Haploskupina B (mtDNA)

Haploskupina B  je haploskupina lidské mitochondriální DNA.

I. A. Zacharov-Gezekhus a kolegové navrhli dát haploskupině B jméno Borbak [1] .

Původ

Předpokládá se, že haploskupina B vznikla v Asii asi před 50 tisíci lety. Jejím předkem byla haploskupina R. Podle výpočtů genetika Theodora Schurra z Pennsylvánské univerzity přišli nositelé mitochondriální haploskupiny B do Severní Ameriky před 24 tisíci lety [2] [3] .

Distribuce

Haploskupina B se nejčastěji vyskytuje ve východní Asii [4] . Jeho podskupina B2 je jednou z pěti haploskupin nalezených mezi Indy , spolu s jako A , C , D a X.

Vzhledem k tomu, že moderní modely dávných migrací do Ameriky naznačují, že předci Indiánů pocházeli ze Sibiře, je zvláště zajímavé, že haploskupina B je jedinou z „indických“ haploskupin, která se v moderní populaci severní Sibiře nevyskytuje. Na druhé straně se vyskytuje mezi obyvateli jižní Sibiře - mezi takovými národy, jako jsou Tuvani , Altajci a Burjati . Mezi Tubalary v Severním Altaji dosahuje mitochondriální haploskupina B4b1 6,3 % [5] . Tato haploskupina se také nachází mezi Mongoly , Tibeťany , Korejci , občas se vyskytuje v zemích a oblastech, jako je Japonsko , Čína , Vietnam , Malajsie , Tchaj-wan , Indonésie , Madagaskar , Filipíny , Melanésie , Mikronésie a Polynésie [6] .

Paleogenetika

• Mitochondriální haploskupina B (Ra) byla nalezena v pozůstatcích moderních lidí ze severočínské jeskyně Tianyuan , kteří žili asi před 39,5 tisíci lety [7]
• B byla určena ve vzorku NE20 (před 34324–32360 lety) z oblasti Amur v Číně [8]
• B4e byl stanoven ve vzorku SRH 12 (před 24 558 - 23 997 lety ) z japonské jeskyně Shiraho-Saonetabaru na ostrově Ishigaki [9]
• B2 byl stanoven ve vzorcích koprolitu starých 14 290–12 750 let z jeskyní Paisley v Oregonu (USA) [10]
• B2 byl identifikován u kojence z lokality Upward Sun River v údolí Tanana na Aljašce (před 11,5 tisíci lety) [11]
• B2 byl stanoven ze vzorku jeskyně Trail Creek Cave 2 z jeskyně Trail Creek Cave 2 ( Aljaška ), která žila před 9000 lety. n. Větev Trail Creek Cave 2 patří k bazální linii mitochondriální haploskupiny B2, která se liší od odvozené linie B2 běžně se vyskytující v Americe [12]
• B4c1a identifikoval vzorek Boshan11 z Boshan ( provincie Shandong), starý 8180 ± 140 let [13]
• Vzorky z brazilského Lapa do Santo ve věku cca . 9,5 tisíce litrů n. a Jabuticabeira 2, stáří 1,2 tisíce let. n. identifikovaný subklad B2, ve vzorku I8348 z argentinských Pamp, Laguna Chica Argentina, starý 6,88 tisíc let. n. identifikovaný podklad B2b [14]
• B5b1 byl identifikován ve vzorku ARS018 z pohřbu střední/pozdní doby bronzové v Kereksuru (Khereksur) [15] [16]
• B4a1a1a byl identifikován u zástupců pacifické kultury Lapita , kteří žili před 2700-3100 lety [17]
• B4b1a1a byl identifikován ve vzorku Yayoi_2 (před 2001–1931 lety, období Yayoi , Japonsko) [18]
• B4b1a1a byl stanoven ve vzorku HN-SJ001 (middle Yayoi , Hanaura, Japonsko) [19]
• B5a1d byl identifikován ve vzorku Th703 (asi před 1670 lety) z doby železné v Thajsku [20]
• B4 byl identifikován u obyvatel Tchaj-wanu z doby železné [21]
• Subklad B2y1 byl nalezen v kultuře Anasazi [22]
• B2 a B2b byly nalezeny u starých obyvatel Jižní Ameriky (Huaca Pucllana, Pueblo Viejo, Pasamayo, Lauricocha v Peru, Pica-8 v Chile, Tiwanaku v Bolívii), subklad B2 byl identifikován ve vzorcích z Cueva Candelaria v Mexiku [23] [24]
• B4a byl identifikován u zástupce kultury Sargat [25] [26]
• B4a1c4, B4c2c, B6a byly stanoveny ve vzorcích ze závěsných rakví z Yunnanu, B5a1d ze severního Thajska [27]
• B5a2a1b, B5a2a1a, D5b2a2 byly identifikovány na konci Xiongnu [ 15]
• B4b1a3a byl identifikován u raného avarského vojevůdce FGDper4 (raný avarský vojevůdce, 620-660), u raných Avarů KFPper31 a KFPper30a (raný Avar, 620-660), ve středně pozdním avarském ARKper41 (středně-pozdní Avar 7 (end)), v pozdním avarském CSPFper213 (pozdní Avar, 700–750) [28]
• B5a2a1b byl identifikován v japonském vzorku z císařského období Kofun JpIw32 (před 1347–1409 lety) [18]
• B4d1 byla stanovena v ženském elitním vzorku K3per6 z období maďarského dobývání Panonie (Conq. elita 10. (2. třetina)), v mužském elitním vzorku SPper10 z období maďarského dobývání (Conq. elita 10. ( 2. třetina)) a v mužském elitním vzorku K3per13 sloučeného období maďarského dobývání (Conq. elita 10. (2. třetina). B5b4 byl identifikován v ženském vzorku SZAper154 z období maďarského dobývání (Conq. commoner 10 .) [28]
• B5b4 byl identifikován ve vzorku MOT12 z pohřebiště Tankeevsky v okrese Spassky v Tatarstánu (pozdní Kushnarenkovo/Karayakupovo, rané období Volga-Kama Bulghar, 10.–11. století) [29]
• B4a3, B5a2a1 identifikované vzorky z hřbitova Zhenzishan v Shangdu, Čína (XIII. století) [30]
• B4a1a1m1 a B4a1a1 byly nalezeny v pěti fosilních exemplářích z ostrova Rapanui (Velikonoce, 1445–1624) [31]
• B4a1a1 byl nalezen v kostech brazilských botocudů z 19. století , možných potomků madagaskarských otrokyň [32] [33]

