Haploskupina J (Y-DNA)

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 19. června 2022; kontroly vyžadují 3 úpravy .
Haploskupina J
Typ Y-DNA
Doba vzhledu před 30 tisíci lety
Umístění spawn Blízký východ
Rodová skupina IJ
sesterské skupiny
Podklady J1 , J2
Markerové mutace M304/Page16/PF4609, 12f2.1

Haploskupina J (J-P209) - haploskupina  Y-DNA , rozšířená především na Středním východě , v severní Africe , na Kavkaze a v jižní Evropě , i když se vyskytuje i v jiných oblastech naší planety. Skládá se ze dvou hlavních větví (kladů, podskupin):

Haploskupina J je odvozena z mutace v haploskupině IJ, ke které došlo u muže, který žil c. před 42 900 lety. Poslední společný předek novodobých přenašečů haploskupiny J žil před 31 600 lety (data určuje z výstřižků YFull [1] ).

Distribuce v moderních populacích

Podle výzkumu lidského genomu je ve 21. století našeho letopočtu haploskupina J nejběžnější na jihozápadě Arabského poloostrova . Mimo to je přítomen na Kavkaze , v jižní Evropě (zejména v jižní Itálii , na Maltě , v Řecku a Albánii ), v severní Africe a jižní Asii . Haploskupina J se nachází v severní Africe , převážně ve formě subkladu J1 . Jeho další odrůda J2a se vyskytuje hlavně v Řecku , Anatolii a jižní Itálii .

Statistiky

Země/oblast Skupina N J-M267, J1 J-M172, J2 Celkem J Studie
Alžírsko Oran 102 22.5 4.9 27.4 Robino, 2008
Kavkaz Čečensko 330 29.9 56,7 86,6 Balanovský, 2011
Kavkaz Ingušsko 143 2.8 88,8 91,6 Balanovský, 2011
Kypr 164 9.6 12.9 22.5 El Sibai, 2009 [2]
Egypt 124 19.8 7.6 27.4 El Sibai, 2009
Řecko Kréta / Heraklion 104 1.9 44,2 46.1 Martinez, 2007
Řecko Kréta 143 3.5 35 38,5 El Sibai, 2009
Řecko 154 1.9 18.1 dvacet El Sibai, 2009
Írán 92 3.2 25 28.2 El Sibai, 2009
Irák 117 33.1 25.1 58,2 El Sibai, 2009
Izrael Akko 101 39.2 18.6 57,8 El Sibai, 2009
Itálie 699 2 dvacet 22 Capelli, 2007
Itálie Marche 59 5.1 35.6 40.7 Capelli, 2007
Itálie Kalábrie 57 3.5 35.1 38.6 Capelli, 2007
Itálie Sicílie 212 5.2 22.6 27.8 El Sibai, 2009
Itálie Sardinie 81 4.9 9.9 14.8 El Sibai, 2009
Kypr 164 9.6 12.9 22.5 El Sibai, 2009
Jordán 273 35.5 14.6 50.1 El Sibai, 2009
Kuvajt 42 33.3 9.5 42.8 El Sibai, 2009
Libanon 951 17 29.4 46.4 El Sibai, 2009
Malta 90 7.8 21.1 28.9 El Sibai, 2009
Maroko 316 jeden 0,2 1.2 El Sibai, 2009
Portugalsko 303 4.3 6.9 11.2 El Sibai, 2009
Katar 72 58,3 8.3 66,6 El Sibai, 2009
Španělsko Cádiz 28 3.6 14.3 17.9 El Sibai, 2009
Španělsko Kantábrie 70 2.9 2.9 5.8 El Sibai, 2009
Španělsko Kastilie 21 0 9.5 9.5 El Sibai, 2009
Španělsko Cordova 27 0 14.7 14.7 El Sibai, 2009
Španělsko Galicie 19 5.3 0 5.3 El Sibai, 2009
Španělsko Huelva 22 0 13.7 13.7 El Sibai, 2009
Španělsko Ibiza 54 0 3.7 3.7 El Sibai, 2009
Španělsko Leon 60 1.7 5 6.7 El Sibai, 2009
Španělsko malaga 26 0 15.4 15.4 El Sibai, 2009
Španělsko Mallorca 62 1.6 osm 9.7 El Sibai, 2009
Španělsko Sevilla 155 3.2 7.8 jedenáct El Sibai, 2009
Španělsko Valencie 31 2.7 5.5 8.2 El Sibai, 2009
Sýrie 554 33.6 20.8 54,4 El Sibai, 2009
Tunisko 148 32.4 3.4 35.8 Arredi, 2004
krocan 523 9.1 24.2 33.3 El Sibai, 2009
Spojené arabské emiráty 164 34.7 10.3 45 El Sibai, 2009
Jemen 62 72,5 9.6 82,1 El Sibai, 2009

Variace

Paragroup J-P209*

Paragroup J-P209* [Fylogenetika 1] jsou všechny varianty J kromě J1 a J2 . J-P209* je velmi běžný na ostrově Socotra , kde jeho frekvence dosahuje 71,4 %. [3] J-P209* byl také nalezen v menším množství v Jemenu ( Giacomo 2004 ) , mezi aškenázskými Židy [4] v Saúdské Arábii ( Abu-Amero 2009 ).

