Histon deacetyláza 11

Identifikátory

HDAC11 ; HD11

Externí ID

OMIM: 607226 MGI : 2385252 HomoloGene : 11743 IUPHAR : ChEMBL : 3310 GeneCards : HDAC11 Gene

3.5.1.98

Genová ontologie
Funkce	• aktivita histondeacetylázy • vazba transkripčního faktoru • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (H3-K14 specifická) • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (specifická pro H3-K9) • aktivita histondeacetylázy závislá na NAD (specifická pro H4-K16) • NAD-dependentní histondeacetylázová aktivita (H3-K18 specifická)
buněčná složka	• histondeacetylázový komplex • jádro • plazmatická membrána • extracelulární vezikulární exozom
biologický proces	• transkripce podle templátu DNA • regulace transkripce, DNA-templát • vývoj oligodendrocytů • modifikace chromatinu • deacetylace histonů • deacetylace histonu H3 • deacetylace histonu H4
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 3:
13,52 – 13,55 Mb

Chr 6:
91,16 – 91,17 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Histone deacetyláza 11 ( Histone deacetyláza 11 ) je 39 kDa enzym kódovaný genem HDAC11 u lidí, který se nachází na chromozomu 3 u lidí a na chromozomu 6 u myší [1] [2] .

Je to HDAC třídy IV. (Třída IV má vlastnosti jak třídy I, tak třídy II HDAC). Poprvé byl popsán v roce 2002.

Histonové deacetylázy, jako je HDAC11, řídí expresi DNA modifikací histonového oktamerního jádra , které sbaluje DNA do hustých chromatinových struktur a potlačuje genovou expresi [2] .

Funkce

HDAC11 je exprimován normálně v mozkových a testikulárních tkáních, ale zvýšená exprese HDAC11 byla také pozorována v různých rakovinných buňkách.

Ukázalo se, že HDAC11 je negativním regulátorem produkce IL-10 v buňkách prezentujících antigen. Kromě toho se ukázalo, že inhibice HDAC11 vede ke zvýšené expresi OX40L v buňkách Hodgkinova lymfomu .

Interakce

Ukázalo se, že HDAC11 interaguje s HDAC6 [3] .

Viz také

Histonové deacetylázy

Poznámky

↑ Gao L., Cueto MA, Asselbergs F., Atadja P. Klonování a funkční charakterizace HDAC11, nového člena rodiny lidských histonových deacetyláz // Journal of Biological Chemistry : journal. - 2002. - Červenec ( roč. 277 , č. 28 ). - S. 25748-25755 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .
↑ 1 2 Entrez Gen: HDAC11 histon deacetyláza 11 . (neurčitý)
↑ Gao, Lin; Cueto Maria A; Asselbergs Fred; Atadja Peter. Klonování a funkční charakterizace HDAC11, nového člena rodiny lidských histonových deacetyláz (anglicky) // Journal of Biological Chemistry : journal. - Spojené státy americké, 2002. - Červenec ( sv. 277 , č. 28 ). - S. 25748-25755 . — ISSN 0021-9258 . - doi : 10.1074/jbc.M111871200 . — PMID 11948178 .

Literatura

Verdin E., Dequiedt F., Kasler HG histondeacetylázy třídy II : všestranné regulátory // Trendy : deník. - 2003. - Sv. 19 , č. 5 . - str. 286-293 . - doi : 10.1016/S0168-9525(03)00073-8 . — PMID 12711221 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA Klonování DNA pomocí in vitro místně specifické rekombinace // Výzkum genomu : deník. - 2001. - Sv. 10 , č. 11 . - S. 1788-1795 . - doi : 10.1101/gr.143000 . — PMID 11076863 .
Simpson JC; Wellenreuther R; Postka A; Pepperkok, R; Wiemann, S. Systematická subcelulární lokalizace nových proteinů identifikovaných rozsáhlým sekvenováním cDNA // Zprávy EMBO : deník. - 2001. - Sv. 1 , ne. 3 . - str. 287-292 . - doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . — PMID 11256614 .
Strausberg R.L.; Feingold EA; Tetřev LH; Derge, JG; Klausner, R.D.; Collins, F.S.; Wagner, L; Shenmen, C. M.; Schuler, GD Generace a počáteční analýza více než 15 000 sekvencí lidské a myší cDNA v plné délce // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America : journal . - 2003. - Sv. 99 , č. 26 . - S. 16899-16903 . - doi : 10.1073/pnas.242603899 . — PMID 12477932 .
Ota T; Suzuki Y; Nishikawa T; Otsuki, Tetsuji; Sugiyama, Tomoyasu; Irie, Ryotaro; Wakamatsu, AI; Hayashi, Koji; Sato, Hiroyuki. Kompletní sekvenování a charakterizace 21 243 lidských cDNA plné délky // Nature Genetics : časopis . - 2004. - Sv. 36 , č. 1 . - str. 40-5 . - doi : 10.1038/ng1285 . — PMID 14702039 .
Gerhard D.S.; Wagner L; Feingold EA; Shenmen, C. M.; Tetřev, LH; Schuler, G; Klein, S.L.; Starý, S; Rasooly, R. Stav, kvalita a rozšíření projektu NIH Full-Length cDNA: The Savmalian Gene Collection (MGC ) // Genome Research : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2121-2127 . - doi : 10.1101/gr.2596504 . — PMID 15489334 .
Wiemann S; Arlt D; Huber W; Wellenreuther, R; Schleeger, S; Mehrle, A; Bechtel, S; Sauermann, M; Korf, U. From ORFeome to Biology: A Functional Genomics Pipeline // Genome Research : deník. - 2004. - Sv. 14 , č. 10B . - S. 2136-2144 . - doi : 10.1101/gr.2576704 . — PMID 15489336 .
Voelter-Mahlknecht S., Ho AD, Mahlknecht U . Chromozomální organizace a lokalizace nového genu lidské histondeacetylázy 11 třídy IV // International Journal of Molecular Medicine : deník. - 2005. - Sv. 16 , č. 4 . - str. 589-598 . - doi : 10.3892/ijmm.16.4.589 . — PMID 16142391 .
Rual JF; Venkatesan K; Hao T; Hirozane-Kishikawa, Tomoko; Dricot, Amelie; Li, Ning; Berriz, Gabriel F.; Gibbons, Francis D.; Dreze, Matija. Směrem k proteomové mapě interakční sítě mezi lidskými proteiny a proteiny (anglicky) // Nature : journal. - 2005. - Sv. 437 , č.p. 7062 . - S. 1173-1178 . - doi : 10.1038/nature04209 . — PMID 16189514 .
Mehrle A; Rosenfelder H; Schupp I; Del Val, C; Arlt, D; Hahne, F; Bechtel, S; Simpson, J; Hofmann, O. Databáze LIFEdb v roce 2006 // Nucleic Acids Research : deník. - 2006. - Sv. 34 , č. Problém s databází . - P.D415-8 . doi : 10.1093 / nar/gkj139 . — PMID 16381901 .
Lindberg D., Akerström G., Westin G. Mutační analýzy WNT7A a HDAC11 jako kandidátních tumor supresorových genů u sporadických maligních endokrinních nádorů pankreatu (anglicky) // Clin. Endocrinol. (Oxf): deník. - 2007. - Sv. 66 , č. 1 . - str. 110-114 . - doi : 10.1111/j.1365-2265.2006.02694.x . — PMID 17201809 .

Odkazy

MeSH HDAC11+protein,+člověk