Methylace DNA

Aktuální verze stránky ještě nebyla zkontrolována zkušenými přispěvateli a může se výrazně lišit od verze recenzované 3. prosince 2019; kontroly vyžadují 9 úprav .

Metylace DNA je modifikace  molekuly DNA beze změny samotné nukleotidové sekvence DNA, kterou lze považovat za součást epigenetické složky genomu [1] [2] [3] .

Methylace DNA spočívá v přidání methylové skupiny k cytosinu jako součásti CpG dinukleotidu v poloze C5 cytosinového kruhu. Methylace v promotorové oblasti genu obvykle vede k supresi odpovídajícího genu. Metylovaný cytosin pak může být oxidován specifickými enzymy, což případně vede k jeho demethylaci zpět na cytosin [4] .

Předpokládá se, že methylace DNA je charakteristická převážně pro eukaryota . U lidí je asi 1 % genomové DNA methylováno. V dospělých somatických buňkách se methylace DNA typicky vyskytuje na CpG dinukleotidech ; K methylaci DNA mimo CpG dinukleotidy dochází v embryonálních kmenových buňkách . [5] [6]

Navíc metylace DNA mimo CpG dinukleotidy je charakteristickým znakem epigenomu pluripotentních kmenových buněk a pokles non-CG metylace je spojen se zhoršenou schopností diferenciace na endodermální buněčné linie [7]

V rostlinách dochází k methylaci cytosinu jak symetricky podél obou řetězců (na CpG nebo CpNpG), tak asymetricky pouze na jednom ze dvou řetězců (na CpNpNp, kde N znamená jakýkoli nukleotid).

Methylace DNA u savců

Asi 60-70 % všech CpG dinukleotidů u savců je methylovaných. Nemethylované CpG dinukleotidy se sdružují do tzv. " CpG ostrovy ", které jsou přítomné v 5' regulačních oblastech mnoha genů . Různá onemocnění, jako je rakovina , jsou doprovázena počáteční abnormální hypomethylací DNA a následnou hypermethylací CpG ostrůvků v promotorových oblastech genů, což vede k trvalé transkripční represi. Transkripční represe je v tomto případě zprostředkována proteiny schopnými vázat se na methylované CpG dinukleotidy. Tyto proteiny, nazývané proteiny vázající methylcytosin , rekrutují histon deacetylázu (HDAC) a další faktory podílející se na remodelaci chromatinu. Vytvořený komplex může modifikovat histony a vytvářet kondenzovanou transkripčně neaktivní heterochromatinovou strukturu . Vliv metylace DNA na strukturu chromatinu má velký význam pro vývoj a fungování živého organismu. Zejména nepřítomnost methylcytosin-binding protein 2 (MeCP2), způsobená např. mutací v odpovídajícím genu, vede u lidí k rozvoji Rettova syndromu ; u onkologických onemocnění byla zaznamenána inaktivace methylcytosin-binding domain protein 2 (MBD2), který se podílí na potlačení transkripce hypermethylovaných genů.

Metylace DNA u lidí

U lidí jsou za methylaci DNA zodpovědné tři enzymy, nazývané DNA methyltransferázy 1, 3a a 3b (DNMT1, DNMT3a, DNMT3b) . Předpokládá se, že DNMT3a a DNMT3b jsou de novo methyltransferázy , které tvoří DNA metylační vzor v raných fázích vývoje, stejně jako jeho změny během buněčné diferenciace. Existuje hypotéza, že de novo metylace DNA je způsobena zejména interferujícími RNA prostřednictvím RNA-dependentní metylace DNA, což je proces, který vznikl během evoluce za účelem potlačení mobilních prvků genomu. [8] DNMT1 je DNA methyltransferáza, která udržuje methylovaný stav DNA přidáním methylových skupin k jednomu z řetězců DNA v místech, kde je methylován jiný komplementární řetězec. Nepolyadenylované dlouhé nekódující RNA (lncRNA) mají hrát roli inhibitorů DNMT1, které regulují metylaci DNA [9] .Protein DNMT3L je homologní s ostatními proteiny DNMT, ale nemá žádnou katalytickou aktivitu. Místo toho DNMT3L podporuje de novo methyltransferázy tím, že usnadňuje vazbu těchto enzymů na DNA a stimuluje jejich aktivitu.

