Přibnovský box

Pribnow box ( také známý jako Pribnow- Schaller box ) je specifická nukleotidová  sekvence potřebná pro promotorovou oblast bakterií, na kterou se váže RNA polymeráza [1] [2] . Nukleotidová sekvence Pribnow-boxu je považována za konsenzuální sekvenci , protože se vyskytuje v mnoha organismech s malými variacemi. Tato sekvence je pojmenována po Davidu Pribnowovi a Heinzi Schallerovi [1] [2] . ТАТААТ

Pribnow box se také nazývá sekvence -10, protože se nachází přibližně 10 párů bází proti směru transkripce od počátečního bodu transkripce .

Funkce této sekvence jsou podobné jako u TATA boxu nalezeného v eukaryotech a archaeách : je rozpoznána a vázána místem RNA polymerázy během iniciace transkripce . Je to také první bod, kde se komplementární řetězce DNA rozcházejí, aby umožnily zahájení syntézy RNA na templátu DNA. To je usnadněno velkým počtem AT-párů, protože vazby mezi adeninem a thyminem jsou méně silné než mezi guaninem a cytosinem [3] .

Pravděpodobnost nalezení každého nukleotidu

Poznámky

1. ↑ 1 2 Pribnow D. Nukleotidová sekvence vazebného místa RNA polymerázy na časném promotoru T7.  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Sv. 72, č.p. 3 . - S. 784-788. — PMID 1093168 .
2. ↑ 1 2 Schaller H. , Gray C. , Herrmann K. Nukleotidová sekvence vazebného místa RNA polymerázy z DNA bakteriofága fd.  (anglicky)  // Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. - 1975. - Sv. 72, č.p. 2 . - S. 737-741. — PMID 1054851 .
3. ↑ Yakovchuk P. , Protozanova E. , Frank-Kamenetskii MD Příspěvky skládání bází a párování bází do tepelné stability dvoušroubovice DNA. (anglicky)  // Výzkum nukleových kyselin. - 2006. - Sv. 34, č. 2 . - S. 564-574. doi : 10.1093 / nar/gkj454 . — PMID 16449200 .  
4. ↑ Harley CB , Reynolds RP Analýza sekvencí promotoru E. coli.  (anglicky)  // Výzkum nukleových kyselin. - 1987. - Sv. 15, č. 5 . - S. 2343-2361. — PMID 3550697 .