Viz také

Poznámky

1. ↑ Zakharov I. A. Středoasijský původ předků prvních Američanů Archivní kopie ze 17. října 2018 na Wayback Machine // First Americans. 2003. č. 11. S. 139-144.
2. ↑ Schurr T. The Story in the Genes // Scientific American. - 2000. - Sv. 2, č. 1. - S. 59-60.
3. ↑ Gnes A.A. The First Americans: Old and New World Dialogues Archived 18. března 2018 na Wayback Machine , 2014
4. ↑ Haploskupina B. . Získáno 2. června 2009. Archivováno z originálu 4. března 2016. (neurčitý)
5. ↑ Starikovskaya E. B. Fylogeografie mitogenomů domorodé populace Sibiře Archivní kopie ze dne 21. ledna 2022 na Wayback Machine , 2016
6. ↑ Theodore G Schurr, Douglas C. Wallace. Diverzita mitochondriální DNA v populacích jihovýchodní Asie // Human Biology , červen 2002.
7. ↑ Tianyuan, mtDNA B a formování národů Dálného východu . Získáno 11. června 2014. Archivováno z originálu 11. září 2017. (neurčitý)
8. ↑ Xiaowei Mao a kol. Hluboká populační historie severní východní Asie od pozdního pleistocénu po holocén Archivováno 28. června 2021 na Wayback Machine , 27. května 2021
9. ↑ Ken-ichi Shinoda, Noboru Adach . Analýza starověké DNA paleolitických obyvatel Ryukyu Archived 29. března 2021 na Wayback Machine // Tento text je převzat z New Perspectives in Southeast Asian and Pacific Prehistory, editovali Philip J. Piper, Hirofumi Matsumura a David Bulbeck, publikoval 2017 ANU Press, Australská národní univerzita, Canberra, Austrálie
10. ↑ Výzkumníci pod vedením archeologa, Find Pre-Clovis Human DNA Archived 21. ledna 2018 na Wayback Machine , 2. dubna 2008
11. ↑ Terminální pleistocén Aljašský genom odhaluje první zakládající populaci domorodých Američanů Archivováno 2. března 2019 na Wayback Machine , 2018
12. ↑ Moreno-Mayar, J. Victor; Vinner, Lasse; de Barros Damgaard, Peter; de la Fuente, Constanza; Chan, Jeffrey; Spence, Jeffrey P.; Allentoft, Morten E.; Vimala, Tharsika; Racimo, Fernando; Pinotti, Thomaz; Rasmussen, Simon; Margaryan, Ashot; Iraeta Orbegozo, Miren; Mylopotamitaki, Dorothea; Wooller, Matěj; Bataille, Klement; Becerra-Valdivia, Lorena; Chivall, David; Comeskey, Daniel; Deviese, Thibaut; Grayson, Donald K.; Jiří, Len; Harry, Harolde; Alexandersen, Werner; Primeau, Charlotte; Erlandson, John; Rodrigues-Carvalho, Claudia; Reis, Silvia; Bastos, Murilo QR; Cybulski, Jerome; Vullo, Carlos; Morello, Flavia; Vilar, Miguel; Wells, Spencer; Gregersen, křesťan; Hansen, Kasper Lykke; Lynnerup, Niels; Mirazón Lahr, Marta; Kjaer, Kurt; Strauss, Andre; Alfonso-Durruty, Marta; Salas, Antonio; Schroder, Hannes; Higham, Thomas; Malhi, Ripan S.; Rasic, Jeffrey T.; Souza, Louis; Santos, Fabricio R.; Malaspinas, Anna-Sapfo; Sikora, Martin; Nielsen, Rasmus; Song, Yun S.; Meltzer, David J.; Willerslev, Eske (8. listopadu 2018b). „Časné rozptýlení lidí v Americe“ . věda . American Association for the Advancement of Science (AAAS). 362 (6419): eaav2621. doi : 10.1126/science.aav2621 . ISSN  0036-8075 . PMID  30409807 .
13. ↑ Qiaomei Fu a kol. Revidované časové měřítko pro lidskou evoluci na základě starověkých mitochondriálních genomů Archivováno 5. září 2020 na Wayback Machine , 2013
14. ↑ Cosimo Posth a kol. Rekonstrukce hluboké populační historie Střední a Jižní Ameriky Archivováno 22. prosince 2021 na Wayback Machine , 2018
