Trombin

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 9. listopadu 2020; ověření vyžaduje 1 úpravu .

Koagulační faktor II (trombin)

Lidský trombin v kombinaci s inhibitorem ( hirudinem ). [jeden]

Dostupné struktury

PNR

Ortologické vyhledávání: PDBe , RCSB

Seznam PDB ID

1A2C , 1A3B , 1A3E , 1A46 , 1A4W , 1A5G , 1A61 , 1ABJ , 1AD8 , 1AE8 , 1AFE , 1AI8 , 1AIX , 1AWF , 1BHH , 1BCU , 1BHX , 1BHX , 1BHX , 1BHX , 1BHX , 1BHX , 1BH ._ _ _ _ 1BMN , 1BTH, 1C1U , 1C1V , 1C1W , 1C4U , 1C4V , 1C4Y , 1C5L , 1C5N , 1C5O , 1CA8 , 1D3D , 1D3P , 1D3Q , 1D3T , 1D4P , 1D6W , 1D9I , 1DE7 , 1DIT , 1DM4 , 1DOJ , 1DWB , 1DWC , 1DWD , 1DWE , 1dx5 , 1e0f , 1eb1 , 1eoj , 1eol , 1fpc , 1fph , 1g30 , 1g32 , 1G37 , 1GHV , 1GHW , 1GHX , 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAH, 1HAP, 1HOP, 1HDTHT, 1HDTT, 1HDT, 1HDT, 1HDT, 1HDT, 1HDT, 1HDT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHBT, 1HDTHT, 1HDTHT, 1HDTHT , 1HDTHT , 1HDTHT , 1HDTHT , 1HDHT , 1HDTHT , 1HDTHT , 1HDTH , 1HDTHAP , 1HDTHAP , 1HDTHAP , 1HDTHAP , 1HDHAP 1HGT , 1HLT , 1HUT , 1HXE , 1HXF , 1IHS , 1IHT , 1JMo , 1JOU , 1JWW , 1K21 , 1K22 , 1KTS , 1KTT , 1LHC , 1LHD , 1LHE , 1LHF , 1LHG , 1MH0 , 1MU6 , 1MU8 , 1MU , 1NM6 , 1NOO9 _ 1nrn , 1nro , 1nrp , 1nrq , 1nrr , 1nrs , 1nt1 , 1nu7 , 1nu9 , 1ny2 , 1nzq , 1o0d , 1o2g , 1o5g , 1ook , 1ook , 1qjn , 1qjn , 1qj7 , 1qj7 , 1qj7 , 1qj1 , 1qj6 , 1qj6 , 1qj . 1RIW , 1SB1 , 1SFQ , 1SG8 , 1SGI , 1SHH , 1SL3 , 1SR5 , 1T4V , 1TA2 , 1TA6 , 1TB6 , 1TBZ , 1THP, 1TMUM _ , 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM, 1TMUM , 1TMUM, 1TMU, 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TQU , 1TM . , 1UVS , 1VR1 , 1VZQ , 1W7G , 1WAY , 1WBG , 1XM1 , 1XMN , 1YPE , 1YPG , 1YPJ , 1YPK , 1YPL , 1YPM , 1Z1ZGI , 1Z1ZGI , 1Z1ZGI , 1Z1ZGI , 1ZGV , 1ZRB , 2A0Q , 2A2X , 2A45 , 2AFQ , 2ANK , 2ANM , 2B5T , 2BDY , 2BVR , 2BVS , 2BVX , 2BVX , 2BX2C8X , 2BX2C8X , 2BX2C8X , 2BX2C8X , 2BXCUWX , 2B, 2C8Z , 2C90 , 2C93 , 2CF8 , 2CF9 , 2CN0 , 2FEQ , 2FES , 2GDE , 2GP9 , 2H9T , 2HGT , 2HNT , 2HPP , 2HPQ , 2HWL , 2JH0 , 2JH5 , 2JH6 , 2OD3 , 2PGB , 2PGQ , 2PKS , 2PW8 , 2R2M 2thf , 2uuf , 2uuj , 2uuk , 2V3H , 2V3O , 2ZC9 , 2ZDA , 2ZDV , 2ZF0 , 2ZFP , 2ZFQ , 2ZFR , 2ZG0, 2ZO2, 2ZOQU, 2ZOK2, 2ZOK2, 2ZOK2, 2ZOK2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOM2, 2ZOQU, 2ZOQU, 2ZOQU , 2ZG0 , 2ZGH2 , 2ZGH2 , 2ZGH2 , 2ZGH2 , 2ZGH2 , 2ZGH2 , 2ZGGB , 2ZHW , 2ZGHT , 2ZHW , 2ZGH . , 3B23 , 3B9F , 3Bef , 3BEI , 3BF6 , 3BIU , 3BV9 , 3C1K , 3C27 , 3d49 , 3DA9 , 3DD2 , 3DHK, 3DT0, 3HET, 3GIC, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS, 3GIS , 3GIS, 3GIS, 3GIC, 3GIC, 3GIC, 3GIC, 3GIC, 3GIC, 3GT0, 3GT0, 3DT0, 3DT0, 3DT0, 3DT0, 3DT0, 3DT0, 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3DT0 , 3 . , 3HTC , 3JZ1 , 3JZ2 , 3K65 , 3LDX , 3LU9 , 3NXP , 3P17 , 3P70 , 3PMH , 3PO1 , 3QDZ , 3QGN , 3QLP, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3RM0, 3QLP, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV, 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QTV , 3QT . 3RMM , 3RMN , 3RMO , 3S7H , 3S7K , 3SHA , 3SHC , 3SI3 , 3SI4 , 3SQE , 3SQH , 3SV2 , 3T5F , 3TU7 , 3U69 , 3U8O , 3U8R , 3U8T , 3U98 , 3U9A , 3UTU , 3UWJ , 3VXE , 3VXF , 4AX9 _ , 4AYV , 4AYY , 4AZ2 , 4BAH , 4BAK , 4BAM , 4BAN , 4BAO , 4BAQ , 4BOH , 4CH2 , 4CH8 , 4DIH , 4DII , 4DIH , 4DII , 4DT7 , 4ED7 05 , 4E7R , 4H6S , 4H6T , 4HFP , 4HFY , 4HTC , 4HZH , 4I7Y , 4LZ1 , 4LZ4 , 4MLF , 4N3L , 4NZE , 4N3L , 4NTHN _ _ _ _ _ _ _ _