Důležitými fázemi ve vývoji maligních novotvarů jsou předběžná hypometylace DNA [10] a následná inaktivace genů potlačujících růst nádoru [11] . V případě, kdy inaktivace byla způsobena methylací promotorové oblasti genu, byly provedeny experimenty k obnovení exprese inhibicí DNMT. 5-aza-2'-deoxycytidin ( decitabin ) je nukleosidový analog , který inhibuje DNMT methyltransferázy. Mechanismus účinku léčiva je založen na kovalentní vazbě enzymu v komplexu s DNA, což znemožňuje enzymu plnit jeho funkci a vede k degradaci methyltransferázy. Nicméně, aby byl decitabin aktivní, musí se integrovat do buněčného genomu , ale to zase může způsobit mutace v dceřiných buňkách, pokud buňka nezemře a pokračuje v dělení. Kromě toho je decitabin toxický pro kostní dřeň, což omezuje jeho terapeutické použití. Tato omezení vedla k intenzivnímu hledání terapeutických intervencí založených na použití „antisense“ RNA, které působí proti DNMT degradací jeho mRNA , a proto blokují translaci . Schopnost selektivně demetylovat gen a tím měnit jeho expresi poskytuje objev tzv. extrakódující RNA, která je schopna se vázat na DNMT1, čímž blokuje jeho schopnost metylovat konkrétní gen [12] . Otázkou však zůstává, zda je inhibice funkce DNMT1 dostatečnou podmínkou pro zvýšenou expresi supresorových genů, jejichž transkripce je downregulována metylací DNA.

Analýza lidských osobních transkriptomů a methylomů ukázala, že korelace mezi metylací a genovou expresí je pozorována pouze u méně než 20 % genů [13].

Young a kol. vyvinuli účinnou metodu pro selektivní cílenou demetylaci specifických CpG v lidských buňkách pomocí TALE (transscription activator-like effector) selektivní DNA-vazebné domény kombinované molekulárním inženýrstvím a TET1 katalytické hydroxylázové domény, která katalyzuje konverzi 5-methylcytosinu na 5-hydroxymethylcytosin [14] . Pomocí této fúzní molekuly TALE-TET1 ukázali, že demetylace určitých promotorů CpG může vést k významnému zvýšení exprese odpovídajících lidských genů. Vývoj enzymu založeného na inaktivované molekule d -Cas9 (neschopné štěpit DNA) značně zjednoduší tvorbu selektivních demetyláz . To umožní, aby byla demethyláza nasměrována do hypermethylovaných genových promotorů vybraných pro aktivaci vodící RNA. [patnáct]

Bylo vyvinuto médium, které způsobuje hypomethylaci DNA v buňkách in vitro. Toto médium, nazývané 2i, obsahuje dva inhibitory s malou molekulou, z nichž jeden inhibuje signální dráhu ERK1/2 a druhý Gsk3p . Je široce používán k přeprogramování a udržení pluripotentního stavu buněk [16] [17] .

Změny v metylaci DNA se stárnutím

Již v 70. letech 20. století v dílech Vanyushina B.F. a řada dalších pracovníků Biologické fakulty Moskevské státní univerzity odhalila vztah mezi fázemi individuálního vývoje a stárnutí zvířat a lidí se změnami v takové enzymatické modifikaci, jakou je metylace DNA [18] . Pro sérii prací "Metylace DNA - epigenetická kontrola nad genetickými funkcemi těla" Vanyushin B.F. získal cenu pojmenovanou po A. N. Belozerském .

Nyní je dobře známo, že krajina metylace genomové DNA se s věkem mění [19] [20] [21] [22] [23] . Tento proces, nazývaný „epigenetický drift“ [24] [25] , úzce souvisí s chronologickým stářím a zároveň podle některých autorů není markerem replikativní buněčné senescence , neboť se vyskytuje i v „ne -senescentní“ kmenové buňky [26] [27] . Pro replikativní buněčné stárnutí byly nalezeny mírně odlišné epigenetické biomarkery, založené také na změnách metylace DNA v určitých místech genomu [28] Stanovení epigenetického stárnutí pomocí metylace DNA genů ITGA2B, ASPA a PDE4C umožňuje stanovit biologický věk osoby s průměrnou absolutní odchylkou od chronologického věku nejvýše 5 let [29] . Tato přesnost je lepší než předpovědi věku založené na délce telomer .

