Primer ( anglicky primer ) - krátký fragment nukleové kyseliny ( oligonukleotid ), komplementární k cíli DNA nebo RNA ; slouží jako primer pro syntézu komplementárního vlákna pomocí DNA polymerázy (během replikace DNA ). Primer je nezbytný pro DNA polymerázy k zahájení syntézy nového vlákna z 3'-konce (hydroxylová skupina) primeru. DNA polymeráza se postupně přidává na 3'-konec primeru nukleotidy komplementární k řetězci templátu [1] [2] .
Ve většině případů přirozené replikace DNA je primerem pro syntézu DNA krátký fragment RNA (vytvořený nově). Takový ribonukleotidový primer je vytvořen enzymem primázou (primáza u prokaryot, DNA polymeráza u eukaryot) a následně nahrazen deoxyribonukleotidy , polymerázou, která normálně plní reparační funkce [2] .
Mnoho laboratorních metod v biochemii a molekulární biologii , které zahrnují použití DNA polymerázy, jako je sekvenování nebo polymerázová řetězová reakce , vyžaduje krátké oligonukleotidy (primery). Takové primery jsou obvykle dlouhé 6 až 50 bází a jsou to chemicky syntetizované oligonukleotidy [3] .
replikace DNA | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
Zahájení |
| ||||||
Prodloužení |
| ||||||
Ukončení |
|