J1-M267

Možná označení [Fylogenetika 2]

J2-M172

Možná označení [Fylogenetika 3]

Paleogenetika

Haploskupina J byla nalezena u paleolitického obyvatele gruzínské jeskyně Satsurbliya , který žil cca. před 13,2 tisíci lety. Subklad J2a byl nalezen u druhohorního lovce z krasové jeskyně Kotias Klde v západní Georgii , který žil před 9529-9895 tisíci lety [5] .

J2a byl identifikován u druhohorního obyvatele ostrova South Oleny na Oněžském jezeře , který žil před 7500 lety [6] , druhohorního obyvatele íránské jeskyně Khotu ( en: Huto a jeskyně Kamarband ) [7] .

J2a2 a J2a1a byly identifikovány u zástupců kultury Cardiac Ware z Ripabianca di Monterado (Itálie) [8] .

J1 byl identifikován u zástupce kultury Kura-Araxes [9] .

J a J2a byly identifikovány u zástupců kultury Maikop [9] .

J2a-M410 byl identifikován u obyvatele s tmavou pletí a hnědýma očima (Kou01) řeckého ostrova Koufonisia ze starší doby bronzové (stará kykladská doba, 2464–2349 př. n. l.) [10] .

J2a byl identifikován u osoby, která žila přibližně 1110-1270 před naším letopočtem. E. zástupce kyjatické kultury pozdní doby bronzové z maďarské lokality Ludas-Varjú-dűlő [11] .

Pozoruhodní členové haploskupiny J

Poznámky

  1. JYTree . Staženo 2. července 2017. Archivováno z originálu 25. února 2017.
  2. El-Sibai, 2009 oznámil výsledky z několika studií: Di Giacomo, 2003 , Al-Zahery, 2003 , Flores, 2004 , Cinnioglu, 2004 , Capelli, 2005 , Goncalves, 2005 , 2080 , Cadenoua, 2080 Zallou
  3. Černý, 2008 : J-12f2(xM267,M172)(45/63)
  4. Shen, 2004 : Haploskupina J-M304(xM267,M172) v 1/20 aškenázských Židů.
  5. Jones, ER a kol. Genomy z horního paleolitu odhalují hluboké kořeny moderních Eurasijců Archivováno 21. srpna 2016 na Wayback Machine , 2015
  6. Iain Mathieson a kol. Osm tisíc let přirozeného výběru v Evropě Archivováno 3. března 2016 na Wayback Machine , 2015
  7. Iosif Lazaridis a kol. Genetická struktura prvních farmářů na světě, 2016. . Získáno 18. června 2016. Archivováno z originálu 16. července 2018.
  8. Margaret L. Antonio a kol. Starověký Řím: Genetická křižovatka Evropy a Středomoří Archivováno 10. listopadu 2019 na Wayback Machine , 2019
  9. 1 2 Chuan-Chao a kol. Genetická prehistorie Velkého Kavkazu Archivováno 18. května 2018 na Wayback Machine , 2018
  10. Florian Clemente a kol. Genomická historie egejských palácových civilizací Archivováno 29. dubna 2021 na Wayback Machine , 29. dubna 2021
  11. Tok a stagnace genomu v transektu pěti tisíciletí evropské prehistorie Archivováno 29. dubna 2015 na Wayback Machine , 2014
  12. Yu. M. Idrisov. Nová data o genogeografii Kumyků // Archiv Kumyků: sbírka článků a materiálů. Problém. 1. Ed. spolupracovníci: Ju. M. Idrisov (vědecký redaktor), R. P. Garunov (odpovědný redaktor), A. B. Ibragimov, Ch. A. Alkhanadzhiev, S. A. Khamurzaev, I. M. Machtibekov. - Machačkala: Abusupiyan Publishing House, 2018.