V procesu stárnutí lidského těla se výrazně snižuje funkční potenciál hematopoetických kmenových buněk (HSC) , což přispívá k rozvoji patofyziologie krvetvorby u seniorů [30] . Tento věkem podmíněný pokles počtu HSC a jejich schopnosti proliferovat , jak se ukázalo, ve větší míře nezávisí na délce telomer, ale na hypermetylaci DNA genů regulovaných proteiny Polycomb Repressor Complex 2 [31] .

Podle čínských vědců [32] může metylace DNA přispívat ke zdravému lidskému stárnutí tím, že reguluje geny náchylné k nemocem souvisejícím s věkem. Například u Alzheimerovy choroby je aktivně exprimován gen CASP3 kaspázy 3 , který se podílí na štěpení prekurzorového proteinu beta-amyloidu 4A, což vede k smrti neuronů, zatímco u stoletých lidí je gen CASP3 blokován hypermethylací místo blízko místa iniciace transkripce tohoto genu. Jiný příklad: gen interleukinového receptoru IL1R2 má nízkou expresi v případě aterosklerózy , zatímco u stoletých lidí není jeho aktivita snížena kvůli hypomethylované oblasti poblíž místa iniciace jeho transkripce [32] [33] .

Viz také: Epigenetické hodiny , stejně jako recenze v ruštině [34] a podrobná recenze v angličtině [35]

Role metylace v onkogenezi

Bylo zjištěno, že epigenetický věk ovlivňuje pravděpodobnost vzniku rakoviny. Byl vyvinut algoritmus pro výpočet epigenetického věku z dat metylace DNA v krvi. Algoritmus je založen na 71 methylačních markerech DNA, které se mohou měnit v závislosti na prostředí, cvičení a stravě dané osoby. Studie využívající tento algoritmus na odběru vzorků krve odebraných v průběhu 15 let ukázala, že osoby s epigenetickým věkem přibližně o jeden rok starší, než je jejich chronologický věk, mají o 6 % vyšší riziko vzniku rakoviny do tří let a osoby, kterým jsou přibližně 2 roky starší než jejich chronologický věk Ti, kteří jsou o 2 roky starší než jejich chronologický věk, mají o 17 % zvýšené riziko úmrtí na rakovinu do pěti let [36] [37] .

Srovnání údajů o genotypu lidí predisponovaných k rakovině s jejich profilem metylace DNA naznačovalo, že asi ve 20 % případů dědičné rakoviny je nalezen vztah mezi úrovní metylace určitých lokusů a genovými polymorfismy spojenými s rizikem rakoviny. Zejména byla pozorována vysoce významná korelace mezi úrovní metylace CpG a expresí klíčových rakovinných genů, jako jsou MYC, TERT a TP63 [38] .

Asi třetina všech solidních nádorů je spojena s mutací v genu KRAS nebo s mutacemi v drahách spojených s KRAS. KRAS vypíná enzym TET1, který podporuje inaktivaci genu prostřednictvím metylace. TET1 katalyzuje počáteční krok aktivní demethylace DNA závislé na železe a alfa-ketoglutarátu u savců, konverzi 5-methylcytosinu (5-MC) na 5-hydroxymethylcytosin (5-HMC) oxidací 5-MC. Přidání TET1 k těmto mutantním buňkám aktivuje tumor supresorové geny, což se zdá být dostatečné pro snížení abnormální proliferace. Stačí však inaktivovat TET1, aby byly tyto buňky opět maligní, a to i bez KRAS [39] .

