; TRAC; TRAC-1; TRAC1
Externí IDOMIM:  600848 MGI :  1337080 HomoloGene :  31370 ChEMBL : 5949 GeneCards : NCOR2 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez961220602
SouborENSG00000196498ENSMUSG00000029478
UniProtQ9Y618Q9WU42
RefSeq (mRNA)NM_001077261NM_001253904
RefSeq (protein)NP_001070729NP_001240833
Locus (UCSC)Chr 12:
124,81 – 125,05 Mb
Chr 5:
125,02 – 125,18 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

Korepresor jaderného receptoru 2 (NCOR2) je transkripční koregulační protein obsahující několik domén interagujících s jadernými receptory. Kromě toho NCOR2 podporuje dodávání histonových deacetyláz do promotorových oblastí DNA. V tomto ohledu se předpokládá, že NCOR2 pomáhá jaderným receptorům při snižování exprese cílového genu [1] [2] . NCOR2 je také označován jako umlčovací mediátor pro receptory vitaminu A a receptory hormonů štítné žlázy ( SMRT ) [1] nebo kofaktor 1 spojený s receptorem T 3 ( TRAC-1 ) [2] .

Funkce

NCOR2/SMRT je transkripční koreregulační protein , který obsahuje několik modulujících funkčních oblastí, včetně několika represivních domén , a také dvě nebo tři C-terminální domény interagující s jadernými receptory [1] . NCOR2/SMRT slouží jako korepresor pro různé transkripční faktory. V tomto ohledu NCOR2/SMRT funguje jako platforma pro podporu vazby histonových deacetyláz k promotorům DNA a transkripčním faktorům Sin3A , následovanou tvorbou multisubunit represorového komplexu [3] .

Objev

SMRT byl původně klonován a charakterizován v laboratoři  Dr. Ronalda M. Evanse v Salk Institute for Biological Research [1] . V dřívější studii této molekuly s podobnými nálezy byl tento protein označován jako TRAC-1 [2] .

Interakce

NCOR2 spolupracuje s:

Poznámky

  1. 1 2 3 4 Chen JD, Evans RM Transkripční korepresor, který interaguje s jadernými hormonálními receptory  //  Nature : journal. - 1995. - Sv. 377 , č.p. 6548 . - str. 454-457 . - doi : 10.1038/377454a0 . — PMID 7566127 .
  2. 1 2 3 Sande S., Privalsky ML Identifikace TRAC (kofaktory sdružující receptor T3), rodina kofaktorů, které se sdružují s jadernými hormonálními receptory a modulují jejich aktivitu  (anglicky)  // Molecular Endocrinology : deník. - 1996. - Sv. 10 , č. 7 . - S. 813-825 . - doi : 10.1210/me.10.7.813 . — PMID 8813722 .
  3. Nagy L., Kao HY, Chakravarti D., Lin RJ, Hassig CA, Ayer DE, Schreiber SL, Evans RM Represe jaderného receptoru zprostředkovaná komplexem obsahujícím SMRT, mSin3A a histondeacetylázu  // Cell  :  journal . - Cell Press , 1997. - Vol. 89 , č. 3 . - str. 373-380 . - doi : 10.1016/S0092-8674(00)80218-4 . — PMID 9150137 .
  4. Liao G., Chen LY, Zhang A., Godavarthy A., Xia F., Ghosh JC, Li H., Chen JD Regulace aktivity androgenního receptoru korepresorem jaderného receptoru SMRT  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2003. - Sv. 278 , č.p. 7 . - S. 5052-5061 . - doi : 10.1074/jbc.M206374200 . — PMID 12441355 .
  5. Song LN, Coghlan M., Gelmann EP Antiandrogenní účinky mifepristonu na interakce koaktivátoru a korepresoru s androgenním receptorem  // Molecular  Endocrinology : deník. - 2004. - Sv. 18 , č. 1 . - S. 70-85 . - doi : 10.1210/me.2003-0189 . — PMID 14593076 .
  6. Dotzlaw H., Moehren U., Mink S., Cato AC, Iñiguez Lluhí JA, Baniahmad A. Aminokonec lidského AR je cílem pro korepresorové působení a antihormonální agonismus   // Molecular Endocrinology : deník. - 2002. - Sv. 16 , č. 4 . - str. 661-673 . - doi : 10.1210/me.16.4.661 . — PMID 11923464 .
  7. 1 2 Wong CW, Privalsky ML Komponenty korepresoru SMRT vykazují složité výrazné interakce s onkoproteiny domény POZ PLZF, PLZF-RARalpha a BCL-6  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 1998. - Sv. 273 , č.p. 42 . - S. 27695-27702 . doi : 10.1074/ jbc.273.42.27695 . — PMID 9765306 .
  8. Huynh KD, Fischle W., Verdin E., Bardwell VJ BCoR, nový korepresor zapojený do represe BCL-6  // Genes & Development  : journal  . - 2000. - Sv. 14 , č. 14 . - S. 1810-1823 . - doi : 10.1101/gad.14.14.1810 . — PMID 10898795 .
  9. Deltour S., Guerardel C., Leprince D. Nábor SMRT/N-CoR-mSin3A-HDAC-represivních komplexů není obecným mechanismem pro BTB/POZ transkripční represory: případ HIC-1 a gamaFBP-B  .)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal. - 1999. - Sv. 96 , č. 26 . - S. 14831-14836 . - doi : 10.1073/pnas.96.26.14831 . — PMID 10611298 .
  10. 1 2 3 4 Lee SK, Kim JH, Lee YC, Cheong J., Lee JW Umlčující mediátor receptorů kyseliny retinové a hormonů štítné žlázy jako nová molekula transkripčního korepresoru aktivujícího proteinu-1, nukleárního faktoru-kappaB a odezvy séra faktor  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2000. - Sv. 275 , č.p. 17 . - S. 12470-12474 . doi : 10.1074 / jbc.275.17.12470 . — PMID 10777532 .
  11. 1 2 Fischer DD, Cai R., Bhatia U., Asselbergs FA, Song C., Terry R., Trogani N., Widmer R., Atadja P., Cohen D. Izolace a charakterizace nové histon deacetylázy třídy II , HDAC10  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2002. - Sv. 277 , č.p. 8 . - S. 6656-6666 . - doi : 10.1074/jbc.M108055200 . — PMID 11739383 .
  12. 1 2 Underhill C., Qutob MS, Yee SP, Torchia J. Nový korepresorový komplex jaderného receptoru, N-CoR, obsahuje složky savčího komplexu SWI/SNF a korepresoru KAP-1  //  Journal of Biological Chemistry  : journal . - 2000. - Sv. 275 , č.p. 51 . - S. 40463-40470 . - doi : 10.1074/jbc.M007864200 . — PMID 11013263 .
  13. 1 2 3 Li J., Wang J., Wang J., Nawaz Z., Liu JM, Qin J., Wong J. Oba korepresorové proteiny SMRT a N-CoR existují ve velkých proteinových komplexech obsahujících   HDAC3 / The EMBO Journal : deník. - 2000. - Sv. 19 , č. 16 . - S. 4342-4350 . - doi : 10.1093/emboj/19.16.4342 . — PMID 10944117 .
  14. 1 2 Yoon HG, Chan DW, Huang ZQ, Li J., Fondell JD, Qin J., Wong J. Purifikace a funkční charakterizace lidského komplexu N-CoR: role HDAC3, TBL1 a  TBLR1  // The EMBO Časopis : deník. - 2003. - Sv. 22 , č. 6 . - S. 1336-1346 . - doi : 10.1093/emboj/cdg120 . — PMID 12628926 .