15. ↑ 1 2 Choongwon Jeong a kol. Dynamická 6000letá genetická historie Eurasie's Eastern Steppe Archivována 3. listopadu 2020 na Wayback Machine , 2020
16. ↑ Jelení kámen-Khirigsuurský komplex (DSKC)
17. ↑ Pontus Skoglund a kol. Genomické pohledy na obyvatelstvo jihozápadního Pacifiku // Příroda, 2016, 3. října
18. ↑ 1 2 Niall P. Cooke a kol. Starověká genomika odhaluje tripartitní původ japonských populací Archivováno 18. září 2021 na Wayback Machine // Science Advances • 17. září 2021 • Vol 7, Issue 38
19. ↑ Fuzuki Mizuno a kol. Dynamika populace na japonském souostroví od pleistocénu odhalená kompletními sekvencemi mitochondriálního genomu // Vědecké zprávy, 2021
20. ↑ Hugh McColl a kol. Starověká genomika odhaluje čtyři prehistorické migrační vlny do jihovýchodní Asie , 2018
21. ↑ Yue-Chen Liu a kol. Starověká DNA odhaluje pět proudů migrace do Mikronésie a matrilokalitu u raných tichomořských námořníků // Science, 2022
22. ↑ Douglas J. Kennett a kol. Archeogenomické důkazy odhalují prehistorickou matrilineární dynastii Archivováno 24. února 2017 na Wayback Machine
23. ↑ Andrej Konkov . Dešifrování starověké DNA vyprávělo o původu jihoamerických indiánů Archivní kopie z 26. prosince 2017 na Wayback Machine
24. ↑ Bastien Llamas a kol. Starověká mitochondriální DNA poskytuje časové měřítko s vysokým rozlišením obyvatel Ameriky, 2016 // Doplňkové materiály. Tabulka S2. Seznam starých vzorků, související metadata a výsledky sekvenování (samostatný dokument Excel Archived 8. ledna 2018 na Wayback Machine
25. ↑ Etnogeneze obyvatelstva jihu západní Sibiře v holocénu (podle archeologie, antropologie a paleogenetiky) (koordinátor akademik V.I. Molodin; IAET, ICG) . Získáno 8. ledna 2018. Archivováno z originálu 10. března 2016. (neurčitý)
26. ↑ Vliv populací jižní Sibiře a střední Asie na genofond sarmatské populace . Získáno 8. ledna 2018. Archivováno z originálu 23. října 2017. (neurčitý)
27. ↑ Xiaoming Zhang a kol. Matrilineální genetická perspektiva zakázkové rakve v jižní Číně a severním Thajsku , 24. dubna, 20.
28. ↑ 1 2 Zoltan Maroti a kol. Analýza celého genomu vrhá světlo na genetický původ Hunů, Avarů a dobývajících Maďarů Archivováno 22. ledna 2022 na Wayback Machine , 2021
29. ↑ Bea Szeifert et al. Sledování genetických spojení starých Maďarů s populací oblasti Volha-Ural ze 6.–14. století Archivováno 12. února 2022 na Wayback Machine , 8. února 2022
30. ↑ Jiawei Li a kol. Starověké genomy odhalují složitou genetickou historii mezinárodní metropole v Kublajchánově horním hlavním městě (Xanadu) , 14. června 2022
31. ↑ Lars Fehren-Schmitz a kol. Genetic Ancestry of Rapanui před a po European Contact Archived 15. října 2017 na Wayback Machine , 2017
32. ↑ Vasiliev S. A. , veBerezkin Yu Wayback Machine . Petrohrad: Nestor-historie, 2015
33. ↑ Gonçalves VF, Stenderup J., Rodrigues-Carvalho C. , 2013. Identifikace polynéských haploskupin mtDNA v pozůstatcích Botocudo Amerindians z Brazílie // Sborník Národní akademie věd USA. sv. 110. Č. 16. S. 6465-6469

Odkazy

Obecné informace

• Místo mitochondriální DNA Iana Logana
• PhyloTree.org – strom mtDNA Sestavení 17 (18. února 2016): podstrom B
• B4'5 YFull MTree 1.02.00 (ve výstavbě)

Haploskupina B

• • Rozšíření Haploskupiny B z National Geographic
  • V