Identifikátory

Symbol

F2 ; PT; RPRGL2; THPH1

Externí ID

OMIM: 176930 MGI : 88380 HomoloGene : 426 ChEMBL : 204 GeneCards : F2 Gene

EC číslo

3.4.21.5

Genová ontologie
Funkce	• endopeptidázová aktivita serinového typu • vazba na receptor • vazba na ionty vápníku • vazba na protein • aktivita růstového faktoru • aktivita trombospondinového receptoru
buněčná složka	• extracelulární oblast • extracelulární prostor • lumen endoplazmatického retikula • Golgiho lumen • plazmatická membrána • extracelulární vezikulární exozom • mikročástice krve
biologický proces	• pozitivní regulace fosforylace proteinů • proteolýza • reakce akutní fáze • signální dráha receptoru na povrchu buněk • vývoj mnohobuněčného organismu • koagulace krve • koagulace krve, vnitřní dráha • pozitivní regulace buněčné proliferace • regulace tvaru buňky • reakce na poranění • negativní regulace aktivace krevních destiček • pozitivní regulace signalizace fosfatidylinositol 3-kinázy • karboxylace peptidyl-glutamové kyseliny • aktivace krevních destiček • regulace srážení krve • pozitivní regulace srážení krve • pozitivní regulace buněčného růstu • pozitivní regulace procesu biosyntézy kolagenu • fibrinolýza • posttranslační protein • metabolismus buněčných proteinů proces • negativní regulace proteolýzy • negativní regulace diferenciace astrocytů • migrace leukocytů • pozitivní regulace uvolňování sekvestrovaného vápenatého iontu do cytosolu • cytosolická homeostáza vápenatých iontů • negativní regulace fibrinolýzy • pozitivní regulace fosfolipázy Signální dráha receptoru spřaženého s C-proteinem • pozitivní regulace metabolického procesu reaktivních forem kyslíku
Zdroje: Amigo / QuickGO

Profil exprese RNA

Více informací

ortology

Pohled

Člověk

Myš

Entrez

RefSeq (mRNA)

RefSeq (protein)

Locus (UCSC)

Chr 11:
46,74 – 46,76 Mb

Chr 2:
91,63 – 91,64 Mb

Hledejte v PubMed

[jeden]

[2]

Trombin (koagulační faktor II) je serinová proteáza , základní součást systému srážení krve u lidí a zvířat. Trombin patří do třídy enzymů hydrolázy ( EC 3.4.21.5 ). Katalyzuje hydrolýzu peptidových vazeb tvořených zbytky argininu a lysinu , má omezenou substrátovou specifitu. Jeho hlavní funkcí je přeměna fibrinogenu na fibrin . Působí také na několik dalších srážecích faktorů.