Důležitým biomarkerem onkogeneze je hypermetylace CpG ostrůvků v promotoru genu ZNF154 ( protein zinc-finger 154) [40] [41] . Hypermethylace ZNF154 byla pozorována u velké většiny nádorových buněk, ale chyběla u normálních buněk [42] . Jakou funkci plní gen ZNF154 v těle, není zatím jasné. Simultánní hypometylace je obvykle pozorována ve dvou genomových oblastech spojených s Casp8 ( kaspáza -8) a VHL (Hippel-Lindau tumor supresor) [42] .

Metylace DNA u hmyzu

Úroveň metylace DNA u Drosophila melanogaster , oblíbeného objektu genetiků , je velmi nízká, což znemožnilo její studium pomocí bisulfitových sekvenačních metod [43] . Takayama a kol. [44] vyvinuli vysoce citlivou metodu, která umožnila odhalit, že metylační profil sekvencí DNA genomu much je velmi odlišný od metylačního profilu lidského, zvířecího nebo rostlinného genomu. Metylace genomu Drosophila je koncentrována v určitých krátkých sekvencích bází (o 5 párech bází), které jsou bohaté na CA a CT, ale jsou ochuzeny o guanin. Navíc se ukázalo, že je nezávislý na aktivitě DNMT2. Další studium metylace DNA u Drosophila pomůže identifikovat změny v epigenomu související s věkem.

Metylace DNA v rostlinách

V poslední době došlo k významnému průlomu v chápání procesu metylace DNA u rostlin, zejména u Arabidopsis thaliana . Hlavní methyltransferázy DNA v A. thaliana jsou Met1, Cmt3 a Drm2, které jsou na úrovni aminokyselinové sekvence podobné výše popsaným methyltransferázám DNA u savců. Předpokládá se, že Drm2 se účastní jak de-novo methylace DNA , tak udržování methylace později ve vývoji. Cmt3 a Met1 slouží především k udržení methylace DNA. [45] V rostlinách jsou přítomny i další DNA metyltransferázy, jejich funkce však dosud nebyla objasněna (viz [1] ). Předpokládá se, že specificita methyltransferázy během methylace DNA je modulována RNA. Specifické RNA transkripty jsou přepisovány z určitých oblastí matrice – genomové DNA. Tyto RNA transkripty mohou tvořit dvouvláknové molekuly RNA. Dvouvláknové RNA prostřednictvím regulačních signálních drah spojených buď s malými interferujícími RNA (siRNA) nebo mikroRNA (miRNA) určují lokalizaci metyltransferáz DNA v místech specifických nukleotidových sekvencí v genomu [46] .