Použité studie

Časopisy

  • Y Chromosome Consortium "YCC". Nomenklaturní systém pro strom lidských Y-chromozomálních binárních haploskupin   // Výzkum genomu : deník. - 2002. - Sv. 12 , č. 2 . - str. 339-348 . - doi : 10.1101/gr.217602 . — PMID 11827954 .
  • Abu-Amero, Khaled K; Hellani, Ali; Gonzalez, Ana M; Larruga, José M; Cabrera, Vicente M; Underhill, Peter A. Diverzita Y-chromozomu v Saudské Arábii a její vztah k blízkým regionům  (anglicky)  // BMC Genetics: journal. - 2009. - Sv. 10 . — S. 59 . - doi : 10.1186/1471-2156-10-59 . — PMID 19772609 .
  • Alshamali, Farida; Pereira, LuÍsa; Budowle, Bruce; Poloni, Estella S.; Currat, Mathias. Místní populační struktura na Arabském poloostrově Odhalená diverzitou Y-STR  // Lidská  dědičnost : deník. - 2009. - Sv. 68 , č. 1 . - str. 45-54 . - doi : 10.1159/000210448 . — PMID 19339785 .
  • Chiaroni, Jacques; King, Roy J; Myres, Natalie M; Henn, Brenna M; Ducourneau, Axel; Mitchell, Michael J; Boetsch, Gilles; Sheikha, Issa; Lin, Alice A. Vznik haploskupiny Y-chromozomu J1e mezi arabsky mluvícími populacemi  // European  Journal of Human Genetics : deník. - 2009. - Sv. 18 , č. 3 . - str. 348-353 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . — PMID 19826455 .
  • Chiaroni, Jacques; King, Roy J; Myres, Natalie M; Henn, Brenna M; Ducourneau, Axel; Mitchell, Michael J; Boetsch, Gilles; Sheikha, Issa; Lin, Alice A. Vznik haploskupiny Y-chromozomu J1e mezi arabsky mluvícími populacemi  // European  Journal of Human Genetics : deník. - 2010. - Sv. 18 , č. 3 . - str. 348-353 . - doi : 10.1038/ejhg.2009.166 . — PMID 19826455 .
  • Cinnioglu, Cengiz; král, Roy; Kivisild, Toomas; Kalfoglu, Ersi; Atasoy, Sevil; Cavalleri, Gianpiero L.; Lilly, Anita S.; Roseman, Charles C.; Lin, Alice A. Excavating Y-chromozom haplotype layer in Anatolia  (anglicky)  // Human Genetics: journal. - 2004. - Sv. 114 , č. 2 . - S. 127-148 . - doi : 10.1007/s00439-003-1031-4 . — PMID 14586639 .
  • Di Giacomo, F.; Luca, F.; Anagnou, N.; Ciavarella, G.; Corbo, R. M.; Cresta, M.; Cucci, F.; Di Stasi, L.; Agostiano, V. Klinovým vzorcům lidské chromozomální diverzity Y v kontinentální Itálii a Řecku dominují driftové a zakladatelské efekty  // Molecular Phylogenetics and Evolution  : journal  . - Academic Press , 2003. - Vol. 28 , č. 3 . - str. 387-395 . - doi : 10.1016/S1055-7903(03)00016-2 . — PMID 12927125 .
  • Di Giacomo, F.; Luca, F.; Popa, L.O.; Akar, N.; Anagnou, N.; Banyko, J.; Brdička, R.; Barbujani, G.; Papola, F. Y chromozomální haploskupina J jako podpis postneolitické kolonizace Evropy  (anglicky)  // Human Genetics : journal. - 2004. - Sv. 115 , č. 5 . - str. 357-371 . - doi : 10.1007/s00439-004-1168-9 . — PMID 15322918 .
  • Hammer, Michael F.; Behar, Doron M.; Karafet, Tatiana M.; Mendez, Fernando L.; Hallmark, Brian; Erez, Tamar; Živovskij, Lev A.; Rosset, Saharon; Skorecký, Karl. Rozšířené haplotypy chromozomu Y řeší mnohočetné a jedinečné linie židovského kněžství  (anglicky)  // Human Genetics: journal. - 2009. - Sv. 126 , č.p. 5 . - str. 707-717 . - doi : 10.1007/s00439-009-0727-5 . — PMID 19669163 .
  • Jobling, Mark A.; Tyler-Smith, Chris. Nová použití pro nové haplotypy  //  Trendy v genetice : deník. - Cell Press , 2000. - Vol. 16 , č. 8 . - S. 356-362 . - doi : 10.1016/S0168-9525(00)02057-6 . — PMID 10904265 .
  • Karafet, T.M.; Mendez, F. L.; Meilerman, MB; Underhill, PA; Zegura, S.L.; Hammer, MF Nové binární polymorfismy přetvářejí a zvyšují rozlišení lidského stromu haploskupin Y chromozomů  // Výzkum  genomu : deník. - 2008. - Sv. 18 , č. 5 . - S. 830-838 . - doi : 10.1101/gr.7172008 . — PMID 18385274 .
  • Luca, F.; Di Giacomo, F.; Benincasa, T.; Popa, L.O.; Banyko, J.; Krachmarová, A.; Malaspina, P.; Novelletto, A.; Brdička, R. Y-chromozomální variace v České republice  // American Journal of Physical Anthropology  :  journal. - 2007. - Sv. 132 , č.p. 1 . - S. 132-139 . - doi : 10.1002/ajpa.20500 . — PMID 17078035 .
  • Louis, J; Rowold, D; Regueiro, M; Caeiro, B; Cinnioglu, C; Roseman, C; Underhill, P; Cavallisforza, L; Herrera, R. Levant versus Africký roh: Důkazy pro obousměrné koridory lidských migrací  // The American  Journal of Human Genetics : deník. - 2004. - Sv. 74 , č. 3 . - str. 532-544 . - doi : 10.1086/382286 . — PMID 14973781 .
  • Nasidze, I.; Ling, EYS; Quinque, D.; Dupanloup, I.; Cordaux, R.; Rychkov, S.; Naumová, O.; Žukova, O.; Sarraf-Zadegan, N. Mitochondriální DNA a Y-chromozomové variace na Kavkaze  //  Annals of Human Genetics : deník. - 2004. - Sv. 68 , č. 3 . - S. 205-221 . - doi : 10.1046/j.1529-8817.2004.00092.x . — PMID 15180701 .
  • Shen, Peidong; Lavi, Tal; Kivisild, Toomas; Chou, Vivian; Sengun, Deniz; Gefel, Dov; Spirer, Issac; Woolf, Eilon; Hillel, Jossi. Rekonstrukce patrilineages a matrilineages Samaritánů a dalších izraelských populací z Y-chromozomu a mitochondriální DNA sekvence Variace  // Lidská  mutace : deník. - 2004. - Sv. 24 , č. 3 . - S. 248-260 . - doi : 10.1002/humu.20077 . — PMID 15300852 .