Syntéza

Trombin vzniká enzymatickým odštěpením dvou míst z protrombinu aktivovaným faktorem X (Xa). Aktivita faktoru Xa se výrazně zvyšuje, když se naváže na aktivovaný faktor V (Va), což vede ke vzniku tzv. protrombinázový komplex. Protrombin je syntetizován v játrech a podléhá kotranslační modifikaci v reakci závislé na vitaminu K vedoucí ke konverzi 10 zbytků kyseliny glutamové (Glu) na kyselinu gama-karboxyglutamovou (Gla). V přítomnosti vápníku zajišťují zbytky kyseliny gama-karboxyglutamové vazbu protrombinu na fosfolipidovou dvojvrstvu membrány. Nedostatek vitaminu K nebo přítomnost antikoagulantu warfarinu inhibuje tvorbu kyseliny gama-karboxyglutamové, která zpomaluje proces srážení krve.

Hladina trombinu v krvi se postupně zvyšuje od okamžiku narození až do dosažení normální hladiny u dospělého člověka: od koncentrace 0,5 U/ml 1 den po narození až po 0,9 U/ml ve věku 6 měsíců [2] .

Regulace zánětu

Trombin se kromě hemostázy podílí na regulaci zánětlivých procesů. Jeho působení je realizováno prostřednictvím receptorů aktivovaných proteázami a závisí na koncentraci [3] .

Viz také

Poznámky

↑ PDB 2C93 ; Howard N., Abell C., Blakemore W., Chessari G., Congreve M., Howard S., Jhoti H., Murray CW, Seavers LC, van Montfort RL Aplikace screeningu fragmentů a fragmentů spojujících objev nového trombinu inhibitory (anglicky) // J. Med. Chem. : deník. - 2006. - únor ( roč. 49 , č. 4 ). - S. 1346-1355 . doi : 10.1021 / jm050850v . — PMID 16480269 .
↑ Andrew M., Paes B., et al. Vývoj lidského koagulačního systému u donošeného dítěte // Krev : deník. — Americká hematologická společnost, 1987. - Sv. 70 , č. 1 . - S. 165-172 . — PMID 3593964 .
↑ Strukova SM Trombin jako regulátor zánětlivých a reparačních procesů v tkáních (anglicky) // Biochemie (Moskva) : deník. - 2001. - Sv. 66 , č. 1 . - S. 8-18 . — ISSN 0006-2979 . - doi : 10.1023/A:1002869310180 . (Angličtina)

Slovníky a encyklopedie	Velká dánština Velká Katalánština Velký Rus Treccani
V bibliografických katalozích	BNF : 12316045k J9U : 987007536583605171 LCCN : sh85135066

Endopeptidázy : serinové proteázy/serinové endopeptidázy ( EC 3.4.21)
Trávicí enzymy	Enteropeptidáza trypsin Chymotrypsin Elastáza ( neutrofilní , pankreatická )
Koagulace	faktory: Trombin Faktor VIIa Faktor IXa faktor Xa Faktor XIa Faktor XIIa Kalikrein ( PSA ) fibrinolýza : Plazmin Plazminogenový aktivátor ( tkáň , urokináza )
Doplňkový systém	Faktor B Faktor D Faktor I MASP ( MASP1 , MASP2 ) C3 konvertáza
Ostatní, imunitní systém	Himaz Granzim tryptáza Proteináza 3/myeloblastin
Z biotoxinů	Ancrod Batroxobin
jiný	Akrosin Prolyl endopeptidáza Pronáza Proprotein konvertáza ( 1 , 2 ) Navinout Subtilisin / Furin streptokináza S1P katepsin ( A , G ) ClpP Dlouho

Hemostatika - ATC kód: B02

inhibitory fibrinolýzy

B02AA Aminokyseliny	Kyselina aminokapronová ( B02AA01 ) Kyselina tranexamová ( B02AA02 ) Kyselina aminomethylbenzoová ( B02AA03 )
B02AB Inhibitory plazmatické proteinázy	Aprotinin ( B02AB01 ) Alfa1 antitrypsin ( B02AB02 )

Vitamin K a další hemostatické léky

B02BA Vitamín K	Menadione ( B02BA02 )
B02BC Hemostatické přípravky pro místní použití	Želatinová absorpční houba ( B02BC01 ) Kolagen ( B02BC07 )
B02BD faktory srážení krve	Koagulační faktory IX, II, VII a X v kombinaci ( B02BD01 ) Koagulační faktor VIII ( B02BD02 ) Inhibitory destrukce koagulačního faktoru VIII ( B02BD03 ) Koagulační faktor IX ( B02BD04 ) Koagulační faktor VII ( B02BD05 ) von Willebrandův koagulační faktor a VIII v kombinaci ( B02BD06 ) Eptakog alfa (aktivovaný) ( B02BD08 ) trombin ( B02BD30 )
B02BX Jiné hemostatické léky	Etamsylát ( B02BX01 ) Romiplostim ( B02BX04 ) Eltrombopag ( B02BX05 )