Viz také

Odkazy

  1. ↑ Bethany A. Buck-Koehntop a Pierre-Antoine Defossez (2013) O tom, jak savčí transkripční faktory rozpoznávají methylovanou DNA. 8(2), 131-137 https://dx.doi.org/10.4161/epi.23632
  2. ↑ Seisenberger S, Peat JR, Hore TA, Santos F, Dean W, Reik W. (2013) Přeprogramování metylace DNA v životním cyklu savců: budování a prolomení epigenetických bariér. Phil. Trans. R. Soc. B 368, 20110330. doi:10.1098/rstb.2011.0330
  3. ↑ Kelsey G, Feil R. (2013) Nové poznatky o vytváření a udržování otisků metylace DNA u savců. Phil. Trans. R. Soc. B 368, 20110336. doi:10.1098/rstb.2011.0336
  4. ↑ Rahul M. Kohli & Yi Zhang (2013) TET enzymy, TDG a dynamika demetylace DNA. Nature 502(7472), 472-479 doi:10.1038/nature12750
  5. ↑ Dodge, Jonathan E.; Bernard H. Ramsahoyeb, Z. Galen Woa, Masaki Okanoa, En Li. De novo methylace proviru MMLV v embryonálních kmenových buňkách: CpG versus non-CpG metylace  // ScienceDirect  :  časopis. - 2002. - Květen.
  6. ↑ Haines, Thomas R. Alelově specifická ne-CpG methylace genu Nf1 během raného vývoje myši  // ScienceDirect  :  časopis. - 2001. - Prosinec.
  7. ↑ Lee M. Butcher, Mitsuteru Ito, Minodora Brimpari, Tiffany J. Morris, Filipa AC Soares, Lars Ährlund-Richter, Nessa Carey, Ludovic Vallier, Anne C. Ferguson-Smith, Stephan Beck. (2016). Non-CG DNA methylace je biomarker pro hodnocení endodermální diferenciační kapacity v pluripotentních kmenových buňkách. Nature Communications 7, číslo artiklu: 10458 doi : 10.1038/ncomms10458
  8. ↑ Galitsky V.A. Hypotéza o mechanismu iniciace de novo metylace DNA a alelické exkluze malými RNA  (rusky)  // Tsitol. - 2008. - T. 50 (4) . - S. 277-286 .
  9. ↑ Fan Lai a Ramin Shiekhattar (leden 2014). Kde se dlouhé nekódující RNA setkávají s methylací DNA Archivováno 23. února 2014 na Wayback Machine . Cell Research, doi: 10.1038/cr.2014.13
  10. ↑ Elias Daura-Oller, Maria Cabre, Miguel A Montero, Jose L Paternain a Antoni Romeu (2009) „Specifická genová hypometylace a rakovina: Nové poznatky o trendech v oblasti kódování“. bioinformace. 2009; 3(8): 340-343.PMID PMC2720671
  11. ↑ Stepanenko, AA, & Kavsan, VM (2012) Imortalizace a maligní transformace eukaryotických buněk. Cytologie a genetika, 46(2), 96-129
  12. ↑ Di Ruscio, A., Ebralidze, A.K., Benoukraf, T. et al. & Tenen, DG (2013) RNA interagující s DNMT1 blokují genově specifickou methylaci DNA . Příroda; DOI: 10.1038/příroda12598
  13. ↑ Rubina Tabassum, Ambily Sivadas, Vartika Agrawal, Haozheng Tian, ​​​​Dalia Arafat a Greg Gibson (2015). Omická osobnost: důsledky stabilních transkriptů a metylačních profilů pro personalizovanou medicínu Archivováno 11. září 2015 na Wayback Machine . Genome Medicine 2015 07:88 doi : 10.1186/s13073-015-0209-4
  14. ↑ Maeder, ML, Angstman, JF, Richardson, ME, et al. & Joung, JK (2013). Cílená demetylace DNA a aktivace endogenních genů pomocí programovatelných fúzních proteinů TALE-TET1. přírodní biotechnologie. doi:10.1038/nbt.2726
  15. ↑ Xu, X., Tao, Y., Gao, X., Zhang, L., Li, X., Zou, W., ... & Hu, R. (2016). Přístup založený na CRISPR pro cílenou demetylaci DNA Archivováno 10. září 2016 na Wayback Machine . Cell Discovery, 2. , Číslo článku: 16009(2016) doi : 10.1038/celldisc.2016.9
  16. ↑ Gabriella Ficz, Timothy A. Hore, Fatima Santos a kol. & Wolf Reik (2013) Inhibice signalizace FGF v ESC řídí rychlou demetylaci celého genomu do epigenetického základního stavu pluripotence Archivováno 24. září 2015 na Wayback Machine . Cell Stem Cell, 13(3), 351-359 https://dx.doi.org/10.1016/j.stem.2013.06.004