  15. 1 2 Guenther MG, Yu J., Kao GD, Yen TJ, Lazar MA Sestavení represního komplexu SMRT-histone deacetyláza 3 vyžaduje kruhový komplex TCP-1  // Genes & Development  : journal  . - 2002. - Sv. 16 , č. 24 . - S. 3130-3135 . - doi : 10.1101/gad.1037502 . — PMID 12502735 .
  16. 1 2 Guenther MG, Lane WS, Fischle W., Verdin E., Lazar MA, Shiekhattar R. Jádrový korepresorový komplex SMRT obsahující HDAC3 a TBL1, protein s opakováním WD40 spojený s hluchotou  //  Genes & Development  : journal. - 2000. - Sv. 14 , č. 9 . - S. 1048-1057 . — PMID 10809664 .
  17. 1 2 Fischle W., Dequiedt F., Hendzel MJ, Guenther MG, Lazar MA, Voelter W., Verdin E. Enzymatická aktivita spojená s HDAC třídy II je závislá na multiproteinovém komplexu obsahujícím HDAC3 a SMRT/N-  CoR.)  // Molekulární buňka : deník. - 2002. - Sv. 9 , č. 1 . - str. 45-57 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00429-4 . — PMID 11804585 .
  18. Yoon HG, Chan DW, Reynolds AB, Qin J., Wong J. N-CoR zprostředkovává represi závislou na methylaci DNA prostřednictvím methyl CpG vazebného proteinu Kaiso   // Molecular Cell : deník. - 2003. - Sv. 12 , č. 3 . - str. 723-734 . - doi : 10.1016/j.molcel.2003.08.008 . — PMID 14527417 .
  19. 1 2 3 Huang EY, Zhang J., Miska EA, Guenther MG, Kouzarides T., Lazar MA Partner korepresorů jaderných receptorů s histon deacetylázami třídy II v represivní cestě nezávislé na Sin3  (anglicky)  // Genes & Development  : journal . - 2000. - Sv. 14 , č. 1 . - str. 45-54 . — PMID 10640275 .
  20. Lyst MJ, Ekiert R., Ebert DH, Merusi C., Nowak J., Selfridge J., Guy J., Kastan NR, Robinson ND, de Lima Alves F., Rappsilber J., Greenberg ME, Bird A. Rett mutace syndromu ruší interakci MeCP2 s korepresorem NCoR/SMRT   // Nature Neuroscience  : journal. - 2013. - Červenec ( roč. 16 , č. 7 ). - S. 898-902 . - doi : 10.1038/nn.3434 . — PMID 23770565 .
  21. Sohn YC, Kwak E., Na Y., Lee JW, Lee SK Tichý mediátor retinoidních a tyreoidálních hormonálních receptorů a aktivační signální kointegrátor-2 jako transkripční koregulátory osiřelého jaderného receptoru Nur77  //  Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 47 . - S. 43734-43739 . - doi : 10.1074/jbc.M107208200 . — PMID 11559707 .
  22. Kakizawa T., Miyamoto T., Ichikawa K., Takeda T., Suzuki S., Mori J., Kumagai M., Yamashita K., Hashizume K. Tichý mediátor pro receptory retinoidů a hormonů štítné žlázy interaguje s oktamerovým transkripčním faktorem- 1 a působí jako transkripční represor  (anglicky)  // Journal of Biological Chemistry  : journal. - 2001. - Sv. 276 , č.p. 13 . - S. 9720-9725 . - doi : 10.1074/jbc.M008531200 . — PMID 11134019 .
  23. Shi Y., Hon M., Evans RM Receptor delta aktivovaný peroxisomovým proliferátorem, integrátor transkripční represe a signalizace nukleárních receptorů  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America  : journal  . - 2002. - Sv. 99 , č. 5 . - S. 2613-2618 . - doi : 10.1073/pnas.052707099 . — PMID 11867749 .
  24. Giangrande PH, Kimbrel EA, Edwards DP, McDonnell DP Protichůdné transkripční aktivity dvou izoforem lidského progesteronového receptoru jsou způsobeny rozdílnou vazbou kofaktorů  //  Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2000. - Sv. 20 , č. 9 . - S. 3102-3115 . - doi : 10.1128/MCB.20.9.3102-3115.2000 . — PMID 10757795 .
  25. Khan MM, Nomura T., Kim H., Kaul SC, Wadhwa R., Shinagawa T., Ichikawa-Iwata E., Zhong S., Pandolfi PP, Ishii S. Role of PML a PML-RARalpha in Mad-mediated transkripční represe  //  Molecular Cell : deník. - 2001. - Sv. 7 , č. 6 . - S. 1233-1243 . - doi : 10.1016/S1097-2765(01)00257-X . — PMID 11430826 .
  26. Hong SH, Yang Z., Privalsky ML Oxid arsenitý je silný inhibitor interakce korepresoru SMRT s jeho partnery transkripčního faktoru, včetně alfa onkoproteinu receptoru PML-kyseliny retinové, který se vyskytuje u lidské akutní promyelocytární  leukémie  Molekulární// : deník. - 2001. - Sv. 21 , č. 21 . - str. 7172-7182 . - doi : 10.1128/MCB.21.21.7172-7182.2001 . — PMID 11585900 .
  27. Beatus P., Lundkvist J., Oberg C., Pedersen K., Lendahl U. Původ oblasti opakování ankyrinu v intracelulárních doménách Notch je kritický pro regulaci aktivity promotoru HES  //  Mechanisms of Development : deník. - 2001. - Sv. 104 , č. 1-2 . - str. 3-20 . - doi : 10.1016/S0925-4773(01)00373-2 . — PMID 11404076 .
