Arenaviry

Arenaviry
Viriony viru Lassa
vědecká klasifikace
Skupina:Viry [1]Oblast:RiboviriaKrálovství:OrthornaviraeTyp:NegarnaviricotaPodtyp:PolyploviricotinaTřída:EllioviricetesObjednat:BunyaviralesRodina:Arenaviry
Mezinárodní vědecký název
Arenaviridae
porod
Mammarenavirus Reptarenavirus
Baltimorská skupina
V: (-)ssRNA viry
Systematika na Wikispecies Obrázky na Wikimedia Commons NCBI   11617 EOL   5047

Arenaviry [2] ( lat.  Arenaviridae , z jiného řeckého arenosa - písečný) jsou čeledí RNA virů . Jméno rodu bylo dáno podle struktury virionu  – který je jakoby posypán pískem. Viry tropů , mortalita po infekci - nad 20%.

Obvykle se arenaviry dělí na viry Nového světa a Starého světa . Mezi čtyřmi viry Starého světa se rozlišuje virus lymfocytární choriomeningitidy , který se vyskytuje u hlodavců po celém světě, a také virus horečky Lassa  – až 15 000 případů v západní Africe , mortalita až 30 %. Viry Nového světa se nacházejí u krys v Jižní Americe .

Virion

Virion je pokrytý membránou obsahující lipidy , na povrchu má velké hroty. Obsahuje dva nukleokapsidy . Morfologie virionů je mnohočetná, průměr je asi 62-200 nm, v průměru asi 110 nm.

Genom

Genomická jednovláknová (-)RNA obsahuje dva otevřené čtecí rámce:

• (S) - 3336-3535 nukleotidů, kóduje dva polypeptidy, dva čtecí rámce - NP - nukleokapsid; GPC - rozštěpený na GP1, GP2 - dva glykoproteiny
• (L) - 7200 nukleotidů, kóduje dva proteiny - RNA polymerázu a Z protein obsahující prst vázající Zn

Replikace

Genomická (-)RNA se replikuje na (+)antigenomickou mRNA, která se překládá.

Diagnostika

• ELISA proti IgG včetně IgM a v akutní fázi.
• PCR - během infekce nejspolehlivější metoda.

Klasifikace

V roce 2014 byl do rodiny arenavirů zařazen nový rod Reptarenavirus [3] a rod Arenavirus , který se tam nachází, byl spolu se všemi svými druhy přejmenován na Mammarenavirus [4] . Podle Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) od března 2017 rodina zahrnuje 2 rody [5] :

• Mammarenavirus (33 druhů)
  • Chapare mammarenavirus - Chapare virus [6]
  • Flexální mammarenavirus _ _
  • Guanarito mammarenavirus - Guanarito virus [2] [6]
  • Junin mammarenavirus - Junin virus [2] [6]
  • Lassa mammarenavirus - Lassa virus [2]
  • Mammarenavirus lymfocytární choriomeningitidy — virus lymfocytární choriomeningitidy [2] [6]
  • Machupo mammarenavirus - Machupo virus [2] [6]
  • Sabiá mammarenavirus - Sabia virus [2]
  • Lujo mammarenavirus - Lujo virus [6]
• Reptarenavirus (3 druhy)

Poznámky

1. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) .
2. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Atlas lékařské mikrobiologie, virologie a imunologie: učebnice pro studenty medicíny / Ed. A. A. Vorobieva , A. S. Bykova . - M .  : Lékařská informační agentura, 2003. - S. 131-132. — ISBN 5-89481-136-8 .
3. ↑ Vytvořte nový rod, Reptarenavirus , zahrnující tři nové druhy z čeledi Arenaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělen kód: 2014.011a-dV. - 2014. - 12 s.
4. ↑ Přejmenujte jeden (1) rod a dvacet pět (25) druhů v čeledi Arenaviridae  : [ eng. ] // ICTVonline. — Přidělen kód: 2014.012aV. - 2014. - 6 s.
5. ↑ Taxonomie virů  na webu Mezinárodního výboru pro taxonomii virů (ICTV) . (Přístup: 26. března 2017) .
6. ↑ 1 2 3 4 5 6 7 Seznam mikroorganismů, toxinů, zařízení a technologií podléhajících kontrole vývozu  : [schváleno. Dekret prezidenta Ruské federace ze dne 20. srpna 2007 č. 1083]: úřední. text: zpřístupněno 1. června 2016