  17. ↑ Hakan Bagci, Amanda G. Fisher (2013) DNA Demethylation in Pluripotency and Reprogramming: The Role of Tet Proteins and Cell Division. Cell Stem Cell, 13(3), 265-269 doi: 10.1016/j.stem.2013.08.005
  18. ↑ Vanyushin B., Berdyshev G. (1977). Molekulárně genetické mechanismy stárnutí Archivováno 12. března 2016 na Wayback Machine . Nakladatelství Medicine. Moskva. Knižní vydání.
  19. ↑ Johansson Å, Enroth S, Gyllensten U (2013) Nepřetržité stárnutí methylomu lidské DNA v průběhu lidského života. PLoS ONE 8(6): e67378. doi:10.1371/journal.pone.0067378
  20. ↑ Hannum, G., Guinney, J., Zhao, L., et al. & Zhang, K. (2013). Methylační profily v celém genomu odhalují kvantitativní pohledy na rychlost lidského stárnutí. Molecular cell, 49(2), 359-367.
  21. ↑ Heyn H, Li N, Ferreira HJ, Moran S, Pisano DG a kol. (2012) Odlišné methylomy DNA novorozenců a stoletých lidí. Proč Natl Acad Sci USA 109: 10522-10527. doi:10.1073/pnas.1120658109
  22. ↑ Pogribny, IP, & Vanyushin, BF (2010). Genetická hypometylace související s věkem. In Epigenetika stárnutí (s. 11-27). Springer v New Yorku. DOI: 10.1007/978-1-4419-0639-7_2
  23. ↑ Florath, I., Butterbach, K., Müller, H., Bewerunge-Hudler, M., et al. & Baca, V. (2013). Průřezové a podélné změny v methylaci DNA s věkem: Analýza celého epigenomu odhalující nová místa CpG spojená s věkem. Lidská molekulární genetika, doi: 10.1093/hmg/ddt531
  24. ↑ Teschendorff, A.E., West, J., & Beck, S. (2013). Epigenetický drift související s věkem: důsledky a případ epigenetické šetrnosti?. Hučení. Mol. Genet. 22(R1):R7-R15 doi:10.1093/hmg/ddt375
  25. ↑ West, J., Widschwendter, M., & Teschendorff, A. E. (2013). Výrazná topologie věkově spojeného epigenetického driftu v lidském interaktomu. PNAS, 110(35), 14138-14143. doi:10.1073/pnas.1307242110
  26. ↑ Steve Horvath (2013) Věk metylace DNA lidských tkání a typů buněk Archivováno 20. ledna 2018 na Wayback Machine . Genome Biology, 14(10):R115 doi:10.1186/cz-2013-14-10-r115
  27. ↑ Bocklandt S, Lin W, Sehl ME, Sánchez FJ, Sinsheimer JS, et al. (2011) Epigenetic Predictor of Age Archived 4. listopadu 2013 na Wayback Machine . PLoS ONE 6(6): e14821. doi:10.1371/journal.pone.0014821
  28. ↑ Koch, CM, & Wagner, W. (2013). Epigenetický biomarker k určení replikativního stárnutí kultivovaných buněk. In Biologické stárnutí. Ser.: Methods in Molecular Biology, sv. 1048, (str. 309-321). Humana Press. DOI: 10.1007/978-1-62703-556-9_20
  29. ↑ Carola Ingrid Weidner, Qiong Lin, Carmen Maike Koch a kol. a Wolfgang Wagner (únor 2014). Stárnutí krve lze sledovat změnami metylace DNA na pouhých třech místech CpG Archivováno 9. února 2014 na Wayback Machine . Genome Biology, 15:R24 doi:10.1186/cz-2014-15-2-r24
  30. ↑ Myung Geun Shin (2014). Stárnutí a porucha krvetvorby. J Korean Med Assoc.; 57(4), 334-340. https://dx.doi.org/10.5124/jkma.2014.57.4.334
  31. ↑ Beerman, I., Bock, C., Garrison, BS, Smith, ZD, Gu, H., Meissner, A., & Rossi, DJ (2013). Změny krajiny metylace DNA závislé na proliferaci jsou základem stárnutí hematopoetických kmenových buněk. Cell Stem Cell, 12(4), 413-425 doi : 10.1016/j.stem.2013.01.017
  32. ↑ 1 2 Xiao FH, He YH, Li QG, Wu H, Luo LH, Kong QP (2015). Skenování celého genomu odhaluje důležité role methylace DNA v lidské dlouhověkosti regulací genů nemocí souvisejících s věkem, archivováno 18. května 2015 na Wayback Machine . PLoS ONE 10(3): e0120388. doi : 10.1371/journal.pone.0120388