  28. Zhou S., Hayward SD Jaderná lokalizace CBF1 je regulována interakcemi s korepresorovým komplexem SMRT   // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2001. - Sv. 21 , č. 18 . - S. 6222-6232 . - doi : 10.1128/MCB.21.18.6222-6232.2001 . — PMID 11509665 .
  29. Espinosa L., Inglés-Esteve J., Robert-Moreno A., Bigas A. IkappaBalpha a p65 regulují cytoplazmatický přesun jaderných korepresorů: cross-talk mezi cestami Notch a NFkappaB   // Molecular Biology of the Cell  : časopis. - 2003. - Sv. 14 , č. 2 . - S. 491-502 . - doi : 10.1091/mbc.E02-07-0404 . — PMID 12589049 .
  30. 1 2 Takahashi S., McConnell MJ, Harigae H., Kaku M., Sasaki T., Melnick AM, Licht JD  Interní tandemový duplikační mutant Flt3 inhibuje funkci transkripčních represorů blokováním interakcí s SMRT  // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 2004. - Sv. 103 , č. 12 . - S. 4650-4658 . - doi : 10.1182/krev-2003-08-2759 . — PMID 14982881 .
  31. Zhang J., Hug BA, Huang EY, Chen CW, Gelmetti V., Maccarana M., Minucci S., Pelicci PG, Lazar MA  Oligomerizace ETO je povinná pro interakci korepresoru  // Molekulární a buněčná biologie : deník. - 2001. - Sv. 21 , č. 1 . - S. 156-163 . - doi : 10.1128/MCB.21.1.156-163.2001 . — PMID 11113190 .
  32. Dong S., Tweardy DJ Interakce  STAT5b -RARalpha, nového fúzního proteinu akutní promyelocytární leukémie, s receptorem kyseliny retinové a signálními cestami STAT3  // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 2002. - Sv. 99 , č. 8 . - str. 2637-2646 . - doi : 10.1182/krev.V99.8.2637 . — PMID 11929748 .
  33. 1 2 Hong SH, David G., Wong CW, Dejean A., Privalsky ML Korepresor SMRT interaguje s PLZF a s PML-receptorem kyseliny retinové alfa ( RARalpha ) a PLZF-RARalfa onkoproteiny spojenými s akutní promyelocytární leukémií   // Pro Národní akademie věd Spojených států amerických  : časopis. - 1997. - Sv. 94 , č. 17 . - S. 9028-9033 . - doi : 10.1073/pnas.94.17.9028 . — PMID 9256429 .
  34. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Hayward SD Role SKIP v EBNA2 aktivaci CBF1-reprimovaných promotorů  //  Journal of Virology : deník. - 2000. - Sv. 74 , č. 4 . - S. 1939-1947 . - doi : 10.1128/JVI.74.4.1939-1947.2000 . — PMID 10644367 .
  35. Zhou S., Fujimuro M., Hsieh JJ, Chen L., Miyamoto A., Weinmaster G., Hayward SD SKIP, protein asociovaný s CBF1, interaguje s opakující se doménou ankyrinu NotchIC , aby se usnadnila funkce NotchIC   // Molekulární a Buněčná biologie : deník. - 2000. - Sv. 20 , č. 7 . - S. 2400-2410 . - doi : 10.1128/MCB.20.7.2400-2410.2000 . — PMID 10713164 .
  36. Shi Y., Downes M., Xie W., Kao HY, Ordentlich P., Tsai CC, Hon M., Evans RM Sharp, indukovatelný kofaktor, který integruje represi a aktivaci jaderného receptoru  //  Genes & Development  : journal. - 2001. - Sv. 15 , č. 9 . - S. 1140-1151 . - doi : 10.1101/gad.871201 . — PMID 11331609 .
  37. Liu Y., Takeshita A., Misiti S., Chin WW, Yen PM Nedostatek interakce koaktivátoru může být mechanismem pro dominantní negativní aktivitu mutantních receptorů hormonů štítné žlázy  //  Endocrinology : journal. - 1998. - Sv. 139 , č.p. 10 . - str. 4197-4204 . - doi : 10.1210/endo.139.10.6218 . — PMID 9751500 .
  38. 1 2 Tagami T., Lutz WH, Kumar R., Jameson JL Interakce receptoru vitaminu D s korepresory jaderného receptoru a koaktivátory  //  Biochemical and Biophysical Research Communications : deník. - 1998. - Sv. 253 , č.p. 2 . - str. 358-363 . - doi : 10.1006/bbrc.1998.9799 . — PMID 9878542 .
  39. Ando S., Sarlis NJ, Krishnan J., Feng X., Refetoff S., Zhang MQ, Oldfield EH, Yen PM Aberantní alternativní sestřih receptoru hormonu štítné žlázy v nádoru hypofýzy secernujícího TSH je mechanismem hormonální  rezistence.)  // Molekulární endokrinologie : deník. - 2001. - Sv. 15 , č. 9 . - S. 1529-1538 . - doi : 10.1210/me.15.9.1529 . — PMID 11518802 .
  40. Puccetti E., Obradovic D., Beissert T., Bianchini A., Washburn B., Chiaradonna F., Boehrer S., Hoelzer D., Ottmann OG, Pelicci PG, Nervi C., Ruthardt M. AML-associated translocation produkty blokují diferenciaci vyvolanou vitaminem D(3) sekvestrací receptoru vitaminu D(3)  //  Cancer Research : deník. - 2002. - Sv. 62 , č. 23 . - str. 7050-7058 . — PMID 12460926 .

Literatura