Blogy

Seznam e-mailových adres

Literatura

Notace

  1. Tato tabulka uvádí možná označení pro J-P209 (také J-12f2.1 nebo J-M304) v různých zdrojích. V Semino 2000 Eu09 označuje podklad z Eu10 a v Karafetu 2001 24 je podklad z 23 .
    YCC 2002/2008 (zkráceně) J-P209
    (také znám jako J-12f2.1 nebo J-M304)
    Jobling a Tyler-Smith 2000 9
    Underhill 2000 VI
    Hammer 2001 Med
    Karafet 2001 23
    Semino 2000 Eu10
    Ne 1999 H4
    Capelli 2001 B
    YCC 2002 (Longhand) J*
    YCC 2005 (Longhand) J
    YCC 2008 (Longhand) J
    YCC 2010r (Longhand) J
  2. Tato tabulka uvádí možná jména pro haploskupinu J-M267 a její dříve studovanou a popsanou podklad J-M62 v publikované recenzované literatuře.
    YCC 2002/2008 (zkráceně) J-M267 J-M62
    Jobling a Tyler-Smith 2000 - 9
    Underhill 2000 - VI
    Hammer 2001 - Med
    Karafet 2001 - 23
    Semino 2000 - Eu10
    Ne 1999 - H4
    Capelli 2001 - B
    YCC 2002 (Longhand) - J1
    YCC 2005 (Longhand) J1 J1a
    YCC 2008 (Longhand) J1 J1a
    YCC 2010r (Longhand) J1 J1a
  3. Tato tabulka uvádí možná jména pro haploskupinu J-M172 v publikované recenzované literatuře. V Semino 2000 je Eu09 podkladem z Eu10 a v Karafetu 2001 je 24 podkladem z 23 .
    YCC 2002/2008 (zkráceně) J-M172
    Jobling a Tyler-Smith 2000 9
    Underhill 2000 VI
    Hammer 2001 Med
    Karafet 2001 24
    Semino 2000 Eu9
    Ne 1999 H4
    Capelli 2001 B
    YCC 2002 (Longhand) J2*
    YCC 2005 (Longhand) J2
    YCC 2008 (Longhand) J2
    YCC 2010r (Longhand) J2

Odkazy

Evoluční stromhaploskupin lidského chromozomu Y
Y-chromozomální Adam
    A0-T
A00   A0   A1
    A1a   A1b
A1b1 BT
  B   ČT
DE   CF
D   E C F
F1 F2 F3     GHIJK  
    G HIJK
H IJK
IJ K
J LT(K1) K2
L(K1a)   T(K1b)       K2a/K2a1/ NO /NO1 K2b
N Ó   K2b1     P(K2b2) /P1  
  S(K2b1a) M(K2b1b) Q R