  33. ↑ Jones, MJ, Goodman, SJ a Kobor, MS (2015), metylace DNA a zdravé lidské stárnutí Archivováno 10. července 2015 na Wayback Machine . stárnoucí buňka. doi : 10.1111/acel.12349
  34. ↑ Epigenetika stárnutí: průlomový směr v gerontologii? . Staženo 21. února 2020. Archivováno z originálu dne 21. února 2020.
  35. ↑ Horvath, S., & Raj, K. (2018). Biomarkery založené na methylaci DNA a teorie epigenetických hodin stárnutí. Nature Reviews Genetics, doi : 10.1038/s41576-018-0004-3 PMID 29643443
  36. ↑ Epigeneticko-chronologický věkový nesoulad varuje před rakovinou Archivováno 21. února 2016 na Wayback Machine . Genetické inženýrství a biotechnologie novinky. 18. února 2016
  37. ↑ Zheng, Y., Joyce, BT, Colicino, E., Liu, L., Zhang, W., Dai, Q., ... & Jafari, N. (2016). Epigenetický věk krve může předpovídat výskyt rakoviny a úmrtnost. EBioMedicine. doi : 10.1016/j.ebiom.2016.02.008
  38. ↑ Heyn H, Sayols S, Moutinho C a kol. & Esteller M. (2014) Vazba kvantitativního lokusu methylace DNA k riziku lidské rakoviny. Cell Reports, https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2014.03.016
  39. ↑ Bo-Kuan Wu, Charles Brenner (2014). Potlačení demetylace DNA závislé na TET1 je nezbytné pro transformaci zprostředkovanou KRAS. Cell Reports, DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.celrep.2014.10.063
  40. ↑ Gennady Margolin, Hanna M. Petrykowska, Nader Jameel, Daphne W. Bell, Alice C. Young, Laura Elnitski (2016). Robustní detekce hypermetylace DNA ZNF154 jako pan-rakovinového lokusu s modelováním in Silico pro diagnostický vývoj založený na krvi. The Journal of Molecular Diagnostics. DOI: https://dx.doi.org/10.1016/j.jmoldx.2015.11.004
  41. ↑ Výzkumníci identifikují pozoruhodný genomický podpis sdílený pěti typy rakoviny . Získáno 5. února 2016. Archivováno z originálu 6. února 2016.
  42. ↑ 1 2 Sánchez-Vega, F., Gotea, V., Petrykowska, HM, Margolin, G., Krivák, TC, DeLoia, JA, ... & Elnitski, L. (2013). Opakující se vzorce methylace DNA v promotorech ZNF154, CASP8 a VHL v širokém spektru lidských solidních epiteliálních nádorů a rakovinných buněčných linií. Epigenetika, 8(12), 1355-1372. doi : 10.4161/epi.26701
  43. ↑ Capuano F., Mülleder M., Kok RM, Blom HJ, Ralser M. Cytosinová methylace DNA se nachází u Drosophila melanogaster , ale chybí u Saccharomyces cerevisiae , Schizosaccharomyces pombe a dalších druzích kvasinek  (anglicky)  // Analytical Chemist. - 2014. - Sv. 86 , č. 8 . - S. 3697-3702 . doi : 10.1021 / ac500447w . — PMID 24640988 .
  44. ↑ S. Takayama, J. Dhahbi, A. Roberts, G. Mao, S.-J. Heo, L. Pachter, DIK Martin, D. Boffelli (2014). Metylace genomu u D. melanogaster se nachází ve specifických krátkých motivech a je nezávislá na aktivitě DNMT2. Genome Research, doi : 10.1101/gr.162412.113
  45. ↑ Cao, Xiaofeng; Jacobsen, Steven E. Locus-specific control of asymetrické a CpNpG methylation by DRM a CMT3 methyltransferase genes // Proceedings of the National Academy of Sciences  : journal  . července — 2003.  
  46. ↑ Aufsatz, Werner; M. Florian Mette, Johannes van der Winden, Antonius JM Matzke, Marjori Matzke. RNA-řízená methylace DNA v Arabidopsis  (neopr.)  // Proceedings of the National Academy of Sciences . — prosinec — 2002.

Literatura

Odkazy

 Přepis (biologie)
Regulace
transkripce
prokaryota
eukaryota
enzymy
modifikující
histony
( histony / nukleozomy )
methylace DNADNA methyltransferáza
Remodelace
chromatinu		CHD7
Společné pro
pro- a eukaryota
Aktivace
ZahájeníMísto začátku přepisu
Prodloužení
Ukončení