TCF4
| TCF4
|
|---|
|
|
|
|
| Symboly
| TCF4 , E2-2, ITF-2, ITF2, PTHS, SEF-2, SEF2, SEF2-1, SEF2-1A, SEF2-1B, SEF2-1D, TCF-4, bHLHb19, FECD3, transkripční faktor 4, CDG2T |
|---|
| Externí ID |
OMIM: 602272 MGI: 98506 HomoloGene: 2407 GeneCards: 6925
|
|---|
|
|
| Název nemoci |
Odkazy |
|---|
| morbidní obezita |
|
| schizofrenie |
|
| ulcerózní kolitida |
|
| sklerotizující cholangitida |
|
| Endoteliální dystrofie rohovky |
|
| Pitt-Hopkinsův syndrom |
|
| Funkce |
• aktivita dimerizace proteinu
• homodimerizace proteinu
• GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 aktivita transkripčního faktoru vázajícího DNA
• GO:0001077, GO:0001212, GO:0100121, GO:01000121 -aktivita vazebného transkripčního aktivátoru, specifická pro RNA polymerázu II
• vazba na transkripční faktor bHLH
• vazba na E-box • vazba
na C-konec proteinu
• GO:0001948, GO:0016582 vazba na plazmatické proteiny
• podobná vazba na protein
• vazba na transkripční faktor třídy TFIIB
• aktivita heterodimerizace proteinu
• DNA-vazba
• GO:0000980 RNA polymeráza II cis-regulační oblast sekvenčně specifická DNA vazba
• GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-vazebná aktivita transkripčního faktoru, RNA polymeráza II-specifická
|
|---|
| buněčná složka |
• komplex regulátorů transkripce
• buněčné jádro
• komplex beta-catenin -TCF
• komplex beta-catenin-TCF7L2
|
|---|
| biologický proces |
• Buněčná diferenciace
• GO:0009373 DNA-dependentní regulace transkripce
• sestavení komplexu protein-DNA
• transkripce, DNA-dependentní
• vývoj nervového systému
• GO:0060469, GO:0009371 DNA-dependentní pozitivní regulace transkripce
• DNA-templátovaná transkripce, iniciace
• iniciace transkripce z promotoru RNA polymerázy II
• GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 pozitivní regulace transkripce promotorem RNA polymerázy II
• pozitivní regulace diferenciace neuronů
|
|---|
| Zdroje: Amigo / QuickGO | |
| Druhy |
Člověk |
Myš |
|---|
| Entrez |
|
|
|---|
| Soubor |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (mRNA) |
| |
|---|
| RefSeq (protein) |
| |
|---|
| Locus (UCSC) |
Chr 18: 55,22 – 55,66 Mb
| Chr 18: 69,34 – 69,69 Mb
|
|---|
| Vyhledávání PubMed |
[9]
| [deset] |
|---|
| Upravit (člověk) | Upravit (myš) |
TCF-4 (z angl . Transscription factor 4 ) neboli transkripční faktor 4 , známý také jako imunoglobulinový transkripční faktor 2 ( ITF-2 ), je protein, který je u lidí kódován genem TCF4 umístěným na chromozomu 18q21.2 [1] .
Funkce
Protein TCF4 působí jako transkripční faktor, který se váže na imunoglobulinový enhancer mu-E5/kappa-E2 motiv. TCF4 aktivuje transkripci vazbou na E-box (5'-CANNTG-3'), který se běžně nachází na SSTR2 -INR nebo iniciačním prvku somatostatinového receptoru2 . TCF4 se primárně podílí na fetálním neurologickém vývoji během těhotenství iniciací nervové diferenciace vazbou na DNA. Nachází se v centrálním nervovém systému, somitech a progenitorových gonádách na počátku vývoje. V pozdějších vývojových stádiích se nachází ve štítné žláze, brzlíku a ledvinách, zatímco v dospělosti se TCF4 nachází v lymfocytech, svalech, zralých neuronech a gastrointestinálním systému [2] [3] [4] .
Klinický význam
Mutace v TCF4 způsobují Pitt-Hopkinsův syndrom (PTHS). Tyto mutace způsobují, že proteiny TCF4 se správně nevážou na DNA a neřídí diferenciaci nervového systému. Ve většině studovaných případů byly mutace de novo, to znamená, že se jednalo o novou mutaci, která nebyla nalezena u jiných členů rodiny pacienta. Mezi běžné příznaky Pitt-Hopkinsova syndromu patří široká ústa, gastrointestinální problémy, opožděný vývoj jemné motoriky, problémy s řečí a dýcháním, epilepsie a další mozkové vady [5] [6] .
Poznámky
- ↑ Henthorn P, McCarrick-Walmsley R, Kadesch T (únor 1990). „Sekvence cDNA kódující ITF-2, pozitivně působící transkripční faktor“ . Výzkum nukleových kyselin . 18 (3): 678. doi : 10.1093/nar/ 18.3.678 . PMC 333500 . PMID2308860 . _
- ↑ de Pontual L, Mathieu Y, Golzio C, Rio M, Malan V, Boddaert N a kol. (duben 2009). "Mutační, funkční a expresní studie genu TCF4 u Pitt-Hopkinsova syndromu." Lidská mutace . 30 (4): 669-76. DOI : 10.1002/humu.20935 . PMID 19235238 .
- ↑ Pscherer A, Dörflinger U, Kirfel J, Gawlas K, Rüschoff J, Buettner R, Schüle R (prosinec 1996). „Trankripční faktor helix-loop-helix SEF-2 reguluje aktivitu nového iniciačního prvku v promotoru genu lidského somatostatinového receptoru II“ . EMBO Journal . 15 (23): 6680-90. DOI : 10.1002/j.1460-2075.1996.tb01058.x . PMC 452492 . PMID 8978694 .
- ↑ D'Rozario, Mitchell; Zhang, Ting; Waddell, Edward A.; Zhang, Yonggang; Sahin, Cem; Sharoni, Michal; Hu, Tina; Nayal, Mohamed; Kutty, Kaveesh; Liebl, Faith; Hu, Wenhui (2016-04-12). „BHLH proteiny typu I bez dcery a Tcf4 omezují větvení neuritů a tvorbu synapsí potlačením neurexinu v postmitotických neuronech“ . Přehledy buněk . 15 (2): 386-397. DOI : 10.1016/j.celrep.2016.03.034 . ISSN 2211-1247 . PMC 4946342 . PMID27050508 . _
- ↑ Amiel J, Rio M, de Pontual L, Redon R, Malan V, Boddaert N a kol. (květen 2007). „Mutace v TCF4, kódující základní transkripční faktor helix-loop-helix I. třídy, jsou zodpovědné za Pitt-Hopkinsův syndrom, těžkou epileptickou encefalopatii spojenou s autonomní dysfunkcí“ . American Journal of Human Genetics . 80 (5): 988-93. DOI : 10.1086/515582 . PMC 1852736 . PMID 17436254 .
- ↑ Zweier C, Peippo MM, Hoyer J, Sousa S, Bottani A, Clayton-Smith J, et al. (květen 2007). „Haploinsuficience TCF4 způsobuje syndromovou mentální retardaci s intermitentní hyperventilací (Pitt-Hopkinsův syndrom)“ . American Journal of Human Genetics . 80 (5): 994-1001. DOI : 10.1086/515583 . PMC 1852727 . PMID 17436255 .