SMC3

Strukturní podpora chromozomů 3
Identifikátory
SymbolSMC3  ; BAM; BMH; CDLS3; CSPG6; HCAP; SMC3L1
Externí IDOMIM:  606062 MGI :  1339795 HomoloGene :  3974 GeneCards : SMC3 Gene
Profil exprese RNA
Více informací
ortology
PohledČlověkMyš
Entrez912613006
SouborENSG00000108055ENSMUSG00000024974
UniProtQ9UQE7Q9CW03
RefSeq (mRNA)NM_005445NM_007790
RefSeq (protein)NP_005436NP_031816
Locus (UCSC)Chr 10:
110,57 – 110,6 Mb
Chr 19:
53,6 – 53,65 Mb
Hledejte v PubMed[jeden][2]

SMC3 neboli Strukturální údržba chromozomů protein 3 je protein kódovaný genem  SMC4 u lidí [1] .

Funkce

Tento gen patří do podrodiny SMC3 proteinů SMC. Protein kódovaný tímto genem může být přítomen v určitých typech buněk jako intracelulární, nukleární nebo dokonce vylučovaný protein. Jaderná forma, známá jako chromozomový strukturní podpůrný protein 3, je součástí kohezinu , multiproteinového komplexu, který drží sesterské chromatidy pohromadě během mitózy, aby byla zajištěna správná segregace chromozomů. Na konci syntézy může tento protein projít posttranslační úpravou – přidáním řetězce chondroitin sulfátu. V důsledku toho vzniká vylučovaný proteoglykan bamakan, který je ve velkém množství obsažen v bazální membráně [1] .

Modelové organismy

Fenotyp knockdown myší Smc3

Ke studiu funkce genu SMC3 byly použity knockoutované myši Smc3 tm1a (EUCOMM)Wtsi [7] [8] . Tato linie byla vytvořena v rámci programu International Consortium Knockout Mouse Program - vysoce výkonná analýza zvířecích mutantů představujících modely onemocnění zajímavé pro vědce [9] [10] [11] .

Jednotlivci mužského a ženského pohlaví podstoupili standardizované fenotypové testy ke stanovení účinků delece genu [5] [12] . Na mutantních myších bylo provedeno 22 studií a bylo zjištěno šest významných abnormalit [5] . Homozygoti pro tuto mutaci zemřeli v raných fázích embryogeneze. Všechny testy byly provedeny na heterozygotních dospělých myších. U samic byla pozorována zvýšená úmrtnost potomků před přechodem na samokrmení a také pokles tělesné hmotnosti. Heterozygotní samci měli krátkou, vzhůru otočenou tlamu [5] [12] .

Viz také

Poznámky

  1. 1 2 Entrez Gen: SMC3 strukturální údržba chromozomů 3 . Archivováno z originálu 7. března 2010.
  2. Údaje o tělesné hmotnosti pro Smc3 . Vítejte Trust Sanger Institute. Získáno 17. listopadu 2015. Archivováno z originálu 17. října 2012.
  3. ↑ Údaje o infekci salmonelou pro Smc3 . Vítejte Trust Sanger Institute.
  4. ↑ Údaje o infekci Citrobacter pro Smc3 . Vítejte Trust Sanger Institute. Získáno 17. listopadu 2015. Archivováno z originálu 17. října 2012.
  5. 1 2 3 4 Gerdin AK The Sanger Mouse Genetics Program: Vysoce výkonná charakterizace knockout myší  //  Acta Ophthalmologica : deník. - 2010. - Sv. 88 . - S. 925-927 . - doi : 10.1111/j.1755-3768.2010.4142.x .
  6. Portál zdrojů myši Archivováno 24. prosince 2011 na Wayback Machine , Wellcome Trust Sanger Institute.
  7. International Knockout Mouse Consortium (odkaz není dostupný) . Získáno 17. listopadu 2015. Archivováno z originálu 3. dubna 2012. 
  8. Informatika genomu myši . Získáno 17. listopadu 2015. Archivováno z originálu 18. listopadu 2015.
  9. Skarnes WC, Rosen B., West AP, Koutsourakis M., Bushell W., Iyer V., Mujica AO, Thomas M., Harrow J., Cox T., Jackson D., Severin J., Biggs P., Fu J., Nefedov M., de Jong PJ, Stewart AF, Bradley A. Podmíněný knockout zdroj pro genomovou studii funkce myšího genu  //  Nature: journal. - 2011. - Sv. 474 , č.p. 7351 . - str. 337-342 . - doi : 10.1038/příroda10163 . — PMID 21677750 .
  10. ↑ Knihovna Dolgin E. Mouse nastavena jako knockout   // Nature . - 2011. - Sv. 474 , č.p. 7351 . - str. 262-263 . - doi : 10.1038/474262a . — PMID 21677718 .
  11. Collins FS, Rossant J., Wurst W. Myš ze všech důvodů   // Cell . - Cell Press , 2007. - Vol. 128 , č.p. 1 . - S. 9-13 . - doi : 10.1016/j.cell.2006.12.018 . — PMID 17218247 .
  12. 1 2 van der Weyden L., White JK, Adams DJ, Logan DW Genetická sada myší: odhalující funkce a mechanismus   // Genome Biology : deník. - 2011. - Sv. 12 , č. 6 . — S. 224 . - doi : 10.1186/cz-2011-12-6-224 . — PMID 21722353 .

Odkazy